BACKGROUND: Non-syndromic autosomal dominant hearing impairment is characteristically postlingual in onset. Genetic diagnostics are essential for genetic counselling, disease prognosis and understanding of the molecular mechanisms of disease. To date, 36 causative genes have been identified, many in only individual families. Gene selection for genetic screening by traditional methods and genetic diagnosis in autosomal dominant patients has therefore been fraught with difficulty. Whole-exome sequencing provides a powerful tool to analyze all protein-coding genomic regions in parallel, thus allo…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of this study was to identify disease-causing gene mutations in a Chinese family affected with autosomal dominant nocturnal frontal lobe epilepsy (ADNFLE), a 4-generation pedigree of 27 members in the Southern Chinese Han population, including 11 individuals diagnosed with ADNFLE. DNA samples were collected from 15 family members, chinese han people, including seven affected and eight unaffected individuals. None of these patients had night blindness or visual disorders. Four affected individuals were screened for mutations using whole-exome sequencing, and 13 potentially interesting m…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Next-generation sequencing (NGS) has enriched the understanding of the human genome. However, homologous or repetitive sequences shared amon … s or mutations. We aimed at elucidating nucleotide misalignments by performing realignment of whole exome sequencing (WES) and whole genome sequencing (WGS) reads to specific Kir2.2, Kir2.5, and Kir2.6 cDNA sequences using BWA-MEM/GATK pipeline. WES/WGS reads correctly aligned 26.9/43.2, 37.6/31.0, and 35.4/25.8 % to Kir2.2, Kir2.5, and Kir2.6, respecti …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lamellar ichthyosis (LI), considered an autosomal recessive monogenic genodermatosis, has an incidence of approximately 1 in 250,000. Usually associated with mutations in the transglutaminase gene ( TGM1), mutations in six other genes have, less frequently, been shown to be causative. Two siblings, born in a collodion membrane, presented with fish like scales all over the body. Karyotyping revealed duplication of the chromosome arm on 22q12+ in the father and two siblings. Whole exome sequencing revealed a homozygous p.Gly218Ser variation in TGM1; a variation reported earlier in an isolated Fi…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Although extensively investigated, the genetic etiology of fetal growth restriction (FGR) has not been fully understood. Previous studies have shown the potential of karyotyping, chromosomal microarray analysis (CMA) and trio-based WES (trio-WES) in prenatal diagnosis, however, there is little knowledge on the comparative effectiveness of these three prenatal genetic tools. The present study aimed to evaluate and compare the effectiveness of karyotyping, CMA and trio-WES for prenatal diagnosis and prognostic evaluation of FGR, in order to identify the optimal genetic diagnostic tes
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Ciliopathies with major skeletal involvement embrace a group of heterogeneous disorders caused by pathogenic variants in a gro … us marriage who was found to have a biallelic p.R474* alteration in GRK2 in reanalysis of the whole-exome sequencing (WES) data. The patient was exhibiting major clinical features of Jeune syndrome, such as shortened long bones, ribs, and narrow thorax.
DISCUSSION: Our reanalysis of WES data revealed a likely pathogenic biallelic variant in the GRK2 wh …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Congenital long QT syndrome (LQTS) is one type of inherited fatal cardiac arrhythmia that may lead to sudden cardiac death (SCD). Mutations … no obvious arrhythmia in the resting state. Three family members have died of suspected SCD. Whole-exome sequencing and bioinformatic analysis based on pedigree revealed that a novel missense mutation KCNA10 (c.1397G>A/Arg466Gln) was the potential genetic lesion. Sanger sequencing was performed to confirm the whole-exome sequencing results. This mutati …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autoimmune coagulation factor XIII deficiency is a bleeding disorder caused by the formation of autoantibodies against the coagulation factor XIII (FXIII); however, the molecular mechanism underlying this process is unknown. Therefore, in the present study, we aimed to elucidate this mechanism by performing whole-exome sequencing analysis of 20 cases of autoimmune FXIII deficiency. We identified approximately 21,788-23,916 variants in each case. In addition to their ability to activate T cells, present antigens, and immune tolerance, the candidate alleles were further narrowed down according t…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Osteogenesis imperfecta (OI) is a rare disease characterized by increased bone fragility and predisposition to fractures, bone deformities and other major signs such as dentinogenesis imperfecta, blue sclera and deafness. Over 90% of OI cases are caused by mutations in the COL1A1 and COL1A2 genes and the inheritance is autosomal dominant.
METHODS: We present a case of a couple requesting genetic counseling, because the man was diagnosed with OI on a clinical and radiological basis and the woman was pregnant. Whole exomes sequencing (WES) was performed in order to identify the muta…
Клинический случайСтатьяСистематический обзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinal muscular atrophy with respiratory distress type 1 (SMARD1) is a rare autosomal recessive disorder caused by a defect in the immunoglobulin mu binding protein 2 (IGHMBP2) gene, leading to motor neuron degeneration. We identified an infant with SMARD1 by targeted exome sequencing from a consanguineous Syrian family having a history of recurrent infant deaths. The patient initially presented intrauterine growth retardation, poor sucking, failure to thrive, and respiratory failure at the age of two months, and an inborn error of metabolism was suspected at first. Over a period of one month,…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A subset of neurofibromatosis type 1 patients develop tibial dysplasia, which can lead to pseudarthrosis. The tissue from the tibial pseudarthrosis region commonly has a somatic second hit in NF1: single-nucleotide variants, small deletions, or loss of heterozygosity (LOH). We used exome next-generation sequencing (NGS) variant frequency data (allelic imbalance analysis) to detect somatic LOH in pseudarthrosis tissue from three individuals with clinically and diagnostically confirmed neurofibromatosis type 1, and verified the results with microarray. The variant files were parsed and plotted u…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The goals are to understand the primary genetic mechanisms that cause Sick Sinus Syndrome and to identify potential modifiers that may result in intrafamilial variability within a multigenerational family. The proband is a 63-year-old male with a family history of individuals (>10) with sinus node dysfunction, ventricular arrhythmia, cardiomyopathy, heart failure, and sudden death. We used exome sequencing of a single individual to identify a novel LMNA mutation and demonstrated the importance of Sanger validation and family studies when evaluating candidates. After initial single-gene studies…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autosomal recessive cerebellar ataxias and autosomal recessive hereditary spastic paraplegias are clinically and genetically heterogeneous disorders with diverse neurological and non-neurological features. We herein describe a Japanese patient with a slowly progressive form of ataxia and spastic paraplegia. Using whole exome sequencing, we identified a novel homozygous frameshift mutation in SPG7, encoding paraplegin, in this patient. This is the first report of an SPG7 mutation in the Japanese population. For disorders previously undetected in a particular population, or unrecognized/atypical…
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Signaling by the glial cell line-derived neurotrophic factor (GDNF)-RET receptor tyrosine kinase and SPRY1, a RET repressor, is essential fo … and cryptorchidism. Presence of both mutations was necessary to affect RET activity. Targeted whole-exome and next-generation sequencing revealed a novel deleterious mutation G443D in GFRα1, the co-receptor for RET, in this patient. Pedigree analysis indicated that the GFRα1 mutation was inherited from the unaffected mother and the RET mutations from th …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The diagnostic efficacy of empirical trio-based whole-exome sequencing (trio-WES) for unexplained syndromic neurodevelopmental disorders (NDDs) remains unsatisfactory. This study aimed to explore the diagnostic value of phenotypic indicators and establish a nomogram for predicting the genetic results of trio-WES for diagnosing patients with unexplained s-NDDs.
METHODS: We retrospectively collected phenotypic and genotypic data from 265 children with s-NDDs who received trio-WES at Sun Yat-sen Memorial Hospital (training cohort), 38 and 97s-NDDs patients with trio-WES test at Shensh…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Orofacial clefts (OFCs) are common congenital disabilities that can occur as isolated non-syndromic events or as part of Mendelian syndromes. OFC risk factors vary due to differences in regional environmental exposures, genetic variants, and ethnicities. In recent years, significant progress has been made in understanding OFCs, due to advances in sequencing and genotyping technologies. Despite these advances, very little is known about the genetic interplay in the Malagasy population.
METHODS: Here, we performed high-resolution whole-exome sequencing (WES) on non-syndromic cleft l…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
It was estimated that 70% of patients with colorectal cancer were found to have viable exfoliated malignant cells in adjacent intestinal lum … nd were finally removed by transanal endoscopic microsurgery (TEM). Pathological examination, whole exome sequencing (WES), and Lineage Inference for Cancer Heterogeneity and Evolution (LICHeE) analysis demonstrated that the two tumors at the rectal anastomosis were probably implantation metastases arising from the previous sigmoid colon cancer. This is …
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.