BACKGROUND: Hepatocellular carcinoma (HCC) is a leading cause of cancer mortality globally, and its progression is associated with various factors, including parasitic infections such as Clonorchis sinensis (C. sinensis). Although C. sinensis infection has been implicated in HCC, the molecular mechanisms, particularly the role of microRNAs (miRNAs), remain poorly understood. This study aims to fill this gap by investigating the miRNA expression profiles in C. sinensis+ and C. sinensis- HCC tissues.
METHOD: We performed miRNA sequencing on HCC tissues from C. sinensis+ and C. sinensis- patient
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The functional diversity of natural killer (NK) cell repertoires stems from differentiation, homeostatic, receptor-ligand interactions and adaptive-like responses to viral infections. In the present study, we generated a single-cell transcriptional reference map of healthy human blood- and tissue-derived NK cells, with temporal resolution and fate-specific expression of gene-regulatory networks defining NK cell differentiation. Transfer learning facilitated incorporation of tumor-infiltrating NK cell transcriptomes (39 datasets, 7 solid tumors, 427 patients) into the reference map to analyze t
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diffuse large B cell lymphoma (DLBCL) is a heterogeneous and aggressive B cell malignancy that accounts for about 30 % of non-Hodgkin lymphomas. The current standard treatment for DLBCL is rituximab plus chemotherapy, but many patients are refractory or relapse, indicating the need for improved understanding of its molecular pathology. T cell exhaustion is a state of dysfunction or impairment that occurs in chronic infections or cancers, and is associated with poor prognosis in DLBCL. However, the molecular mechanisms of T cell exhaustion in DLBCL are poorly understood. In this study, we perfo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Male infertility is a risk factor for the development of testicular germ cell tumors. In this study, we investigated microRNA profiles in seminal plasma to identify potential noninvasive biomarkers able to discriminate the men at highest risk of developing cancer among the infertile population. We compared the microRNA profiles of individuals affected by testicular germ cell tumors and healthy individuals with normal or impaired spermiograms using high-throughput technology and confirmed the results by single-assay digital PCR. We found that miR-221-3p and miR-222-3p were downregulated and miR
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A growing number of studies suggest a positive association between obesity and the high incidence of papillary thyroid cancer (PTC), suggesting that the abnormal levels of adipokines associated with obesity may be a risk factor for these aggressive thyroid cancers, but the underlying regulatory mechanisms are not yet clear. We downloaded bulk RNA sequence data for subcutaneous adipose tissue (SAT) in obesity and healthy population and tumor tissues of PTC from GEO database. Through analysis of Differential Expression Genes (DEGs), Gene Set Variation Analysis (GSVA) and Weighted Correlation Net
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mantle cell lymphoma (MCL) is a rare, incurable, and aggressive B-cell non-Hodgkin lymphoma (NHL). Early MCL diagnosis and treatment is critical and puzzling due to inter/intra-tumoral heterogeneity and limited understanding of the underlying molecular mechanisms. We developed and applied a multifaceted analysis of selected publicly available transcriptomic data of well-defined MCL stages, integrating network-based methods for pathway enrichment analysis, co-expression module alignment, drug repurposing, and prediction of effective drug combinations. We demonstrate the "butterfly effect" emerg
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Using human gene chip expression profiling technology to screen out downstream genes related to TrkB regulation in laryngeal cancer cells.
METHODS: Using the Hep-2 TrkB shRNA cell line, divide it into an experimental group (shNTRK2) and a control group (PLKO1), and use the human gene expression microarray to screen out the differential genes. Then, select 10 upregulated genes and 10 downregulated genes from the differential genes, and use RT-PCR to verify whether the screening results of human gene expression microarray profiles are reliable. Use GO, KEGG, and miRNA enrichment analys
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Cancer Genome Atlas (TCGA) sequencing analysis of head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) recently reported on gene fusions, however, few human papillomavirus (HPV) positive samples were included, and the functional relevance of identified fusions was not explored. We therefore performed an independent analysis of gene fusions in HPV-positive oropharyngeal SCC (OPSCC). RNA sequencing was performed on 47 HPV-positive OPSCC primary tumors and 25 normal mucosal samples from cancer unaffected controls on an Illumina TruSeq platform. MapSplice2 was used for alignment and identification of
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The behavior and genetics of serous epithelial ovarian cancer (EOC) metastasis, the form of the disease lethal to patients, is poorly understood. The unique properties of metastases are critical to understand to improve treatments of the disease that remains in patients after debulking surgery. We sought to identify the genetic and phenotypic landscape of metastatic progression of EOC to understand how metastases compare to primary tumors. DNA copy number and mRNA expression differences between matched primary human tumors and omental metastases, collected at the same time during debulking sur
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The pathogenesis of nasopharyngeal carcinoma (NPC) is a complicated process involving genetic predisposition, Epstein-Bar Virus infection, and genetic alterations. Although some oncogenes and tumor suppressor genes have been previously reported in NPC, a complete understanding of the pathogenesis of NPC in the context of global gene expression, transcriptional pathways and biomarker assessment remains to be elucidated.
METHODS: Total RNA from 32 pathologically-confirmed cases of poorly-differentiated NPC was divided into pools inclusive of four consecutive specimens and each pool
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Serial analysis of gene expression (SAGE) was applied to compare expression profiles of normal thyroid tissue and papillary thyroid carcinoma (PTC). A SAGE tag corresponding to the partial cDNA for the small protein 31 (SMAP31) is upregulated approximately 13-fold in papillary thyroid cancer (PTC) and was selected for further research. BLAST-searching the human genome database reveals that the SMAP31 gene is located on chromosome 4q11-12 and contains 6 exons. Alternative splicing results in seven transcripts encoding 2 possible open reading frames (ORF) of 73 and 95 amino acids. Database searc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNA (miRNA) deregulation contributes to cancer pathogenesis. However, analysis of miRNAs in diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) has been hindered by a focus on cell lines, limited number of miRNAs examined, and lack of copy number data. To address these restrictions, we investigated genomewide miRNA expression and copy number data in 86 DLBCLs. Permutation analysis showed that 63 miRNAs were recurrently disrupted in DLBCL, including highly expressed oncomirs not previously linked to chromosomal abnormalities. Further, using training and validation tumor groups, we defined a collection o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An important component of tissues is the extracellular matrix (ECM), which not only forms a tissue scaffold, but also provides the environment for numerous biochemical reactions. Its composition is strictly regulated, and any irregularities can result in the development of many diseases, including cancer. Sarcoid is the most common skin cancer in equids. Its formation results from the presence of the genetic material of the bovine papillomavirus (BPV). In addition, it is assumed that sarcoid-dependent oncogenic transformation arises from a disturbed wound healing process, which may be due to t
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Occupational exposure to nickel compound, such as nickel refining, electroplating, and in conjunction with other metals, is harmful to the health, causing respiratory distress, and lung and nasal cancer. In this work, the different gene expression patterns of lung tissues from nickel-exposed rats and controls were investigated. The suppression subtractive hybridization (SSH) method was used to generate two subtracted cDNA libraries with gene transcripts differentially expressed after nickel inducing. Dot-blot hybridizations were used to confirm differential ratios of expression of obtained SSH
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: With advances in intracranial recording techniques, converting speech-related brain activity into commands for brain-computer interfaces (BCIs) is becoming increasingly feasible. In this study, we explored the utility of stereoencephalography (sEEG) for decoding covert and overt speech in humans. sEEG data were collected from 11 epilepsy patients undergoing presurgical monitoring, while they performed a set of speech tasks-overt speech, articulated speech, and imagined (inner) speech, as well as a handwriting task. Time- and frequency-domain analyses revealed that each speech condi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tricholoma terreum, a mushroom rich in bioactive compounds, exhibits notable antioxidant and anticancer properties. Despite its traditional use, its effects on breast cancer metabolism remain underexplored. Here, we conducted comprehensive phytochemical and volatile organic compound profiling of T. terreum extracts and evaluated their cytotoxicity against MCF-7 breast cancer cells. Using SPME-GC-MS and HPLC, we identified a complex chemical matrix dominated by organic acids (acetic acid, 43.85%) and nitrogen-containing heterocyclics (2-acetylpyridine, 15.19%), alongside significant phenolic ac
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Breast cancer (BC) is a complex genetic disorder and a major global health concern among women. The rising incidence of BC highlights the need for reliable molecular biomarkers to enable early diagnosis, monitor disease progression, and guide therapeutic interventions. MicroRNAs (miRNAs) have emerged as promising candidates due to their key regulatory roles in gene expression and their diagnostic and prognostic potential.
METHODS: In this study, serum miR-9-5p expression was evaluated in 100 BC patients and 100 healthy controls using quantitative real-time PCR (qPCR). Potential ta
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neuroblastoma (NB) is the most common extracranial solid tumor in children. Despite treatment advances, the survival rates of high-risk NB patients remain low. This highlights the urgent need for a deeper understanding of the molecular mechanisms driving NB progression to support the development of new therapeutic strategies. In this study, we demonstrated that the reduced levels of DNAJC12, a protein involved in metabolic regulation, are associated with poor prognosis in NB patients. Our data indicate that low DNAJC12 expression activates glycolysis in NB cells, leading to increased lactic ac
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bladder cancer is a common malignancy in the genitourinary system with its incidence rate among the world's highest. Neuralized E3 ubiquitin protein ligase 1 (NEURL1) belongs to the RING E3 ubiquitin ligase family, and its role in bladder cancer has not been reported yet. We aimed to explore the expression and roles of NEURL1 in bladder cancer. The NEURL1 expression was determined in clinical samples of bladder cancer. We stably overexpressed NEURL1 and NEURL1 with the RING domain deletion in human bladder cancer cell lines 5637 and RT-112 to investigate its functions. NEURL1 was confirmed to
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SF3B1 gene mutations are prevalent in myelodysplastic syndrome (MDS) and define a distinct disease subtype. These mutations are associated with dysregulated genes and pathways, offering potential for novel therapeutic approaches. However, the aberrant mRNA alternative splicing landscape in SF3B1-deficient MDS cells remains underexplored. In this study, we investigated the influence of SF3B1 gene alterations on the pre-mRNA splicing landscape in MDS cells using transcriptomic data from two independent MDS cohorts. we identified over 5000 significant differential alternative splicing events asso
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.