PURPOSE: Psittacosis is a zoonotic infectious disease caused by the transmission of the bacterium Chlamydia psittaci (C. psittaci) from birds to humans. Infections in humans mainly present as community-acquired pneumonia (CAP). However, most cases are treated without diagnostic testing, and the importance of Chlamydia psittaci infection as a cause of CAP is therefore unclear. Diagnostic tools, including culture, serologic test, and PCR-based methods, are available but prone to false negative results. Metagenomic next-generation sequencing (mNGS) has been increasingly used in the diagnosis of i
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enterotypes are used to describe clusters of specific gut microbial community structures, but few reports exist on the identification of enterotypes in poultry. In addition, there is incomplete understanding on the role of the foregut microbiota in the digestion and absorption of nutrients in poultry. Thus, this study aimed to identify the duodenal enterotypes by examining microbial communities from 206 broilers using 16S rRNA high-throughput sequencing and explore the effects of enterotypes on phenotypic performance and nutrient metabolism with metabolomics. The duodenal microbial communities
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: In the era of precision medicine, genomic characterization of blind patients is critical. Here, we evaluate the effects of comprehensive genetic analysis on the etiologic diagnosis of potentially hereditary vision loss and its impact on clinical management.
METHODS: We studied 100 non-syndromic and syndromic Spanish patients with a clinical diagnosis of blindness caused by alterations on the retina, choroid, vitreous and/or optic nerve. We used a next-generation sequencing (NGS) panel (OFTALMOgenics™), developed and validated within this study, including up to 362 genes previously as
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: To detect gene mutation sassociated with deafness in four Waardenburg syndrome (WS) type Ⅱ patients, and to explore the possible mechanism of molecular genetics. Methods: All patients with WS were identified at the genetic and prenatal diagnosis center of the First Affiliated Hospital of Zhengzhou University from August 2015 to December 2018.Clinical materials and peripheral blood were collected from patients and family members. The genes associated with deafness of the patients were tested by next generation sequencing(NGS). And suspected mutations were verified by Sanger sequencin
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: MYH9-related disease (MYH9-RD) is a rare autosomal dominant disorder caused by mutations in MYH9, which is responsible for encoding nonmuscle myosin heavy chains IIA (NMMHCIIA). MYH9-RD is clinically characterized by congenital macrothrombocytopenia, granulocyte inclusions variably associated with the risk of developing progressive sensorineural deafness, cataracts and nephropathy.
PATIENT CONCERNS: A 5-year-old boy had a history of a mild bleeding tendency and chronic thrombocytopenia, first identified at four months of age. No other family members were noted to have similar cl
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fresh-frozen tissue is the "gold standard" biospecimen type for next-generation sequencing (NGS). However, collecting frozen tissue is usually not feasible because clinical workflows deliver formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tissue blocks. Some clinicians and researchers are reticent to embrace the use of FFPE tissue for NGS because FFPE tissue can yield low quantities of degraded DNA, containing formalin-induced mutations. We describe the process by which formalin-induced deamination can lead to artifactual cytosine (C) to thymine (T) and guanine (G) to adenine (A) (C:G > T:A) mutation
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microbial community profiles have been associated with a variety of traits, including methane emissions in livestock. These profiles can be difficult and expensive to obtain for thousands of samples (e.g. for accurate association of microbial profiles with traits), therefore the objective of this work was to develop a low-cost, high-throughput approach to capture the diversity of the rumen microbiome. Restriction enzyme reduced representation sequencing (RE-RRS) using ApeKI or PstI, and two bioinformatic pipelines (reference-based and reference-free) were compared to bacterial 16S rRNA gene se
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ability of antibodies to recognize their target antigens with high specificity is fundamental to their natural function. Nevertheless, therapeutic antibodies display variable and difficult-to-predict levels of nonspecific and self-interactions that can lead to various drug development challenges, including antibody aggregation, abnormally high viscosity, and rapid antibody clearance. Here we report a method for predicting the overall specificity of antibodies in terms of their relative risk for displaying high levels of nonspecific or self-interactions at physiological conditions. We find
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ataxia is a common clinical feature in inherited metabolic disorders. There are more than 150 inherited metabolic disorders in patients presenting with ataxia in addition to global developmental delay, encephalopathy episodes, a history of developmental regression, coarse facial features, seizures, and other types of movement disorders. Seizures and a history of developmental regression especially are important clinical denominators to consider an underlying inherited metabolic disorder in a patient with ataxia. Some of the inherited metabolic disorders have disease specific treatments to impr
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rare genetic variants that disrupt speech development provide entry points for deciphering the neurobiological foundations of key human capacities. The value of this approach is illustrated by FOXP2, a transcription factor gene that was implicated in speech apraxia, and subsequently investigated using human cell-based systems and animal models. Advances in next-generation sequencing, coupled to de novo paradigms, facilitated discovery of etiological variants in additional genes in speech disorder cohorts. As for other neurodevelopmental syndromes, gene-driven studies show blurring of boundarie
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nager syndrome is a rare genetic syndrome characterized by craniofacial and preaxial limb anomalies. Haploinsufficiency of the SF3B4 gene has been identified as a significant reason for Nager syndrome. Treacher Collins syndrome (TCS) has similar facial features; however, the TCOF1, POLR1D, and POLR1C genes have been reported as the critical disease-causing genes. Similar phenotypes make it easy to misdiagnose.
CASE REPORT: In this report, we have presented a case of one newborn with acrofacial dysostosis, who was first diagnosed with TCS. Expanded next-generation sequencing eventu
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kyphoscoliotic Ehlers-Danlos syndrome (kEDS) is an autosomal recessive connective tissue disorder characterized by muscular hypotonia, hyperextensible skin, skin fragility, joint hypermobility, and progressive kyphoscoliosis. The disorder results from a deficiency of the enzyme collagen lysyl hydroxylase 1 due to mutations in the gene PLOD1. We describe the rare cases of kEDS in Korean siblings with two novel compound heterozygous variants, c.926_934del (p.Leu309_Leu311del) and c.2170_2172del (p.Phe724del) in the PLOD1 gene. They had congenital hypotonia, joint laxity, skin hyperextensibility,
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In South Africa, canid rabies virus (RABV) infection is maintained in domestic and wildlife species. The identification of rabies in African civets raised the question of whether this wildlife carnivore is a potential reservoir host of RABVs of direct and ancestral dog origin (dog-maintained and dog-derived origins) with an independent cycle of transmission. Genetic analyses of African civet nucleoprotein sequences for 23 African civet RABVs and historically published sequences demonstrated that RABVs from African civets have two origins related to dog and mongoose rabies enzootics. The data s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE OF REVIEW: Inherited myopathies, and in particular mitochondrial myopathies, are heterogeneous disorders, and ocular manifestations may be the presenting feature or offer important diagnostic clues. The ophthalmologist may be key to diagnosis, facilitating recognition of associated potentially life-threatening organ manifestations and an integral part of multidisciplinary care. This review, focusing especially on mitochondrial myopathies, provides updates on clinical features, diagnosis and recent therapeutic developments.
RECENT FINDINGS: Ptosis and/or ophthalmoplegia is present in o
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This article reports the clinical features and C12orf65 gene mutations of a girl with autosomal recessive spastic paraplegia-55. The 8-year-old girl experienced disease onset at the age of 5 years and had optic atrophy as the main clinical manifestation, with slow movements in standing up and a slight duck-shaped gait. Peripheral blood DNA samples were collected from this child and her parents and brother to perform high-throughput whole-exome sequencing and high-throughput mitochondrial genome sequencing. Sanger sequencing was performed for verification. The results showed two compound hetero
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RESEARCH QUESTION: Can next-generation sequencing (NGS) based on copy number variation sequencing (CNV-Seq) identify normal/balanced embryos in balanced reciprocal translocation carriers and what are their reproductive outcomes?
DESIGN: One hundred couples with balanced reciprocal translocation who underwent a total of 134 preimplantation genetic testing (PGT) cycles between January 2015 and October 2017 were evaluated. Trophectoderm cells of blastocysts were biopsied for CNV-Seq-based NGS. All the balanced/normal blastocysts were vitrified and cryopreserved. Single balanced/normal blastocyst
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Atrial septal defect is a persistent interatrial communication. It is the second most common congenital heart defect and is detected in 1:1500 live births. Clinical course is variable and depends on the size of the malformation. Clinical diagnosis is based on patient history, physical and instrumental examination. Atrial septal defect is frequently sporadic, but familial cases have been reported. The disease has autosomal dominant inheritance with reduced penetrance, variable expressivity and genetic heterogeneity. Supravalvular aortic stenosis is a congenital narrowing of the lumen of the asc
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To screen the key circulating microRNAs (miRNAs) involved in missed abortion (MA) and explore their role in MA process. We examined the miRNA profile from the serum of three MA patients and three early pregnancy induced abortion patients (controls) by next-generation sequencing. We analyzed the target genes of the differentially expressed (DE) miRNAs to analyze the function and pathway enrichment using Gene Ontology and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, respectively. We validated five candidate miRNAs by real time-qPCR. Integrated miRNA-mRNA-pathway network analysis was performed to sho
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genomic landscape in human B-cell lymphoma has revealed several somatic mutations and potentially relevant germline alterations affecting therapy and prognosis. Also, mutations originally described as somatic aberrations have been shown to confer cancer predisposition when occurring in the germline. The relevance of mutations in canine B-cell lymphoma is scarcely known and gene expression profiling has shown similar molecular signatures among different B-cell histotypes, suggesting other biological mechanisms underlining differences. Here, we present a highly accurate approach to identify
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.