BACKGROUND: Parkinson's disease (PD) is a rapidly growing global health concern, with aging populations driving increasing prevalence. While neuronal degeneration is a hallmark, emerging evidence implicates chronic neuroinflammation as a key contributor to disease progression. Despite its recognized importance, the cellular sources, functional heterogeneity, and actionable mechanisms of inflammation in the human substantia nigra remain poorly understood, limiting the development of precise diagnostic biomarkers and therapeutic interventions.
METHODS: We integrated single-nucleus RNA sequencin
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Pleural mesothelioma (PM) is an aggressive thoracic cancer related to historical exposure to asbestos fibres. Symptoms often appear at an advanced stage, leading to delayed diagnosis and dismal prognosis. Early diagnosis is thus crucial in improving patient outcome. Current biomarker research for early detection focuses on different -omics research fields (genomics, proteomics, transcriptomics, metabolomics and volatomics), however with no clinically useful result. Moreover, currently no screening program is advocated for asymptomatic individuals with an established asbestos exposu
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gammaherpesviruses (GHVs) represent a global clinical burden as the causative agents of Kaposi's sarcoma and mononucleosis, among other diseases. Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus (KSHV) and Epstein-Barr virus (EBV) are the most studied human GHVs, and murine gammaherpesvirus 68 (MHV-68) is a recognized experimental model. GHVs are defined by their modulation of the host cell to establish lifelong latent infections and increase host dysregulation during periodic reactivation. Due to their ubiquitous changes in host cells, systems-level techniques are well-suited to study GHV infections a
СтатьяОбзорПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The COVID-19 pandemic has led to an unprecedented increase in the volume of biological data generation, demonstrating the importance of developing an integrative and intelligent analytical framework. In the last few years, advancements in the artificial intelligence (AI) approaches have completely transformed the biological research landscape. Researchers have integrated the AI approaches with the multi-omics data generated from the COVID-19 patients to have a systems-level understanding of underlying disease mechanisms, predicting new variants and their spread rate, disease severity, immune r
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The use of Artificial Intelligence (AI), especially Machine learning (ML) and Deep learning (DL), has led to a major shift in medical diagnosis. AI can assist medical professionals in medical diagnosis by its unique ability to analyze complex data from multiple sources, including medical images, gene sequences, and Electronic Health Records (EHRs).
AREAS COVERED: Its application in other clinical processes, such as risk classification, diagnostic workflows, and disease risk prediction from patient symptoms, can also speed up diagnosis, reduce costs, and improve diagnostic outcom
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mounting evidence indicates that the rumen microbiota plays a crucial role in the reproductive health of sheep. However, the potential beneficial effects of rumen microbiota on lambing performance in sheep across different stages of the reproductive cycle and the precise mechanisms underlying these effects remain unclear. We aimed to elucidate the rumen microbial regulatory network underlying differences in reproductive performance in sheep by integrating multi-stage metagenomics and metabolomics.
RESULTS: No significant difference was observed in the ruminal microbial α-diversity
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bidirectional signalling between the oocyte and surrounding cumulus cells is essential for coordinating follicular development and acquiring oocyte competence. The metabolic networks governing bovine cumulus cell function, however, remain poorly characterized. To address this gap, we performed integrated metabolomic and proteomic analyses of cumulus cells isolated from cumulus-oocyte complexes at two critical maturation stages: (1) meiotically arrested germinal vesicle stage (0 h) and (2) metaphase II stage (24 h). This temporal profiling reveals dynamic metabolic reprogramming events supporti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer (BC) is a highly heterogeneous malignancy and remains a major cause of cancer-related mortality among women worldwide. Advances in multi-omics profiling spanning genomics, transcriptomics, epigenomics, proteomics, and metabolomics have enabled finer subtype stratification and more comprehensive characterisation of tumour biology, thereby accelerating the discovery of diagnostic and prognostic biomarkers and actionable therapeutic targets. Nonetheless, translating multi-layer molecular signals into clinically robust decision support remains challenging because of the high dimensio
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The World’s major abiotic stress is salinity stress, which affects over 833 million hectares of agricultural lands and risks food security by reducing crop yields and interfering with plant physiological systems. It has been predicted that salinity stress will affect about 50% of crops by 2050. Through a variety of molecular mechanisms, PGPR (plant growth-promoting rhizobacteria) have evolved as bioinoculants that enhance plant tolerance to salinity stress. Bacterial molecular mechanisms include the biosynthesis of suitable key osmolytes, ion transporters, modulation of hormones via ACC deamin
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Atrial fibrillation (AF) is a common cardiac arrhythmia that contributes significantly to morbidity and mortality, with associated risks such as stroke and heart failure. This study aimed to identify novel biomarkers for AF progression using a multi-omics approach, combining proteomics and metabolomics, to gain a deeper understanding of AF pathophysiology and uncover potential diagnostic and therapeutic targets.
METHODS: We enrolled 39 participants, including 23 AF patients and 16 SR controls, and subjected their serum samples to tandem mass spectrometry-based proteomics and untar
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sichuan paocai is a traditional Chinese fermented vegetable whose characteristic aroma is strongly influenced by volatile sulfur-containing compounds (VSCs). Among them, 3-(methylthio)-1-propanol and 2-(methylthio)ethanol are key odor-active components, yet their biosynthetic mechanisms and microbial drivers in paocai remain poorly understood. In this study, an integrated metatranscriptomic, metaproteomic, and metabolomic approach was employed to systematically elucidate the formation pathways of these two methylthio alcohols during industrial radish paocai fermentation. Dynamic changes in mic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The etiology and pathogenesis of idiopathic oligoasthenospermia (IOA) remain unclear, and current treatment options yield suboptimal outcomes. Consequently, there is an urgent need to identify novel biomarkers and develop diagnostic tools to improve patient identification and clinical management. Multi-omics technologies offer a promising pathway toward achieving this goal in the future.
METHODS: This study included 40 untreated patients with idiopathic oligoasthenospermia (IOA) and 30 healthy fertile males (HP) as controls. Semen samples were analyzed using 16S rRNA gene sequenci
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Identifying transcriptional regulators that control important biological pathways in plants is fundamental to understanding regulatory mechanisms, network hierarchy, and phenotypic variation. This remains challenging because transcription factors (TFs) and their targets operate within highly interconnected, dynamic, and often redundant regulatory networks. Over the past two decades, advances in omics technologies, sequencing data generation, and computational tools have shifted gene discovery from single-gene studies to network-level investigation. At the same time, these advances have created
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Alzheimer's disease (AD) is a progressive neurodegenerative disorder characterized by widespread gray matter volume (GMV) reductions. Emerging evidence links glucose and lipid metabolic dysregulation to AD pathophysiology. However, the extent to which AD-related GMV alterations and metabolic traits share a common genetic basis remains poorly understood.
OBJECTIVES: To explore the shared genetic architecture between GMV alterations in AD and metabolites related to glucose and lipid metabolism, aiming to provide biological insights into the prevention and treatment of AD.
DESIGN: T
СтатьяМетаанализПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study explored the effects of dietary riboflavin supplementation on breast meat quality, muscle fiber characteristics, metabonomics, transcriptomics, and phosphoproteomics of Pekin ducks. A total of 96 14-day-old ducks were randomly allotted to two treatment groups, each with 8 replicates of 6 birds, and were fed diets supplemented with 0 or 10 mg/kg riboflavin for 28 days. Compared to the control group without riboflavin supplementation, dietary riboflavin supplementation significantly increased breast muscle shear force, myofiber diameter, perimeter, and cross-sectional area, as well as
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute-on-chronic liver failure (ACLF) is characterized by profound metabolic dysfunction and high mortality. Identifying amino acid metabolism-related biomarkers is crucial for early diagnosis and therapeutic intervention. Amino acid metabolism-related genes (AAMGs) and ACLF transcriptomic data were integrated to identify core genes via weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) and differential expression analysis. Three machine learning (ML) algorithms-Random Forest, SVM-RFE, and Boruta-were applied to screen hub genes. Specific cellular profiles and immune landscapes were characte
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Elderly sepsis (ES), characterized by dual insults of aging and sepsis, is associated with substantial morbidity and mortality and exhibits distinct pathophysiological features. Elucidating these unique mechanisms is critical for developing precise therapeutic strategies and improving patient prognoses.
METHODS: We performed integrative analyses of untargeted metabolomics and proteomics in four groups: young and elderly healthy controls and young and elderly patients with sepsis. Characteristic metabolites and proteins in ES were identified by using a three-step screening pipeline
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study adopted a comprehensive multi-omics approach integrating blood microRNA (miRNA) transcriptomic profiles, resting-state functional magnetic resonance imaging (rs-fMRI) neuroimaging data, and clinical symptomatology to elucidate the molecular and biological underpinnings of schizophrenia. miRNA sequencing was performed on peripheral blood samples collected from 43 patients with schizophrenia and 60 age- and sex-matched healthy controls. A total of 65 differentially expressed miRNAs (DEMs) were detected, among which the vast majority (n = 47, |FC| > 1.5, P < 0.05) exhibited significant
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinal cord injury (SCI) is a major global health issue with severe complications, yet effective biomarkers remain elusive. We analyzed the GSE226238 dataset from the Gene Expression Omnibus (GEO) database and identified 4621 differentially expressed genes (DEGs) between SCI and controls, comprising 2684 upregulated and 1577 downregulated genes. Functional enrichment analyses revealed these DEGs are predominantly involved in protein degradation pathways, immune-related processes and ubiquitin-mediated proteolysis. Immune infiltration analysis using multiple algorithms showed significant altera
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thallium (Tl) is an extremely toxic and strongly bioaccumulative metal increasingly detected in agricultural soils, yet its behavior at the plant-rhizosphere interface remains poorly constrained. Here, we integrated in situ diffusive gradients in thin films (DGT) with multi-omics analyses (transcriptomics, metabolomics, and 16S rRNA sequencing) to elucidate how plant-rhizosphere interactions regulate Tl mobility and detoxification in Brassica rapa. In situ DGT profiling coupled with the European Community Bureau of Reference (BCR) sequential extraction identified the root-soil interface (0-3 c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.