BACKGROUND: Several studies indicate that immunohistochemical detection of the c-myc oncogene might serve as an additional prognostic marker in malignant melanoma.
OBJECTIVE: To study c-myc expression in paraffin-embedded cutaneous melanoma and to correlate to metastatic potential and onset of metastases.
METHODS: Cytoplasmic c-myc protein expression was visualized using the APAPP method, and reactivity (percent total tumor cells stained) was assessed in 62 formalin-fixed paraffin-embedded primary cutaneous melanomas (21 not metastasizing, mean Breslow 3.0 +/- 2.9 mm, 41 metastasizing, mean …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Different methods have been described for the preservation of biopsy or resection samples. In routine pathology, the cheapest and most used method is fixation of samples in formalin and embedding in paraffin (FFPE samples). This method preserves tissue samples for a very long time and is suitable for several specialized techniques, such as fluorescence in situ hybridization (FISH) and immunohistochemistry, the latter being the most frequent and often the only additional method used for the establishment of the final diagnosis. However, in light of the growing need for next-generation sequencin…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accurate pathological assessment of tissue samples is key to diagnosis and optimal treatment decisions. Traditional pathology techniques suf … y tissue differences. For MS data to be useful, molecular information collected from formalin-fixed paraffin-embedded-biopsy tissues needs to be consistent and quantitatively accurate and contain sufficient clinically relevant molecular information. Therefore, we developed an MS-based workflow and assessed the analytical repeatability on 36 kidney biopsies …
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyloidosis comprises a heterogeneous group of disorders marked by the extracellular deposition of insoluble protein fibrils, known as amylo … ctrometry (FAIMS). With the integration of these methods, we present the analysis of formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue sections. This comprehensive workflow enables precise excision of amyloid-rich regions and enhances detection of amyloid proteins and co-deposited biomarkers from minimal tissue input. The combination of FAIMS with DIA and DDA …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT.—: Immunohistochemistry-based assessment of human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) is increasingly useful for clinical decision-making in breast, gastroesophageal, and other cancers. Retroactive use of cancer tissue for research purposes is increasing alongside increased understanding of HER2's role in determining cancer outcomes. Best practices for formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tissue handling are addressed in guidelines for diagnostic and scientific activities; however, preanalytic variables arising after tissue embedding and sectioning are minimally discussed.
O…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Filter-aided expansion proteomics (FAXP) is a spatial proteomics approach designed for high-resolution analysis of formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tissues. Here we describe the integration of hydrogel-based tissue expansion with mass spectrometry, enabling isotropic expansion and robust protein retention while preserving spatial features. The FAXP workflow consists of several sequential steps, including tissue section dewaxing, in situ protein anchoring, hydrogel embedding, homogenization, staining, isotropic expansion, microdissection and filter-aided in-gel digestion to maximize pep…
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Differences in prognostic outcomes are prevalent in patients with colorectal cancer liver metastases. Comparative analysis of tissue samples, particularly applying single-cell transcriptome sequencing technology, can provide a deeper understanding of potential impacting factors. However, long-term monitoring for prognosis determination necessitates extended preservation of tissue samples using formalin-fixed and paraffin-embedded (FFPE) treatments, which can cause substantial RNA degradation, presenting challenges to single-cell or single-nucleus sequencing. In this study, employing snRandom-s…
СтатьяDatasetПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: OncoMasTR is a recently developed multigene prognostic test for early-stage breast cancer. The test has been developed in a kit-based format for decentralized deployment in molecular pathology laboratories. The analytical performance characteristics of the OncoMasTR test are described in this study.
METHODS: Expression levels of 6 genes were measured by 1-step reverse transcription-quantitative PCR on RNA samples prepared from formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) breast tumor specimens. Assay precision, reproducibility, input range, and interference were determined using FFPE-…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Eczema (atopic dermatitis; AD) is a very common itchy skin condition affecting 1 in 5 children and up to 1 in 10 adults worldwid … lycerol cream; UGC), with those of a glycerol-containing moisturizer (glycerol cream; GC), a simple paraffin cream (PC) with no humectant, and a no-treatment control (NTC).
METHODS: This was an observer-blinded prospective Phase 2 within-subject multilateral single-centre randomized controlled trial in adults with AD (Clinical Trials #NCT03901144). The in …
Клиническое исследование II фазыСтатьяРандомизированное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cytology specimens are often used for biomarker testing in the setting of neoplasia. On occasion, formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) cell blocks unfortunately may not yield sufficient material for testing. Recent studies have suggested that residual supernatant fluid from cell block preparation is a valuable source of DNA: both cellular and cell-free DNA (cfDNA). In the present study, the use of cfDNA from supernatant is compared against DNA from FFPE materials.
METHODS: cfDNA was extracted prospectively from residual supernatants of 30 cytology samples (29 neoplastic cases a…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Modern histopathology is built on the cornerstone principle of tissue fixation, however there are currently no analytical methods of detecting fixation and as a result, in clinical practice fixation is highly variable and a persistent source of error. We have previously shown that immersion in cold formalin followed by heated formalin is beneficial for preservation of histomorphology and have combined two-temperature fixation with ultra-sensitive acoustic monitoring technology that can actively detect formalin diffusing into a tissue. Here we expand on our previous work by developing a predict
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Renal amyloidosis typically manifests albuminuria, nephrotic-range proteinuria, and ultimately progresses to end-stage renal failure if diag … that optimized the proteomics pre-processing procedures for trace renal amyloidosis formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue samples, combined with statistical and bioinformatics analysis to screen out the amyloidosis-related proteins to accurately type or subtype renal amyloidosis in order to achieve individual treatment. A sensitive, specific and …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: HER2/neu testing in breast cancer is a mandate due to availability of trastuzumab, a monoclonal antibody targeted against this biomarker. Dual-color dual-hapten in situ hybridization (D-DISH) is a new test for assessment of HER2/neu gene overexpression on light microscopy.
AIMS: This was a validation study for D-DISH in our laboratory and was conducted to study the concordance between fluorescence in situ hybridization (FISH) and D-DISH for HER2/neu testing in breast cancer.
MATERIALS AND METHODS: In all, 150 cases of invasive breast carcinoma requested for FISH analysis were select
Сравнительное исследованиеСтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Positive immunohistochemistry (IHC) controls are intended to detect problems in both immunostaining and heat-induced epitope retrieval (HIER). However, it is not known what features in a control are important for verifying HIER. Contrary to expectation, the fact that a tissue is formalin-fixed does not necessarily render it suitable in verifying proper HIER. Some tissue controls, for some immunostains, strongly stain even without HIER. Consequently, the control may verify the immunostain but provide little or no information regarding the HIER step. To sort this out, we used formalin-fixed pept
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of this study is to investigate the effects of formalin fixation on the degradation of DNA molecules in five different healthy tissues exempted during the autopsy, as well as the selection of the method that is most suitable for the DNA isolation. Heart muscle, liver, brain, lung and kidney tissue obtained from the healthy people who suddenly died from a violent death were used. The parts of tissue were fixed in 10% phosphate-buffered formalin as well as in 4% unbuffered formalin at room temperature. Morphology of tissue was studied using H&E staining. The DNA was isolated 6 h, 1-7 day
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Proper examination and accurate reporting of radical prostatectomy specimens (RPS) is essential in determining post-surgical treatment and predicting patient outcome. Surveys have demonstrated the absence of consensus on handling of RPS. The aim of this study was to determine whether significant information is lost when only half the horizontal tissue sections are examined.
METHODS AND RESULTS: During a 1-year period, 238 RPS were sectioned into horizontal slices. Apex and basis was cut sagittally, and remaining slices were embedded in quadrants. Glass slides from every second horizonta
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To investigate the expression of laminin receptor 1 (LR1), a non-integrin-type laminin receptor, in gestational trophoblastic diseases and normal first-trimester placenta, since it may play a role in controlling trophoblast invasion in normal and molar pregnancies.
METHODS: Paraffin sections from 24 gestational age controlled normal first-trimester placentas, 47 partial moles, 56 complete moles, 3 invasive moles, 4 gestational choriocarcinomas, and 1 placental-site trophoblastic tumor were studied immunohistochemically for expression of LR1.
RESULTS: In complete and partial moles…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A case of solitary microcarcinoid and chronic ulcerative colitis of the rectal stump is described. The association of intestinal carcinoid with ulcerative colitis has been reported previously in 26 patients. Pathogenic pathways are discussed according to the presence of multifocal carcinoid and/or gut endocrine cell hyperplasia.
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования