The anaplastic large cell, CD30 positive lymphomas represent a heterogeneous group of lymphomas in which immunocytochemical and molecular investigations have demonstrated the existence of malignancies of T, B or undetermined origin. The recent identification, in a few cases of this group of a chromosomal 5q35 breakpoint may allow the individualization of a peculiar disease entity. In these cases, the 5q35bp has been found to be a permanent abnormality, present in five human permanent cell lines and associated with various translocations including t(2;5), t(1;5) and t(5;6). A primitive myelo-mo
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Among 52 patients diagnosed as acute myeloid leukemia (AML), nine cases were found in which interleukin-5 (IL-5) induced a proliferative response in the leukemic cells, as measured by the stimulation of DNA synthesis or colony formation in vitro. All cases (n = 7) with the cytogenetic abnormality t(8;21)(q22;q22) belonged to this group of IL-5 responders. Of the additional two cases, one had an apparently normal karyotype, but the other expressed a dicentric chromosome 21, an abnormality also involving the breakpoint region 21q22. The leukemic cells of the IL-5 responsive patients could also b
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Kinase gene fusions are strong driver mutations in neoplasia; however, kinase intergenic-breakpoint rearrangements (IGRs) confound the detection of such fusions and of targeted treatments. We aim to provide an overview of kinase IGRs in a large lung cancer cohort and examine real-world survival outcomes of patients with such fusions.
METHODS: Mutational profiles analyzed using targeted next-generation sequencing of 425 cancer-related genes between June 2016 and July 2019 were retrospectively reviewed. Patients' demographic data, clinical characteristics, and survivals were analyze
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The PRDM16 (1p36) gene is rearranged in acute myeloid leukaemia (AML) and myelodysplastic syndrome (MDS) with t(1;3)(p36;q21), sharing characteristics with AML and MDS with MECOM (3q26.2) translocations. We used fluorescence in situ hybridization to study 39 haematological malignancies with translocations involving PRDM16 to assess the precise breakpoint on 1p36 and the identity of the partner locus. Reverse-transcription polymerase chain reaction (PCR) was performed in selected cases in order to confirm the partner locus. PRDM16 expression studies were performed on bone marrow samples of pati
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Low-grade follicular lymphoma (FL) (grade 1/2, FL1/2) has an annual risk of transformation of ≈3%, which is associated with aberrations in CDKN2A/B, TP53, and MYC. As in diffuse large B-cell lymphoma, high MYC expression in transformed FL (tFL) might predict a MYC breakpoint.
METHODS AND RESULTS: We quantified MYC expression by immunohistochemistry and digital analysis in 41 paired biopsies from 20 patients with FL1/2 with subsequent transformation and in four isolated biopsies of tFL. As controls, 28 biopsies of FL1/2 without transformation (median follow-up of 105 months) and nine bio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Germline mutations in DNA mismatch repair (MMR) genes, such as MSH2, cause Lynch syndrome, an autosomal dominant predisposition to colorectal as well as other cancers. Our research clinic focuses on hereditary colorectal cancer, and over the past 9 years we have identified germline mutations in DNA MMR genes in 101 patients using commercial genetic reference laboratories. We also collected samples from twelve patients with absent MSH2 protein expression and microsatellite instability in tumor tissue, with a family history suggestive of Lynch syndrome, but negative germline test results. The mo
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Helicobacter pylori (H. pylori) cytotoxin-associated gene A protein (CagA) is the first bacterial oncoprotein identified in human gastric cancer. The carboxy terminus (C-terminus) of CagA may undergo polymorphisms to give different types of EPIYA motifs, which may exist in single or combination form within the infected host. Sequence variations in the 3' region of the cagA impose a functional impact to the translated CagA protein. In this study, we characterize the diversity of the H. pylori CagA EPIYA types, their associations with their hosts' clinical status, and the potential of using the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cefiderocol (FDC) is a new siderophore-conjugated cephalosporin that enters the periplasm via iron transport systems. However, the specific contribution of individual iron uptake pathways to FDC activity remains unclear. We investigated the role of 13 iron acquisition systems using several Escherichia coli strain collections. FDC MICs were determined in iron-depleted and iron-supplemented media for E. coli mutants (Keio and pathogenic island [PAI]-deleted collections) and for no-acquired β-lactamase or TEM (NoBL/TEM-Ec) and NDM-producing E. coli (NDM-Ec) clinical isolates. Prevalence of iron u
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Chromosome 4q12 rearrangements are recurrent in hematologic malignancies, most frequently involving PDGFRA. Fluorescence in situ hybridization (FISH) is routinely used for detecting 4q12 rearrangements. This study aimed to clarify 4q12 rearrangements misdiagnosed by FISH and explore the transcriptomic profile of acute myeloid leukemia (AML) with CHIC2 rearrangements.
METHODS: Fluorescence in situ hybridization with a PDGFRA/CHIC2/FIP1L1 probe set detected 4q12 rearrangements. RNA sequencing (RNA-seq) characterized fusion transcripts and compared transcriptomic profiles between CHI
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The complex 2 Mb survival motor neuron (SMN) locus on chromosome 5q13, including the spinal muscular atrophy (SMA)-causing gene SMN1 and modifier SMN2, remains incompletely resolved due to numerous segmental duplications. Variation in SMN2 copy number, presumably influenced by SMN1 to SMN2 gene conversion, affects disease severity, though SMN2 copy number alone has insufficient prognostic value due to limited genotype-phenotype correlations. With advancements in newborn screening and SMN-targeted therapies, identifying genetic markers to predict disease progression and treatment re
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius (MRSP) lineages harbouring staphylococcal cassette chromosome (SCC) mec types IV, V and ΨSCCmec57395 usually display low oxacillin MICs (0.5-2 mg/L).
OBJECTIVES: To evaluate how oxacillin MICs correlate with PBP mutations and susceptibility to β-lactams approved for veterinary use.
METHODS: Associations between MICs and PBP mutations were investigated by broth microdilution, time-kill and genome sequence analyses in 117 canine MRSP strains harbouring these SCCmec types. Clinical outcome was retrospectively evaluated in 11 MRSP
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The pleomorphic adenoma (PA), which is the most common salivary gland neoplasm, is a benign tumor characterized by recurrent chromosome rearrangements involving 8q12 and 12q14-15. We have previously shown that the PLAG1 and HMGA2 oncogenes are the targets of these rearrangements. Here, we have identified previously unrecognized subsets of PAs with ins(9;8)/t(8;9) (n = 5) and ins(9;12)/t(9;12) (n = 8) and breakpoints located in the vicinity of the PLAG1 and HMGA2 loci. RNA-sequencing and reverse transcriptase (RT)-PCR analyses of a case with an ins(9;8) revealed a novel NFIB-PLAG1 fusion in whi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phelan-McDermid syndrome (22q13.3 deletion syndrome) is a contiguous gene disorder resulting from the deletion of the distal long arm of chromosome 22. SHANK3, a gene within the minimal critical region, is a candidate gene for the major neurological features of this syndrome. We report clinical and molecular data from a study of nine patients with overlapping interstitial deletions in 22q13 not involving SHANK3. All of these deletions overlap with the largest, but not with the smallest deletion associated with Phelan-McDermid syndrome. The deletion sizes and breakpoints varied considerably amo
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To present the perinatal findings and molecular cytogenetic characterization of prenatally detected mosaic r(21).
MATERIALS, METHODS, AND RESULTS: A 29-year-old primigravid woman underwent amniocentesis at 22 weeks' gestation because of hyperechogenic cardiac foci and intrauterine growth restriction. Amniocentesis revealed a karyotype of 46,XY,r(21)[15]/45,XY,-21[5]. The parental karyotypes were normal. The woman requested repeat amniocentesis. Oligonucleotide-based array comparative genomic hybridization was applied to the uncultured amniocytes, rapidly detecting a 2.09-Mb deletio
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cytologic and cytogenetic results obtained from patients fulfilling the FAB criteria for the diagnosis of acute nonlymphocytic leukemia (ANLL) of megakaryocytic lineage (ANLL-M7) are reported. Eleven cases were de novo ANLL-M7, of whom three presented with acute myelofibrosis. Four cases were megakaryoblastic transformations of chronic myelogenous leukemia (two cases), refractory anemia with excess of blasts (one case), and polycythemia vera (one case). Four patients showed a minority of granular blasts, with occasional Auer rods in one. Positive myeloperoxidase and/or sudan black-B stainings
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: X-linked acrogigantism (X-LAG; MIM: 300942) is a severe form of pituitary gigantism caused by chromosome Xq26.3 duplications involving GPR101. X-LAG-associated duplications disrupt the integrity of the topologically associating domain (TAD) containing GPR101 and lead to the formation of a neo-TAD that drives pituitary GPR101 misexpression and gigantism. As X-LAG is fully penetrant and heritable, duplications involving GPR101 identified on prenatal screening studies, like amniocentesis, can pose an interpretation challenge for medical geneticists and raise important concerns for pat
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: Pseudohypoparathyroidism type Ia (PHP1A) is a rare endocrine disorder characterized by hypocalcemia, hyperphosphatemia, multiple hormonal resistance, and features of Albright hereditary osteodystrophy. When the phenotype is present but not associated with hormonal resistance, it is called psedopseudohypoparathyroidism (PPHP). Both entities have been associated to GNAS haploinsufficiency, and are mostly caused by inherited inactivating mutations at GNAS gene that codes for the stimulatory alpha subunit of G protein, although the cause remains unidentified in approximately 30% of patien
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Previous studies have shown a high prevalence of syndromes in children with cancer. We described four patterns of co-occurring morphological abnormalities indicating new tumour predisposition syndromes. These patterns were named after their key-abnormalities: blepharophimosis (BP), epicanthal folds (EF), asymmetric lower limbs (LLA) and Sydney creases (SC) pattern. The purpose of our study was to identify structural genomic variants possibly involved in these tumour predisposition syndromes.
PATIENTS AND METHODS: In 49 probands (13 from BP, nine from EF, 20 from LLA and seven from
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High-resolution microarray technology has facilitated the detection of submicroscopic chromosome aberrations and characterization of new microdeletion syndromes. We present clinical and molecular data of five patients with previously undescribed overlapping interstitial deletions involving 8q22.2q22.3. All deletions differ in size and breakpoints. Patients 1-4 carry deletions between 5.25 and 6.44 Mb in size, resulting in a minimal deletion overlap of 3.87 Mb (from 100.69 to 104.56 Mb; hg18) comprising at least 25 genes. These patients share similar facial dysmorphisms with blepharophimosis, t
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To determine the consequences and significance of an acquired 46XX,t(2;13;2;21)(p13;q12;q33;q11.2) in atypical chronic myeloid leukemia (aCML).
METHODS: Translocation breakpoints were identified by fluorescence in situ hybridization and a novel fusion gene identified by rapid amplification of cDNA ends polymerase chain reaction. Functional analysis of the fusion was performed using the Ba/F3 transformation assay and specific inhibition demonstrated using small molecule inhibitors.
RESULTS: Fluorescence in situ hybridization indicated that FLT3 at 13q12 was disrupted and 5'-rapid
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования