Root system architecture (RSA) plays a pivotal role in nutrient acquisition, water uptake, lodging resistance, and environmental adaptation in maize (Zea mays L.). However, the genetic basis of RSA at the mature stage under field conditions remains poorly characterized, primarily owing to the challenges of high-throughput phenotyping. In this study, RSA-related traits were evaluated in a diverse maize association panel across four field environments using Shovelomics combined with manual measurements. Genome-wide association analysis (GWAS) was performed using the BLINK and 3VmrMLM models, ide
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fritillaria taipaiensis: a medicinal plant of the Liliaceae family endemic to the Qinling Mountains and southern regions of China, is renown … genomic resources for future studies in conservation biology, population genetics, and comparative genomics within the Fritillaria genus.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Andes virus (ANDV) is the only hantavirus known to transmit between humans and causes hantavirus cardiopulmonary syndrome in Chile and Argentina. In Chile, ANDV genomic diversity remains incompletely characterised. This study aimed to characterise the genetic diversity, geographical structure, and molecular signatures of ANDV using human clinical samples collected over a 13-year period (2011-24).
METHODS: We conducted a retrospective genomic epidemiology study of ANDV infections in Chile. Clinical samples from patients with confirmed ANDV, collected between March 9, 2011, and June
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bisphenol A (BPA) is a prevalent chemical used in the production of plastics. While adverse effects on the reproductive system have been documented, more recent studies also associated BPA exposure with carcinogenesis as well as genomic instability. However, these studies were generally performed using BPA concentrations much higher than those observed in the serum or urine of the general population, making their relevance unclear. To address this, we report here an unbiased genetic study to identify mechanisms responding to levels of BPA exposure relevant to plastic manufacturers. We performe
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PREMISE: The presence of more than two full chromosome sets, polyploidy, is an important component in plant evolution. However, knowledge of the frequency of polyploidization and which pathways contribute to polyploid formation and gene flow among cytotypes remains limited.
METHODS: Flow cytometry and chromosome counts were used to determine genome size of Artemisia tridentata parents and offspring. Reduced-representation sequencing was used on the parents, offspring, and conspecific taxa to confirm genetic relationships among parents and offspring.
RESULTS: A polyploidization rate of 0.22%
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pathogenic variants in COL1A1 and COL1A2 account for 85-90% of osteogenesis imperfecta (OI). Glycine substitutions within the triple-helical domain are traditionally considered highly pathogenic. The COL1A2 c.2827G>A p.(Gly943Arg) variant was previously classified as pathogenic under ACGS 2019/2020 criteria.
METHODS: One proband with this heterozygous variant was identified through national newborn genomic screening prompting further evaluation from the UK National OI Reference Laboratory. Four additional patients with the same variant were identified through referral to tertiary
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background. The Mycobacterium tuberculosis H37Rv reference genome (Lineage 4), sequenced in 1998, may be incomplete and inaccurate due to earlier technology. Moreover, its use is problematic in regions like East Asia where the dominant Beijing lineage (Lineage 2) is prevalent, as it may introduce biases due to lineage-specific genetic differences.Methods. We performed hybrid sequencing to generate high-quality assemblies of a clinically isolated Beijing family strain (A2018772) and a Chinese laboratory-adapted H37Rv strain (H37Rv_CN). Comparative genomic analysis was conducted against the stan
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Genome sequencing (GS) is increasingly used to investigate rare conditions, primarily in children. The 100,000 Genomes Project (100KG) evaluated GS ahead of implementation in the English National Health Service. In 2020, the National Health Service Genomic Medicine Service (GMS) became the first public health care system to offer GS in routine clinical care. We investigate how learning from 100KG informed GMS service delivery.
METHODS: We compare GS outcomes in children tested at a large pediatric hospital via GMS (n = 501) and 100KG research (n = 1759).
RESULTS: GMS diagnostic yiel
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In infected individuals, viruses are present as a population consisting of dominant and minor variant genomes. Most databases contain information on the dominant genome sequence. Since the emergence of SARS-CoV-2 in late 2019, variants have been selected that are more transmissible and capable of partial immune escape. Currently, models for projecting the evolution of SARS-CoV-2 are based on using dominant genome sequences to forecast whether a known mutation will be prevalent in the future. However, novel variants of SARS-CoV-2 (and other viruses) are driven by evolutionary pressure acting on
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: As of September 2024, Mexico had reported over 7.6 million confirmed cases of COVID-19 and 334,785 deaths. Genomic surveillance has been essential, with 94,799 SARS-CoV-2 genomes sequenced nationwide, 38.5% by the Mexican Consortium for Genomic Surveillance (CoViGen-Mex).
AIMS: Analyze the genomic diversity and geographic distribution of SARS-CoV-2 across Mexico's nine pandemic waves, with an emphasis on the seventh to ninth waves.
METHODS: Data from 94,799 SARS-CoV-2 genomes spanning from February 2020-September 2024 were analyzed. Sublineages with a prevalence of at least 5% we
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Elizabethkingia meningoseptica (E. meningoseptica) is a significant pathogen associated with various infections. This study aimed to analyze the general molecular and pan-genomic characteristics of E. meningoseptica. The 104 E. meningoseptica genomes were retrieved from NCBI, annotated using Prokka, and screened for antibiotic resistance genes via ABRicate. Core-genome single-nucleotide polymorphisms (SNPs) were identified using Parsnp, with phylogenetic trees constructed. Pan-genomic analysis employed BPGA for gene clustering at 80% identity, supplemented by COG and KEGG functional annotation
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteoporosis is a common disease characterized by a reduction in bone mineral density (BMD), leading to an increased risk of pathological fractures and even mortality. Although menopause is a major risk factor, osteoporosis can also occur in premenopausal women. The aim of this study was to identify genetic variants associated with the development of osteoporosis in Korean premenopausal women. Subjects were recruited from the Anseong and Ansan cohorts of the Korean Genome and Epidemiology Study (KoGES). Clinical and epidemiological characteristics were assessed, and participants were classifie
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human cytomegalovirus (HCMV), a member of the Herpesviridae family, is prevalent worldwide. HCMV is generally asymptomatic but causes severe disease in immunocompromised patients or infants who are congenitally infected. Recent advances in sequencing technology have led to the rapid expansion of the HCMV genetic database, providing a comprehensive resource for studying viral genetics. Although genetic investigations have been vigorously performed in European countries, information on the whole-genome sequence of HCMV in the East Asian region remains limited. In this study, we determined whole-
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enteromyxosis, or emaciation disease, caused by myxosporean parasites of the Enteromyxum genus, results in significant economic losses in aquaculture, particularly affecting adult flounders. Although the pathogen has been identified, effective treatments for Enteromyxum infections remain limited. In this study, a genome-wide association study (GWAS) and genomic prediction (GP) were conducted to evaluate Enteromyxum leei resistance in a flounder population using a high-density single-nucleotide polymorphism (SNP) panel. Fish were categorized based on infection severity, and disease-related trai
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transmission of the dengue virus (DENV) places a huge burden on public health in several endemic regions. Like other RNA viruses, mutations in the DENV genome greatly governs its virulence, transmissibility, and interaction with the host immune system. Present study focuses on integrated analysis of mutation and clinical data accompanied at the onset of dengue fever. The findings from the associated clinical data with the variants of the DENV are critical for early detection of the disease and understanding the disease progression. RNA was isolated from the 1310 serum samples collected from th
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cutaneous melanoma (CM) is the most common type in Caucasians, while acral melanoma (AM) and mucosal melanoma (MM), which are resistant to immunotherapies and BRAF/MEK-targeted therapies, are more common in East Asians. Genomic profiling is essential for treating melanomas, but such data are lacking in Japan.
METHODS: Comprehensive genomic profiling data compiled in the Center for Cancer Genomics and Advanced Therapeutics (C-CAT) were analyzed.
RESULTS: A total of 380 melanomas was analyzed, including 136 CM, 46 AM, 168 MM, and 30 uveal melanoma (UM). MM included conjunctival, si…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: A rapid decline in forced expiratory volume in 1 second (FEV1) is considered an important phenotype of the development of chronic obstructive pulmonary disease (COPD). However, the associations between specific genetic variants (single-nucleotide polymorphisms; SNPs) and this phenotype remain uncertain.
METHODS: We enrolled 6,516 individuals from the Korean Genome and Epidemiology Study (KoGES). A rapid decline in FEV1 was defined as an annual decrease of FEV1 ≥ 60 mL/year. A multivariable logistic regression model was used to assess the associations between SNP variants and the r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ongoing advancements in CRISPR-Cas technologies can significantly accelerate the preclinical development of both in vivo and ex vivo organ genome-editing therapeutics. One of the promising applications is to genetically modify donor organs prior to implantation. The implantation of optimized donor organs with long-lasting immunomodulatory capacity holds promise for reducing the need for lifelong potent whole-body immunosuppression in recipients. However, assessing genome-targeting interventions in a clinically relevant manner prior to clinical trials remains a major challenge owing to the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
How coronaviruses evolve by altering the structures of their full-length genome and defective viral genome (DVG) under dynamic selection pressures has not been studied. In this study, we aimed to experimentally identify the dynamic evolutionary patterns of the S protein sequence in the full-length genome and DVG under diverse selection pressures, including persistence, innate immunity and antiviral drugs. The evolutionary features of the S protein sequence in the full-length genome and in the DVG under diverse selection pressures are as follows: (i) the number of nucleotide (nt) mutations does
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Shigella spp have been associated with community-wide outbreaks in urban settings. We analysed a sustained shigellosis outbreak in Seattle, WA, USA, to understand its origins and mechanisms of antimicrobial resistance, define ongoing transmission patterns, and optimise strategies for treatment and infection control.
METHODS: We did a retrospective study of all Shigella isolates identified from stool samples at the clinical laboratories at Harborview Medical Center and University of Washington Medical Center (Seattle, WA, USA) from May 1, 2017, to Feb 28, 2022. We characterised iso
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования