The combined application of biochar and Trichoderma spp. represents a promising strategy for enhancing plant resilience and soil health; however, the molecular mechanisms underlying their synergistic interactions remain poorly understood and inadequately integrated. This review critically synthesizes evidence from transcriptomic, proteomic, metabolomic, and microbiome analyses to elucidate how biochar-Trichoderma interactions modulate plant defense signaling pathways and stress adaptation responses. Transcriptomic analyses reveal context-dependent activation of the jasmonic acid (JA), salicyli
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recurrent pregnancy loss (RPL) is a heterogeneous reproductive disorder in which dysregulation of maternal-fetal immune tolerance, aberrant decidual immune remodeling, and altered inflammasome signaling have been implicated within a complex multi-omics landscape. Multi-omics profiling (genomics, epigenomics, single-cell/spatial transcriptomics, proteomics, metabolomics, microbiome analyses, and immunomics) is increasingly being used to characterize mechanistic heterogeneity in RPL and to support biomarker discovery and immune-informed stratification. Genomic studies have associated chromosomal
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SUMMARY: Association measurements, such as mutual information (MI), are fundamental in the analysis of cancer multi-omics data for identifying cancer-related genes, gene signatures, and gene regulatory networks, thereby shedding light on tumor development, progression, and treatment. Confounding factors, including tumor purity and mutation burden, can bias association measurements in MI, potentially leading to the misclassification of passenger events as drivers. Conditional mutual information (CMI) provides a robust framework for assessing both linear and nonlinear associations while effectiv
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sarcopenia is an aging-related skeletal-muscle disorder characterized by progressive loss of muscle mass, strength, and function, and it frequently co-occurs with chronic liver disease (CLD) and other comorbidities. Conventional approaches struggle to resolve its pronounced heterogeneity, whereas multi-omics technologies now offer a systematic, molecular-level avenue to dissect its pathogenesis. By integrating ten omics studies of sarcopenia and six of CLD-associated sarcopenia, we propose a dual-layer "commonality-specificity" framework. At the level of commonality, we identify four core path
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bladder cancer, a common malignant tumor of the urinary system, possesses a highly heterogeneous tumor immune microenvironment that critically influences disease progression, treatment response, and patient prognosis. The limitations of traditional tissue biopsies have spurred interest in non-invasive, dynamic, and spatially resolved assessment strategies. Radiomics enables non-invasive quantification of macroscopic tumor phenotypes through high-throughput extraction of medical imaging features, while spatial omics technologies, such as single-cell and spatial transcriptomics, reveal the fine-
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Equus caballus is a species of considerable economic and cultural significance. However, the regulatory networks involved in equine sexual maturation remain unclear and eventually limit its reproduction and utilization. In this study, testicular tissues from eight Kazakh horses at two developmental stages (2 years, representing pre-maturation, and 3 years, representing post-maturation) were analyzed using whole transcriptome sequencing, data-independent acquisition (DIA) proteomics, and untargeted metabolomics. An integrated regulatory network was constructed encompassing ceRNA, mRNA, protein,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Reproductive performance is a key determinant of pig production, yet the placental molecular characteristics associated with breed-related reproductive differences remain incompletely understood. We compared Landrace sows, a highly prolific European commercial breed, with Chuanzang black sows, a Chinese local composite breed with lower reproductive performance. Term placental tissues were collected from 12 sows, with three sows in each breed × parity group: Chuanzang black parity 2, Landrace parity 2, Chuanzang black parity 5, and Landrace parity 5. One placenta per sow was analysed by integra
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Disinfection by-products, including those arising from secondary reactions between chlorinated reagents and natural organic matter such as trihalomethanes (THMs), have been associated with several adverse health outcomes, such as bladder and colorectal cancer.
AIMS: We aim to identify metabolic signatures of THM exposure in a high exposure setting (swimming pool), validate these markers in an external dataset with low exposure contrast (residential tap water), and characterise the multi-omic responses to THM exposures.
MATERIALS AND METHODS: In PISCINA-II study (discovery data),
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The razor clam Sinonovacula constricta is an economically important cultured mollusk in China, but the molecular mechanism of its gonadal development and sexual differentiation remains unclear. This study integrated gonadal transcriptomic, proteomic, and metabolomic analysis to identify key sex-related molecules. Transcriptome analysis identified 2795 DELs and 6497 DEGs between sexes, including the sex-related genes Fem-1b, Fem-1c, GUCY1B2 and FAT4, as well as a regulatory network of 39 lncRNA-mRNA pairs involving Tektin-4, Ropporin-1, Histone H1, and FoxN4. Proteomic analysis revealed 3217 DE
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Malignant pleural effusion (MPE) is a common manifestation in advanced malignancies. However, its differentiation from benign pleural effusions, such as parapneumonic effusion (PPE) and tuberculous pleural effusion (TPE), remains challenging. This study aimed to profile differentially expressed proteins and metabolites between MPE, PPE, and TPE.
METHODS: Pleural effusion samples from patients with MPE, PPE, and TPE were collected and subjected to proteomic and metabolomic profiling. Differentially expressed proteins (DEPs) and differentially abundant metabolites (DAMs) were identi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Advances in spatially resolved technologies enable the simultaneous acquisition of diverse data modalities within a tissue slice while preserving critical spatial context, which presents unprecedented opportunities to decipher intricate tissue heterogeneity. However, existing computational approaches lack the intrinsic flexibility to universally process both spatial multi-modal and multi-omics data. Here, we introduce STransformer, a unified deep learning framework designed to seamlessly accommodate a comprehensive landscape of spatial data. By simultaneously capturing short-range cellular int
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Magnaporthe oryzae, the causative agent of rice blast, is a devastating fungal pathogen that threatens global rice production. While natamycin is a known antimicrobial compound of microbial origin, its efficacy and precise mode of action against M. oryzae have remained largely unexplored. In this study, treatment with various concentrations of natamycin potently inhibited mycelial growth by 16.43% to 100%, with an EC₅₀ value of 11.77 mg/L. Pathogenicity of M. oryzae was also markedly reduced, declining to 4.1% of the control level under both in vitro and greenhouse conditions. To elucidate the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Corticotroph pituitary neuroendocrine tumours (PitNETs)/adenomas are heterogeneous sellar neoplasms. Currently established histopathological classification approaches are often considered limited in fully capturing the clinical and biological complexity of these tumours. Thus far, a molecular-based classification has not been established in corticotroph PitNETs. We compile molecular data of 270 corticotroph PitNETs (111 internal, 159 external), encompassing epigenome, transcriptome, and proteome profiles. Comprehensive integrative analyses are performed to identify, validate and characterise d
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Omics biomarkers comprise several molecular entities, including genomic, epigenomic, transcriptomic, proteomic, and metabolomic signatures. They play an essential role in oncology drug development and clinical settings by enabling personalized medicine. In precision oncology, validating biomarkers is a greater challenge than discovering them. The biomarkers discussed here span a wide evidentiary spectrum, from those endorsed in clinical guidelines to those that remain investigational.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Aneurysmal subarachnoid hemorrhage (aSAH), caused by the rupture of intracranial aneurysms, is a devastating cerebrovascular event with high mortality and disability. However, effective diagnostic biomarkers and therapeutic targets remain limited.
METHODS: We combined 4D label-free quantitative proteomics with transcriptomic datasets (GSE122897, GSE36791, GSE73378) for integrative analysis. Weighted Gene Co-expression Network Analysis (WGCNA) identified key gene modules. Functional enrichment (GO, KEGG) and GeneMANIA interaction networks were constructed. A diagnostic model was bu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Testicular aging has profound effects on spermatogenesis, sperm function, and the spermatogenic microenvironment, contributing to reduced male fertility. However, the precise molecular mechanisms by which mitochondria influence spermiogenesis during aging still remain largely unclear.
METHODS: Vha68-3 KO flies were generated using the CRISPR/Cas9 technique. Testicular phenotypes and functions were mainly observed through immunofluorescence staining and transmission electron microscopy. Multi-omics study was mainly conducted through single-cell RNA sequencing and transcriptome-meta
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The fungus Candida albicans is a frequent colonizer of humans but also an opportunistic pathogen causing superficial to severe infections, especially in vulnerable individuals. Its broad metabolic flexibility is key for the fungal adaptation to host environments, evasion from immune attack, and virulence. Amino acid metabolism and homeostasis, in particular, are critical for fungal fitness-illustrated by a rapid metabolic shift in response to amino acid starvation to restore intracellular metabolic balance. To investigate the cellular mechanisms underlying such compensatory metabol
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease (MASLD) is a common condition linked to obesity and the metabolic syndrome, yet its transkingdom connections have been under-investigated. We performed high-resolution multi-omic profiling-including stool metagenomes, metatranscriptomes and metabolomes-in 211 MASLD cases and 502 controls from a cohort of female nurses. Here we show that MASLD is associated with shifts in 66 gut bacterial species, including widespread enrichment of oral-typical microbes, and transkingdom dysbiosis involving not only bacterial but also viral taxa. Streptoc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The association between oral microbiome (OM) and myocardial infarction (MI) has become a noteworthy topic in recent years, yet the role played by cathepsin in this association remains unclear. The main objective of this study was to elucidate the role of cathepsin in mediating the effect of OM on MI. The mutual causality among OM, cathepsins, and MI was analyzed using two-sample Mendelian randomization (TSMR), and the mediating role of cathepsins between OM and MI was evaluated using mediation MR analysis. Furthermore, we conducted a meta-analysis to verify the causal relationship between Cath
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The global incidence of diabetic foot ulcers (DFUs) has increased in parallel with the global incidence of diabetes mellitus, leading to a range of pathophysiologic conditions and a poor prognosis. ENTPD1, also known as CD39, is an extracellular nucleotidase associated with immunogenic cell death (ICD), but its role in DFUs remains unclear. Through single-cell RNA sequencing, we obtain the genetic, functional, trajectory, and communication differences between DFUs and healthy subjects. Then, we selected vascular endothelial cells (Vasendo) for further re-clustering to identify DFU-healing-prom
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования