When hybridization subtraction was used to enrich for sequences induced by heat shock in Chinese hamster cells, B2 sequences were found to be one of the major sequences enriched. With cloned B2 probes, we found that the level of the short, 0.1 to 0.6 kb, polyadenylated RNA polymerase III transcripts of this repetitive genetic element increased approximately 10 to 20 fold after heat shock. Transcription of B2 RNA by RNA polymerase III was rapidly induced after heat shock based on time course studies and nuclear runoff experiments. The induction of B2 RNA was not a nonspecific response to lethal
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteoarticular tuberculosis (OAT) is an extrapulmonary tuberculosis and accounts for 1 to 3% of all tuberculosis cases. We used an rpoB PCR-plasmid TA cloning-sequencing method to detect and identify tubercle bacilli in surgical specimens from patients suspected of having OAT. By comparing the similarities of the rpoB sequences determined with those in GenBank, Mycobacterium tuberculosis was detected in 23 of 43 samples. Three of the 23 positive samples had mutations at codon 531, which are commonly observed in rifampin-resistant M. tuberculosis strains. Our results suggest that the rpoB PCR-T
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We analyzed the transcriptional properties of a repetitive sequence element, BmX, that belongs to a large gene family (approximately 2 x 10(4) copies) in the genome of the Bombyx mori silkworm. We discovered BmX elements because of their ability to direct transcription by polymerase III in vitro and used them to test the generality of the properties of previously identified silkworm polymerase III control elements. We found that the signals that act in cis to control BmX transcription strongly resemble those that direct transcription of other silkworm polymerase III templates. As with silkworm
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CV1 cells were made permeable by treatment with lysolecithin and incubated in a transcription mixture containing ribonucleoside triphosphates including ATP or GTP 32P-labeled either in the alpha or beta position. 5'-terminal cap structures (7mGpgamma pbeta palpha X) on newly synthesized RNA were analyzed by digestion with nuclease P1 or with ribonuclease T2/bacterial alkaline phosphatase. Cap structures obtained after labeling with alpha-32P-GTP show that the 32P is found only adjacent to the 7mG residue (i.e., in the gamma position) and adjacent to the penultimate Gm or G nucleotide (i.e., in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA and RNA methylation are key epigenetic and epitranscriptomic modifications involved in gene regulation, genome stability, RNA metabolism, and disease progression. Aberrant methylation patterns in cell-free DNA and RNA have emerged as valuable biomarkers for cancer detection, disease monitoring, and therapeutic stratification. However, conventional methods such as bisulfite sequencing, methylation-specific PCR, MeRIP-seq, SCARLET, and LC-MS/MS often require harsh processing, high sample input, complex instrumentation, or lack site-specific resolution, limiting their clinical and point-of-ca
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA viruses of the family Rhabdoviridae include arthropod-borne agents that infect plants, fish and mammals, and also include a variety of non-vector-borne mammalian viruses. Herein is presented a molecular phylogenetic analysis, the largest undertaken to date, of 56 rhabdoviruses, including 20 viruses which are currently unassigned or assigned as tentative species within the Rhabdoviridae. Degenerate primers targeting a region of block III of the L polymerase gene were defined and used for RT-PCR amplification and sequencing. A maximum-likelihood phylogenetic analysis of a 158-residue L polym
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bovine leukemia virus (BLV) is the etiologic agent of leukemia in cattle and is believed to cause decreases in milk productivity, fertility, and life span in infected cows. BLV is a type C retrovirus in the Oncovirinae subfamily. It is most closely related to human T-cell lymphoma/leukemia virus type I (HTLV-I) and type II (HTLV-II). Since the polymerase chain reaction (PCR) provides rapid and efficient amplification of DNA sequences, primers were designed to amplify regions of the polymerase (pol) and pX genes specific for BLV targets. These sets of primers consistently amplified as few as 10
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We document a helper-independent reverse genetics system for rescuing infectious arenaviruses from cloned cDNAs. We constructed plasmids containing full-length cDNAs of the antigenomic (ag) L and S segments of the Armstrong (ARM) strain of the prototypic Arenavirus lymphocytic choriomeningitis virus (LCMV) flanked at their 5'- and 3'-termini by the T7 RNA polymerase (T7RP) promoter and ribozyme sequences, respectively. These plasmids directed intracellular synthesis of viral L and S ag RNA species in cells expressing plasmid-supplied T7RP. Co-expression of plasmid-supplied LCMV trans-acting fa
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Wiedemann-Rautenstrauch syndrome (WRS), also known as neonatal progeroid syndrome, is a rare disorder of unknown etiology. It has been proposed to be autosomal-recessive and is characterized by variable clinical features, such as intrauterine growth restriction and poor postnatal weight gain, characteristic facial features (triangular appearance to the face, convex nasal profile or pinched nose, and small mouth), widened fontanelles, pseudohydrocephalus, prominent scalp veins, lipodystrophy, and teeth abnormalities. A previous report described a single WRS patient with bi-allelic truncating an
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An RNA polymerase identified in the genome of Pseudomonas phage Njord offers a promising tool for the synthesis of mRNA and other therapeutic nucleic acids. Originating from a marine microbial ecosystem, Njord RNAP transcribes RNA at high yield even under low temperature conditions. Key properties of the enzyme relevant to mRNA synthesis are presented including transcriptional fidelity, promoter specificity, incorporation of modified nucleotides, and the impurity profile of the RNA. Specific attention is given to the formation of contaminating double-stranded RNA (dsRNA) species. Analysis of t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The RING finger protein TRAIP protects genome integrity and its mutation causes Seckel syndrome. TRAIP encodes a nucleolar protein that migrates to UV-induced DNA lesions via a direct interaction with the DNA replication clamp PCNA. Thus far, mechanistically how UV mobilizes TRAIP from the nucleoli remains unknown. We found that PCNA binding is dispensable for the nucleolus-nucleoplasm shuttling of TRAIP following cell exposure to UV irradiation, and that its redistribution did not rely on the master DNA damage kinases ATM and ATR. Interestingly, I-PpoI-induced ribosomal DNA damage led to TRAI
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Replication of human norovirus requires nucleotidylylation of VPg by a viral polymerase, either mature Pol or the precursor protein ProPol. The reaction catalyses the covalent attachment of a nucleoside monophosphate to tyrosine 27 of HuNV VPg, which forms the first nucleotide of the genome and primes RNA replication. VPg at the genomic 5' terminus is also critical for translation initiation. Despite the importance of nucleotidylylation, the effect of antivirals on the reaction is not well characterized. This work investigated the effect of norovirus polymerase inhibitors on nucleotidylylation
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The effect of rifamycin on R14 phage growth in vivo was examined using rifamycin sensitive and resistant strains of E. coli as host cells. The following conclusions were obtained: (1) There is a time lag between the addition of rifamycin to the culture and the initiation of inhibitory action by the drug. At 25 mug rifamycin per ml, this time lag is approximately 30 min. At 50 mug per ml, it takes 10 min to exert 90% inhibition of RNA synthesis in both infected and non-infected cultures. (2) The rifamycin sensitive stage for R17 growth is the first 20 min of its infectious cycle during which ti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Joining oligonucleotides together (ligation) is a powerful means of retrieving information from the nanoscale. To recover this information, the linkages created must be compatible with polymerases. However, enzymatic ligation is restrictive and current chemical ligation methods lack flexibility. Herein, a versatile ligation platform based on the formation of urea and squaramide artificial backbones from minimally modified 3'- and 5'-amino oligonucleotides is described. One-pot ligation gives a urea linkage with excellent read-through speed, or a squaramide linkage that is read-through under se
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The flavivirus NS5 is a natural fusion of a methyltransferase (MTase) and an RNA-dependent RNA polymerase (RdRP). Analogous to DNA-dependent RNA polymerases, the NS5 polymerase initiates RNA synthesis through a de novo mechanism and then makes a transition to a processive elongation phase. However, whether and how the MTase affects polymerase activities through intramolecular interactions remain elusive. By solving the crystal structure of the Japanese encephalitis virus (JEV) NS5, we recently identified an MTase-RdRP interface containing a set of six hydrophobic residues highly co
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
By fluorimetric titration of Rifs (E. coli B) and Rifr (E. coli rpoB255) RNA polymerases with rifamycin, the mutant polymerase was demonstrated to bind rifamycin. A comparison of spatial structures of rifamycin and dinucleotide fragment of RNA in the hybrid with DNA revealed their similarity. Taking into account this structural similarity and also the fact that two phosphodiester bonds can be formed by RNA polymerase in the presence of rifamycin, a model for the inhibition mode was proposed. According to this model, rifamycin occupies the place of two terminal nucleotides of synthesized, but n
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Аннотация не предоставлена источником. Откройте карточку для перехода к публикации.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The L proteins of rhabdoviruses, such as vesicular stomatitis virus (VSV) and rabies virus (RABV), possess an unconventional mRNA capping enzyme (GDP polyribonucleotidyltransferase, PRNTase) domain with a loop structure protruding into an active site cavity of the RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) domain. Here, using complementary VSV and RABV systems, we show that the loop governs RNA synthesis and capping during the dynamic stop-start transcription cycle. A conserved tryptophan residue in the loop was identified as critical for terminal de novo initiation from the genomic promoter to synth
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Loss of methylation (LOM) at GNAS-A/B:TSS-differentially methylated regions (DMRs) in the GNAS locus is observed in pseudohypoparathyroidism type 1B (PHP1B). Many PHP1B cases are sporadic, but autosomal dominant-PHP1B has a deletion involving NESP55 expressed from the maternal allele or STX16 located upstream of the GNAS locus on the maternal allele. We report the possible first familial PHP1B cases with retrotransposon insertion in the GNAS locus on the maternal allele. To our knowledge, they are the possible first cases with imprinting disorders caused by retrotransposon insertion. The two s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Reverse genetics, an approach to rescue infectious virus entirely from a cloned cDNA, has revolutionized the field of positive-strand RNA viruses, whose genomes have the same polarity as cellular mRNA. The cDNA-based reverse genetics system is a seminal method that enables direct manipulation of the viral genomic RNA, thereby generating recombinant viruses for molecular and genetic studies of both viral RNA elements and gene products in viral replication and pathogenesis. It also provides a valuable platform that allows the development of genetically defined vaccines and viral vectors for the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАVideo-Audio MediaПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования