Monogenetic diseases can be analyzed routinely by targeted DNA sequencing. If causative variants are not found, complementary methods like RNA sequencing or analysis of copy number variations by multiplex ligation-dependent probe amplification have to be considered. In the latter, especially exonic duplications or deletions can be detected, but the precise sites of mutations remain unclear. As we demonstrate in this casuistic report of Fabry disease, next-generation sequencing (NGS) of a long-range PCR product can identify the recombination site directly and illuminate the underlying molecular
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clinical implementation of two recently approved antisense RNA therapeutics - Exondys51® to treat Duchenne muscular dystrophy (Duchenne MD) and Spinraza® as a treatment for spinal muscular atrophy (SMA) - highlights the therapeutic potential of antisense oligonucleotides (ASOs). As shown in the Duchenne and Becker cases, the identification and specific removal of 'dispensable' exons by exon-skipping ASOs could potentially bypass lethal mutations in other genes and bring clinical benefits to affected individuals carrying amenable mutations. In this review, we discuss the potential of therapeuti…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The PAX5 gene, which encodes the B-cell specific activator protein, is one of the most important factors in determination of B-cell development. This gene is the main target of somatic mutations in acute B lymphoblastic leukemia (B-ALL). For example, point mutations, deletions, as well as other gene rearrangements may lead to several forms of B-cell malignancy. In this study, we obtained 50 blood samples from patients diagnosed with ALL, and screened for PAX5 mutations using sequencing in exons 1, 2 and 3. We found a heterozygous germline variant, c.113G>A (p.Arg38His), which affects the paire…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alternative splicing is an important regulator of the transcriptome. However, mutations may cause alteration of splicing patterns, which in turn leads to disease. During the past 10 years, exon skipping has been looked upon as a powerful tool for correction of missplicing in disease and progress has been made towards clinical trials. In this review, we discuss the use of antisense oligonucleotides to correct splicing defects through exon skipping, with a special focus on diseases affecting the nervous system, and the latest stage achieved in its progress.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Based on studies in animals and humans, PAX3 and T (brachyury) are candidate genes for spina bifida. However, neither gene has been definitively identified as a risk factor for this condition.
METHODS: Sanger sequencing was used to identify variants in all PAX3 and T exons and promoter regions in 114 spina bifida cases. For known variants, allele frequencies in cases were compared with those from public databases using unadjusted odds ratios. Novel variants were genotyped in parents and assessed for predicted functional impact.
RESULTS: We identified common variants in PAX3 (n = …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report a Tunisian patient born from consanguineous marriage affected with progressive myoclonus epilepsy and cognitive decline, consistent with the diagnosis of Lafora disease. Genetic analysis showed a novel c.659 T>A mutation on exon 3 of the EPM2A gene, converting a leucine to a glutamine residue at amino acid position 220 (p.Leu220Gln), in the dual-specificity phosphatase domain.
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Atypical fibroxanthoma (AFX) histologically mimics high-grade sarcoma in the skin, although it follows a benign clinical course. AFX occurs in the sun-exposed skin and for this reason, an association with ultraviolet light has long been suspected. Bax and Gadd45 are p53 effector proteins. Bax is a programmed cell death protein and belongs to the Bcl-2 family. Gadd45 is a multifunctional DNA damage-inducible gene associated with the process of DNA damage.
METHODS: Immunohistochemical expression of Bax was analyzed in 7 cases of AFX, and in 7 cases of benign fibrous histiocytoma (BF
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Erythrocytosis can arise from deregulation of the erythropoietin (Epo) axis resulting from defects in the oxygen-sensing pathway. Epo synthesis is controlled by the hypoxia inducible factor (HIF) complex, composed of an alpha and a beta subunit. There are 2 main alpha subunits, HIF-1 alpha and HIF-2 alpha. Recently, a HIF-2 alpha Gly537Trp mutation was identified in a family with erythrocytosis. This raises the possibility of HIF2A mutations being associated with other cases of erythrocytosis. We now report a subsequent analysis of HIF2A in a cohort of 75 erythrocytosis patients and identify 4
Клинический случайСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The V617F mutation, which causes the substitution of phenylalanine for valine at position 617 of the Janus kinase (JAK) 2 gene (JAK2), is often present in patients with polycythemia vera, essential thrombocythemia, and idiopathic myelofibrosis. However, the molecular basis of these myeloproliferative disorders in patients without the V617F mutation is unclear.
METHODS: We searched for new mutations in members of the JAK and signal transducer and activator of transcription (STAT) gene families in patients with V617F-negative polycythemia vera or idiopathic erythrocytosis. The mutat
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Point mutations in SPG4, the gene encoding spastin, are a frequent cause of autosomal dominant hereditary spastic paraplegia (AD-HSP). However, standard methods for genetic analyses fail to detect exonic microdeletions.
METHODS: 121 mutation-negative probands were screened for rearrangements in SPG4 by multiplex ligation-dependent probe amplification.
RESULTS: 24 patients with 16 different heterozygotic exon deletions in SPG4 (20%) were identified, ranging from one exon to the whole coding sequence. Comparison with 78 patients with point mutations showed a similar clinical pictur
Сравнительное исследованиеПисьмо в редакциюПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The enhancement of GABAergic neurotransmission has been closely linked to antipanic drug efficacy. This is the first study to investigate a putative association of exonic sequence variants of the human GABA(B) receptor 1 (GABA(B)R1) gene and susceptibility to panic disorder. Three DNA sequence variants in exons 1a1, 7 and 11 were assessed by polymerase chain reaction-based restriction fragment length polymorphism in a case-control study among patients with panic disorder with and without agoraphobia (DSM III-R criteria) and blood donors. There was no indication of an increased vulnerability to…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Uncommon and complex EGFR variants respond variably to tyrosine kinase inhibitors, and data on their frequency in Brazil are scarce.
METHODS: We retrospectively analysed 141 patients with EGFR-mutated lung adenocarcinoma at a single Northeastern Brazilian centre. All profiling used treatment-naive diagnostic specimens: next-generation sequencing (NGS) in 111 patients (78.7%) and rapid PCR or single-gene assay in 30 (21.3%). Concurrent alterations and PD-L1 were assessed where panels covered those genes. Overall survival was estimated by Kaplan-Meier analysis and log-rank test.
RE
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The BCR::ABL1 fusion gene, resulting from the Philadelphia (Ph) chromosome, is the defining feature of Chronic Myeloid Leukemia (CML). The fusion transcript typically results from the juxtaposition of ABL1 exons 2 or 3 and BCR exons 1, 13, 14 or 19, while exons 6 and 8 are less frequently involved. Here, we report the first case of a translocation in a patient with newly diagnosed chronic-phase CML harboring a novel e4a2 BCR::ABL1 fusion gene. This unique fusion includes a 298 bp insertion, derived from a CSE1L gene exons 9 and 10, at the fusion site. The patient showed resistance to first-lin…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Becker muscular dystrophy (BMD) is a genetic neuromuscular disease of growing importance caused by in-frame, partial loss-of-fun … te bmx (Becker muscular dystrophy, X-linked) mice, which express an in-frame ~40 000 bp deletion of exons 45-47 in the murine Dmd gene, reproducing the most common BMD patient mutation. Here, we characterize muscle pathogenesis using molecular and histological techniques and then test skeletal muscle and cardiac function using muscle function assays and …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Congenital contractural arachnodactyly (CCA) is a rare connective tissue disorder, associated with heterozygous mutations in the FBN2 gene. The objective of this study was to evaluate the prevalence of an intragenic deletion encompassing exons 1-8 of FBN2 gene in Israeli population.
MATERIALS AND METHODS: A search for intragenic FBN2 microdeletions was performed in two databases of chromosomal microarray analysis (CMA) - genetic laboratory of a tertiary medical center (the primary cohort) and one of the largest Israeli health maintenance organizations (replication cohort).
RESU…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiple endocrine neoplasia type 1 (MEN1) syndrome is an autosomal dominant disease, characterized by parathyroid adenomas, endocrine gastr … ng the TaqMan copy number variation assay we identified a large deletion of the MEN1 gene involving exons 1 and 2, in three affected family members, but not in the other nine family members that were to date clinically unaffected. The same genetic alteration was not found in a group of ten unaffected subjects, without family history of endocrine tumors. …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CaV1.2 calcium channels play roles in diverse cellular processes such as gene regulation, muscle contraction, and membrane excitation and are diversified in their activity through extensive alternative splicing of the CaV1.2 mRNA. The mutually exclusive exons 8a and 8 encode alternate forms of transmembrane segment 6 (IS6) in channel domain 1. The human genetic disorder Timothy syndrome is caused by mutations in either of these two CaV1.2 exons, resulting in disrupted Ca(2+) homeostasis and severe pleiotropic disease phenotypes. The tissue-specific pattern of exon 8/8a splicing leads to differ…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования