BACKGROUND: The relationship between heart failure (HF) and atrial fibrillation (AF) is clear, with up to half of patients with HF progressing to AF. The pathophysiological basis of AF in the context of HF is presumed to result from atrial remodeling. Upregulation of the transcription factor FOG2 (friend of GATA2; encoded by ZFPM2) is observed in human ventricles during HF and causes HF in mice.
METHODS: FOG2 expression was assessed in human atria. The effect of adult-specific FOG2 overexpression in the mouse heart was evaluated by whole animal electrophysiology, in vivo organ electrophysiolo
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alcoholic liver disease (ALD) has a complex pathogenesis. Although early-stage ALD can be reversed by ceasing alcohol consumption, early symptoms are difficult to detect, and several factors contribute to making alcohol difficult to quit. Continued alcohol abuse worsens the condition, meaning it may gradually progress into alcoholic hepatitis and cirrhosis, ultimately, resulting in irreversible consequences. Therefore, effective treatments are urgently needed for early-stage ALD. Current research mainly focuses on preventing the progression of alcoholic fatty liver to alcoholic hepatitis and c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Duchenne muscular dystrophy (DMD) is a severe X-linked recessive disorder caused by mutations in the dystrophin gene, which leads to heart and respiratory failure. Despite the critical impact of DMD on endothelial cells (ECs), there is limited understanding of its effect on the endothelial gene network. The aim of this study was to investigate the impact of DMD on the gene regulatory network of ECs.
METHODS AND RESULTS: To gain insights into the role of the dystrophin muscular dystrophy gene (DMD) in ECs from Duchenne muscular dystrophy; the study utilized single-nuclei RNA sequ
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: As a systemic skeletal dysfunction, osteoporosis (OP) is characterized by low bone mass, impairment of bone microstructure, and a high global morbidity rate. There is increasing evidence that microRNAs (miRNAs) are associated with the pathogenesis of OP. Weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) is a systematic method for identifying clinically relevant genes involved in disease pathogenesis. However, the study of the miRNA-messenger RNA (mRNA) regulatory network in combination with WGCNA in OP is still lacking.
METHODS: The GSE93883 and GSE7158 microarray datasets we
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although the incidence of Alzheimer's disease (AD) is continuously increasing in the aging population worldwide, effective therapies are not … ive oxygen species. Additionally, our results clearly point to an important role of FOXA1 and FOXA2 gene regulatory networks in the etiology of AD. This finding is in corroboration with the recently reported major role of the dopaminergic system in the development of AD and its regulation by FOXA1 and FOXA2.
СтатьяМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Salmonella enteritidis (SE), a previously widespread infectious disease, is still cited as a major factor in economic losses in commercial chicken production. The host's genetic immune system determines the pathogenicity of a particular bacterium. To shed light on this topic, it was necessary to understand the key candidate genes essential for regulating susceptibility and resistance to the target disease. The field of poultry farming in particular has benefited greatly from the connection between quantitative and molecular genetics.
OBJECTIVES: This study aims to identify the mos
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: As the first organ to develop in utero, the human heart undergoes extensive molecular, structural and metabolic remodeling during development and must sustain its function throughout life.
RESULTS: We generate an integrated multiomic atlas of human cardiac cells, combining newly generated and publicly available single-nucleus RNA sequencing datasets from 299 donors and single nucleus ATAC-seq datasets from 106 donors. Developmental and disease-associated processes drive far more extensive molecular remodeling than sex-associated or aging-dependent effects. Across nearly all cardia
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The development and egg-laying performance of hens are precisely regulated by hormones secreted by the pituitary. In this study, we performed comprehensive transcriptome sequencing of pituitary from Hy-Line Brown hens at 15, 20, 30 and 68 W of age. Through association analysis, we identified key genes and ceRNA regulatory networks related to pituitary development and egg production.
RESULTS: Based on the comprehensive transcriptome data, we identified 470 differentially expressed lncRNAs (DE-lncRNAs), 38 differentially expressed miRNAs (DE-miRNAs), and 2,449 differentially express
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gene dystrophin is responsible for Duchenne muscular dystrophy (DMD), a grave X-linked recessive ailment that results in respiratory and cardiac failure. As the expression of dystrophin in muscle stem cells (MuSCs) is a topic of debate, there exists a limited understanding of its influence on the gene network of MuSCs. This study was conducted with the objective of investigating the effects of dystrophin on the regulatory network of genes in MuSCs. To comprehend the function of dystrophin in MuSCs from DMD, this investigation employed single-nuclei RNA sequencing (snRNA-seq) to appraise th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genes associated with immune response and inflammation have been identified as genetic risk factors for late-onset Alzheimer´s disease (LOAD). The rare R47H variant within triggering receptor expressed on myeloid cells 2 (TREM2) has been shown to increase the risk for developing Alzheimer's disease (AD) 2-3-fold. Here, we report the generation and characterization of a model of late-onset Alzheimer's disease (LOAD) using lymphoblast-derived induced pluripotent stem cells (iPSCs) from patients carrying the TREM2 R47H mutation, as well as from control individuals without dementia. All iPSCs effi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hypertension is a multifactorial disease with stage-specific gene expression changes occurring in multiple organs over time. The temporal sequence and the extent of gene regulatory network changes occurring across organs during the development of hypertension remain unresolved. In this study, female spontaneously hypertensive (SHR) and normotensive Wistar Kyoto (WKY) rats were used to analyze expression patterns of 96 genes spanning inflammatory, metabolic, sympathetic, fibrotic, and renin-angiotensin (RAS) pathways in five organs, at five time points from the onset to established hypertension
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Considering that imbalance of central tolerance in the thymus contributes to aggressive autoimmunity, we compared the expression of peripheral tissue autoantigens (PTA) genes, which are involved in self-representation in the thymic stroma, of two mouse strains; DBA-1/J (MHC-H2(q)) susceptible and DBA-2/J (MHC-H2(d)) resistant to collagen induced arthritis (CIA). We evaluate whether these strains differ in their thymic gene expression, allowing identification of genes that might play a role in susceptibility/resistance to CIA. Microarray profiling showed that 1093 PTA genes were differentially
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The association between vitamin D deficiency and cardiovascular disease remains a controversial issue. This study aimed to further elucidate … al transcriptomics of heart cryosections revealed more pronounced pro-inflammatory and pro-fibrotic gene regulatory networks in the stressed cardiac tissue niches of TAC VDRCM-KO compared to VDRfl/fl mice. Hence, our study supports the notion that vitamin D signaling in cardiomyocytes plays a protective role in the stressed heart.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Infection with SARS-CoV-2 leads to coronavirus disease 2019 (COVID-19), which can result in acute respiratory distress syndrome and multiple organ failure. However, its comprehensive influence on pathological immune responses in the respiratory epithelium and peripheral immune cells is not yet fully understood.
METHODS: In this study, we analyzed multiple public scRNA-seq datasets of nasopharyngeal swabs and peripheral blood to investigate the gene regulatory networks (GRNs) of healthy individuals and COVID-19 patients with mild/moderate and severe disease, respectively. Cell-ce…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Moderate folic acid (FA) intake is an effective strategy that slows colorectal cancer (CRC) progression. However, high consumption of FA may trigger the transition of precancerous tissue towards malignancy. MicroRNAs (miRNAs) are considered to be potential biomarkers of CRC. Thus, identification of miRNAs of dysregulated genes in CRC cells by detailed analysis of mRNA and miRNA expression profile in the context of FA deficiency could substantially increase our understanding of its oncogenesis. mRNA-seq and miRNA-seq analyses were utilized to investigate the expression of miRNAs in FA-deficient
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human mesenchymal stem cells (hMSCs) have the capacity to differentiate into fabricate cartilage, muscle, marrow stroma, tendon/ligament, fat, and other connective tissues, providing a potential source for tissue regeneration. The aim of this study was to find the key transcription factors (TFs), which regulated osteogenic differentiation of hMSCs. In this study, three methods were performed to find the key TFs, which included enrichment analysis, direct impact value and indirect impact value. We used the patient and public involvements (PPI) network to integrate the results of the above metho
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: We identified functional genes and studied the underlying molecular mechanisms of diabetic cardiomyopathy (DCM) using bioinformatics tools.
METHODS: Original gene expression profiles were obtained from the GSE21610 and GSE112556 data sets. We used GEO2R to screen the differentially expressed genes (DEGs). Gene Ontology and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pathway enrichment analyses were performed on DEGs. Protein-protein interaction (PPI) networks of DEGs were constructed using STRING and hub genes of signaling pathways were identified using Cytoscape. Aberrant hub gene ex
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tomato is a drought-sensitive crop which has high susceptibility to adverse climatic changes. Dehydration-responsive element-binding (DREB) are significant plant transcription factors that have a vital role in regulating plant abiotic stress tolerance by networking with DRE/CRT cis-regulatory elements in response to stresses. In this study, bioinformatics analysis was performed to conduct the genome-wide identification and characterization of DREB genes and promoter elements in Solanum lycopersicum. In genome-wide coverage, 58 SlDREB genes were discovered on 12 chromosomes that justified the c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Organic acids and anthocyanins are the most important compounds for the flavor and nutritional quality of citrus fruit. However, there are few reports on the involvement of co-regulation of citrate and anthocyanin metabolism. Here, we performed a comparative transcriptome analysis to elucidate the genes and pathways involved in both citrate and anthocyanin accumulation in postharvest citrus fruit with 'Tarocco' blood orange (TBO; high accumulation) and 'Bingtangcheng' sweet orange (BTSO; low accumulation).
RESULTS: A robust core set of 825 DEGs were found to be temporally associat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parkinson's disease (PD) is a progressive neurodegenerative disease affecting the ventral midbrain dopaminergic neurons, resulting in motor defects mainly tremor, rigidity, and bradykinesia along with a wide array of non-motor symptoms. The current study is focused on determining the potential druggable targets of PD by consolidating gene expression profiling and network methodology. Initially, the differentially expressed genes were established from which the central network was constructed by assimilating the interacting partners. Investigating the topological parameters of the network, the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования