BACKGROUND: Postmenopausal osteoporosis (PMO) develops as a result of pathological cross-tissue interactions. However, current experimental paradigms are constrained by their single-tissue focus, hindering efforts to discover systemwide regulatory genes.
OBJECTIVE: We aimed to discover conserved genetic regulators of PMO by integrating cross-tissue transcriptomic profiles in humans and to characterize their biological functions via combined genetic epidemiology and experimental studies using integrated analytical strategies.
METHODS: Our analytical framework encompassed transcriptome profile
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Infrapopliteal atherosclerosis and calcification are major causes of chronic limb ischemia. This study aimed to identify causati … abacavir, and lamotrigine could be potential therapeutics targeting HLA-B.
CONCLUSION: Integrated multiomics revealed HLA-B upregulation drives infrapopliteal atherosclerosis and calcification, identifying IgD- CD27- B cell %B cell and IgD+ CD24- B cell %lymphocyte as causal immune phenotypes.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinal cord injury (SCI) leads to a complex cascade of cellular events, among which necroptosis plays a critical role in exacerbating neuronal injury and inflammation. In this study, we aimed to identify and validate key genes associated with necroptosis in SCI using bulk RNA-seq data, followed by differential analysis and weighted gene coexpression network analysis (WGCNA). We identified several candidate necroptosis-related genes, and further least absolute shrinkage and selection operator (LASSO) regression highlighted five SCI-necroptosis differentially expressed genes (DEGs): toll-like re
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Regular exercise is well established to protect against metabolic disorders and bolster immunity, but the underlying molecular and cellular mechanisms remain incompletely understood. We integrated plasma metabolomics and lipidomics with single-cell transcriptomic and chromatin accessibility profiles from regularly exercising versus sedentary individuals. We observed that regular exercise was associated with enhanced fatty acid oxidation and antioxidant metabolites in plasma. In the circulating immune cells of exercising individuals, antigen-presenting cells (APCs), particularly classical monoc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tinnitus is a prevalent auditory disorder with poorly understood links between environmental exposure and disease, complicating objective diagnosis and intervention. In a graded observational cohort with documented occupational noise histories, we integrated serum metabolomics, lipidomics, and immunophenotyping with interpretable machine learning. Mediation analysis suggested that a panel of metabolites, including gamma-aminobutyric acid (GABA), fumaric acid, and sphingolipids, accounted for a substantial proportion of the association between noise exposure and tinnitus severity (indirect effe
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lung cancer remains a leading cause of cancer-related mortality worldwide due to its extensive molecular heterogeneity, late-stage diagnosis, and therapeutic resistance. Advances in high-throughput omics technologies have enabled comprehensive characterization of tumors across multiple biological layers, including genomics, epigenomics, transcriptomics, proteomics, and metabolomics. However, single-omics analyses provide only fragmented insights into tumor biology, highlighting the need for integrative multiomics approaches. Artificial intelligence (AI), particularly machine learning and deep …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: This study was designed to identify candidate marker proteins that influence the growth and development of Shandong black cattle bull testes through multiomics joint analysis, thereby providing a certain theoretical basis for testis growth and development as well as bull selection. Eight 12-month-old Shandong Black cattle bulls were selected, and testis tissues were collected. The testes were categorized into two groups on the basis of their morphological characteristics: Group 1 (weight > 120 g) and Group 2 (weight < 120 g), with 4 animals in each group. Group 2 was employed as th…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parkinson's disease (PD) is the second most common neurodegenerative disease. It primarily affects the motor system but is also associated with a range of cognitive impairments that can manifest early in disease progression, indicating its multifaceted nature. In this paper, we performed a meta-analysis of transcriptomics and proteomics data using MultiOmicsIntegrator to gain insights into the post-transcriptional modifications and deregulated pathways associated with this disease. Our results reveal differential isoform usage between control and PD patient brain samples that result in enriche…
СтатьяМетаанализПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Colorectal cancer is the fourth most deadly cancer, with a high mortality rate and a high probability of recurrence and metastas … pth mechanism of colorectal cancer recurrence and metastasis. Therefore, this study proposes such a multiomics data-based predictive model for the recurrence and metastasis of colorectal cancer. LR, SVM, Naïve-bayes and ensemble learning models are used to build this predictive model.
CONCLUSIONS: The experimental results indicate that our proposed multiomi …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Digestive and liver disease : official journal of the Italian Society of Gastroenterology and the Italian Association for the Study of the Liver2025eng
BACKGROUND/AIMS: Functional constipation (FC) is a prevalent form of functional gastrointestinal disorder with an elusive etiology. Despite numerous investigations into the role of the gut microbiome in FC, no study has yet integrated microbiome, metabolome, and lipidome profiling to characterize FC.
METHODS: In this study, fecal samples were collected from patients with FC both before and after laxative administration to minimize the impact of intestinal transit time and to identify the characteristics unique to patients with FC. These samples underwent comprehensive microbiome, metabolome,
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hypoxia leads to endothelial dysfunction and increased blood-brain barrier (BBB) permeability, promoting the incidence of diseases such as stroke and acute high-altitude illness. Brain microvascular endothelial cells (BMECs) are important structural and functional components of the BBB; however, the molecular changes that occur in BMECs during hypoxia remain unknown. We reported the molecular and functional changes in BMECs under hypoxia through whole-transcriptome sequencing, small RNA microarray, TMT quantitative proteomic, and untargeted metabolomic analyses. We found that hypoxia affected
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Wound healing is crucial for restoring homeostasis in living organisms. Although wound response mechanisms have been studied extensively, the gene regulatory programs involved remain to be elucidated. Here, we used single-cell RNA sequencing (RNA-seq) and ATAC sequencing (ATAC-seq) analysis to profile the regulatory landscape of mouse corneal epithelium in early wound response.
METHODS: We used our previously published single-cell data sets of homeostatic adult mouse corneal epithelium as the unwounded group. The wounded group data sets were obtained by sequencing the epithelium afte
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcription factors such as Tbx5, Gata4, Mef2c and Pitx2 are required during cardiac development, and in adult cardiac homeostasis. We demonstrate that the gene dosage and modulation of these factors are mediated in vivo by the miR-200 family. Inhibition of a single miR-200 family member within the cluster results in defects of the left ventricle and cardiomyocyte maturation during development. Inhibition of the entire miR-200 family results in a ventricular septal defect and embryonic lethality by embryonic day (E)16.5. Inhibition of each miR-200 family has distinct heart phenotypes in cell
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Skeletal muscle is a major target for ethanol-induced perturbations, leading to sarcopenia in alcohol-related liver disease (ALD). The complex interactions and pathways involved in adaptive and maladaptive responses to ethanol in skeletal muscle are not well understood. Unlike hypothesis-driven experiments, an integrated multiomics-experimental validation approach provides a comprehensive view of these interactions.
METHODS: We performed multiomics analyses with experimental validation to identify novel regulatory mechanisms of sarcopenia in ALD. Studies were done in a comprehensi…
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Periodontitis (PD) is a common chronic inflammatory oral disease that severely affects patients' quality of life. Fisetin has been shown to possess antioxidant and anti-inflammatory properties in various biological systems.
METHODS: This study first identified the molecular targets of fisetin for PD through network pharmacology analysis. The therapeutic effects of fisetin were then evaluated in an animal model of PD and validated through in vitro experiments. Additionally, we utilised single-cell and spatial transcriptomics technologies to identify key cell populations in PD and t
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heart failure is a leading cause of morbidity and mortality; yet gene regulatory mechanisms driving cell type-specific pathologic responses remain undefined. Here, we present the cell type-resolved transcriptomes, chromatin accessibility, histone modifications and chromatin organization of 36 non-failing and failing human hearts profiled from 776,479 cells spanning all cardiac chambers. Integrative analyses revealed dynamic changes in cell type composition, gene regulatory programs and chromatin organization, which expanded the annotation of cardiac cis-regulatory sequences by ten-fold and map
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The adipose tissue (AT) is a main regulator of systemic energy homeostasis, and AT dysfunction leads to insulin resistance and other metabol … romotes cholesterol biogenesis, associated with hyperlipidemia and hepatic steatosis in mice. These multiomics approaches uncover previously unappreciated roles of PRMT5 as an epigenetic regulator of metabolic homeostasis via coordinating membrane transport, balancing glucose and FA metabolism, and promoting cholesterol biosynthesis. This study highlights a …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ObjectiveGout is a prevalent form of inflammatory arthritis in which many patients respond suboptimally to current therapies. Drug development is hampered by a lack of genetically validated targets, leading to high clinical trial attrition. This study aimed to systematically identify and prioritize novel, druggable targets for gout via a multilayered genetic and functional genomics approach.MethodsWe performed two-sample Mendelian randomization (MR) using cis-expression quantitative trait locus (cis-eQTL) data and dual independent gout genome-wide association study (GWAS) cohorts (openGWAS and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A comprehensive analytical strategy for multiomics analysis of dried blood spots (DBS) has been developed, featuring prespotted stable isotope internal standards (SIIS) for enhanced quantitation. The method combines an optimized Folch extraction protocol for dried plasma spots with high-resolution mass spectrometry analysis using a Thermo Q Exactive Orbitrap mass spectrometer coupled to a Dionex Ultimate 3000 ultrahigh performance liquid chromatography system. This internal quantitative DBS approach addresses key analytical challenges in microsampling applications through strategic incorporati…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования