The intestine is a complex organ composed of the small and the large intestines. The small intestine can be further divided into duodenum, j … ical region and fixed in a flat orientation. Then, the tissue is carefully rolled and processed for paraffin embedding. Proper tissue fixation and orientation is an often-overlooked laboratory technique but is critically important for downstream analysis. Additionally, improper Swiss rolling of intestinal tissue can damage the fragile intestinal epithelium …
СтатьяVideo-Audio MediaПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) brain tissue held in tissue banks constitutes a valuable research resource, especially when associated with clinical annotations and longitudinal psychometric testing. Apolipoprotein-E (APOE) genotyping is important to fully characterise this resource, however older FFPE tissue may not be suitable for genotyping. We performed polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) assays on DNA extracted from post-mortem FFPE brain tissue ranging from 2-19 years old. A maximum of three years in paraffin was determined for robust APO…
Письмо в редакциюПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The use of archival formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue samples for biochemical analyses is problematic because of the formation of a Schiff base, leading to low protein and metabolite yields during analytical extractions. Here, we overcome this issue using a unified protocol on FFPE tissue for metabolomics and proteomics analyses. Using 20 mg of wet mass tissue, this protocol consistently extracted more than 50 metabolites (across 11 classes of metabolites) and over 900 proteins.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
According to the World Health Organization (WHO), around 1 million children worldwide are diagnosed with tuberculosis each year. The Bacillu … aim of the study was to assess the usefulness of genetic testing for Mycobacterium bovis BCG in the paraffin-embedded specimens' methods. We describe two cases of VAE in immune-compromised children presenting with osteoarticular changes that had been clinically suspected of tuberculosis and led to molecular identification through GeneXpert, GenoType MTBC, …
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: Adrenocortical carcinoma (ACC) is a rare aggressive disease with heterogeneous prognoses. Previous studies identified hypermethylation in the promoter region of specific genes to be associated with poor clinical outcome.
OBJECTIVE: Comparative analysis of promising hypermethylated genes as prognostic markers and evaluation of their added value to established clinical prognostic tools.
DESIGN: We included 237 patients with ACCs. Tumor DNA was isolated from formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) samples. Targeted pyrosequencing was used to detect promoter region methylation in 5 pres…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The transfer of mid-infrared spectral histopathology to the clinic will be possible provided that its application in clinical practice is simple. Rapid analysis of formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue section is thus a prerequisite. The chemical dewaxing of these samples before image acquisition used by the majority of studies is in contradiction with this principle. Fortunately, the in silico analysis of the images acquired on FFPE samples is possible using extended multiplicative signal correction (EMSC). However, the removal of pure paraffin pixels is essential to perform a releva…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIM: Cancer profiling tests using formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) specimens with various conditions have become an essential tool for cancer treatment. The robustness of these tests needs to be addressed.
MATERIALS AND METHODS: A cancer profiling test, NCC oncopanel, was tested with FFPE specimens from various tissues with different storage conditions and fixation lengths. Next generation sequencing was performed with Miseq and the data were assembled using the human reference genome hg19.
RESULTS: Duration of storage and fixation affected the mapping statistics. Prolonged…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) is a key cellular entry factor for severe acute respiratory syndrome coronavirus 2. Hence, identifying cell types that express ACE2 is important for understanding the pathophysiology of coronavirus disease 2019. We performed extensive testing of multiple primary antibodies across various human tissue types. Here, we describe an optimized protocol for immunostaining of ACE2 in formalin-fixed paraffin-embedded human pancreas, small intestine, and kidney tissue sections obtained from organ donors and autopsies. For complete details on the use and execution o…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mineral oils have been widely used in the pest control of several crops. However, their mode of action is poorly understood, especially in the case of their antifungal properties. The possible direct fungicidal activity and the stress-inducing capability of paraffin oil on grapevine were examined using Vitis vinifera L. cv 'Kékfrankos' cuttings and the fungus Erysiphe necator, the causal agent of powdery mildew.
RESULTS: Our experiments demonstrated that paraffin oil does not have fungicide activity on E. necator, but induces significant stress-related changes in grapevine physiol…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The bone is a dynamic and metabolically active organ in which growth and resorption of the osteochondral matrix is orchestrated by osteoblasts and osteoclasts. For decalcified paraffin-embedded specimens, decalcifying agents alter the staining intensity, and excess decalcification interferes with bone staining. Robust bone staining methods independent of the decalcification conditions and animal species are lacking. In this study, we have developed a novel polychrome staining method, named JFRL staining, which stains the components of osteochondral tissue in different colors. With this stainin…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Data on the efficacy of treatment modalities in De Quervain's tenosynovitis (DQT) is limited. Paraffin therapy is routinely used in treating hand osteoarthritis and neuropathies. However, there are not enough studies investigating paraffin effectiveness. This study evaluates the effectiveness of paraffin bath therapy on pain, functional status, muscle strength, and quality of life in patients with DQT. This prospective, single-blind, randomized, controlled study enrolled 51 DQT patients. Group 1 (n = 26) received paraffin bath + splint + exercise; Group 2 (n = 25) received splint + exercise th…
СтатьяРандомизированное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Cystic Echinococcosis (CE) is a medically important disease that is caused by the metacestodes of Echinococcus granulosus. Human hydatid is considered an endemic disease in specific regions of Iran. The goal of the present study was to determine the genetic diversity of E. granulosus from the paraffin-embedded human tissue samples which were collected from the endemic regions of Iran.
METHODS: Fifty-five formalin-fixed and paraffin-embedded hydatid cysts (FFPE) of humans, which had been removed surgically, were obtained from the South Khorasan and Sistan and Baluchistan provinces. Th…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA junctions (DNAJs) frequently impact clinically relevant genes in tumors and are important for diagnostic and therapeutic purposes. Although routinely screened through fluorescence in situ hybridization assays, such testing only allows the interrogation of single-gene regions or known fusion partners. Comprehensive assessment of DNAJs present across the entire genome can only be determined from whole-genome sequencing. Structural variance analysis from whole-genome paired-end sequencing data is, however, frequently restricted to copy number changes without DNAJ detection. Through optimized
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To investigate paraffin section thickness in immunohistochemical detection of p16 expression in cervical tissue samples.
METHODS: p16 immunohistochemical staining was performed in 150 cases of chronic cervicitis, 126 cases of low-grade squamous intraepithelial lesions(LSIL), 96 cases of high-grade squamous intraepithelial lesions (HSIL) and 78 cases of cervical cancer from January 2014 to March 2018 in Zhongshan Boai Hospital. The results of p16 protein expression in paraffin sections with thickness of 2, 3, 4, 5 and 6 μm were compared using Logistic regression analysis.
RESULTS: …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nucleic acid amplification techniques (NATs), such as PCR, are highly sensitive and specific methods that have become valuable supplements to culture and serology in the diagnosis of infectious disorders. However, especially when using formalin-fixed and paraffin-embedded tissue, these techniques are associated with both false-negative and false-positive results, a pitfall that is frequently misjudged. Representatives of the German Society of Hygiene and Microbiology (DGHM) and the German Society of Dermatology (DDG) therefore set out to develop a consensus - in the form of a review article - …
Consensus StatementСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carpal tunnel syndrome (CTS) is the most frequently diagnosed neuropathy of upper extremity entrapment neuropathies. We aimed to investigate the effectiveness of paraffin therapy in patients with CTS. Seventy patients diagnosed with mild or moderate CTS were randomly divided into two groups as splint treatment (during the night and day time as much as possible for 3 weeks) alone and splint (during the night and day time as much as possible for 3 weeks) + paraffin treatment (five consecutive days a week for 3 weeks). Clinical and electrophysiological assessments were performed before and 3 week…
СтатьяРандомизированное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proteomics, the large-scale analysis of proteins, is a rapidly evolving field with an increasing number of key clinical applications, such as diagnosis, prognosis, and classification. In order to generate complete protein expression profiles, or protein atlases, any crude sample format must be addressable in a rapid, multiplex, and sensitive manner. A common and clinically central sample format, formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tissue material, holds great potential as a source for disease-associated biomarker signatures. However, despite major efforts, extraction and subsequent profil…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Follicular lymphoma is associated with the t(14;18) translocation, which is one of the most common chromosomal translocations in cancer. Generally, tissues from such patients are preserved as formalin-fixed and paraffin-embedded samples. Most of the time, retrieving the molecular information from such samples is hampered due to quality of preservation, extraction procedures and reaction conditions. In the present study, we isolate the chromosomal DNA from the paraffin-embedded nodal tissues of lymphoma patients and use a highly sensitive nested PCR approach to detect t(14;18) translocation. Ou…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Journal of oral pathology & medicine : official publication of the International Association of Oral Pathologists and the American Academy of Oral Pathology2007eng
BACKGROUND: Although human papillomavirus (HPV) infection has been shown to be a significant carcinogen in cervical squamous cell carcinoma (SCC), its significance in oral SCC remains unclear.
METHODS: We developed highly sensitive detection methods for HPV to elucidate the prevalence and localization of HPV in paraffin sections from human oral SCC using modified in situ polymerase chain reaction (PCR) and in situ hybridization AT tailing (ISH-AT). Analyses revealed a high prevalence of several HPV types (HPV-16, -18, -22, -38 and -70) under optimal conditions. The ISH-AT method can be used a…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования