Fleas are among the most prevalent hematophagous ectoparasites found on mammals and have the ability to spread various pathogens. This study presents the first sequencing and analysis of the mitochondrial genomes of Palaeopsylla remota and Frontopsylla elata elata, alongside a comparative examination using mitochondrial genomic data from other flea species. Multiple aspects were investigated, including nucleotide composition, tRNA secondary structures, codon usage bias, nucleotide diversity, selective pressure, phylogenetic relationships, and divergence time estimation. Both species possess a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cytomegalovirus (CMV) poses significant risks to infants and immunocompromised individuals. This study investigated the prevalence, associated risk factors, and phylogenetic profile of CMV DNA in the breast milk of lactating mothers in Khyber Pakhtunkhwa (KP), Pakistan. Breast milk samples (n = 406) were collected from mothers across four districts. Demographic factors were recorded, and CMV DNA was detected by conventional and nested PCR targeting the UL71 gene. Sanger sequencing was performed on the UL71 amplicons, and phylogenetic analysis was carried out using MEGA 7. CMV DNA was detected
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plague has an enigmatic history as a zoonotic pathogen. This infectious disease will unexpectedly appear in human populations and disappear just as suddenly. As a result, a long-standing line of inquiry has been to estimate when and where plague appeared in the past. However, there have been significant disparities between phylogenetic studies of the causative bacterium, Yersinia pestis, regarding the timing and geographic origins of its reemergence. Here, we curate and contextualize an updated phylogeny of Y. pestis using 601 genome sequences sampled globally. Through a detailed Bayesian eval
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alignment-free methods for sequence comparison and phylogeny inference have attracted a great deal of attention in recent years. Several algorithms have been implemented in diverse software packages. Despite the great number of existing methods, most of them are based on word statistics. Although they propose different filtering and weighting strategies and explore different metrics, their performance may be limited by the phylogenetic signal preserved in these words. Herein, we present a different approach based on the species-specific amino acid neighborhood preferences. These differential p
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genus Aedes (Diptera: Culicidae) includes species of great epidemiological relevance, particularly involved in transmission cycles of leading arboviruses in the Brazilian Amazon region, such as the Zika virus (ZIKV), Dengue virus (DENV), Yellow fever virus (YFV), and Chikungunya virus (CHIKV). We report here the first putatively complete sequencing of the mitochondrial genomes of Brazilian populations of the species Aedes albopictus, Aedes scapularis and Aedes serratus. The sequences obtained showed an average length of 14,947 bp, comprising 37 functional subunits, typical in animal mitoch
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bats are hosts for a variety of microorganisms, however, little is known about the presence of Chlamydiales and hemotropic mycoplasmas. This study investigated 475 captive and free-living bats from Switzerland, Germany, and Costa Rica for Chlamydiales and hemotropic mycoplasmas by PCR to determine the prevalence and phylogeny of these organisms.
RESULTS: Screening for Chlamydiales resulted in a total prevalence of 31.4%. Positive samples originated from captive and free-living bats from all three countries. Sequencing of 15 samples allowed the detection of two phylogenetically dis
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastric juice is a unique combination of hydrochloric acid (HCl), lipase, and pepsin. Acidic gastric juice is found in all vertebrates, and its main function is to inactivate microorganisms. The phylogenetic preservation of this energy-consuming and, at times, hazardous function (acid-related diseases) reflects its biological importance. Proton pump inhibitors (PPIs) are one of the most widely used drugs in the world. Due to the reduced prevalence of Helicobacter pylori infection as well as the increased use of inhibitors of gastric acid secretion, the latter has become the most important caus
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although Newcastle disease virus (NDV) has a worldwide distribution, some NDV genotypes have more regional geographical ranges within continents. In this study, we isolated a subgenotype XIIb NDV strain, Goose/CH/GD/E115/2017 (E115), from geese in Guangdong province, Southern China, in 2017. Phylogenetic analysis showed that E115 and six other NDVs from geese in China were grouped under subgenotype XIIb and were distinct from subgenotype XIIa, isolated from chickens in South Africa, and subgenotype XIId, isolated from chickens in Vietnam. To better understand the pathogenicity and transmission
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Order Cyclophyllidea (of cestode platyhelminths) has a rich diversity of parasites and includes many families and species that are known to cause serious medical condition in humans and domestic and wild animals. Despite various attempts to resolve phylogenetic relationships at the inter-family level, uncertainty remains. In order to add resolution to the existing phylogeny of the order, we generated partial mtCO1 sequences for some commonly occurring cyclophyllidean cestodes and combined them with available sequences from GenBank. Phylogeny was inferred taking a total 83 representative specie
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The patterns of parasite sharing among hosts have important implications for ecosystem structure and functioning, and are influenced by several ecological and evolutionary factors associated with both hosts and parasites. Here we evaluated the influence of fish diet and phylogenetic relatedness on the pattern of infection by parasites with contrasting life history strategies in a freshwater ecosystem of key ecological importance in South America. The studied network of interactions included 52 fish species, which consumed 58 food types and were infected with 303 parasite taxa. Our results show
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pterygospinous and pterygoalar ligaments present at the cranial base may sometimes get ossified leading to the formation of complete or incomplete bony bars in relation to foramen ovale. These are of clinical importance because these may obliterate the foramen ovale causing mandibular neuralgia. They may cause trouble in performing thermocoagulation and anaesthesia for trigeminal neuralgia. They may pose surgical difficulty in approaching the retro and parapharyngeal spaces and hence the anatomy of these bony bars is very important.
MATERIALS AND METHODS: The present study was con
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Horizontal gene transfer plays a crucial role in microbial evolution. While much is known about the mechanisms that determine whether physical DNA can be transferred into a new host, the factors determining the utility of the transferred genes are less clear. We have explored this issue using dichloromethane consumption in Methylobacterium strains. Methylobacterium extorquens DM4 expresses a dichloromethane dehalogenase (DcmA) that has been acquired through horizontal gene transfer and allows the strain to grow on dichloromethane as the sole carbon and energy source. We transferred the dcmA ge
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The discovery of Borrelia species that were related to the agents of relapsing fever but were transmitted by hard ticks rather than soft ticks challenged previous taxonomies based largely on microbe-host specificities and geographic considerations. One of these newly-identified organisms is the Borrelia miyamotoi sensu lato strain LB-2001 from North America and transmitted by Ixodes scapularis. This or related strains have been identified as the cause of human disease, but comparatively little is known about their biology or genetics. Using recently acquired chromosome sequence of LB-2001 toge
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Baurusuchidae is a group of extinct Crocodyliformes with peculiar, dog-faced skulls, hypertrophied canines, and terrestrial, cursorial limb morphologies. Their importance for crocodyliform evolution and biogeography is widely recognized, and many new taxa have been recently described. In most phylogenetic analyses of Mesoeucrocodylia, the entire clade is represented only by Baurusuchus pachecoi, and no work has attempted to study the internal relationships of the group or diagnose the clade and its members.
METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: Based on a nearly complete skull and a ref
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Saksenaea is a monotypic genus belonging to the order Mucorales and capable of producing severe human infections. Through a polyphasic study based on analysis of the sequences of the internal transcribed spacer (ITS) region, domains D1 and D2 of the 28S rRNA gene, and the elongation factor 1α (EF-1α) gene, as well as by evaluation of relevant morphological and physiological characteristics of a set of clinical and environmental strains, we have demonstrated that Saksenaea vasiformis is a complex of species. We propose as new species Saksenaea oblongispora, characterized by oblong sporangiospor
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The nucleotide sequence of the complete mitochondrial DNA (mtDNA) molecule of the salt-water crocodile (Crocodylus porosus) was determined in this article. The molecule is 16,917 base pairs (bp) in length, and codes for 22 tRNAs, 13 protein-coding genes, 2 rRNAs, as well as a control region (D-loop), as is characteristic for mitochondrial genomes of other metazoans. The gene order conforms to that of other crocodilians sequenced, but the arrangement of some tRNA genes differs from other vertebrates. It shows that the gene order of crocodilians is remarkably conserved. In this study, the relati
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A database search identified a rat cDNA clone which phylogenetic analysis revealed to encode a cathelicidin most similar to mouse cathelicidin CRAMP. The analysis also showed that the evolutionary pattern of the cathelicidin family is lineage specific. The rat cathelicidin is called rCRAMP. Its peptide was isolated from granulocytes, and determined to be 43 amino acids long by mass spectrometry and N-terminal sequencing. Synthetic rCRAMP had antimicrobial activity. The expression of rCRAMP was investigated by reverse-transcriptase polymerase chain reaction followed by Southern hybridization an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Eleven species of Rhodnius and one of Psammolestes were compared by DNA sequence analysis of fragments of the mitochondrial large subunit ribosomal RNA (mtlsurRNA), the mitochondrial cytochrome b (mtCytb), and the D2 variable region of the 28S nuclear RNA (D2), totaling 1,429 base pairs. The inferred phylogeny, using Triatoma infestans as an outgroup, revealed two main clades within the Rhodniini--one, including the prolixus group of species (Rhodnius prolixus, Rhodnius robustus, Rhodnius neglectus, and Rhodnius nasutus) together with Rhodnius domesticus and Rhodnius neivai, and the other comp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The phylogenetic relationships of all seven known species of Cecidophyopsis mites (Acari: Eriophyidae) with Ribes hosts have been inferred from ribosomal DNA sequences. This analysis found groups of closely related mites. The five gall-forming species, four of which are monophagous and one which has two hosts, were found in two groups. Another group consisted of the two non gall-forming species, one of which has two hosts, while the other is monophagous. The molecular phylogeny of their known Ribes host plants was calculated using the equivalent ribosomal regions as the mites. The structure of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Yellow fever was presumably imported to the Americas from West-Africa from the 16th to the 19th century. American and African genotypes of the virus are distinguishable, indicating separate evolution in different vector/host cycles. The complete nucleotide sequence of the yellow fever virus strain TRINID79A, isolated in Trinidad in 1979, has been established. It exhibits extensive homology with those of current West-African strains and attenuated strain FNV. However, a unique deletion of the 3' non-coding region (NCR) of the viral RNA has been identified. It indicates that RYF1 and RYF2 repeat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования