Salmonella Typhimurium is a food-borne pathogen that causes salmonellosis. When in contact with the host, neutrophils are rapidly recruited to act as first line of defense. To better understand the pathogenesis of this infection, we used an in vitro model of neutrophil infection to perform dual RNA-sequencing (both host and pathogen). In addition, and given that many pathogens interfere with kinase-mediated phosphorylation in host signaling, we performed a phosphoproteomic analysis. The immune response was overall diminished in infected neutrophils, mainly JAK/STAT and toll-like receptor signa
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Under stress conditions, polyamines decreased the permeability of the outer membrane of Escherichia coli. This effect is caused by at least three mechanisms providing for an increase in the resistance to antibiotics transported through porin channels (fluoroquinolones, beta-lactams): a positive modulation of the gene micF transcription (its product antisense RNA inhibits the synthesis of porin proteins on the translational level); a positive effect on the cell content of the multiple stress resistance factor sigma(S) (it is accompanied by a decrease in the porin transport because of suppressio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although vitamin D is critical for the function of the intestine, most studies have focused on the duodenum. We show that transgenic expression of the vitamin D receptor (VDR) only in the distal intestine of VDR null mice (KO/TG mice) results in the normalization of serum calcium and rescue of rickets. Although it had been suggested that calcium transport in the distal intestine involves a paracellular process, we found that the 1,25-dihydroxyvitamin D3 [1,25(OH)2D3]-activated genes in the proximal intestine associated with active calcium transport (Trpv6, S100g, and Atp2b1) are also induced b
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Emtricitabine (FTC) is a first-line antiviral drug recommended for the treatment of AIDS during pregnancy. We hypothesized that transporters located in the placenta contribute to FTC transfer across the blood-placenta barrier. BeWo cells, cell models with stable or transient expression of transporter genes, primary human trophoblast cells (PHTCs), and small interfering RNAs (siRNAs) were applied to demonstrate which transporters were involved. FTC accumulation in BeWo cells was reduced markedly by inhibitors of equilibrative nucleoside transporters (ENTs), concentrative nucleoside transporters
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neoadjuvant chemotherapy (NAT) is increasingly used in the treatment of pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC). However, the actual molecular impact of NAT on the tumor remains unknown, particularly on the cancer-associated fibroblasts (CAFs) remains largely unknown. Here, mass-spectrometry (MS)-based proteomic profiling of primary CAFs derived from treatment-naïve (TN) and NAT-treated resected PDAC (n = 10 in each group) was conducted to explore potential NAT-associated changes. Differentially abundant proteins (DAPs; p < 0.05) in NAT versus TN CAFs accounted for 10.6% of all 5438 proteins m
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The syncytiotrophoblast (STB) is a multinucleated cell layer that forms the outer surface of human chorionic villi. Its unusual structure, with billions of nuclei in a single cell, makes it difficult to resolve using conventional single-cell methods. To better understand STB differentiation, we performed single-nucleus and single-cell RNA sequencing on placental tissue and trophoblast organoids (TOs). Single-nucleus RNA-seq was essential for capturing STB populations, revealing three nuclear subtypes: a juvenile subtype co-expressing CTB and STB markers, one enriched in oxygen sensing genes, a
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The current study established the first in vitro Encorafenib resistance protocol in BRAF-mutated malignant melanoma (MM) cells and investigated the resistance-related mechanisms. After establishing Encorafenib-resistant A375-MM cells, resistant-related mechanisms were investigated using WST-1, Annexin V, cell cycle, morphological analysis, live-cell, Western blot, RNA-Seq, transmission electron microscopy-(TEM), oxidative stress and iron colorimetric assay. The most resistant group, called A375-R, was determined in the cells treated with a constant dose of 10 nM over 3 months. The viability, a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fatty acid-binding protein 7 (FABP7) is vital for uptake and trafficking of fatty acids in the nervous system. To investigate the involvement of FABP7 in noise-induced hearing loss (NIHL) pathogenesis, we used Fabp7 knockout (KO) mice generated via CRISPR/Cas9 in the C57BL/6 background. Initial auditory brainstem response (ABR) measurements were conducted at 9 weeks, followed by noise exposure at 10 weeks. Subsequent ABRs were performed 24 h later, with final measurements at 12 weeks. Inner ears were harvested 24 h after noise exposure for RNA sequencing and metabolic analyses. We found no sig
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis C virus (HCV) exploits an extensive network of host proteins to maintain chronic infection. Using RNA-Seq technology, we identified 30 host genes that were differentially expressed in cell culture grown HCV (HCVcc)-infected cells. Of these candidate genes, we selected solute carrier family 3 member 2 (SLC3A2) for further investigation. SLC3A2, also known as CD98hc, is a member of the solute carrier family and encodes a subunit of heterodimeric amino acid transporter. SLC3A2 and LAT1 constitute a heterodimeric transmembrane protein complex that catalyzes amino acid transport. In this
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA methylation represents the most abundant post-transcriptional modification in RNA and has recently emerged as a central topic in molecular biology. It precisely regulates various biological functions by influencing key processes like RNA splicing, translation, transport, and stability. Pancreatic cancer remains one of the most aggressive and lethal malignancies, with its high mortality largely attributed to late diagnosis and limited therapeutic options. Recent research has shown that RNA methylation is intimately linked to tumor immunity and is vital in forming the tumor microenvironment
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The hexanucleotide repeat expansion GGGGCC (G4C2)n in the C9orf72 gene is the most common genetic abnormality associated with amyotrophic lateral sclerosis (ALS) and frontotemporal dementia (FTD). Recent findings suggest that dysfunction of nuclear-cytoplasmic trafficking could affect the transport of RNA binding proteins in C9orf72 ALS/FTD. Here, we provide evidence that the RNA editing enzyme adenosine deaminase acting on RNA 2 (ADAR2) is mislocalized in C9orf72 repeat expansion mediated ALS/FTD. ADAR2 is responsible for adenosine (A) to inosine (I) editing of double-stranded RNA, and its fu
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human patients carrying genetic mutations in RNA binding motif 20 (RBM20) develop a clinically aggressive dilated cardiomyopathy (DCM). Genetic mutation knockin (KI) animal models imply that altered function of the arginine-serine-rich (RS) domain is crucial for severe DCM. To test this hypothesis, we generated an RS domain deletion mouse model (Rbm20ΔRS). We showed that Rbm20ΔRS mice manifested DCM with mis-splicing of RBM20 target transcripts. We found that RBM20 was mis-localized to the sarcoplasm in Rbm20ΔRS mouse hearts and formed RBM20 granules similar to those detected in mutation KI an
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The primary focus of our research was to obtain global gene expression data in baker's yeast exposed to sub-lethal doses of quantum dots (QDs), such as green-emitting CdSe/ZnS and InP/ZnS, to reveal novel insights on their unique mechanisms of toxicity. Despite their promising applications, their toxicity and long-lasting effects on the environment are not well understood. To assess toxicity, we conducted cell viability assays, ROS detection assays, and assessed their effects on the trafficking of Vps10-GFP toward the trans-Golgi network with confocal microscopy. Most notably, we used RNA-sequ
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tau-directed therapies can achieve biochemical target engagement without delivering consistent clinical benefit, suggesting that a key bottleneck in tauopathy development lies not only in target access, but in whether tau engagement leads to measurable recovery of disease-relevant cellular states. Recent studies increasingly link tau-associated dysfunction to RNA abnormalities in surveillance, compartmentalization and stress responses. These findings position RNA quality control as both a downstream consequence of tau pathology and a co-development layer, with potential therapeutic relevance i
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis B virus (HBV) remains a major global health challenge, with over 296 million people chronically infected worldwide. Despite the availability of antiviral therapies, a functional cure is rarely achieved, highlighting the need for novel therapeutic strategies. RNA 5-methylcytosine (m5C) is a pivotal epitranscriptomic mark implicated in RNA stability, transport, and translation. Emerging evidence shows that m5C is conserved within HBV RNA and plays critical roles in the viral life cycle. This review provides a comprehensive overview of the molecular mechanisms governing m5C deposition a
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antisense oligonucleotide (ASO) therapeutics silence gene expression through RNase H-mediated mRNA degradation or steric blockade, yet their clinical efficacy is limited by inefficient intracellular trafficking, with <1% of internalized ASOs escaping endosomes to access target RNA. A deeper understanding of the cellular mechanisms governing ASO trafficking and activity is therefore critical. Here, we identify the endosomal sorting complex required for transport-I (ESCRT-I) as a previously unrecognized regulator of ASO pharmacological activity. Using human hepatocyte-derived cell models and FDA
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nepal is an endemic area for hepatitis E virus (HEV) epidemics. The research on viral hepatitis in Nepal is limited.
METHODS: Serum samples from 170 patients presenting with symptoms of hepatitis were collected from April to May 2014 in Biratnagar, Nepal, and then transported to Xiamen, China, for further evaluation. All samples were tested for HEV RNA, HEV antigen, anti-HEV IgM, anti-HEV IgG and anti-HBc IgM, anti-HCV IgG, and anti-HAV IgM.
RESULTS: Sixteen patients were identified as acute hepatitis E with the presence of ≥ 2 HEV acute phase markers (antigen, RNA, and anti-HEV
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polyglutamine diseases are rare, inherited neurodegenerative pathologies that arise as a result of expansion of trinucleotide CAG repeats in the coding segment of certain genes. This expansion leads to the appearance of mRNA with abnormally long repetitive CAG triplets (mCAG-RNA) and proteins with polyglutamine (PolyQ) tracts in the cells, which is why these pathologies are commonly termed polyglutamine diseases, or PolyQ diseases. To date, nine PolyQ diseases have been described: Huntington's disease, dentatorubral pallidoluysian atrophy (DRPLA), spinal and bulbar muscular atrophy (SBMA), and
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA biomarkers are vital for diagnosing infections, cancer, and neurodegenerative diseases. RT-qPCR is sensitive but complex and equipment-intensive, limiting point-of-care use. Herein, for the first time, an organic electrochemical transistor (OECT) biosensor is reported utilizing small molecules as recognition elements for rapid, ultrasensitive and amplification-free detection of RNA. The biosensor leverages "click chemistry" to precisely immobilize screened and chemically edited small molecules to the OECT gate, enabling efficient target RNA binding. To further enhance sensitivity and reduc
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Paracoccidioides brasiliensis and P. lutzii cause human paracoccidioidomycosis. We have previously characterized the <200-nt RNA sub-populations contained in fungal extracellular vesicles (EVs) from P. brasiliensis Pb18 and other pathogenic fungi. We have presently used the RNA-seq strategy to compare the <200- and >200-nt RNA fractions contained in EVs isolated from culture supernatants of P. brasiliensis Pb18, Pb3, and P. lutzii Pb01. Shared mRNA sequences were related to protein modification, translation, and DNA metabolism/biogenesis, while those related to transport and oxidation-reductio
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.