Gallbladder cancer (GBC) is the most common biliary tract neoplasm. Identifying biomarkers for GBC initiation and progression remains a challenge. This study aimed to identify GBC biomarkers using machine learning and bioinformatics. Differentially expressed genes (DEGs) were identified from two microarray datasets (GSE100363, GSE139682) from the GEO database. Gene Ontology and pathway analyses were performed using DAVID. A protein-protein interaction network was constructed using STRING, and hub genes were identified via three ranking algorithms (degree, MNC and closeness centrality). Feature
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein kinase membrane associated tyrosine/threonine 1 (PKMYT1) is a protein-coding gene associated with cell cycle regulation and cancer development, but its specific mechanism in prostate cancer (PCa) has not been clarified. This study sought to elucidate the role of PKMYT1 in PCa. Expression patterns, prognostic significance and potential mechanisms of PKMYT1 were explored by the TCGA database. Single-cell sequencing was performed using the GSE137829 dataset. Multi-database prediction identified potential transcription factors regulating PKMYT1 expression. PC3 cell line with PKMYT1 knockdo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vitamin A, E, and other vitamins have been demonstrated to potentially be used in the treatment of brain injury in preterm infants; however, whether all types of vitamins can be utilized for this purpose remains unclear. In this study, we systematically investigated the therapeutic mechanisms of vitamins in preterm infant brain injury using network pharmacology and molecular docking techniques. A total of 23 potential targets for four vitamin components against preterm infant brain injury were identified through public databases. Key genes mediating preterm infant brain injury were obtained vi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In humans, rheumatoid arthritis (RA) is a deadly autoimmune disease that affects bone health. Although the specific etiology of RA is unknown, scientific evidence suggests that smoking, genetic abnormalities, and environmental factors may all contribute to the disease's progression. We employed protein-protein interaction (PPI) networking analysis to identify a possible therapeutic target for RA. The lead-like molecule for the selected target was then found via virtual screening in the Indian medicinal plants phytochemistry and therapeutics database. Molecular dynamics has confirmed the stabil
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sarcopenia and type 2 diabetes mellitus (T2DM) are chronic conditions that gradually affect the elderly, often coexisting and interacting in complex ways. Sarcopenia, which is characterized by the progressive loss of muscle mass and function, is frequently observed in individuals with T2DM. Although the clinical association is well known, the molecular mechanisms remain unclear. Gene expression datasets were retrieved from the Gene Expression Omnibus database. DEGs were identified using the limma package in R (R 4.4.0). Shared DEGs were subjected to Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Gestational diabetes mellitus (GDM) is a pregnancy-related diabetic condition that may cause serious complications. However, its pathogenesis remains unclear. Placental damage due to GDM may lead to several health issues that cannot be ignored. Thus, we aimed to identify the mechanisms underlying GDM by screening differentially expressed genes (DEGs) related to vascular endothelial cells in the GDM databases and verify the expression of these DEGs in the placentas of women afflicted by GDM. Methods: We used GDM microarray datasets integrated from the Gene Expression Omnibus (GEO) d
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptococcus suis (S. suis) is a Gram-positive bacterium and the main culprit behind zoonotic outbreaks, posing a serious threat to public health. The prevalent strains in China are mainly of sequence types (ST) 1 and 7, with few cases of human infections caused by other sequence type being reported. This study presents the first isolation of a ST25 strain from the blood of a septicemic patient. A 57-year-old febrile patient was admitted to a hospital in Hainan of China, diagnosed as septicemia and hepatic dysfunction. A strain of S. suis was isolated from blood culture and confirmed to be se
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diabetic foot ulcer (DFU) and peripheral artery disease (PAD) are common diseases that seriously affect the quality of life and bring a huge economic burden to society. Although mounting evidence supports a close link between the two disorders, the mechanisms of comorbidity remain to be fully elucidated.
METHODS: The gene expression profiles of DFU (GSE80178) and PAD (GSE100927) were downloaded from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) performed pathway enrichment analysis for common differentially expres
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiple morphological abnormalities of the sperm flagellum (MMAF) have been reported to be an important cause of male infertility and reflect a heterogeneous genetic disorder. Previous studies have identified dozens of candidate pathogenic genes for MMAF, but the aetiology in approximately 50% of cases remains unexplained. The present study aimed to identify novel potentially pathogenic gene variants of MMAF. A Chinese family with a 32-year-old infertile proband presenting with MMAF was recruited, and sperm morphology of the patient was examined by Papanicolaou staining. Whole exome sequencin
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mycobacteroides abscessus complex (MABC), an emerging pathogen, causes human infections resistant to multiple antibiotics. In this study, the genome data of 1,581 MABC strains were downloaded from NCBI database for phylogenetic relatedness inference, resistance profile identification and the estimation of evolutionary pressure on resistance genes in silico.
RESULTS: From genes associated with resistance to 28 antibiotic classes, 395 putative proteins (ARPs) were identified, based on the information in two antibiotic resistance databases (CARD and ARG-ANNOT). The ARPs most frequent
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Crim1 has been implicated in cataracts in mice and is of great importance in the development of the eye in both humans and mice. Therefore, we aimed to clarify how Crim1 mutations affect lens development and the molecular mechanism of cataracts in mice through comprehensive bioinformatics analysis. The microarray chip was downloaded from the GEO database to obtain the gene expression profile data set. Differentially expressed genes (DEGs) were screened using the limma package. GO and KEGG analyses of DEGs were performed using the DAVID database. Then, we established the protein-protein interac
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Monocytes are closely associated with tuberculosis (TB). Latent tuberculosis in some patients gradually develops into its active state. This study aimed to investigate the role of hub monocyte-associated genes in distinguishing latent TB infection (LTBI) from active TB. The gene expression profiles of 15 peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) samples were downloaded from the gene expression omnibus (GEO) database, GSE54992. The monocyte abundance was high in active TB as evaluated by the Cell-type Identification by Estimating Relative Subsets of RNA Transcripts (CIBERSORT) algorithm. The l
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Interstitial cystitis (IC)/bladder pain syndrome (BPS) is a chronic inflammatory disease that can cause bladder pain and accompanying symptoms, such as long-term urinary frequency and urgency. IC/BPS can be ulcerative or non-ulcerative. The aim of this study was to explore the core genes involved in the pathogenesis of ulcerative IC, and thus the potential biomarkers for clinical treatment.
MATERIALS AND METHODS: First, the gene expression dataset GSE11783 was downloaded using the Gene Expression Omnibus (GEO) database and analyzed using the limma package in R to identify different
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Discoid lupus erythematosus (DLE) is the most common skin manifestation of lupus; however, the molecular mechanisms underlying DLE remain unknown. Therefore, we aimed to identify key differentially expressed genes (DEGs) in discoid lupus skin and investigate their potential pathways.To identify candidate genes involved in the occurrence and development of the disease, we downloaded the microarray datasets GSE52471 and GSE72535 from the Gene Expression Database (GEO). DEGs between discoid lupus skin and normal controls were selected using the GEO2R tool and Venn diagram software (http://bioinfo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Currently, Chlamydia trachomatis-specific host defense mechanisms in humans remain poorly defined. To study the characteristics of host cells infected early with Chlamydia trachomatis, we used bioinformatics methods to analyze the RNA transcription profiles of the conjunctiva, fallopian tubes, and endometrium in humans infected with Chlamydia trachomatis.
METHOD: The gene expression profiles of GSE20430, GSE20436, GSE26692, and GSE41075 were downloaded from the Gene Expression Synthesis (GEO) database. Then, we obtained the differentially expressed genes (DEGs) through the R 4.0.1
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The loss of major histocompatibility complex class I (MHC I) molecules is an important mechanism by which cancer cells escape immunosurveillance in head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC). Several long non-coding RNAs (lncRNAs) have been implicated in immune response and regulation including antigen processing and presentation. However, few studies on lncRNAs regulating MHC I expression in HNSCC have been conducted. In this study, MHC I related lncRNAs were identified from the The Cancer Genome Atlas (TCGA) HNSCC database. One of the lncRNAs, long intergenic non-protein coding RNA 2195 (
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The intraflagellar transport protein 140 homolog (IFT140) is involved in the process of intraflagellar transport (IFT), a process that is essential for the formation and maintenance of most eukaryotic cilia and flagella. Variants IFT140 have been reported to account for ciliopathy but association with male fertility has never been described in humans. Here we report the identification of two novel variants of IFT140 which caused spermatogenic dysfunction and male infertility.
METHODS: Whole-exome sequencing was performed in a 27-year-old infertile man presented with severe oligozo
Клинический случайКлиническое исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Peripheral nerve injury (PNI) has devastating consequences. Dorsal root ganglion as a pivotal locus participates in the process of neuropathic pain and nerve regeneration. In recent years, gene sequencing technology has seen rapid rise in the biomedicine field. So, we attempt to gain insight into in the mechanism of neuropathic pain and nerve regeneration in the transcriptional level and to explore novel genes through bioinformatics analysis. Methods: The gene expression profiles of GSE96051 were downloaded from GEO database. The gene ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes a
СтатьяКомментарийПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Snake venoms are complex mixtures mainly composed of proteins and small peptides. Crotoxin is one of the most studied components from Crotalus venoms, but many other components are less known due to their low abundance. The venome of Crotalus durissus terrificus, the most lethal Brazilian snake, was investigated by combining its venom gland transcriptome and proteome to create a holistic database of venom compounds unraveling novel toxins. We constructed a cDNA library from C. d. terrificus venom gland using the Illumina platform and investigated its venom proteome through high resolution liqu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The rarity of acute liver failure, along with its severity and heterogeneity, has resulted in a very limited evidence to understand of the molecular mechanism. To analyze the differentially expressed genes (DEGs) in the Hepatitis B Virus -Associated Acute Liver Failure and elucidate the biological significance of the DEGs.
METHODS: Firstly, differentially expressed genes (DEGs) between seventeen HBV-associated acute liver failure liver samples and ten control normal liver samples were identified by R package. Then, the enriched GO terms and KEGG pathways of those DEGs were obtaine
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования