Dietary restriction (DR) increases lifespan in a range of evolutionarily distinct species. The polyphenol resveratrol may be a dietary mimetic of some effects of DR. The pivotal role of the mammalian histone deacetylase (HDAC) Sirt1, and its homologue in other organisms, in mediating the effects of both DR and resveratrol on lifespan/ageing suggests it may be the common conduit through which these dietary interventions influence ageing. We propose the novel hypothesis that effects of DR relevant to lifespan extension include maintenance of DNA methylation patterns through Sirt1-mediated epigen
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Systemic lupus erythematosus (SLE) is a chronic autoimmune condition with alternating phases of heightened symptoms and periods of disease inactivity. Our investigation focuses on the distinct molecular profiles of resting naive B cells from both active and inactive SLE states in female adults, primarily of Black ancestry. We identified a distinct transcriptome and epigenome during inactive SLE. Transcriptional patterns indicated an increase in distinct cytokine signaling pathway expression in SLE B cells, encompassing both common and disease activity-specific components. Specifically, while b
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A gene is essential if its loss of function results in lethality, reduced fitness, or disease. Essential genes have attracted increasing attention due to their vital functions in biological systems. Many efforts have been made to find essential protein-coding genes. In complex organisms, the majority of the genome does not encode proteins. Noncoding genes play vital roles in many biological processes. Investigating the essentiality of noncoding genes is necessary. We present ELE (estimating long noncoding RNA essentiality), the first computational model for finding essential long noncoding RNA
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Conventional CD8+ T cells can acquire natural killer (NK) cell receptors upon persistent antigen exposure, forming antigen-experienced NK-T (AENK-T) cells. Their dual-state plasticity within the tumor immune microenvironment determines cancer immunotherapy outcomes. This narrative review synthesizes recent transcriptomic, epigenomic, and functional data to define the trajectory, regulation, and therapeutic relevance of AENK-T cells. The analysis establishes a "temporal hierarchy" differentiating AENK-T cells from innate-like T cells: activating NK receptors (NKG2C, NKG2D) emerge early, while i
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dysregulated protein modifications alter the stability and activation status of key regulatory proteins and contribute to tumorigenesis. RING finger (RNF) proteins as E3 ubiquitin ligases, play fundamental roles in diverse biological processes, including cancer cell stemness. Through cancer epigenomic profiling, we identify tumor-specific promoter CpG methylation of the E3 ligase RINES across multiple common cancer types (esophageal, nasopharyngeal, colorectal, breast, lung, kidney, cervical, and liver), in addition to previously reported gastric cancer, which correlates with poor patient surv
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Childhood obesity is a prevalent public health concern, particularly among children from marginalized backgrounds. Epigenomic mechanisms, including DNA methylation (DNAm), offer insight into the biological embedding of metabolic risk, yet protective family-level factors remain understudied. This study examined whether participation in a positive parenting intervention was associated with reduced epigenetic cardiometabolic risk among preschool-aged children.
METHODS: Participants were 74 children (n = 35 intervention; n = 39 services-as-usual; mean age = 36 months). Using a seconda
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Triple-negative breast cancer (TNBC) is a major cause of cancer mortality, with distant metastases, particularly to the lungs, presenting a significant clinical challenge. While epigenetic mechanisms like DNA methylation (DNAm) are known to influence TNBC progression, their association with lung metastasis remains underexplored. To address this gap, we analyze epigenomic and transcriptomic profiles from TNBC cells, xenograft models, and patient cohorts. DNAm profiling of primary tumors, lymph nodes, and lung metastases in our xenograft model reveals significant genome-wide hypomethylation in l
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mutualistic association between plants and their seed-associated microbiota has emerged as a key determinant of crop productivity, influencing plant nutrition, immunity, and tolerance to abiotic stress. Seed biopriming, the controlled application of beneficial microorganisms to seeds before sowing, exploits this interaction to enhance germination, seedling establishment, and stress resilience. Unlike conventional chemical priming, seed biopriming induces coordinated molecular reprogramming through changes in the seed metabolome, proteome, and epigenome. This review synthesizes current evid
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The retina is a complex sensory neural tissue composed of six major types of neurons and one type of glial cell. The cell fate specification of retinal cells is tightly governed by intrinsic factors and extrinsic microenvironmental cues. Among the key regulators directing retinal cell fate differentiation is a group of bHLH family transcription factors (TFs). Our previous work demonstrated that the bHLH TF Ngn3 exhibits robust potential to induce retinogenesis in both distantly related fibroblasts in vitro and late retinal progenitor cells (RPCs) in vivo. However, the underlying molecular mech
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chimeric antigen receptor (CAR) T-cell therapy has transformed hematological cancer care, yet variability in efficacy, durability, and safety cannot be explained solely by antigen selection or patient factors. We propose that manufacturing platforms are active biological determinants of outcome. Viral vectors, used in all licensed products, provide stable genomic integration and durable expression but are limited by cost, cargo capacity, and centralized production. Nonviral strategies, including transposons, CRISPR knock-ins, and messenger RNA delivery, enable faster, less-expensive manufactur
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Integrating single-cell transcriptomic and epigenomic data provides a robust framework for investigating gene regulation mechanisms. Existing analyses typically treat these modalities as synchronized features that can be translated in a static manner; however, the temporal delays that underpin cellular kinetics are intrinsic to dynamic biological systems. To address this limitation, we propose utilizing the "molecular asynchrony" within regulatory hierarchies to determine the thermodynamic properties of individual cells. Here, we present SeqTag, a single-cell multiomics sequencing method that
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rotavirus (RV) infection is a leading cause of gastroenteritis in children under five, often causing severe dehydration and hospitalization. The genetic factors influencing host susceptibility to severe RV infection remain poorly understood. We conducted whole-exome sequencing (WES) in children with severe RV infection and compared their profiles to those of healthy controls. Analyses identified seven candidate Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) across distinct genes, several of which are functionally linked to gastrointestinal cancer pathways. Transcriptomic data from acutely infected pat
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic inflammation is a well-established risk factor for cancer, but the underlying molecular mechanisms remain unclear1,2. Using a mouse model of colitis, we demonstrate that colonic stem cells retain an epigenetic memory of inflammation following disease resolution that persists for more than 100 days. Here we find that memory of colitis is characterized by a cumulative gain of activator protein 1 (AP-1) transcription factor activity, with durable changes to chromatin accessibility. Further, we develop SHARE-TRACE, a method that enables simultaneous profiling of gene expression, chromatin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic abnormalities cause cancer, a heterogeneous disease. These abnormalities comprise unregulated proliferation, invasion, and metastasis. Transcriptional factors are altered by dysregulation, like DNA methylation, histone modifications, and chromatin remodeling, during tumor formation, progression, and resistance to therapy. These can be reversed and transmitted to subsequent generations. Consequently, tumor suppressor genes can be deactivated without altering DNA sequences. Epigenetic markers have been detected in carcinomas, sarcomas, hematological malignancies, and organ-specific tumor
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation at CpG dinucleotides represents a key epigenetic mechanism linking genetic variation to gene regulation in complex human diseases. Single-nucleotide polymorphisms (SNPs) that create or disrupt CpG sites can alter local DNA methylation and transcriptional activity, thereby influencing disease susceptibility. These CpG-modifying variants provide a functional interface between inherited genetic variation and epigenetic regulation in complex metabolic disorders. This review summarizes current evidence on SNP-derived CpG variation and its role in allele-specific DNA methylation and
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spatial omics technologies are providing new opportunities for plant biology by enabling molecular profiling within structurally intact tissues, revealing spatially organised cell states, developmental gradients, and regulatory interactions. While spatial transcriptomics has driven early advances, the field is rapidly expanding toward integrated spatial multi-omics by combining single-cell and spatial transcriptomic, epigenomic, proteomic, and metabolomic data. These approaches offer new opportunities to study development, physiology, and plant biotic and abiotic interactions in spatially pres
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: Gene expression prediction benefits from integrating DNA sequences and epigenomic signals. Existing approaches typically combine these modalities using simple operations such as concatenation or summation, without explicitly modeling fine-grained token-level cross-modal interactions. Establishing precise cross-modal correspondences remains challenging due to (1) inter-modal discrepancies, and (2) intra-modal structural preservation.
RESULTS: To address these challenges, we propose OrchAlign, an orchestrated multimodal alignment framework that establishes fine-grained cross-modal a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Beta human papillomaviruses (betaHPVs) act as cofactors in keratinocyte carcinogenesis, but how they reprogram host gene regulation remains unclear. Here, we combined transcriptomic, small RNA and epigenomic profiling to dissect the impact of betaHPV8 oncogene expression on keratinocytes. The viral E6 protein emerged as the major driver of host gene regulatory reprogramming, repressing epidermal differentiation programs, whereas E7 induced fewer, complementary changes. Small RNA sequencing revealed E6-dependent remodeling of the microRNA (miRNA) landscape, and integrative analyses linked miRNA
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Retrotransposons are major components of mammalian genomes, yet their genome-wide annotation and epigenetic regulation in cattle remain incompletely characterized. Here, we present a comprehensive annotation and integrative epigenomic analysis of major retrotransposon classes in the bovine genome, with emphasis on DNA methylation patterns and their potential roles in subclinical mastitis. Using a multi-step de novo pipeline, we identified and classified long interspersed nuclear elements (LINEs), short interspersed nuclear elements (SINEs), and endogenous retroviruses (ERVs) in the bovine refe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nuclear envelope (NE) proteins are essential for maintaining nuclear morphology, a central process controlling cellular phenotypes. While these proteins and structures are largely characterized in developmental biology, their function and associated abnormal nuclear morphology in disease, in particular cancer, remain elusive. We reported that throughout pancreatic transformation, oncogenic mutant KRAS (mKRAS) alters cancer cells nuclear size. Furthermore, we identified the NE protein Emerin as a mediator of these nuclear changes. Emerin's function is versatile and dynamic depending on its prot
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования