BACKGROUND: Gastric cancer (GC) is a highly aggressive malignancy with a poor prognosis, closely linked to the tumor microenvironment (TME). Emerging evidence highlights the critical role of gastric cancer-associated mesenchymal stem cells (GC-MSCs) in recruiting neutrophils and facilitating neutrophil extracellular traps (NETs) formation, thereby remodeling the tumor microenvironment (TME) and promoting tumor progression, immune modulation, and metastasis.
METHODS: This study integrated single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), Mendelian randomization (MR), and functional enrichment analyses t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The gut-skin axis represents a critical but poorly understood pathway in atopic dermatitis (AD) pathogenesis. This study aimed to establish causal relationships between gut microbiota and AD risk while identifying key molecular bridges and therapeutic targets. We integrated multiple analytical approaches, including single-cell RNA sequencing analysis of skin biopsies from five AD patients and four healthy controls, intercellular communication network analysis, pseudotime trajectory inference, reverse drug prediction, molecular docking, and molecular dynamics simulations. Analysis r
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic kidney disease (CKD) is the leading cause of mortality in aged cats. After injury, feline kidneys undergo extensive metabolic reprogramming, but a comprehensive evaluation is lacking. Here we show a multi-omics study including serum metabolomics from 14 healthy control, 15 early stages, 6 late stages CKD cats, and renal cortical and medullary tissue RNA sequencing and proteomics. The analysis reveals a spatiotemporal pattern of gene and protein expression changes. In the early stages, there are 6 differentially expressed genes in the cortex, while nearly 2000 in the medulla. The number
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The abnormal barrier function of the stratum corneum is a significant characteristic of surface-active agent-induced inflammatory skin diseases, and its cause is closely related to the abnormal lipid components of the stratum corneum. Total saponins of Panax notoginseng (TSPN) have significant potential in improving inflammatory skin barrier function. This study aims to investigate the barrier repair efficacy of TSPN using the EpiKutis® skin model and to explore the potential mechanisms through multi-omics analysis based on transcriptomics, proteomics, and lipid metabolomics. We found that TSP
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic prostatitis (CP) imposes a considerable global disease burden, with notable regional disparities in China and significant associated healthcare costs. Traditional classification systems, particularly type III subtypes, are hindered by high symptom heterogeneity and low treatment response rates. Recent advances in multi-omics approaches have elucidated the molecular mechanisms underlying CP, including genomic and epigenetic regulation, transcriptomic and immune microenvironment interactions, metabolomic and microbiome interplay, as well as proteomic and neural remodeling. Precision diag
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Polycystic ovary syndrome (PCOS) is a common endocrine disorders in women of reproductive age with limited targeted therapies. This study aimed to identify and prioritize potential druggable genes for PCOS through a purely computational, multi-omics approach. METHOD: We conducted an integrated in silico analysis leveraging publicly available datasets. A multi-omics Mendelian randomization (MR) framework was applied to 2,888 druggable genes. Our workflow incorporated two-sample MR for initial discovery of gene-PCOS associations with false discovery rate (FDR) correction, followed by
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spatial multi-omics technologies have revolutionized our understanding of biological systems by enabling simultaneous measurement of multiple molecular features while preserving spatial information. However, the effective integration and analysis of these complex datasets remain challenging. Here we introduce SpaOmicsVAE, a novel computational framework that combines variational autoencoder architecture with a dual graph neural network to address these challenges. The framework uniquely integrates spatial and feature information through an attention-based mechanism, effectively handling data s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Moyamoya disease (MMD) is a rare cerebrovascular disease in humans. Although early revascularization can improve symptoms, it cannot reverse the progression of the disease. The current diagnosis still relies on traditional a Digital Subtraction Angiography (DSA) examination, which is invasive and expensive, leading to delayed diagnosis and affecting treatment timing and patient prognosis. The ability to diagnose MMD early and develop personalized treatment plans can significantly improve the prognosis of patients. Here, we have introduced the research on MMD biomarkers. By integrating proteomi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diarrhea is common in infants, particularly children less than 2 years old. Intractable or protracted infancy diarrhea is typically associated with feeding intolerance and malabsorption that is lethal for newborns. The objective of this study is to explore the regulatory effects of baizhu shaoyao decoction (BSD) on the gut microbiota and associated metabolites in weaned piglets, thereby elucidating the mechanism by which BSD mitigates weaning stress in piglets. Piglets were allocated into five groups, with each group receiving designated medication for a continuous 14-day period: control, zaoh
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sanfilippo syndrome (mucopolysaccharidosis type III, MPSIII) causes childhood dementia, while Alzheimer's disease is the most common type of adult-onset dementia. There is no cure for either of these diseases, and therapeutic options are extremely limited. Increasing evidence suggests commonalities in the pathogenesis of these diseases. However, a direct molecular-level comparison of these diseases has never been performed. Here, we exploited the power of zebrafish reproduction (large families of siblings from single mating events raised together in consistent environments) to conduct sensitiv
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recent studies have demonstrated that prolonged sperm storage adversely affects offspring through epigenetics, yet its broader effects on other molecular levels such as transcription and proteomics in progeny have been rarely explored.
RESULTS: We employed comprehensive multi-omics approaches to uncover storage-induced epigenetic changes in sperm and their effects on embryonic development and offspring health. Sperm from common carp (Cyprinus carpio) was stored in vitro in artificial seminal plasma for 14 days, and the impacts of storage on functional properties of sperm and proge
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A significant subset of Neuromyelitis Optica Spectrum Disorder (NMOSD) cases occurs as a paraneoplastic syndrome, where an underlying tumor triggers a devastating autoimmune attack against the central nervous system. This autoimmune response is driven by pathogenic aquaporin-4 autoantibodies (AQP4-IgG), likely initiated by the tumor's expression of AQP4 in a phenomenon of molecular mimicry. Understanding the precise immune mechanisms that link a patient's cancer to their neurological disease is critical for early diagnosis of the occult malignancy and for improved patient outcomes. This review
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
В рамках этого исследования проводится всеобъемлющий многомерный анализ в рамках силико для изучения генетических и молекулярных механизмов множественного склероза (MS), с уделением особого внимания его психонейроиммунологической связи с путями, связанными со стрессом. Данные с высокой пропускной способностью из Gene Express Omnibus были сосредоточены на каллосуме Corpus, ключевом регионе в патологии MS. С использованием GEO2R были выявлены значительные дифференциально выраженные гены в MS, после чего был проведен анализ путей с помощью баз данных KEGG для выявления связанных с ними биологичес
СтатьяПоиск полного текста в очередиМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Appendiceal adenocarcinoma (AA) is unique from other gastrointestinal malignancies in that it almost exclusively metastasizes to the peritoneal cavity. However, few studies have investigated the molecular interaction of the peritoneal microenvironment and AA. Here, we use a multi-omics approach with orthotopic and flank-implanted patient-derived xenografts (PDX) to study the effect of the peritoneal microenvironment on AA. AA tumors implanted in the peritoneal microenvironment tended to grow faster and displayed greater nuclear expression of Ki-67 relative to the same tumors implan
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microcystin-LR (MC-LR) is a cyanobacterial metabolite produced during cyanobacterial blooms and is toxic to aquatic animals, and the liver is the main targeted organ of MC-LR. To comprehensively understand the toxicity mechanism of chronic exposure to environmental levels of MC-LR on the liver of fish, juvenile Nile tilapia were exposed to 0 μg/L (control), 1 μg/L (M1), 3 μg/L (M3), 10 μg/L (M10), and 30 μg/L (M30) MC-LR for 60 days. Then, the liver hepatotoxicity induced by MC-LR exposure was systematically evaluated via histological and biochemical determinations, and the underlying mechanis
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Blood samples are easily obtained from sheep. Therefore, blood analysis can be a convenient method for evaluating reproductive traits in sheep by detecting genetic and metabolic changes in the ovary. By combining 167 RNA sequencing data and 60 untargeted metabolomics data, this study analyzed the relationship between genes and metabolites in the ovary and blood. The conjoint KEGG enrichment analysis enriched glutathione (GSH) metabolic pathways both in the ovary and blood. This finding provides an explanation for possible GSH metabolic processes in the ovary with metabolite exchange in the blo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Concurrent chemo-radiotherapy (CCRT) is the preferred non-surgical treatment for patients with locally advanced esophageal squamous cell carcinoma (ESCC). Unfortunately, some patients respond poorly, which leads to inappropriate or excessive treatment and affects patient survival. To accurately predict the response of ESCC patients to CCRT, we developed classification models based on the clinical, serum proteomic and radiomic data.
METHODS: A total of 138 ESCC patients receiving CCRT were enrolled in this study and randomly split into a training cohort (n = 92) and a test cohort (
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Citrus reticulata cv. Chachiensis (CRC) is an important medicinal plant, its dried mature peels named "Guangchenpi", has been used as a traditional Chinese medicine to treat cough, indigestion, and lung diseases for several hundred years. However, the biosynthesis of the crucial natural products polymethoxylated flavonoids (PMFs) in CRC remains unclear. Here, we report a chromosome-scale genome assembly of CRC with the size of 314.96 Mb and a contig N50 of 16.22 Mb. Using multi-omics resources, we discover a putative caffeic acid O-methyltransferase (CcOMT1) that can transfer a methyl group to
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bone morphogenetic proteins (BMPs) are a group of cancer-related proteins vital for development and progression of certain cancer types. Nevertheless, function of BMP family in pan-cancer was not detailedly researched.
OBJECTIVE: Investigating expression pattern and prognostic value of the BMPs family (BMP1-8A and BMP8B) expression across multiple cancer types.
METHODS: Our research integrated multi-omics data for exploring potential associations between BMPs expression and prognosis, clinicopathological characteristics, copy number or somatic mutations, immune characteristics, t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long-term exposure to fine particulate matter (PM2.5) posed injury for gastrointestinal and respiratory systems, ascribing with the lung-gut axis. However, the cross-talk mechanisms remain unclear. Here, we attempted to establish the response networks of lung-gut axis in mice exposed to PM2.5 at environmental levels. Male Balb/c mice were exposed to PM2.5 (dose of 0.1, 0.5, and 1.0 mg/kg) collected from Chengdu, China for 10 weeks, through intratracheally instillation, and examined the effect of PM2.5 on lung functions of mice. The changes of lung and gut microbiota and metabolic profiles of m
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования