Massively parallel sequencing following hybridisation enrichment provides new opportunities to obtain genetic data for various types of forensic testing and has proven successful on modern as well as degraded and ancient DNA. A customisable forensic intelligence panel that targeted 124 SNP markers (67 ancestry informative markers, 23 phenotype markers from the HIrisplex panel, and 35 Y-chromosome SNPs) was used to examine biogeographic ancestry, phenotype and sex and Y-lineage in samples from different ethnic populations of Pakistan including Pothwari, Gilgit, Baloach, Pathan, Kashmiri and Sir
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Primary focal hyperhidrosis (PFH, OMIM %144110) is a genetically influenced condition characterised by excessive sweating. Prevalence varies between 1.0-6.1% in the general population, dependent on ethnicity. The aetiology of PFH remains unclear but an autosomal dominant mode of inheritance, incomplete penetrance and variable phenotypes have been reported. In our study, nine pedigrees (50 affected, 53 non-affected individuals) were included. Clinical characterisation was performed at the German Hyperhidrosis Centre, Munich, by using physiological and psychological questionnaires. Genome-wide p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Systemic sclerosis (SSc) is an autoimmune disease that shows one of the highest mortality rates among rheumatic diseases. We perform a large genome-wide association study (GWAS), and meta-analysis with previous GWASs, in 26,679 individuals and identify 27 independent genome-wide associated signals, including 13 new risk loci. The novel associations nearly double the number of genome-wide hits reported for SSc thus far. We define 95% credible sets of less than 5 likely causal variants in 12 loci. Additionally, we identify specific SSc subtype-associated signals. Functional analysis of high-prio
СтатьяМетаанализПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Neisseria gonorrhoeae antimicrobial resistance (AMR) is a global problem heightened by emerging resistance to ceftriaxone. Appropriate molecular typing methods are important for understanding the emergence and spread of N. gonorrhoeae AMR. We report on the development, validation and testing of a Sequenom MassARRAY iPLEX method for multilocus sequence typing (MLST)-style genotyping of N. gonorrhoeae isolates.
METHODS: An iPLEX MassARRAY method (iPLEX14SNP) was developed targeting 14 informative gonococcal single nucleotide polymorphisms (SNPs) previously shown to predict MLST type
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Eleven novel HLA class I and class II alleles detected by next-generation sequencing.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The novel HLA-C*01:303 allele was identified in a Canadian donor of Dutch descent by next-generation sequencing.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HLA-A*02:1264 differs from A*02:07:01:01 by a single nucleotide substitution at position 427, exon 3.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two novel HLA-A alleles, A*01:516 and A*03:538 with non-synonymous substitutions were identified during routine clinical HLA typing.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HLA-G*01:04:01:13 differs from HLA-G*01:04:01:01 by a single nucleotide substitution in intron 5.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Next-generation sequencing (NGS) turnaround times (TAT) exceed two weeks and can delay the initiation of targeted therapy. Rapid cartridge-based platforms such as Idylla deliver single-gene or fusion results from minimal cytology material within hours, but time savings have not been systematically quantified.
METHODS: Forty-two cases of non-small cell lung carcinoma, thyroid carcinoma, melanoma, and mammary analogue secretory carcinoma of the salivary gland that underwent both Idylla testing (KRAS, EGFR, BRAF, and GeneFusion assays) and orthogonal NGS at a single academic center w
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute myeloid leukemia with myelodysplasia-related changes (AML-MRC) represents a high-risk subtype of AML, characterized by poor prognosis and limited therapeutic options. Recent updates in the WHO and ICC classifications have redefined AML-MRC, emphasizing molecular and cytogenetic criteria over morphological features alone. This review provides a comprehensive overview of the pathogenesis, key biomarkers, and diagnostic innovations in AML-MRC, highlighting the role of genetic mutations (e.g., TP53, RUNX1, and splicing factors), cytogenetic abnormalities, and immune microenvironment alterati
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Determination of measurable residual disease (MRD) in pediatric acute lymphoblastic leukemia (ALL) using next-generation immunosequencing (clonoSEQ; Adaptive Biotechnologies) has emerged as an essential and sensitive tool. The clonoSEQ assay identifies and tracks all the B-cell and T-cell receptor rearrangements present in a sample. With widening clinical use of immunosequencing for MRD monitoring (next-generation sequencing [NGS]-MRD), clinicians are increasingly encountering cases with results that are considered to be inconclusive, where immunosequencing yields detectable clonotypic sequenc
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genomic technologies including next-generation sequencing (NGS) and arrays for cytogenetic anomalies are now standard of care in England for the diagnostic evaluation of patients with suspected haematological malignancies. Challenges remain in the management of potential germline findings as a result of NGS panels and copy number variant analyses in haemato-oncology pathways. The first national consensus meeting in April 2022 organised by the UK Cancer Genetics Group (UKCGGG), in collaboration with the CanGene-CanVar research programme and the NHS England haemato-oncology working group led to
СтатьяКлинические рекомендацииConsensus StatementПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Next-generation sequencing (NGS) has transformed the diagnostic and prognostic landscape of acute myeloid leukemia (AML) by enabling the simultaneous detection of multiple clinically relevant mutations. However, access to this technology remains limited in many Latin American countries due to economic and infrastructural constraints. This study reports the implementation and validation of an NGS workflow for AML molecular profiling within the International Consortium on Acute Leukemias (ICAL), emphasizing feasibility and reproducibility across reference laboratories in Brazil. iSeq100 sequence
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Next-generation sequencing-based mutational signatures are frequently used to identify tumors with specific DNA repair deficiencies for targeted therapeutic strategies. Although mutational signatures are commonly derived from whole-exome or whole-genome sequencing data, patients often undergo tumor sequencing using more limited targeted panels that typically encompass several hundred cancer-associated genes. Identifying clinically relevant mutational signatures from targeted panel data requires new approaches capable of deriving signatures from the more limited sequencing data.
METHO
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiple myeloma (MM) exhibits marked clinical heterogeneity, with outcomes ranging from long-term disease control to rapid progression. Accurate identification of high-risk patients is therefore essential. Over the past decades, cytogenetic abnormalities have emerged as key prognostic factors, leading to successive staging systems integrating genomic data. However, limitations in existing models and a lack of standardization have hindered optimal risk assessment. The recent Consensus Genomic Staging (CGS) provides a unified definition of high-risk disease, emphasizing TP53 alterations, bialle
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: In December 2022, the zero - COVID strategy was amended, eliminating mandatory testing and isolation. The purpose of this study was to explore the effectiveness of targeted prevention measures in a key population (inmates and prison guards) and to provide data for similar situations in the future. METHODS: After the 2022 policy changes, a comprehensive 40 - day study was executed within the prison’s enclosed environment. 79,075 nucleic acid samples from facility entrants were collected, complemented by near-full-length viral genome sequencing using a targeted next-generation sequ
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Urinary tract infections (UTIs) are diagnosed based on symptoms and confirmed by urine culture, despite its limitations in sensitivity. False-negative cultures can lead to inappropriate antimicrobial use or urosepsis in high-risk patients. Next-generation sequencing (NGS)-based metagenomics offers a comprehensive and precise alternative but is rarely applied clinically. We developed and validated BIOTIA-ID, a clinical-grade NGS-based diagnostic pipeline for pathogen detection in urine. Remnant clinical and spiked urine samples underwent extraction, metagenomic library preparation, and Illumina
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) is a biologically heterogeneous disease. Two genomic classification systems, LymphGen and DLBclass, are capable of reproducibly classifying single tumors into subtypes with prognostic relevance in the context of standard-of-care R-CHOP (rituximab, cyclophosphamide, doxorubicin, vincristine, and prednisone) chemoimmunotherapy. Preliminary data from subgroup analyses of clinical trials suggest that the distinct biological features are targetable with drugs that exploit subtype-specific vulnerabilities, and large clinical trials are being designed to test thi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To evaluate the performance of metagenomic next-generation sequencing (mNGS) in detecting pathogens in suspected neonatal sepsis and central nervous system infections.
METHODS: This retrospective study included 648 neonates with suspected sepsis or central nervous system infections, with 734 cerebrospinal fluid and 733 blood samples collected. The pathogen spectra detected by mNGS and traditional culture were compared. Using clinical diagnosis as the gold standard, the diagnostic efficacy of the two methods was analyzed.
RESULTS: The positive rates of pathogen detection by mNGS i
Аннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.