Subcellular distribution of calmodulin (CaM) in human immunodeficiency virus type-1 (HIV-1)-infected cells is distinct from that observed in uninfected cells. CaM co-localizes and interacts with the HIV-1 Gag protein in the cytosol of infected cells. Although it has been shown that binding of Gag to CaM is mediated by the matrix (MA) domain, the structural details of this interaction are not known. We have recently shown that binding of CaM to MA induces a conformational change that triggers myristate exposure, and that the CaM-binding domain of MA is confined to a region spanning residues 8-4
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ferric form of truncated hemoglobin II from Thermobifida fusca (Tf-trHb) and its triple mutant WG8F-YB10F-YCD1F at neutral and alkaline pH, and in the presence of CN(-) have been characterized by resonance Raman spectroscopy, electron paramagnetic resonance spectroscopy, and molecular dynamics simulations. Tf-trHb contains three polar residues in the distal site, namely TrpG8, TyrCD1 and TyrB10. Whereas TrpG8 can act as a potential hydrogen-bond donor, the tyrosines can act as donors or acceptors. Ligand binding in heme-containing proteins is determined by a number of factors, including th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cell clone #21 is a long-term producer of the infectious SARS-coronavirus, although the incorporation rate of spike (S) protein into virions is significantly lower. Sequencing analysis of the viral structural proteins revealed four and one amino acid substitutions in the S and membrane (M) proteins, respectively. We demonstrated, using a viral-like particle formation system, that the S mutations were involved in the lower incorporation of the S protein into virions, although the M mutation that disrupts the glycosylation was not present in this phenotype. Further mutational experiments identif
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Triton X-114 has been employed to isolate integral membrane proteins from Schistosoma japonicum and Schistosoma mansoni adult worms. Suitable marker molecules and antisera directed or raised against schistosome proteins partitioned by Triton X-114 extraction indicated that the phase separation and purification of integral membrane proteins had been successful and this fraction was free of contamination with aqueous (soluble) or secretory antigens. Two dimensional immunoblots further exemplified differences between antigens in the integral membrane protein extract and those of the aqueous fract
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein-protein interactions are thought to be mediated by domains, which are autonomous folding units of proteins. Recently, a second type of interaction has been suggested, mediated by short segments termed linear motifs, which are related to recognition elements of intrinsically disordered regions. Here, we propose a third kind of protein-protein recognition mechanism, mediated by disordered regions longer than 20-30 residues. Bioinformatics predictions and well-characterized examples, such as the kinase-inhibitory domain of Cdk inhibitors and the Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP)-hom
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Variable-temperature electrospray ionization native mass spectrometry (vT-ESI nMS) provides a means to determine how temperature-dependent c … es, indicating changes in the dynamics governing ligand binding that may reflect contributions from protein conformational and protonation microstates. Temperature-dependent shifts in average charge state, consistent with changes in solvent-accessible surface area, indicate corresponding changes in protein conformation. Binding is predominantly enthalpy-driven below ∼ …
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein folding dynamics emerge from subtle changes in intramolecular interactions, where hydration shapes free energy landscapes and influences conformational ensembles and supramolecular assembly. While these shape-shifting principles have been primarily explored in well-behaved systems with sharp transitions, their applicability to multidomain protein assemblies, particularly those containing partially folded or disordered regions, remains unclear. Here, we investigate how a single leucine-to-alanine mutation modulates the hierarchical interplay between folding, micelle formation, and macro
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Myocardial infarction (MI) complicated by chronic kidney disease (CKD) is associated with adverse outcomes and exacerbated myocardial fibrotic remodeling. Finerenone is a non-steroidal mineralocorticoid receptor antagonist, but its effects and myocardial signaling changes in non-diabetic CKD-MI remain insufficiently characterized.
METHODS: Network pharmacology identified candidate genes associated with finerenone and CKD-MI, and protein-protein interaction network topology prioritized candidate hub nodes. Molecular docking predicted finerenone-protein binding poses, while 100-ns m
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVE: Dengue is a major infectious disease with potential for outbreaks and epidemics. A specific and sensitive diagnosis is a prerequisite for clinical management of the disease. We designed our study to identify epitopes on the Dengue virus (DENV) envelope (E) and non-structural protein 1 (NS1) with potential for diagnosis.
METHODS: Serology and immunoinformatic approaches were employed. We collected DENV-positive, DENV-negative and Japanese encephalitis virus-positive samples from collaborating hospitals in 2019 and 2022-2023. Seropositive peptides in 15-18 mer peptide
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mucopolysaccharidosis (MPS) IIIA, also known as Sanfilippo syndrome type A, is a severe, progressive disease that affects the central nervous system (CNS). MPS IIIA is inherited in an autosomal recessive manner and is caused by a deficiency in the lysosomal enzyme sulfamidase, which is required for the degradation of heparan sulfate. The sulfamidase is produced by the N-sulphoglucosamine sulphohydrolase (SGSH) gene. In MPS IIIA patients, the excess of lysosomal storage of heparan sulfate often leads to mental retardation, hyperactive behavior, and connective tissue impairments, which occur due
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Much has been learned about the folding of proteins from comparative studies of the folding of proteins that are related in sequence and structure. Observation of the effects of mutations helps account for sequence-specific properties and large variations in folding rates observed in homologous proteins, which are not explained by structure-derived descriptions. The folding kinetics of variants of a β-stranded protein, toxin α from Naja nigricollis, depends on the length of their loop lk1. These proteins, named Tox60, Tox61, and Tox62, contain four disulfide bonds. We show that their oxidative
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There is increasing interest in the role of antibodies targeting specific membrane proteins in neurological and other diseases. The target(s) of these pathogenic antibodies is known in a few diseases, usually when candidate cell surface proteins have been tested. Approaches for identifying new antigens have mainly resulted in the identification of antibodies to intracellular proteins, which are often very useful as diagnostic markers for disease but unlikely to be directly involved in disease pathogenesis because they are not accessible to circulating antibodies. To identify cell surface antig
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A series of 1-ns MD simulations were performed on the scorpion toxin Lqh III in native and disulfide bond broken states. The removal of disulfide bonds has caused hydrogen bond network alteration in the five-residue turn, the long loop, the alpha-helix, the loop connecting strands II and III, and the C-terminal region. In addition and more importantly, it has influenced the amplitude of the fluctuations of five-residue turn, loops, and C-terminal region with a minor effect on the fluctuations of the cysteines in the broken bond sites. These findings suggest that disulfide bonds are not the mos
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Serotonin transporter (SERT) precisely regulates serotonin (5-HT) signaling in the central nervous system and is a major target of antidepressants for the treatment of major depressive disorder. Despite significant progress in characterizing its structure and transport mechanism, the regulation of SERT function by various modulators remains to be fully understood. In the present study, we focused on two potential cholesterol sites in human SERT to investigate cholesterol occupation at these sites and its functional relevance by biochemical approaches. Mutations of an intramolecular site (CHOL2
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The C-terminal tails (CTTs) of αβ-tubulin heterodimer are intrinsically disordered regions (IDRs) which play critical roles in regulating the processivity and velocity of kinesin walking along microtubule. However, their involvement in the binding process of kinesin to microtubule remains poorly understood. To seek the binding process, a kinesin with high binding ability, KIF7 and its partner microtubule TUBA4A-TUBB8 complex were chosen. They were employed biphasic steered and long-term all-atom molecular dynamic simulation to study the CTTs' conformational changes induced by kinesin recruitme
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Dubin-Johnson Syndrome (DJS; OMIM 237500) is a rare autosomal recessive disorder caused by pathogenic variants in the ABCC2 gene, encoding for the multidrug resistance protein 2 (MRP2), resulting in impeded biliary excretion of bilirubin metabolites. It is typically characterized by chronic or intermittent jaundice and conjugated hyperbilirubinemia.
CASE PRESENTATION: We report the case of a 54-year-old male with hyperbilirubinemia (mostly conjugated) and hypertransaminasemia. Hypertransaminasemia was due to presence of Metabolic dysfunction-associated fatty liver disease (MASLD),
СтатьяКлинический случайПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infectious Bursal Disease Virus (IBDV) remains a significant threat to global poultry health due to its immunosuppressive effects and high mutation rate, which challenge existing vaccine strategies. This study presents a comprehensive computational analysis of the VP2 protein from Malaysian IBDV isolate UPM1432/2019 to elucidate its structural stability and antigenic potential. Phylogenetic analysis revealed evolutionary divergence among VP2 sequences, while physicochemical profiling demonstrated the protein's high thermostability (aliphatic index: 98.77) and cellular stability (instability in
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aggregation of amyloid-β (Aβ) into fibrils is a molecular hallmark of Alzheimer disease (AD). Cryo-EM results show that Aβ fibrils are polymorphic, with distinct molecular fibril structures depending on the AD subtype. Here, we used a mass spectrometry-based chemical protein footprinting method that is named covalent protein painting (CPP) to obtain conformational information on filamentous Aβ in tissue samples of aged persons without dementia (5), with AD (5) or cerebral cardiovascular angiopathy (CAA, 1) or AD with CAA (3). We measured and quantified the relative abundances of Aβ40 and A
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The formation of hemoglobin (Hb) and myoglobin (Mb) supramolecular complexes is examined. These key proteins for oxygen transport and storage undergo conformational transitions, some of which are induced by stress factors, particularly redox-active and toxic substances, e.g., reactive oxygen species (ROS) and reactive carbonyl compounds (RCC). These modifications can lead to partial denaturation, exposure of hydrophobic regions, and loss of stability, promoting self-assembly into high-molecular structures. Reversible associations serve regulatory roles: protein stabilization, transient functio
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Poly (vinyl alcohol) (PVA)-based hydrogels are widely regarded as ideal cartilage replacement materials because of their excellent properties. However, they have drawbacks such as high coefficient of friction (COF) and insufficient wear resistance. As important components of the synovial fluid, proteins are involved in counter-pairs and effect their tribological behavior via denaturation. Tannic acid (TA), which is rich in hydroxyl groups, can bind strongly proteins and change their conformation. In this study, the structure and lubrication performance of TA/PVA hydrogels in phosphate buffer s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования