The global circulation of SARS-CoV-2 has been extensively documented; however, the dynamics within Central America, particularly Nicaragua, remain underexplored. This study characterizes the genomic diversity of SARS-CoV-2 in Nicaragua from March 2020 through December 2022, utilizing 1064 genomes obtained via next-generation sequencing. These sequences were selected nationwide and analyzed for variant classification, lineage predominance, and phylogenetic diversity. We employed both Illumina and Oxford Nanopore Technologies for all sequencing procedures. Results indicated a temporal and spatia
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Blood-based liquid biopsies represent a transformative, minimally-invasive, and patient-friendly approach. Tumor-derived components in the bloodstream, are at the forefront of active research for diagnosis and prediction of prognosis. Early cancer detection and real-time monitoring of treatment effectiveness are the most relevant from the perspective of both the clinicians and the patients. A demand for noninvasive markers is ably powered by sustained advancements in high-throughput technologies such as Next Generation Sequencing and mass spectrometry, paired with artificial inte
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The limited genomic targeting range of current targeted next-generation sequencing (tNGS) workflows results in limited detection of pathogen-derived cell-free DNA (cfDNA), making it challenging to apply this approach to bloodstream infections (BSIs). Here, we developed an ultra-broad hybrid capture-based tNGS method to detect plasma pathogen-derived cfDNA and evaluate its suitability for the diagnosis of BSI.
METHODS: This study introduced an ultra-broad hybrid capture-based tNGS method featuring an ultra-broad pathogen panel (1872 pathogens) and high-density probe coverage. To ad
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: After recovery from hepatitis B virus (HBV) infection, the virus is likely to reactivate once the body is in an immunosuppressed state. Currently, routine liver biopsies are difficult to obtain, and there are few reports on HBV nucleic acid detection in biopsies of other human organs and tissues. Targeted Next-Generation Sequencing (tNGS) can precisely focus on specific gene regions. Through high-throughput sequencing techniques, it can efficiently obtain a large amount of target nucleic acid sequence information and is widely applied in fields such as disease gene detection and tu
СтатьяКлинический случайПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Simultaneously hermaphroditic animals allocate resources to both male and female reproductive functions (sex allocation). Although male reproductive success is a key factor in determining sex allocation, it is seldom evaluated in marine hermaphrodites, as it requires the development of suitable DNA markers to trace paternity. The sessile, simultaneously hermaphroditic barnacle Chthamalus challengeri Hoek, 1883 is widely found along rocky intertidal shores in the northwestern Pacific. In this report, we describe microsatellite DNA markers for C. challengeri and multiplex panels of t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic prostatitis/chronic pelvic pain syndrome (CP/CPPS) is the most common of the prostatitis syndromes. It is characterised by pelvic pain, with or without voiding symptoms. CP/CPPS accounts for 2 million office visits in the US alone. Recent epidemiological studies have shown that CP/CPPS can affect men at any age, including those in their 80s. The aetiology is unknown but proposals include infectious, autoimmune, neurologic and psychiatric causes. Men with CP/CPPS are much more likely to have had a past medical history of cardiovascular, neurologic, psychiatric or infectious disease (par
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vascular transformation of lymph node sinuses (VTSs) is defined as phenotypic transformation of the lymph node sinusoidal lining from lymphatic to vascular endothelium. The pathogenesis of VTS remains unclear. Thus far, VTS has not been characterized at the molecular level. Herein, we shed some light on VTS pathogenesis while providing a detailed description of its clinical, histopathologic, immunophenotypic, and molecular features. Our specimens involved 2 women and 3 men, aged 36 to 66 years (mean 49 years old). The lymph nodes were in the right inguinal (n = 2), left axillary (n = 1), right
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Juvenile Xanthogranuloma (JXG) is a rare form of non-Langerhans cell histiocytosis. The most common known gene mutations affect the mitogen-activated protein (MAP) kinase, phosphoinositide 3-kinase (PI3K), and Janus kinase/signal transducer and activator of transcription ( JAK / STAT ) signaling pathways. We present a case of congenital JXG in a premature newborn from a dicygotic twin pregnancy with subdermal infiltrates on the chest, hepatosplenomegaly, ascites, pancytopenia, and petechiae on the abdomen and extremities. Next-generation sequencing of tissue from a subdermal infiltrate reveale
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sheep coccidiosis could disturb the balance of intestinal microbiota, causing diarrhea, and even death in lambs. Chemical drugs are the primary method of treating sheep coccidiosis, but their use will bring drug resistance, toxic side effects, drug residues, and other problems. Chinese herbal medicines are investigated as alternative methods for controlling coccidian infections.
METHODS: In this study, the effect of fermented Artemisia annua (FA) on oocysts per gram (OPG), average daily gain (ADG), and expression of inflammatory factors were investigated in lambs that were natural
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
European spine journal : official publication of the European Spine Society, the European Spinal Deformity Society, and the European Section of the Cervical Spine Research Society2025eng
BACKGROUND: Spinal infections pose diagnostic dilemmas owing to nonspecific early symptoms (e.g., back pain and fever) overlapping with degenerative, neoplastic, or inflammatory conditions, resulting in high misdiagnosis rates. Metagenomic next-generation sequencing (mNGS) offers rapid culture-independent pathogen detection, and its clinical utility in spinal infections when integrated with C-arm-guided percutaneous biopsy remains inadequately characterized. OBJECTIVE: To evaluate the diagnostic value of integrating C-arm-guided percutaneous biopsy with mNGS and conventional microbial culture
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
While T-cell lymphomas are classified as mature neoplasms, emerging evidence indicates that malignant transformation may occur at an earlier stage of T-cell maturation. In this study, we determined clonal architecture in a broad range of T-cell lymphomas. Our multidimensional profiling indicates that many of these lymphomas do in fact emerge from an immature lymphoid T-cell precursor at a maturation stage prior to V(D)J rearrangement that undergoes branching evolution. Consequently, at single-cell resolution we observed considerable clonal tiding under selective therapeutic pressure. T-cell re
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coronaviruses rapidly evolve and are prone to new virus emergence. Human coronavirus (HCoV)-229E is one of the seven coronaviruses (aside HCoV-OC43, HCoV-HKU1, HCoV-NL63, SARS-CoV, MERS-CoV, SARS-CoV-2) causing respiratory infections in humans. Genomic data are very scarce for this virus. We implemented an in-house multiplex PCR strategy to amplify HCoV-229E genomes from nasopharyngeal samples, before next-generation sequencing using Nanopore or Illumina technologies. HCoV-229E genomes were assembled and analyzed using MAFFT, MEGA, Itol, Nexstrain, and Nextclade softwares. Thirty-one PCR prime
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Next-generation sequencing (NGS) has transformed our understanding of oncogenic pathways and mutational processes underlying many breast tumors. Although large-scale NGS studies included mostly common invasive breast carcinomas, the genetic landscapes of several less common or rare special histologic types and other breast tumors have now also been elucidated. Many of these lesions harbor highly specific types of mutations or rearrangements/gene fusions, including invasive lobular carcinoma, tall cell carcinoma with reversed polarity, most salivary gland-like neoplasms, fibroepithelial neoplas
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RATIONALE: Brucella neuropathy is a rare clinical condition, particularly in nonendemic areas, where it often presents with nonspecific symptoms such as fever and headaches, leading to frequent misdiagnoses. In these regions, Brucella antibodies are not routinely tested, and the positive rate of blood cultures is relatively low during the early stage of the disease. In addition, the low culture-positive rate of cerebrospinal fluid (CSF) means that many neurobrucellosis diagnoses rely on peripheral blood cultures or Brucella antibodies, which is not rigorous. This is problematic because the tre
СтатьяКлинический случайОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report on the rediscovery of a presumably lost type specimen of Echinococcus multilocularis (Leuckart, 1863). The study establishes the mitochondrial genome of E. multilocularis from a historical syntype specimen and explores modern genomic techniques to clarify its identity in European populations. Despite initial failure in nested PCR, high-throughput next-generation sequencing (NGS) successfully assembled the mitochondrial genome from post-capture reads, revealing a 13,738 bp sequence. This genome contained 12 protein-coding genes, 2 rRNA genes, and 22 tRNA genes. Phylogenetic analysis p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Visceral leishmaniasis in northern parts of Europe is rare and can be difficult to diagnose. The microbiome 16S/18S-test is based on next-generation sequencing (NGS)-technology and a software program able to species annotate most types of bacteria, fungi, and parasites. We present a case of an 86-year-old male born in Denmark with multiple myeloma diagnosed with visceral leishmaniasis via the 16S/18S metabarcode test. This case highlights the potential of the test and the importance of obtaining a thorough travel anamnesis, as immunocompromised patients are susceptible to opportunistic infecti
СтатьяКлинический случайАннотация на английскомПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Type B1 and B2 thymomas are lymphocyte-rich malignant tumours with few somatic mutations in protein-coding regions of the nuclear genome; nonetheless, noncoding regions remain uncharacterized. Here, we developed a method to isolate pure thymoma cells from lymphocyte-rich tissues, and then performed genome-wide deep sequencing. The total number of somatic mutations was ~80 times higher in noncoding regions than in coding regions in type B12 thymomas (1,671.3 versus 21.1 per case). Coding mutations were identified in epigenetic regulators, DNA repair genes, and some other genes. Nevertheless, 40
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ticks are important vectors of bacterial pathogens affecting both human and animal health. In Ghana, Amblyomma variegatum is the predominant cattle-infesting tick, yet most studies have focused on a limited range of well-characterized pathogens, potentially overlooking a broader diversity of less-recognized, emerging, or opportunistic bacteria. In this study, we used 16S rRNA amplicon sequencing to characterize the bacteriome of partially blood-fed Am. variegatum ticks, with emphasis on underexplored taxa. As ticks were blood-fed at the time of collection, some detected microorganisms may repr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Заболевание вирусом Марбурга (MARV) (MVD) представляет собой необычную, но серьезную вирусную геморрагическую лихорадку, которая оказывает воздействие на человека и нечеловеческих приматов. У людей инфекция МАРВ характеризуется быстрым наступлением, высокой способностью к трансмиссии и высокой смертностью, что создает значительные препятствия для разработки вакцин и лечения. Баты, в частности Русетт аегиптиак, предположительно являются естественными хозяевами МАРВ. Предыдущие исследования показали, что у летучих мышей асимптоматическая инфекция МАРВ резко контрастирует с сильными реакциями, на
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chagas meningoencephalitis can present in immunocompromised patients after organ transplantation. We present the first reported instance in which metagenomic next-generation sequencing (mNGS) of cerebrospinal fluid diagnosed Chagas meningoencephalitis in a patient. The diagnosis of Chagas in this case underscores the role of mNGS in identifying rare or unexpected pathogens.
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования