This study conducted a comparative genomic investigation of 40 strains of Lentilactobacillus buchneri isolated from various environments-including fermented foods, silage, cattle rumen, and the nasopharynx-to identify species-level diversity and assess their CRISPR immunity. An average genome size of 2.55 ± 0.07 Mb, a GC content of 44.18 ± 0.15%, and 2444 ± 83 coding sequences were identified. Prophages were found in all strains except for two, while 17 strains contained plasmids. No genes associated with bacteriocins were identified. CRISPR analysis revealed the presence of 42 Type II-A and 4
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The development of effective and feasible engineering technologies to control the transmission of antibiotic resistance genes (ARGs) and pathogenic antibiotic-resistant bacteria (PARB) form drinking water sources is urgently needed for ensuring drinking water safety. In this study, metagenomic analysis was applied to systematically explore the full profiles, removal, and potential health risks of antibiotic resistomes in a large constructed wetlands-reservoir ecosystem (CWs-R) for drinking water source improvement. A total of 343 ARG subtypes belonging to 18 ARG types were identified from wate
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Staphylococcus aureus is a leading cause of skin and soft tissue infections and systemic infections. Wall teichoic acids (WTAs) are cell wall-anchored glycopolymers that are important for S. aureus nasal colonization, phage-mediated horizontal gene transfer, and antibiotic resistance. WTAs consist of a polymerized ribitol phosphate (RboP) chain that can be glycosylated with N-acetylglucosamine (GlcNAc) by three glycosyltransferases: TarS, TarM, and TarP. TarS and TarP modify WTA with β-linked GlcNAc at the C-4 (β1,4-GlcNAc) and the C-3 position (β1,3-GlcNAc) of the RboP subunit, respectively,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genus Litomosoides Chandler, 1931, includes species that as adults occur in the thoracic and abdominal cavity of mammalian hosts and are presumably vectored by mites. The vertebrate hosts include a variety of Neotropical mammals such as phyllostomid and mormoopid bats; cricetid, sciurid, and hystricognath rodents; and didelphid marsupials. It has been suggested that Litomosoides is not a monophyletic group and that rampant horizontal transfer explains their presence in disparate groups of mammals. Herein we present a phylogenetic reconstruction including mitochondrial genes of 13 vouchered
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During the period from April 2012 to May 2013, 13 newborns (1 to 4 weeks of age) and 1 child in a pediatric hospital ward in Germany were colonized with Klebsiella oxytoca producing an extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) (CTX-M-15). A microbiological source-tracking analysis with human and environmental samples was carried out to identify the source and transmission pathways of the K. oxytoca clone. In addition, different hygienic intervention methods were evaluated. K. oxytoca isolates were detected in the detergent drawer and on the rubber door seal of a domestic washer-extractor machine
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Shigella strains are important agents of bacillary dysentery, and in recent years Shigella sonnei has emerged as the leading cause of shigellosis in industrialized and rapidly developing countries. More recently, several S. sonnei and Shigella flexneri strains producing Shiga toxin (Stx) have been reported from sporadic cases and from an outbreak in America. In the present study we aimed to shed light on the evolution of a recently identified Shiga toxin producing S. sonnei (STSS) isolated in Europe. Here we report the first completely assembled whole genome sequence of a multidrug resistant (
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The presence of self-resistance genes in antibiotic-producing organisms poses a paradox: how can resistance evolve before the antibiotic exists, and how can an antibiotic producer arise without first evolving resistance? Here we examine the evolutionary origins of self-resistance to mycophenolic acid (MPA), an inhibitor of inosine monophosphate dehydrogenase (IMPDH). The MPA biosynthetic gene cluster (BGC) includes a resistant IMPDH-B. Homologs of IMPDH-B occur not only in MPA producers but also in many non-producing fungi, where remnants of the MPA BGC remain detectable. The phylo
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/OBJECTIVE: Extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing Escherichia coli (E. coli), a bacterium resistant to most β-lactam antibiotics, is a critical clinical global health concern, posing significant health risks to humans and animals including giant pandas. The Chengdu Research Base of Giant Panda Breeding (CRBGP) has the world's largest captive population of giant pandas. This study aimed to investigate the prevalence, antibiotic resistance characteristics, and molecular epidemiology of ESBL-producing E. coli among captive giant pandas at the CRBGP.
METHODS: ESBL production wa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptococcus pyogenes (Group A Streptococcus, GAS) remains a formidable global public health challenge. In this study, we conducted a high-resolution genomic epidemiology study on 176 non-invasive throat GAS isolates collected from pediatric patients in Beijing, China, between June 2024 and March 2025. Whole-genome sequencing was employed to characterize population structure, phylogenetic relationships, virulence genes, and antimicrobial resistance (AMR) determinants. The results showed that the population of GAS isolates in this study was dominated by emm12/ST36 (77.8%) and emm1 (22.2%) type
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Introduction Acinetobacter baumannii is a common nosocomial pathogen that has developed multidrug resistance (MDR) to different classes of antibiotics, including carbapenems. The World Health Organization has declared carbapenem-resistant A. baumannii (CRAB) a critical priority pathogen. Aims and objective This study aimed to determine the antimicrobial susceptibility of CRAB, identify carbapenemase production, and detect carbapenemase genes in clinical isolates of CRAB. Methods This study was conducted in the Department of Microbiology, Himalayan Institute of Medical Sciences and School of Bi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial resistance (AMR) in Escherichia coli from livestock poses a growing public health threat, yet genomic data on cattle-derived strains in China remain limited. This study investigated AMR, virulence, and plasmid profiles of E. coli from diarrheic cattle in four provinces: Anhui (AH), Ningxia (NX), Shandong, and Shanxi (SX). Ninety-one isolates were characterized using antimicrobial susceptibility testing and whole-genome sequencing. Resistance to ampicillin (49.5%), cefotaxime (37.4%), and tetracycline (36.3%) was common, with NX showing the highest resistance rate. Twenty-one mult
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Identification of differentially expressed genes between normal and diseased states is an area of intense current medical research that can lead to the discovery of new therapeutic targets. However, isolation of differentially expressed genes by subtraction often suffers from unreported contamination of the resulting subtraction library with clones containing DNA sequences not from the original RNA samples.
MATERIALS AND METHODS: Subtraction using cDNA representational difference analysis (RDA) was performed on human B cells from normal or common variable immunodeficiency patients
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The recently emerged SARS-CoV-2 is the cause of the global health crisis of the coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic. No evidence is yet available for CoV infection into hosts upon zoonotic disease outbreak, although the CoV epidemy resembles influenza viruses, which use sialic acid (SA). Currently, information on SARS-CoV-2 and its receptors is limited. O-acetylated SAs interact with the lectin-like spike glycoprotein of SARS CoV-2 for the initial attachment of viruses to enter into the host cells. SARS-CoV-2 hemagglutinin-esterase (HE) acts as the classical glycan-binding lectin and
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The presence of the plasmid-mediated quinolone resistance determinants qnrA, qnrB, qnrS and aac(6')-Ib-cr was evaluated in a collection of 382 isolates of extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae collected between February and March 2006 for the nationwide Spanish GEIH-ESBL 2006 project. In total, 14 isolates (3.7%) were positive for qnr genes (3 qnrA1, 5 qnrB-like and 6 qnrS1) and 62 isolates (16.2%) were positive for the mutant variant of aac(6')-Ib-cr. The Aac(6')-Ib-cr enzyme was the most prevalent plasmid-mediated mechanism of quinolone res
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
How DNA is repaired after retrovirus integration is not well understood. DNA-dependent protein kinase (DNA-PK) is known to play a central role in the repair of double-stranded DNA breaks. Recently, a role for DNA-PK in retroviral DNA integration has been proposed (R. Daniel, R. A. Katz, and A. M. Skalka, Science 284:644-647, 1999). Reduced transduction efficiency and increased cell death by apoptosis were observed upon retrovirus infection of cultured scid cells. We have used a human immunodeficiency virus (HIV) type 1 (HIV-1)-derived lentivirus vector system to further investigate the role of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phylogenetic diversity (PD) plays an important role in biodiversity, conservation, and evolutionary studies by measuring the diversity of a set of taxa based on their phylogenetic relationships. In phylogenetic trees, a subset of k taxa with maximum PD can be found by a simple and efficient greedy algorithm. However, this algorithmic tractability is lost when considering phylogenetic networks, which incorporate reticulate evolutionary events such as hybridization and horizontal gene transfer. To address this challenge, we introduce PaNDA (Phylogenetic Network Diversity Algorithms), the first s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Evolution is an intrinsic property of autopoietic systems performing natural computation, which is based on an internal formal self-description representing the arrangement of digital and analog coding structures. Autopoietic systems are capable of assigning new values to previously unproven (ambiguous) statements, which occurs, in particular, in conditions beyond the limits of adaptability. This process, defined by Marcello Barbieri as codepoiesis, occurs through the introduction of new codes or the rearrangement of existing ones, increasing the computing power of biological systems. Formally
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigated the disinfection, and removal of contaminants of emerging concern (CECs) and antibiotic-resistant bacteria (ARB) from hospital wastewater (HWW) using biological treatment followed by the LED photo-Fenton (BIO + LED-PF) and LED photo-Fenton followed by biological treatment (LED-PF + BIO). BIO was conducted by the Zahn Wellens method, while the LED-PF was applied in a pulse width modulation reactor (20 mg L-1 Fe2+, 50 mg L-1 H2O2, pH 2.8, 70 % duty cycle, 60 min). CECs removal exceeded 90 % using BIO + LED-PF and 71 % using LED-PF + BIO. Both treatments were efficient in
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The use of antibiotics to treat bacterial infections often imposes strong selection for antibiotic resistance. However, the prevalence of antibiotic resistance varies greatly across different combinations of pathogens and drugs. What underlies this variation? Systematic reviews, meta-analyses, and literature surveys capable of integrating data across many studies have tried to answer this question, but the vast majority of these studies have focused only on cases where resistance is common or problematic. Yet much could presumably be learned from the cases where resistance is infrequent or abs
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования