Pseudomonas aeruginosa biofilms are recalcitrant to conventional antibiotic therapy due to their extracellular polymeric substance (EPS) matrix, in which Psl polysaccharide serves as the primary structural scaffold. PslG glycoside hydrolase can degrade Psl and trigger biofilm dispersal, yet the dynamic glycan release profile and metabolic consequences remain poorly characterized. Mature P. aeruginosa PAO1 biofilms were treated with PslG (1-1000 nM) for 0-30 min. Biomass was quantified by crystal violet staining. Matrix glycan composition and untargeted metabolomics was performed using LC-MS/MS
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Immune checkpoint inhibitors (ICIs) can cause immune-related adverse events (irAEs) across multiple organs. High-throughput omics approaches may help characterize susceptibility, molecular mechanisms, diagnostic features, and monitoring markers related to irAEs; however, evidence remains dispersed across platforms, clinical applications, and toxicity phenotypes.
OBJECTIVE: To map original human evidence in which high-throughput omics approaches were directly linked to irAE susceptibility, occurrence, severity, diagnosis, longitudinal monitoring, clinical course, recovery, response
СтатьяScoping ReviewСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colorectal cancer (CRC) is the third most prevalent cancer type worldwide. Despite improvements in screening programs, the incidence of early-onset CRC (EOCRC) in patients under 50 years old is rapidly increasing, including in Korea, in contrast to the decreasing trend of late-onset CRC (LOCRC). However, a comprehensive biological understanding of CRC's coding and non-coding variants, onset-dependent prognostic variables, and the genetic and transcriptomic differences between EOCRC and LOCRC remains limited. To provide insights into this, we present a high-quality multi-omics dataset consistin
СтатьяDatasetПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Crohn's disease (CD) is a chronic inflammatory disorder with a high rate of postoperative recurrence, posing major challenges for long-term management. Conventional clinical indices have limited capacity for individualized prognostic prediction. While Digital Twin (DT) technology-virtual replicas of individual patients-offers a transformative paradigm for clinical decision support, its application in CD postoperative management remains largely unexplored.
METHODS: We developed CrohnTwin-X, an explainable digital twin framework that integrates transcriptomic and clinical features t
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fiber-based therapies focus on butyrate production, a process often dysregulated in inflammatory bowel disease (IBD), but seldomly examine other metabolites or functional pathways. Here, we systematically profiled ex vivo responses of 66 pediatric IBD microbiomes to nine resistant starches (RS), with extensive multi-omic characterization in a subset. Our study demonstrates that inter-individual variability dominates over RS-specific effects, yielding consistent yet highly personalized fermentation phenotypes, microbial compositional shifts, and metabolite outputs. Beyond butyrate, we identify
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PurposeTo elucidate the dynamic molecular evolution and immune heterogeneity in diabetic retinopathy (DR) and identify diagnostic biomarkers.MethodsMulti-omics integrative analysis was performed on peripheral blood transcriptomic data from diabetic patients with and without DR. Techniques included differential expression analysis, immune infiltration profiling, unsupervised clustering, and LASSO regression for biomarker selection. Findings were validated in an independent high-glucose-treated endothelial cell model.ResultsDR progression exhibits staged molecular evolution from diabetes (immune
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polycystic ovary syndrome (PCOS) is a prevalent endocrine disorder in reproductive-age women, characterized by limited therapeutic options that address its underlying mechanisms. This study aimed to identify novel druggable protein targets for PCOS using a multi-omics integrative approach. Proteome-wide association studies (PWAS)-Mendelian randomization (MR) and summary-based MR (SMR) analyses were performed on large-scale plasma proteomics data from deCODE and UK Biobank cohorts, integrated with PCOS genome-wide association study (GWAS) summary statistics to screen for causal associations. Va
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lung cancer is the leading cause of cancer-related deaths globally. Non-small cell lung cancer (NSCLC) accounts for approximately 85% of all lung cancer cases, and drug resistance severely undermines treatment efficacy. This review summarizes recent advances in elucidating NSCLC drug-resistance mechanisms using multi-omics integration. Multi-omics integration systematically reveals the molecular networks of drug resistance, identifies key biomarkers and targets, and facilitates the screening of high-priority candidates for drug development through experimental validation. Small-molecule inhibi
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The development of the male inflorescence in maize (Zea mays) is a complex and highly regulated process that is essential for reproductive success and yield. To gain a comprehensive understanding of the regulatory programs involved in tassel formation, including the initial specification of anther cell types, the transcriptomes, small RNAs (sRNAs), and proteomes were profiled at four developmental stages (0.5-2.0 cm). The RNA-seq analysis indicates dynamic shifts in gene expression underlying the transition from indeterminate meristems to organ initiation and germinal cell determination by 2.0
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gut-liver axis is critical to integrate microbial, metabolic, and immune signaling networks to control hepatic homeostasis and carcinogenesis. Gut microbial balance disruption (dysbiosis) stimulates chronic inflammation, metabolic disorders, and transition from non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD) to hepatocellular carcinoma (HCC). Latest evidence points to the gut and intratumoral microbiota's roles in shaping immune regulation and responsiveness to immunotherapy against cancer. This review encapsulates the latest evidence on the microbiome-gut-liver axis in chronic liver disease and can
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Profiling molecular panorama from massive omics data identifies regulatory networks in cells but requires mechanistic interpretation and experimental follow up. Here we combine deep learning and large language model reasoning to develop a hybrid workflow for omics interpretation, called LyMOI. LyMOI incorporates GPT-3.5 for biological knowledge reasoning and a large graph model with graph convolutional networks (GCNs). The large graph model integrates evolutionarily conserved protein interactions and uses hierarchical fine-tuning to predict context-specific molecular regulators from multi-omic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The significant clinical and molecular heterogeneity of pulmonary arterial hypertension (PAH) poses challenges in identifying effective therapies. Advanced multidimensional profiling offers an opportunity to capture molecular responses and assess biomarker stability, yet its application in randomised trials remains limited.
METHODS: We evaluated the multi-omic profiles of participants with PAH in a randomised, placebo-controlled trial of famotidine. Plasma metabolomic and proteomic profiling was performed at enrolment and 24 weeks. Baseline profiles were compared between treatment
СтатьяРандомизированное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVE: Identifying key biomarkers from multi-omics data is essential for advancing COVID-19 diagnosis and understanding disease mechanisms. Quantum machine learning approaches, particularly the quantum support vector machine, offer potential for biomarker analysis. This study aimed to assess the applicability of the quantum support vector machine for biomarker evaluation under a performance-based feature importance framework.
METHODS: Proteomic and metabolomic biomarker data from two independent cohorts (Cleveland Clinic and Swedish Medical Center) were analyzed. Biomarkers
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Host dependency factors (HDF) are essential for viral replication and are promising targets for broad-spectrum antivirals. However, most work has focused on individual viruses or individual data types, limiting our understanding of shared host mechanisms across viruses.
METHODS: We developed a pan-viral framework that integrates multi-omics data-including genome-wide perturbation screens, single-cell transcriptomes and viral interactomes-and combines graph-based learning with classical machine-learning models to prioritize HDF for four RNA viruses (SARS-CoV-2, influenza A virus, d
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lysozyme is a natural antimicrobial protein increasingly used as an antibiotic alternative in animal husbandry. However, its role in hepatic lipid metabolism, especially in post-peak laying poultry, is not well understood. This study employed a multi-omics approach to investigate the hepatic responses in late-laying quails supplemented with lysozyme (500 mg/kg diet) for 8 weeks compared to a control group. Lysozyme supplementation significantly increased average egg weight during week 1∼4 (P < 0.01). At the end of the trial, it significantly reduced hepatic lipid droplet area and triglyceride
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parkinson's disease (PD) is a disorder involving progressive degeneration of the nervous system. Its clinical signs typically become noticeable only after substantial impairment has occurred in the substantia nigra, a brain region involved in motor control. Therefore, early and accurate prediction of PD based on molecular alterations is essential for proper diagnosis and improved patient outcomes. In this context, feature-level multi-omics integration has become a useful strategy because it combines molecular information from multiple biological levels and may support a broader understanding o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prolificacy is a crucial economic trait in goat production, yet its underlying molecular mechanisms remain incompletely understood due to its polygenic nature. While previous studies have identified several candidate genes, a comprehensive understanding of the local and systemic regulatory networks is lacking. This study aims to dissect the complex molecular basis of high prolificacy in goats through an integrated multi-omics approach.
RESULTS: We conducted transcriptomic, proteomic, and metabolomic profiling of ovarian tissues from high-fecundity (HF, n = 3) and low-fecundity (LF
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mitochondrial dysfunction is linked to sleep disorders in previous report, but the potential roles of specific genes remain unclear. This study aimed to dissect different subtype-specific genetic associations and their underlying mechanisms. A multi-omics Summary-data-based Mendelian Randomization (SMR) approach was performed to identify potential causal links between mitochondrial function-related genes and sleep disorders. We integrated GWAS data from FinnGen database (the discovery set), independent GWAS datasets (covering different sleep-disorder subtypes and used for validation), and cis-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Abiotic stresses-drought, salinity, extreme temperature, flooding, and heavy-metal toxicity-constrain rice (Oryza sativa L.) yield worldwide, and the cellular programmes underlying them are unevenly distributed across cell types that bulk-tissue assays average together. This review examines, from a methodological standpoint, what single-cell and spatial omics technologies can and cannot establish about rice abiotic stress biology. We first define the modality space: single-cell omics measures RNA, chromatin accessibility, DNA methylation, protein, or metabolite features at the resolution of in
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Wheat production is severely limited by soil salinity-alkalinity, yet the molecular mechanisms governing seed germination under such stress remain largely unelucidated. This study employed integrated transcriptomics, metabolomics, and WGCNA to decipher the adaptation strategies of germinating wheat seeds to gradient saline-alkali stress. Our results showed that stress induced a functional differentiation in carbon metabolism: fructose and mannose metabolism was enhanced, whereas starch and sucrose metabolism was inhibited. Concurrently, the phenylpropanoid defense network was differentially re
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования