The identification of mutations in genes that cause human diseases has largely been accomplished through the use of positional cloning, whic … f this gene in zebrafish and expression correlation analyses among other BBS genes in an expression quantitative trait loci data set demonstrate that TRIM32 is a BBS gene. This study shows the value of high-density SNP genotyping for homozygosity mapping and the use of expression correlation data for evaluation of candidate genes and identifies the proteasome degradation …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Previous genetic studies of skeletal variation in threespine stickleback fish (Gasterosteus aculeatus) have focused primarily on striking morphological differences. Here, we examine the largely unexplored genetic architecture of internal bone microstructural variation between marine and freshwater stickleback. Micro-computed tomography X-ray analysis revealed differences in the porosity, bone thickness, and bone volume fraction within armor plates and vertebrae from a marine and freshwater stickleback. Quantitative trait locus mapping in F2 progeny from a marine × freshwater stickleback cross
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Previous genetic studies of skeletal variation in threespine stickleback fish (Gasterosteus aculeatus) have focused primarily on striking morphological differences. Here, we examine the largely unexplored genetic architecture of internal bone microstructural variation between marine and freshwater stickleback. μCT X-ray analysis revealed differences in the porosity, bone thickness, and bone volume fraction within armor plates and vertebrae from a marine and freshwater stickleback. Quantitative trait locus mapping in F2 progeny from a marine × freshwater stickleback cross identified a significa
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Bipolar disorder (BD) is a complex disease associated with various hereditary traits, including a higher body mass index (BMI). … also explored the potential mechanism behind the detected associations using human brain expression quantitative trait loci (eQTL) analysis.
RESULTS: The analysis provided independent evidence of an rs12772424-BMI interaction (p = 0.011). Furthermore, while overall there was no evidence for SNP marginal effects on BD, the TCF7L2-BMI interaction was significant at the ge …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This organism-independent theoretical study examines genomic evaluation of open-pollinated progeny from partially selfing species when the f … ed families with exchangeable covariance blocks. An independent Mendelian simulation with biallelic quantitative trait loci recovered the classical pair-specific coefficients without supplying them to the data-generating model and closely reproduced the theoretical coefficient, with a coefficient of determination of 0.9998 and mean absolute error of 0.0073. The additive …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
People with human immunodeficiency virus (PWH) exhibit accelerated aging and a higher prevalence of aging-related conditions, despite effective antiretroviral therapy. The biological mechanisms involved remain incompletely understood. Integrating genomic and metabolomic profiling may help uncover genes and pathways contributing to aging-related disease in this population. Using a genome-wide association study framework and untargeted metabolomic profiling, we searched for associations between human genetic variants and the plasma concentrations of 1,930 putative metabolites in 1,244 individual
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The hooded coat pattern in laboratory rats is produced by recessive alleles of the h (Kit) locus on chromosome 14. A quantitative trait locus (QTL) on chromosome 17 has been previously identified as a potential modifier locus of dorsal pigmentation in hooded Long-Evans Agouti (LEA) rats. To validate the contribution of this chromosome 17 locus, we analyzed an (LEA × F344) F2 population and identified distinct genetic determinants of dorsal and ventral pigmentation. Genome-wide QTL mapping identified a major locus influencing dorsal pigmentation on chromosome 17 near D17Rat2 exceeding a highly
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding how numerous heterotic quantitative trait loci (hQTL) shape heterosis and shifting from hQTL to candidate genes are central challenges. To address these challenges, we performed a systematic, genome-wide mapping in a biparental population and a population of diverse hybrids. Leveraging both a triple testcross and immortalized F2 designs, we examined the genetic basis of the heterosis of the wheat hybrid Piko × Hermann. We detected a major hQTL on chromosome 4B, primarily driven by epistasis. This region contains the Green Revolution gene Rht-B1 as the primary candidate gene. Then…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The circadian clock enables organisms to align internal daily rhythms with environmental cues, with major consequences for survival and fitness. Although the molecular framework of this system in Drosophila melanogaster is well characterized through transcription translation feedback loops involving ten core clock genes, the genetic basis of natural variation in their expression remains poorly understood. Here, we used natural expression variation to identify expression quantitative trait loci (eQTLs) through genome-wide association mapping. Using the Drosophila Genetic Reference Panel, we mea…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The role of mitochondrial-related genes in the pathophysiology of hypertrophic scars (HS) is not well understood. This study aims to provide multi-omics insight into mitochondrial genes associated with HS through Mendelian randomization (MR) methods.
METHODS: Mitochondrial-related genes in this study were obtained from the MitoCarta3.0 database. Relevant single nucleotide polymorphisms (SNPs) were screened from methylation, expression and protein quantitative trait loci (mQTLs, eQTLs, and pQTLs) of mitochondrial genes. Five regression models including MR-Egger regression, Inverse var…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study aims to systematically elucidate the shared and specific genetic basis of osteoarthritis (OA) and obesity by integrating large-scale genome-wide association study (GWAS) summary statistics, cross-tissue quantitative trait loci (QTLs), and single-cell and spatial transcriptomic data.
METHOD: The research employed a multi-omics integrative analysis pipeline. First, a meta-analysis was conducted on GWAS data for OA and obesity. Next, tissue- and spatial-specific enrichment analyses were performed using methods such as QTLEnrich, MAGMA, and gsMap. Key steps included the appl…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Early warning markers of ovarian cancer, especially those that can be detected through noninvasive methods, are very limited; the … microRNAs (miRNAs), and 2 proteomes were obtained for Mendelian randomization (MR), and expression quantitative trait loci data were employed for summary-data-based Mendelian randomization (SMR). Specifically, we employed inverse variance weighted as the main method to calculate the MR effect. The robustness of the results was ensured through 3 other MR methods, multiva …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The observational research indicates that risky sexual activities contribute to the development of mental disorders. However, th … ervational analysis using NHANES 2015-2016 was conducted for validation. We further used expression quantitative trait loci (eQTL) to proxy drug target genes and examined the impact of sildenafil and contraceptives on mental disorders using SMR and IVW-MR methods.
RESULTS: We found that an increased genetically predicted AFS was associated with decreasing anxiety disord …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hashimoto's thyroiditis (HT) is a common autoimmune thyroid disorder with a complex genetic background. Interleukin-6 (IL-6) has been implicated in its pathogenesis, but the genetic mechanisms remain unclear. Two-sample Mendelian randomization (MR) using expression quantitative trait loci (eQTL) and gene set enrichment analysis (GWAS) data identified IL‑6-HT genes. In vivo validation in nonobese diabetic (NOD) mice involved siRNA knockdown, histopathology HE/Immunohistochemistry (HE/IHC), and enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). GSEA and molecular docking explored mechanisms. Western blo…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cerebrovascular disease frequently co-occurs with amyloid-β (Aβ) plaques and tau tangles, the pathological hallmarks of Alzheimer's disease … d infarcts but not Aβ plaque burden. Integrating AD genome-wide association studies and CSF protein quantitative trait loci (pQTLs) identified CRIP1 as a candidate causal protein for AD. Carriers of the minor allele at the CRIP1 pQTL exhibited reduced CRIP1 levels, less WMH, and lower CSF levels of ECM proteins linked to CAA. In vitro, CRIP1 bound Aβ and accelerated fibr …
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Postpartum depression (PPD) represents a debilitating perinatal psychiatric disorder with elusive pathogenesis. While ferroptosis-an iron-dependent regulated cell death pathway-is implicated in neuropsychiatric conditions, its mechanistic role in PPD remains undefined.
METHODS: We integrated blood-derived protein quantitative trait loci (bd-pQTL) from 35,559 Icelanders with FerrDb-curated ferroptosis genes through bidirectional Mendelian randomization (MR) to identify causal PPD regulators. Mediation MR delineated ferroptosis-related pathways validated in an ovariectomy/hormone-wi…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is a fatal and incurable neurodegenerative disease. The impacts of antihypertensive drugs an … ployed to evaluate the impact of antihypertensive drugs on ALS. Furthermore, we used cis-expression quantitative trait loci (cis-eQTLs) data from brain tissue and blood to validate the positive results by a summary-based MR method.
RESULTS: We found that an increment in systolic BP (SBP) could elevate the risk of ALS (inverse-variance weighted [IVW] odds ratio [OR] = 1. …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pelvic inflammatory disease (PID) is a common gynecological disorder that seriously affects women's physical and mental health, yet there are few effective therapeutic options.
OBJECTIVE: Mendelian randomization (MR) has been used to repurpose existing drugs and identify new therapeutic targets. Therefore, we performed a systematic drugable genome-wide MR analysis to explore potential therapeutic targets for PID.
METHODS: We utilized cis-expressed quantitative trait loci (cis-eQTL) of druggable genes and PID Genome-Wide Association Study (GWAS) data to perform MR analysis and col…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lipid metabolism plays an important role in the pathogenesis and development of calcific aortic valve stenosis. Our aim was to evaluate the causal effect of lipid-lowering drugs, such as low-density lipoprotein cholesterol (LDL-C) lowering and triglyceride lowering drugs, on the outcome of aortic valve stenosis using a two-sample Mendelian randomization (MR) study.
METHODS: We used two genetic tools to represent the exposure of lipid-lowering drugs, including expression quantitative trait loci for the expression of drug target genes, and genetic variants within or near drug target…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many single nucleotide polymorphisms (SNPs) identified by genome-wide association studies exert their effects on disease risk as expression quantitative trait loci (eQTL) via allele-specific expression (ASE). While databases for probing eQTLs in tissues from normal individuals exist, one may wish to ascertain eQTLs or ASE in specific tissues or disease-states not characterized in these databases. Here, we present a protocol to assess ASE of two possible target genes (GPNMB and KLHL7) of a known genome-wide association study (GWAS) Parkinson's disease (PD) risk locus in postmortem human brain t…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования