Structure-based virtual screening is an attractive strategy in drug design. It enables the selection of potential binders to target biomolecules with known molecular structures, providing a rational framework for studying their mechanisms of action and guiding further optimization. However, accurately predicting the free energy of binding remains an extremely challenging task, and the available tools only provide approximate estimates. In this context, one strategy to improve the predictive power of virtual screening and increase the probability of identifying true binders is to employ multipl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diabetic nephropathy (DN) is a severe complication of diabetes mellitus, leading to end-stage renal disease and significant morbidity. Current therapies are limited by efficacy and side effects, highlighting the need for novel treatments. Lianmei granules (LMG) show potential for treating DN, although their mechanisms remain unclear. This study explored DN epidemiology and investigated the active components, targets, and mechanisms of LMG using a comprehensive bioinformatics approach. We conducted a cross-sectional analysis involving 44,090 participants from the National Health and Nutrition E
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To investigate the complement-modulating mechanisms of Ginkgo biloba extract (EGb 761) in dry age-related macular degeneration (dry AMD) through an integrative approach combining bioinformatics, molecular docking, and molecular dynamics (MD) simulations.
METHODS: Bioinformatics analysis was used to identify dry AMD-related targets, followed by molecular docking and 100-ns MD simulations to evaluate the binding stability and free energy of EGb 761 components with complement proteins C3 and C5.
RESULTS: Quercetin and ginkgolide B showed the strongest and most stable interactions with
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Histone deacetylases (HDACs) regulate neuroprotection; however, Trichostatin A (TSA), an HDAC inhibitor, lacks clear molecular mechanisms and core targets in Alzheimer's disease (AD), limiting clinical translation. This study aimed to decipher TSA's AD-regulating network, screen core genes, and support AD early diagnosis and multi-target therapies.
METHODS: TSA targets were computationally predicted. Five GEO AD datasets were analyzed for differential genes and core modules, and 130 machine learning algorithms were employed to identify core genes. Functional annotation, immune cel
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mammalian orthoreoviruses (MRVs), commonly known as reoviruses, are an emerging zoonotic threat that are known for their broad host tropism and potential for causing severe clinical pathology in both humans and animals. Despite this epidemic risk, currently, there are no approved therapeutic agents that are able to disrupt MRV transmission. The viral attachment protein sigma1 (σ1), mediating the entry of the virus into the host cells is a critical target for antiviral intervention. This study used an in silico structure-based drug design strategy to screen for bioactive phytochemicals that are
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AD is a widespread and debilitating neurodegenerative disorder, and existing treatments have demonstrated limited efficacy, emphasizing the need for novel therapeutic strategies. This study focused on the design of drug-like molecules with enhanced efficacy and minimized side effects by application of structure-based scaffold hopping and molecular hybridization strategies. Molecular docking was carried out on Glide module; Molecular dynamics simulation of 500 ns was executed employing Desmond and ADMET prediction was achieved by QikProp modules of Schrödinger. Through molecular docking studies
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neurodegenerative disorders such as Parkinson's disease are closely associated with dysregulated activity of monoamine oxidase-B (MAO-B), which leads to dopamine depletion and oxidative stress. Despite the availability of numerous monoamine oxidase (MAO) inhibitors on the market, their irreversibility and associated side effects necessitate the development of more effective and reversible MAO-B inhibitors. In this study, a series of twenty-one indole-based derivatives (PSH1-PSH21), collectively designated as PSH, was synthesised and evaluated for inhibitory activity against MAO isoforms. Most
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hematological malignancies are highly heterogeneous diseases characterized by dysregulated signaling pathways and limited durable therapeutic responses. Calcium homeostasis has emerged as a critical regulator of cancer cell fate, yet the role of the sodium/calcium exchanger 1 (NCX1/SLC8A1) in leukemogenesis remains poorly defined. In this study, we comprehensively investigated the biological significance and therapeutic potential of NCX1 across major hematological malignancies by integrating transcriptomic analyses, protein-protein interaction networks, experimental validation, and in silico d
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Osteoarthritis (OA) and psoriasis (PSO), while distinct systemic diseases, both affect the joint system and share similar inflammatory factor expression profiles and immune cell infiltration patterns, suggesting potential common pathogenic mechanisms. Tissue plasminogen activator (PLAT), a pivotal fibrinolytic enzyme, may represent a candidate molecule associated with the molecular overlap between these two diseases.
METHODS: This study applied an integrated multi-omics and experimental strategy, including Weighted Gene Co-expression Network Analysis (WGCNA), machine learning (LAS
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: Candida albicans is the most common cause of candidemia and is classified as a high-priority pathogen due to its increasing prevalence among fragilised and hospital-based patients. In this study, the subtractive proteomics approach identified 12 key targets involved in vital pathways that play a crucial role in metabolism and regulation, supporting fungal growth, maintaining balance, and enabling pathogenicity. These pathways are essential for the pathogen's survival and virulence, highlighting them as potential targets for treatments against C. albicans infections. Notably, aspartate
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The continued reemergence of Ebola virus epidemics remains a global health concern, largely due to limited therapeutic interventions. This study is aimed at identifying and characterizing antiviral peptides as potential lead candidates against the Sudan Ebola virus. We retrieved antiviral peptides from the AVPdb and designed novel peptides from them using support vector machine, RF, and discriminant analysis algorithms. The toxicity and allergenicity predictions were performed using ToxinPred, ADMETLab 3.0, Allertop, and AllergenFP web servers, respectively. The 3D structures of selected pepti
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: Ovarian aging represents a critically important aspect of female senescence. It not only denotes the loss of fertility but is also accompanied by a series of physiological changes and the aging of other organs. Hydroxytyrosol (HT), a natural polyphenolic phytocompound, has been demonstrated to exhibit remarkable effects in regulating autophagy, inflammation, and the aging process. However, the relationship between HT and ovarian aging, as well as the specific underlying mechanisms, remains poorly understood. Methods: In this study, network pharmacology, molecular docking
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oral pathogens pose a significant global health concern, affecting 80% of the world's population across all age groups. Among these pathogens, Streptococcus mutans stands out as a prominent threat. The rise in antibiotic resistance has limited the effectiveness of conventional antibiotics. In contrast, probiotics produce antibacterial peptides known as bacteriocins, which exhibit inhibitory effects against closely related and even unrelated bacterial species. Specifically, Lactobacillus acidophilus bacteriocins are encapsulated within membrane vesicles (MVs), allowing for long-distance transpo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Type 2 Diabetes Mellitus (T2DM) is a multifactorial metabolic disorder embedded in impaired adipose tissue function and underlying elements of altered lipid metabolism. Adipokines and lipid-processing enzymes play a critical role in the regulatory mechanisms of metabolic homeostasis. To report the possible modulators of lipid metabolism from Hygrophila auriculata via the integrated in silico approaches of network pharmacology, molecular docking, and dynamic simulations. The dedicated approach involved identifying phytochemicals from H. auriculata via GC-MS, followed by obtaining their physicoc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Menangle Virus (MenV) is a zoonotic pathogenic virus that can penetrate humans, causing infection in them. It is an essential threat to public health due to the possibility of cross-species transmissions. Traditional vaccine development methods are time-consuming and resource-intensive, highlighting the need for innovative approaches. This study uses computational techniques to develop a multiepitope vaccine for MenV. We employed in silico tools to find potential B-cell, T-cell, and MHC-binding epitopes in the viral proteome. To ensure their safety and efficacy, these epitopes were evaluated f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer cells have a higher evolutionary potential than normal cells, which commonly leads to medication resistance and a decrease in the efficacy of existing cancer treatments. As a result, discovering new therapeutic drugs is an important priority in the field of oncology. The tumor suppressor protein p53, regulates many cellular activities but is frequently rendered inactive in malignancies due to aberrant overproduction of MDM2 and MDMX. As a result, the method of targeting MDM2 with small-molecule inhibitors to reactivate p53 signalling has gained popularity as a promising approach for ant
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ebola virus is a member of the Filoviridae family, which causes hemorrhagic fever in primates, exhibiting a mortality rate that can reach up to 90%. The VP35 suppresses the host IFN-β/α production by disrupting the immune responses of the host during viral infection, making it a putative target for therapeutic intervention. Herein, the UMH SuperNatural II database was mined to identify prospective VP35 inhibitors employing advanced in silico approaches. Filtration of the UMH SuperNatural II database was first conducted based on drug-likeness features. These compounds were screened towards VP35
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diabetic mellitus (DM) is a chronic disorder, and type 2 DM (T2DM) is the most prevalent among all categories (nearly 90%) across the globe every year. With the availability of potential drugs, the prevalence rate has remained uncontrollable, while natural resources showed a promising potency, and exploring such potential candidates at the preclinical stage is essential. An extensive literature search selected 89 marine and plant-derived indole derivatives with anti-inflammatory, antioxidant, lipid-lowering, etc., activities. However, as we know, drugs have not been able to convert from 'lead'
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiple myeloma (MM) is a disease that causes plasma cell growth in the bone marrow and immune globulin buildup in blood and urine. Despite recent advances in MM therapy, many still die due to its high mortality rate. A study using computational simulations analyzed 100 natural ingredients from the SANC database to determine if they inhibited the IgH domain, a known cause of multiple myeloma. Natural component Diospyrin inhibited the IgH enzyme with the best binding energy of -10.3 kcal/mol and three carbon-hydrogen bonds, followed by Parviflorone F complex with a binding energy of -10.1 kcal
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Due to the pivotal role of carbonic anhydrase IX (CA IX) in pathological conditions, there's a pressing need for novel inhibitors to improve patient outcomes and clinical management. Herein, we investigated the inhibitory efficacy of six alkaloids from Ruta chalepensis against CA IX through in vitro inhibition assay and computational modeling. Skimmianine and maculosidine displayed significant inhibitory activity in vitro, with low IC50 values of 105.2 ± 3.2 and 295.7 ± 14.1 nM, respectively. Enzyme kinetics analyses revealed that skimmianine exhibited a mixed inhibition mode, contrasting with
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования