Epigenetic mechanisms are thought to contribute to neurodevelopmental vulnerability for psychiatric disorders, yet longitudinal evidence linking DNA methylation (DNAm) to brain maturation and psychopathology is limited. Using epigenome-wide DNAm (372,582 CpGs) and whole-brain structural MRI data from the IMAGEN cohort (n = 506, ages 14-19), we identified 18 co-regulated DNAm clusters, ten enriched for brain-expressed genes involved in neuronal development and signalling. The clusters showed consistent longitudinal change and were reproducible in independent adult samples (PPMI, n = 513; ADNI,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The transition of endothelial cells (EC) to tumor-associated ECs (TEC) is a critical process in tumor progression. The underlying mechanisms driving this angiogenic state could represent potential therapeutic targets. In this study, we revealed that a co-opted gene regulatory program from EC progenitors promotes the angiogenic phenotypes of TECs. Specifically, the TEC-specific gene regulatory program, derived from large-scale single-cell transcriptomic and epigenomic atlases across multiple solid tumors, was projected onto multiomic maps of human embryonic stem cell-derived EC diff
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The advent of cancer immunotherapy has led to dramatically improved outcomes in several immunogenic adult cancers. Similar successes have been seen in some pediatric cancers, but only in specific settings. A particular challenge has been the application of immunotherapy approaches to pediatric brain tumors, with early clinical experience showing promise but few durable responses. Key barriers to immunotherapy arise from distinctive features of pediatric brain tumors, including low tumor immunogenicity, an immunosuppressive tumor microenvironment, and impaired effector cell function. Additional
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Single-cell genetic perturbation screens are increasingly used to study gene function at single-cell resolution. However, their analysis remains difficult because available computational methods differ in assumptions, input requirements, and output definitions, which can complicate cross-study comparison and consistent tool selection.
AIM OF REVIEW: We summarize current methods by organizing single-cell genetic perturbation analysis into a five-step computational workflow: basic data preprocessing, data refinement and correction, perturbation-specific quality control and filtering
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Periconceptional folate intake decreases the risk of pediatric acute lymphoblastic leukemia (ALL); however, the mechanism is not fully understood. We sought to identify sites of DNA methylation measured at birth both responsive to periconceptional folate and associated with lymphoblasts at the time of ALL diagnosis in a "meet in the middle" analysis. Folate-associated differentially methylated regions (DMRs) were identified from retrospectively collected periconceptional maternal folate intake (by dietary source) and epigenome-wide DNA methylation status from archived dried neonatal blood spot
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vitamin D signaling has recognized roles in female reproductive physiology, but its effects at the chromatin level in endometrial stromal cells are still unclear. Here, we investigated how the active form of vitamin D, 1α,25-dihydroxyvitamin D3, or calcitriol, influences the accessible chromatin landscape of human endometrial stromal cells. Assay for transposase-accessible chromatin using sequencing (ATAC-seq) was performed on T-HESCs treated with either a vehicle or 1,25(OH)2D3. Ligand treatment increased overall chromatin accessibility, shown by higher ATAC-seq signal intensity, while causin
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation (DNAm) is a key epigenetic modification, and datasets capturing DNAm are typically high-dimensional. Although dimension reduction (DR) techniques are commonly applied, it remains unclear how different DR methods perform specifically on the DNAm dataset. In this study, we aim to evaluate the performance of several DR techniques to determine their performance for reducing the dimensionality of DNAm datasets. We leveraged the DNAm dataset from the STRiDE (STratification of Risk of Diabetes in Early pregnancy) prospective study, which consists of 8,62,927 CpG sites each from 258 pr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer remains a major cause of morbidity and mortality among women worldwide, highlighting the necessity for predictive tools to identify at-risk individuals prior to the manifestation of symptoms. Standard imaging, like mammography, has limited sensitivity in dense breasts and relies on visible morphological changes. In contrast, circulating DNA methylation biomarkers provide a minimally invasive, stable alternative that detects systemic epigenetic changes before tumors develop. This study analyzes DNA methylation profiles from the GSE51032 EPIC-Italy cohort (Illumina HumanMethylation
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Beckwith-Wiedemann syndrome (BWS) is an overgrowth disorder caused by genetic and epigenetic alterations at chromosome 11p15.5. Increasing evidence suggests that imprinting defects may be accompanied by broader epigenomic perturbations affecting repetitive elements such as human endogenous retroviruses (HERVs). We quantified the transcriptional levels of the HERV-H, HERV-K, and HERV-W-pol genes, the HERV-derived env genes, Syncytin-1 (SYN1) and Syncytin-2 (SYN2), and the epigenetic regulators, TRIM28 and SETDB1, in whole blood from children and adolescents with BWS, stratified by molecular sub
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Axon regeneration is limited in the mammalian central nervous system1. Neurons must balance stress responses with regenerative demands after axonal injury2, but the mechanisms remain unclear. Here we identify aryl hydrocarbon receptor (AhR), a ligand-activated basic helix-loop-helix/PER-ARNT-SIM (bHLH-PAS) transcription factor, as a key regulator of this stress-growth switch. We show that ligand-mediated AhR signalling restrains axon growth, whereas neuronal deletion or pharmacological inhibition of AhR promotes axonal regeneration and functional recovery in both peripheral nerve and spinal co
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Temporomandibular joint osteoarthritis (TMJOA) is a degenerative disease characterized by cartilage degradation and synovial inflammation with limited therapeutic options. In our study, cell-free fat extract (CEFFE), a bioactive fraction derived from adipose tissue, is evaluated as a therapeutic strategy for TMJOA. In chondrocytes, CEFFE enhances proliferation and viability, attenuates inflammatory apoptosis, and preserves extracellular matrix homeostasis by upregulating Col2a1 and Sox9 while suppressing matrix metalloproteinases. Integrated transcriptomic and epigenomic analyses demonstrate t
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Preeclampsia is increasingly understood not only as a clinical syndrome of hypertension and organ dysfunction, but also as a disorder in which placental gene regulation, maternal vascular adaptation, and inflammatory signaling are shaped by abnormal epigenetic control. While several reviews have described epigenetic biomarkers in preeclampsia, the therapeutic implications of these mechanisms remain less clearly integrated. This review, therefore, focuses on the translational potential of epigenetic pathways as therapeutic entry points, with particular attention to DNA methylation, histone regu
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Endometrial receptivity (ER) serves as a critical determinant for successful embryo implantation, yet its molecular complexity and limited clinical assessment methods pose significant challenges. Despite advancements in assisted reproductive technology (ART), recurrent implantation failure (RIF) linked to ER abnormalities persists, creating a need for precise, non-invasive diagnostics.
MAIN BODY: This review outlines ER research, from the biology of the window of implantation (WOI) to the roles of immune components and the microbiome in shaping the receptive microenvironment. Mult
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To determine whether trophectoderm (TE) biopsy performed for preimplantation genetic testing induces molecular, epigenetic, or developmental perturbations in preimplantation embryos and subsequent placental development.
DESIGN: Comparative multi-omics investigation of human blastocysts combined with a murine embryo transfer model.
SUBJECTS: Surplus cryopreserved human euploid blastocysts donated to research and murine blastocysts that were either subjected to TE biopsy or no biopsy.
EXPOSURE: The impact of blastocyst-stage trophectoderm biopsy on transcriptomic, epigenomic, devel
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Advances in spatially resolved technologies enable the simultaneous acquisition of diverse data modalities within a tissue slice while preserving critical spatial context, which presents unprecedented opportunities to decipher intricate tissue heterogeneity. However, existing computational approaches lack the intrinsic flexibility to universally process both spatial multi-modal and multi-omics data. Here, we introduce STransformer, a unified deep learning framework designed to seamlessly accommodate a comprehensive landscape of spatial data. By simultaneously capturing short-range cellular int
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liver metastases (LM) in small cell lung cancer (SCLC) are associated with a limited response to immune checkpoint inhibitors (ICIs). In this trial, we evaluated the efficacy of first-line envafolimab plus chemotherapy in SCLC patients with LM and explored potential predictive biomarkers. Patients received envafolimab in combination with chemotherapy for four cycles, followed by envafolimab monotherapy until disease progression or unacceptable toxicity. The primary endpoint was progression-free survival (PFS). Secondary endpoints included safety, objective response, overall survival, and ident
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Psychiatric disorders are biologically complex conditions arising from interactions across genomic, epigenomic, transcriptomic, proteomic, metabolomic, and metagenomic layers. Single-omics approaches rarely capture more than a fraction of the variance in complex conditions, underscoring the importance of integrative multi-omics frameworks. This mini-review summarizes key methodologies and their application in psychiatric research, with a focus on systems-level integration of genomic risk scores, transcriptomic networks, and neuroimaging data to advance biological understanding of disorders suc
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation is an important epigenetic mechanism that helps define and maintain cellular functions. It is influenced by many factors, including environmental exposures, genotype, cell type, sex, and aging. Since age is the primary risk factor for developing neurodegenerative diseases, it is important to determine if age-related DNA methylation is retained when cells are reprogrammed to an induced Pluripotent Stem Cell (iPSC) state. Here, we selected peripheral blood mononuclear cells (PBMCs; n = 99) from a cohort of diverse and healthy individuals enrolled in the Genetic and Epigenetic Sig
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AbstractThe t(4;14) chromosomal translocation drives overexpression of the histone methyltransferase NSD2 and defines a high-risk segment of patients with multiple myeloma (MM). Herein, we report the discovery of NSD2-ligand-directed degrader (NSD2-LDD), a cereblon-recruiting and PWWP1-mediated LDD that selectively and potently eliminates full-length and PWWP1 domain-containing NSD2 protein isoforms. NSD2-LDD treatment induces the global loss of H3K36me2, leading to promoter-proximal spreading of H3K27me3 and rewiring of cis-regulatory interactions that reverse t(4;14) transcriptional programs
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Toxoplasmosis is a widespread parasitic disease affecting roughly one-third of the global population. In immunocompromised individuals or during pregnancy, infection can result in severe complications. Following primary infection, Toxoplasma gondii forms dormant bradyzoite cysts in tissues such as the brain and eyes. These cysts can rupture, particularly in immunocompromised hosts, releasing active parasites and triggering recrudescence. Efforts to experimentally induce and study bradyzoite cyst recrudescence have been hindered by the limited capacity of cell culture adapted strains to form ti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования