OBJECTIVE: To establish a TaqMan based real-time reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) assay for the detection of Japanese encephalitis virus.
METHODS: The gene sequences of Japanese encephalitis virus downloaded from the GenBank was aligned, using the biologic software. Specific primers and probes were designed in the conserved region of the C gene for Japanese encephalitis virus. The real-time RT-PCR reactive condition was optimized and the sensitivity, specificity and the stability of the assay were evaluated. Mosquitoes collected from Zhejiang province were detected by …
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To evaluate the usefulness of the Gram-specific probe-based quantitative polymerase chain reaction test for rapid detection and differentiation of Gram-negative and Gram-positive bacterial bloodstream infection in preterm infants.
DESIGN: Cross-sectional study.
SETTING: University-affiliated Level III neonatal intensive care unit.
PATIENTS: Preterm infants with clinical features suggestive of late-onset infection.
INTERVENTIONS: None.
MEASUREMENTS AND MAIN RESULTS: In addition to the full sepsis screen, 0.5 mL of EDTA blood was collected aseptically for Gram-specific quantitati…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The identification of the etiological factor of many cervical precancerous lesions and cervical cancer, the human papillomavirus (HPV) is widely used. In this study, we evaluated the consensus and type-specific (TS) polymerase chain reaction (PCR), restriction fragment length polymorphism (RFLP), line probe assay (LiPA, Innogenetics) and sequencing to determine the HPV types in cervical specimens. Out of 690 High-grade Squamous Intraepithelial Lesion (HSIL) samples, 86.7% were HPV positive and 13.3% HPV negative by consensus primers (MY09/MY11, L1C1/L1C2-1/L1C2-2 and/or GP5/6) directed PCR. Ou…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The Siemens VERSANT transcription-mediated amplification (TMA) assay is extremely sensitive for the detection of hepatitis C virus (HCV) RNA in serum. Eleven of 180 subjects in the Hepatitis C Antiviral Long-term Treatment against Cirrhosis (HALT-C) Trial who achieved polymerase chain reaction (PCR)-defined sustained virological response (SVR) at week 72 also had TMA-positive results from the same blood draw; six were positive on repeat testing. We report the follow-up on these 11 patients, and the reproducibility of TMA test results from PCR-negative samples in relationship to ant…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A thermostat chip of indium-tin oxide glass substrate for static chip polymerase chain reaction (PCR) is, for the first time, introduced in this paper. The transparent conductive layer was used as an electro-heating element. Pulse width modulation and fuzzy proportional integration-differentiation algorithm were adopted in the temperature programming of the chip. The temperature distribution was investigated, and a dynamic control precision within +/-2 degrees C was achieved. The highest ramping rates were 37 degrees Cs(-1) for heating and 8 degrees Cs(-1) for cooling with an electric fan. The…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Perinatal viral infections of fetus are among the leading causes of congenital cataract and identifying the viral etiology is im … fty lens aspirates from 50 infants with congenital cataract were subjected to HSV, RV isolation and polymerase chain reaction (PCR) for detection of HSV and CMV. Reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) was applied for RV detection. Peripheral blood specimens were screened for anti-HSV, RV and CMV antibodies by enzyme-linked immunosorbant assay (ELISA).
RE …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A rapid and specific nested polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) has been developed to detect and differentiate pathogenic and nonpathogenic Leptospira spp. Leptospiral genomic DNA was extracted from suspected human sera using an improved method of standard phenol-chloroform, and specific primers have been used to amplify 16S ribosomal RNA from all pathogenic and nonpathogenic Leptospira spp. The PCR products of all nonpathogenic species were digested with ApoI enzyme, but not pathogenic. To evaluate this assay, we analyzed 283 serum samples collected f…
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Information is lacking regarding efficiency of removal of circulating dendritic cells (DCs) by leucoreduction (LR) of blood. This is important since DCs may play a role in transporting abnormal prion, the likely infectious agent of variant Creutzfeldt-Jakob disease. In this study, we report development of a real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) assay to quantify residual DCs in LR whole blood via measurement of selected messenger RNA (mRNA) markers. Taqman-based RT-PCR assays were set up for CD83 as a marker of mature DCs, and CD1c, CD11c, CD303 and CD304 as markers for plasmacytoid and…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Using polymerase chain reactions, this study aimed to evaluate the incidence of neonatal chlamydial conjunctivitis in our region of Hong Kong and explore any association between such conjunctivitis and nasopharyngeal colonisation with Chlamydia trachomatis.
DESIGN: Prospective epidemiological study.
SETTING: Regional hospital, Hong Kong.
PATIENTS: Consecutive patients with neonatal conjunctivitis presenting to our hospital were recruited from May 2004 to April 2005 inclusive. Both eyes were investigated separately for Chlamydia trachomatis by polymerase chain reaction, direct im…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The objectives of this study were to evaluate the use of a real-time multiplex polymerase chain reaction (M-PCR) assay to differentiate between trachoma and lymphogranuloma venereum (LGV) biovars of Chlamydia trachomatis and to validate its performance with the conventional genotyping method.
STUDY: Swab specimens from 115 patients with anorectal symptoms or syndromes associated with LGV were tested by a real-time M-PCR assay and the results compared with the PCR-based restriction fragment length polymorphism analysis of the major outer membrane protein gene (omp1).
RESULTS: A hi…
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An 18-month-old bovine heifer was presented for clinical evaluation after a sudden onset of ventral edema. Clinical and pathological evaluations were consistent with thymic lymphosarcoma, a sporadic form of lymphosarcoma in cattle, which is not generally considered to be associated with bovine leukemia virus (BLV). This heifer was seropositive for BLV at 6 and 18 months of age. Tissues obtained at necropsy were evaluated using in situ polymerase chain reaction. The BLV proviral DNA was detected in lymphocytes of the thymus as well as in epithelial cells of the liver and kidney. This report pre…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increasing incidence of tuberculosis and other mycobacterial infections due to AIDS epidemic resulted in the need of rapid and accurate identification of isolated mycobacteria. The correct identification result leads to the selection of an appropriate therapeutic regimen. Polymerase chain reaction and restriction enzyme analysis (PCR-REA) has been developed since 1992 and used as the rapid method for identifying mycobacteria. Several genes or sequences have been used as an amplified target for PCR-REA. The present study aims to evaluate the potential use of PCR-REA of gene-encoding heat sh…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A multiplex polymerase chain reaction assay was developed for the rapid simultaneous detection of category A select bacterial agents (Bacillus anthracis and Yersinia pestis) and parasitic pathogens (Leishmania species) in blood using the Cepheid Smart Cycler platform. B. anthracis (Sterne) and Yersinia. pseudotuberculosis were used in the assay for optimization for B. anthracis and Y. pestis, respectively. The specificity of the target amplicons [protective antigen gene of B. anthracis and rRNA genes of other pathogens or human (internal control)] was evaluated by staining the amplicons with S…
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To investigate the potential association between prostate infection and chronic prostatitis/chronic pelvic pain syndrome (CP/CPPS), we used molecular approaches described in previous reports. These methods employed standard polymerase chain (PCR) reaction assays to provide a qualitative evaluation of prostatic bacterial species. Here, we report on the detection of prostatic bacteria using a real-time PCR. Template DNAs were examined from prostatic tissue samples from patients with CP/CPPS. Two PCR primer sets were used: one that amplifies a portion of all known bacterial ribosomal DNAs (16S rD
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Mycobacterium is one of the causes of granulomatous diseases within the anorectal region. Early diagnosis of infection is important before the use of antituberculosis chemotherapy. Clinical diagnosis is usually dependent on microscopic detection using Ziehl-Neelsen stain and mycobacterial culture, but the sensitivity and specificity of these two methods are low. In this study nested polymerase chain reaction was used to detect mycobacterial infection in anal fistulas.
METHODS: Paraffin-embedded specimens from three patients and discharge from one patient were used. DNA extraction was…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular assays for qualitative detection of Legionella spp. in clinical specimens were evaluated. DNA extraction was done either with a fully automated DNA extraction protocol on the MagNA Pure LC System or with manual DNA extraction. Amplification and detection were done by real-time polymerase chain reaction (PCR) on the LightCycler (LC) instrument. Oligonucleotides were derived from the 16S rRNA gene of Legionella spp. The assays included a specially designed DNA fragment as Legionella-specific internal control. For both molecular assays, the detection limit was determined to be 5 CFU per…
Оценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The histopathologic diagnosis of cutaneous tuberculosis (CTB) is often troublesome, because there are several other entities (tuberculids, d … the case of granulomatous rosacea. Routinely processed biopsy specimens were evaluated with nested polymerase chain reaction (nPCR) for Mycobacterium tuberculosis (MBT) DNA. The correlation between nPCR results and clinical outcome was less than optimal; in fact, one case showed an excellent clinical response to the antituberculous drug therapy despite the absence of MBT …
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rift Valley fever (RVF) is an anthropozoonosis caused by a Phlebovirus (Bunyaviridae family) that has re-emerged recently in East and West Africa in 1997-1998. This emphasizes the need for early and rapid detection of the virus and an efficient surveillance system. To this goal, a single tube or a nested reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) method focusing on the NSs coding region of the S segment was developed and used to detect the RVF virus (RVFV) genome, resulting respectively in the synthesis of 810 and 662 bp DNA amplimers. The assay was specific for RVFV and did not …
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pneumocystis carinii pneumonia (PCP) is an important cause of morbidity and death among persons with human immunodeficiency virus (HIV) infection. Polymerase chain reaction (PCR) analysis of respiratory specimens has been investigated as a rapid diagnostic method. We have previously reported on the utility of this technique for diagnosing PCP in HIV-infected patients. In this report we evaluate PCR used in a blinded study design to avoid biases inherent to retrospective and nonblinded studies. The diagnosis of PCP was established on the basis of clinical findings and morphological studies of b…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We developed a polymerase chain reaction based approach using restriction fragment length polymorphisms of the mitochondrial cytochrome c-oxidase subunit I to identify nine genotypes (Trichinella spiralis, Trichinella britovi-European strains, Trichinella britovi-Japanese strains, Trichinella nativa, Trichinella nelsoni, Trichinella T5, Trichinella T6, Trichinella T8 and Trichinella pseudospiralis) in the genus Trichinella. Partial mitochondrial cytochrome c-oxidase subunit I genes of nine genotypes were amplified by polymerase chain reaction, sequenced, and digested with three restriction end…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования