Histoplasmosis is an endemic disease mainly occurring in North America and is rare in China. Confirmation of histoplasmosis should be based on a compatible clinical scenario and a positive culture or histopathology. However, there are still many cases that are misdiagnosed or missed, especially in individuals from non-endemic areas. In recent years, metagenomic next-generation sequencing (mNGS) has led to the accurate and timely diagnosis of some rare and complicated infectious diseases. We describe the case of a 27-year-old Chinese man who had chronic progressive pulmonary lesions without any
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: With limited information on germline mutations in biliary tract cancers, this study performed somatic and germline testing for patients at Memorial Sloan Kettering Cancer Center with known biliary tract carcinoma with the aim of determining the frequency and range of pathogenic germline alterations (PGAs).
METHODS: Patients with biliary tract carcinoma were consented for somatic tumor and matched blood testing of up to 468 genes via the Memorial Sloan Kettering Cancer Center Integrated Mutation Profiling of Actionable Cancer Targets next-generation sequencing platform. A germline
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast implant-associated anaplastic large cell lymphoma (BIA-ALCL), a newly included provisional entity in the 2016 revision of the World Health Organization classification, is a distinct form of CD30-positive T-cell non-Hodgkin lymphoma that arises in association with a breast implant after reconstructive or cosmetic surgery. In addition to its characteristic clinical presentation, recent studies using next-generation sequencing have revealed that BIA-ALCL has a unique pattern of genetic alterations. BIA-ALCL is consistently negative for ALCL-related gene rearrangements involving ALK, DUSP22
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute myeloid leukaemia (AML) is a blood cancer characterized by acquired genetic mutations. There is great interest in accurately establishing measurable residual disease (MRD) burden in AML patients in remission after treatment but at risk of relapse. However, inter- and intrapatient genetic diversity means that, unlike in the chronic myeloid and acute promyelocytic leukaemias, no single genetic abnormality is pathognomonic for all cases of AML MRD. Next-generation sequencing offers the opportunity to test broadly and deeply for potential genetic evidence of residual AML, and while not curre
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heteroresistance - the simultaneous presence of drug-susceptible and -resistant organisms - is common in Mycobacterium tuberculosis. In this study, we aimed to determine the limit of detection (LOD) of genotypic assays to detect gatifloxacin-resistant mutants in experimentally mixed populations. A fluoroquinolone-susceptible M. tuberculosis mother strain (S) and its in vitro selected resistant daughter strain harbouring the D94G mutation in gyrA (R) were mixed at different ratio's. Minimum inhibitory concentrations (MICs) against gatifloxacin were determined, while PCR-based techniques include
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rare genetic disorders are often challenging to diagnose. Anomalies of tooth number, shape, size, mineralized tissue structure, eruption, and resorption may exist as isolated symptoms or diseases but are often part of the clinical synopsis of numerous syndromes (Bloch-Zupan A, Sedano H, Scully C. Dento/oro/craniofacial anomalies and genetics, 1st edn. Elsevier, Boston, MA, 2012). Concerning amelogenesis imperfecta (AI), for example, mutations in a number of genes have been reported to cause isolated AI, including AMELX, ENAM, KLK4, MMP20, FAM83H, WDR72, C4orf26, SLC24A4, and LAMB3. In addition
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJETIVES: The aim of this study was to identify CMV drug resistance mutations (DRM) in solid organ transplant (SOT) recipients with suspected resistance comparing next-generation sequencing (NGS) with Sanger sequencing and assessing risk factors and the clinical impact of resistance.
METHODS: Using Sanger sequencing as the reference method, we prospectively assessed the ability of NGS to detect CMV DRM in the UL97 and UL54 genes in a nationwide observational study from September 2013 to August 2016.
RESULTS: Among 44 patients recruited, 14 DRM were detected by Sanger in 12 patients (27%) an
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: As the application of next generation sequencing (NGS) is moving to earlier stages in the diagnostic pipeline for primary immunodeficiencies (PIDs), re-evaluation of its effectiveness is required. The aim of this study is to systematically review the diagnostic yield of NGS in PIDs.
METHODS: PubMed and Embase databases were searched for relevant studies. Studies were eligible when describing the use of NGS in patients that had previously been diagnosed with PID on clinical and/or laboratory findings. Relevant data on study characteristics, technological performance and diagnostic
СтатьяСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Piroplasmosis is caused by tick-borne haemoprotozoa of the genera Theileria and Babesia. These parasitic infections can seriously impact on the health of livestock and production. Piroplasms of multiple species can be present in a single host, but reliable molecular diagnostic tools are needed in order to understand the composition of these complex parasite communities. Theileria and Babesia vary in their epidemiology, drug sensitivity, pathogenicity and interaction with co-infecting species, but are similar in that infected animals become persistent carriers after recovery from primary infect
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infertility due to genetic mutations that cause other defects, besides infertility, is defined as syndromic. Here we describe three of these disorders for which we perform genetic tests. 1) Hypopituitarism is an endocrine syndrome characterized by reduced or absent secretion of one or more anterior pituitary hormones with consequent dysfunction of the corresponding peripheral glands. Deficiencies in all the hormones is defined as pan-hypopituitarism, lack of two or more hormones is called partial hypopituitarism, whereas absence of a single hormone is defined as selective hypopituitarism. Pan-
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: We report an unusual case of epithelioid angiosarcoma (AS) mimicking an epithelioid hemangioma (EH) and analyze mutational patterns in EHs and ASs.
METHODS AND RESULTS: A 58-year-old woman presented with a finger lump and metastatic lung nodules. Initial needle biopsies showed an EH, with only focal atypical histologic features. The patient underwent finger amputation and resection of lung nodules. The amputation specimen and lung nodules revealed features of AS. Fluorescence in situ hybridization for FOS and FOSB gene rearrangements were negative in the primary tumor as well as in the
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Henoch-Schönlein purpura (HSP) is characterized by non-thrombocytopenic palpable purpura, abdominal pain, and arthralgia/arthritis. We aimed to describe the clinical presentations of children with HSP in a single center and compare the prevalence of each manifestations between patients with MEFV variants, particularly in exon 10 and those without.
METHODS: This cohort retrospectively included 144 HSP (59 females, 85 males) patients without Familial Mediterranean Fever (FMF) symptoms and followed for at least 6 months. We utilized the MEFV gene sequencing by using next-generation s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-invasive follicular thyroid neoplasm with papillary-like nuclear features (NIFTP) is an indolent thyroid tumor characterized by frequent RAS mutations and an absence of the BRAF V600E mutation commonly seen in classical papillary thyroid carcinoma (cPTC). The ability to differentiate potential NIFTP/follicular variant of papillary thyroid carcinoma (FVPTC) from cPTC at the time of fine-needle aspiration (FNA) can facilitate conservative management of NIFTP. The aim of the current study was to investigate how molecular testing may add to cytologic assessment in the pre-operative differentia
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ataxias with oculomotor apraxia (AOA) belong to autosomal recessive ataxias. Their common feature is oculomotor apraxia: inability to coordinate eye movements not due to muscle weakness. Next-generation sequencing (NGS) gives unique opportunities of rare disorders diagnostics and discovering of new forms, including AOA. In 2015, AOA type 4 produced by PNKP mutations was delineated in a group of Portuguese patients. We diagnosed AOA4 in a 9-year-old boy from Byelorussian family. He presented with ataxia since 2 years and deterioration in 8 years, oculomotor apraxia, dystonic hyperkinesia, dysar
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.