BACKGROUND: Areca nut polyphenols (AP) that extracted from areca nut, have been demonstrated for their potential of anti-fatigue effects. However, the underlying mechanisms for the anti-fatigue properties of AP has not been fully elucidated to date. Previous studies have predominantly concentrated on single aspects, such as antioxidation and anti-inflammation, yet have lacked comprehensive multi-dimensional analyses.
PURPOSE: To explore the underlying mechanism of AP in exerting anti-fatigue effects.
METHODS: In this study, we developed a chronic sleep deprivation-induced fatigue model and u
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: To validate the performance of a multi-omics combined test for early screening of high-risk liver cancer populations. Methods: 173 high-risk patients with liver cancer were prospectively screened in a real-world setting, and 164 cases were finally enrolled. B-ultrasound, alpha-fetoprotein (AFP), and HCC screens were conducted in all patients. A multi-omics early screening test was performed for liver cancer in combination with multi-gene methylation, TP53/TERT/CTNNB1 mutations, AFP, and abnormal prothrombin (PIVKA-II). Differences in rates were compared using the chi-square test, ad
Аннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Secondary lymphedema (LE) following breast cancer-related surgery is a life-long complication, which currently has no cure. LE induces significant regional adipose tissue deposition, requiring liposuction as a treatment. Here, we aimed to elucidate the transcriptional, metabolomic, and lipidomic signature of the adipose tissue developed due to the surgery-induced LE in short- and long-term LE patients and compared the transcriptomic landscape of LE adipose tissue to the obesity-induced adipose tissue. Adipose tissue biopsies were obtained from breast cancer-operated females with LE from the af
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dysbiosis of the gut microbiota is closely associated with neurodegenerative diseases, including Huntington's disease (HD). Gut microbiome-derived metabolites are key factors in host-microbiome interactions. This study aimed to investigate the crucial gut microbiome and metabolites in HD and their correlations. Fecal and serum samples from 11 to 26 patients with HD, respectively, and 16 and 23 healthy controls, respectively, were collected. The fecal samples were used for shotgun metagenomics while the serum samples for metabolomics analysis. Integrated analysis of the metagenomics and metabol
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonellae are associated epidemiologically and experimentally with colon cancer. To understand how Salmonella induces cell transformation, we performed multi-omics and phenotypic analyses of Salmonella clinical strains isolated from patients later diagnosed with colon cancer (case strains) and control strains from patients without cancer. We show that high transformation efficiency is a frequent intrinsic feature of clinical (case and control) salmonellae, yet case strains showed higher transformation efficiency than control strains. Transformation efficiency correlates with gene expression,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Skin cutaneous melanoma (SKCM) poses a significant challenge in skin cancers. Recent immunotherapy breakthroughs have revolutionized melanoma treamtment, yet tumor heterogeneity persists as an obstacle. Epigenetic modifications orchestrated by DNA methylation contributed to tumorigenesis, thus potentially unveiling melanoma prognosis. Here, we identified an interferon-gamma (IFN-g) sensitive subtype, which possesses favorable outcomes, robust infiltration CD8+T cells, and IFN-g score in bulk RNA-seq profile. Subsequently, we established an IFN-g sensitivity signature based on machine learning.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sodium-glucose cotransporter 2 (SGLT2) inhibitors constitute the gold standard treatment for type 2 diabetes mellitus (T2DM). Among them, empagliflozin (EMPA) has shown beneficial effects against heart failure. Because cardiovascular diseases (mainly diabetic cardiomyopathy) are the leading cause of death in diabetic patients, the use of EMPA could be, simultaneously, cardioprotective and antidiabetic, reducing the risk of death from cardiovascular causes and decreasing the risk of hospitalization for heart failure in T2DM patients. Interestingly, recent studies have shown that EMP
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Opioid crisis is an ongoing epidemic since the past several decades in the United States. Opioid use-associated microbial dysbiosis is emerging as a key regulator of intestinal homeostasis and behavioral responses to opioid. However, the mechanistic insight into the role of microbial community in modulating host response is unavailable. To uncover the role of opioid-induced dysbiosis in disrupting intestinal homeostasis we utilized whole genome sequencing, untargeted metabolomics, and mRNA sequencing to identify changes in microbiome, metabolome, and host transcriptome respectively. Morphine t
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Acetaminophen (APAP) is the most common cause liver injury following alcohol in US patients. Predicting liver injury and subsequent hepatic regeneration in patients taking therapeutic doses of APAP may be possible using new 'omic methods such as metabolomics and genomics. Multi'omic techniques increase our ability to find new mechanisms of injury and regeneration.
METHODS: We used metabolomic and genomic data from a randomized controlled trial of patients administered 4 g of APAP per day for 14 days or longer with blood samples obtained at 0 (baseline), 4, 7, 10, 13 and 16 days. W
Рандомизированное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The latest research proposed a novel copper-dependent programmed cell death named cuproptosis. We aimed to elucidate the influence of cuproptosis in clear cell renal cell carcinoma (ccRCC) from a multi-omic perspective.
METHODS: This study systematically assessed mRNA expression, methylation, and genetic alterations of cuproptosis genes in TCGA ccRCC samples. Through unsupervised clustering analysis, the samples were classified as different cuproptosis subtypes, which were verified through NTP method in the E-MTAB-1980 dataset. Next, the cuproptosis score (Cuscore) was computed bas
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We present a comprehensive multi-omic analysis of the EPISTOP prospective clinical trial of early intervention with vigabatrin for pre-symptomatic epilepsy treatment in Tuberous Sclerosis Complex (TSC), in which 93 infants with TSC were followed from birth to age 2 years, seeking biomarkers of epilepsy development. Vigabatrin had profound effects on many metabolites, increasing serum deoxycytidine monophosphate (dCMP) levels 52-fold. Most serum proteins and metabolites, and blood RNA species showed significant change with age. Thirty-nine proteins, metabolites, and genes showed significant dif
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Suicide or other intentional self-harm (SSH) represents a critical global public health burden, yet biologically informed targets remain poorly defined due to its complex and incompletely understood etiology. This study aimed to prioritize genetically supported candidate targets for SSH and characterize their biological and translational relevance.
METHODS: We developed a multi-omics evidence framework integrating transcriptomic and proteomic Mendelian randomization, colocalization, and sensitivity diagnostics. The primary SSH outcome was from FinnGen R12 (11,538 cases; 488,810 co
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Characterizing CRISPR interference (CRISPRi) phenotypes presents a fundamental temporal challenge: pre-existing overabundance of target proteins can mask early silencing, requiring extended growth for dilution, yet prolonged repression rapidly selects for escaper mutants. To resolve this, we integrated a tightly regulated CRISPRi system in Pseudomonas putida with an automated mini bioreactor platform operating in turbidostat mode. By maintaining continuous exponential growth, we mapped the exact temporal dynamics of essential gene silencing. We identified a critical observation window between
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tissue-specific resolution remains a critical barrier in liquid biopsy for precision medicine. To address this, we developed NEXPLOR (Novel EXtracellular vesicle PopuLation Omics Revealer), an immunoaffinity platform enabling selective enrichment of circulating tissue-specific extracellular vesicles (TS-EVs), demonstrated here for liver-derived hepatocyte-EVs (h-EVs). Through in silico discovery and orthogonal antibody validation across tissues, we identified a four-marker panel (ASGR1, ASGR2, TFR2, SLCO1B1) that selectively enriched hepatocyte EVs without co-capturing the dominant platelet- a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bispecific antibodies are a growing class of therapeutics that simultaneously engage two targets. However, their complex molecular structures pose challenges for production in Chinese hamster ovary cells, the current industry standard for biologics manufacturing. Here we present a case study of three IgG-scFv format bsAbs expressed in CHO cells, in which one candidate exhibited markedly lower titers despite high sequence homology to the other two. Using multi-omics analysis (RNA sequencing, splicing prediction, codon optimization assessment, and motif screening) to investigate potential causes
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic liver disease (CLD) represents a major global public health challenge, necessitating a systematic understanding of its complex immunopathological mechanisms. This review comprehensively summarizes the groundbreaking applications of cutting-edge technologies-including single-cell sequencing, spatial transcriptomics, and organoid models-in chronic liver disease immunology research: Single-cell sequencing resolves immune cell heterogeneity at unprecedented resolution, identifies rare cell subsets, and reveals dynamic changes and regulatory networks through multi-omics integration; Spatial
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Glioblastoma (GBM) is characterized by pronounced transcriptional plasticity and a highly structured immune microenvironment, yet the molecular features associated with tumor-state transitions and immune remodeling remain incompletely understood. Methods: We used an integrative multi-omics framework to examine how secreted phosphoprotein 1 (SPP1) relates to tumor microenvironment organization in human gliomas. Results: Single-cell analyses associated SPP1 with myeloid populations, mesenchymal-like (MES-like) malignant states, inflammatory regulatory programs, and inferred ligand-re
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic obstructive pulmonary disease (COPD) is a respiratory disorder characterized by chronic inflammation, oxidative stress, and metabolic dysregulation. The lack of convenient and easily-accessible non-invasive diagnostic approaches remains a major clinical challenge. This study applied an integrated saliva-based proteomic and untargeted metabolomic strategy to identify potential biomarkers for COPD classification. Comprehensive multi-omics analyses identified 225 differentially abundant proteins and 60 differentially abundant metabolites between patients with COPD and healthy controls, in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liping cattle, an indigenous Chinese breed, may possess unique meat quality characteristics, yet systematic comparisons with commercial breeds remain limited. This study systematically compared nutritional composition, amino acids, fatty acids, volatile flavor-related substances of longissimus dorsi muscle among Liping cattle (LP), Angus hybrid cattle (AG) and Simmental cattle (XM), and further adopted untargeted metabolomics and transcriptome sequencing to reveal the molecular basis for excellent meat quality of LP cattle. Nutritional detection demonstrated LP beef possessed typical advantage
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In recent years, high dimensional omics analyses have become more commonplace for investigating complex biological systems. Typically, these studies attempt to identify key biomolecules associated with a particular biological process. Often, machine learning (ML) is used to identify these biomolecules, typically by learning which biomolecules are highly predictive of a treatment, biological outcome, or phenotype. A major challenge of applying ML to high throughput omics is overcoming noise when sample size is limited and unbalanced with respect to tens of thousands of biomolecules measured. Th
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.