Spectral flow cytometry has ushered in a new era in immunology. Through the improvement of the resolution of surface and intracellular protein expression, this approach enables in depth characterization of rare immune cell subsets, such as innate lymphoid cells (ILCs), in health and disease. Due to their heterogeneity, the identification of ILCs requires the use of many lineage marker antibodies for non-ILC exclusion, together with the analysis of several transcription factor expression profiles for ILC subset distinction. Such intricacies toward their identification and their scarcity in tiss
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Immune checkpoint inhibitors (ICIs) have demonstrated significant potential in cancer therapy. However, the immunosuppressive nature of the tumor microenvironment (TME) and ICI remains a major challenge in clinical treatment. Recently, epigenetic regulators, such as the histone demethylase Lysine (K)-Specific Demethylase 1 A(KDM1A/LSD1), have participated in tumor progression and immune evasion by reshaping the epigenetic state of tumor cells and the immune microenvironment. This study systematically reviewed the dual role of KDM1A in colorectal cancer (CRC). On one hand, KDM1A can promote tum…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Small cell carcinoma of the ovary, hypercalcemic type (SCCOHT) is a rare and lethal cancer lacking effective treatment. Its genomic mutations and tumor microenvironment need further exploration.
METHODS: We performed whole-exome sequencing or gene panel test to explore the SMARCA4 mutation spectrum in SCCOHT (15 samples). Single-cell RNA sequencing was conducted on one primary lesion with matched normal ovarian tissue and one recurrent lesion to investigate the intra-tumoral heterogeneity and immune microenvironment. Multiplex immunofluorescence staining validated T cell infiltration…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: IL-33 is an epithelial-derived alarmin with various roles in cancer. In melanoma, endogenous and exogenous IL-33 exert anti-tumor effects through the stimulation of several immune effector cells. In this study, we explored the combination of IL- 33 with Decitabine (DAC), a DNA methylation inhibitor that promotes immune recognition by re-activating silenced genes, for melanoma treatment.
METHODS: Multicellular spheroids, organ-on-chip technology and in vivo models were used to test the anti-tumor effects of IL-33 combined with DAC against mouse and human melanoma. Mice deficient fo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diffuse large B cell lymphomas (DLBCLs) are a heterogeneous group of malignancies that can arise in lymph nodes or extranodal locations, including immune-privileged sites. Here, we applied highly multiplexed spatial transcriptomics and proteomics together with genomic profiling to characterize the immune microenvironment architecture of 78 DLBCL tumors. We define seven distinct cellular niches, each characterized by unique cellular compositions, spatial organizations and patterns of intercellular communication associated with niche-specific phenotypes of both T cells and tumor B cells. Among t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prostate adenocarcinoma (PRAD) is a leading cause of male mortality, with NK/T cell communication being key areas of the research.
METHODS: The Seurat package was utilized to normalize and reduce the dimensionality of the single-cell data, and CellMarker 2.0 was employed for cell annotation. CellChat was utilized to construct the ligand-receptor interaction network of cell subsets. Differentially expressed genes (DEGs) were filtered by the limma package. Univariate Cox and the LASSO regression in the glmnet package were used to obtain biomarkers and develop a risk model. The survm
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Constitutive JAK/STAT pathway activation is crucial in the pathogenesis of BCR::ABL1-negative myeloproliferative neoplasms (MPN), but has not yet been linked to interferon (IFN)-γ signaling and tumor microenvironment. Human JAK2 V617F-mutated cell lines, 265 bone marrow biopsies (BMB) of two MPN cohorts, and 50 non-neoplastic BMB, revealed an intrinsic activation of IFN-γ signaling, which was confirmed by public RNA expression data. In vitro analysis of JAK2-mutated cell lines showed an activation of IFN-γ signaling pathway in the absence of IFN-γ in the cell supernatants. In addition, a heter…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Introduction: Rheumatoid arthritis (RA) is a common chronic autoimmune disease with high incidence rate and high disability rate. One of the top complications is cancer, especially lung adenocarcinoma (LUAD). However, the molecular mechanisms linking RA and LUAD are still not clear. Therefore, in this study, we tried to identify the shared genetic signatures and local immune microenvironment between RA and LUAD and construct a clinical model for survival prediction. Methods: We obtained gene expression profiles and clinical information of patients with RA and LUAD from GEO and TCGA datasets. W
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The aim of this study was to investigate the impact of Porphyromonas gingivalis (P. gingivalis) on the progression of oral squamous cell carcinoma (OSCC) through neutrophil extracellular traps (NETs) in the tumor immune microenvironment.
METHODS: The expression of NETs-related markers was identified through immunohistochemistry, immunofluorescence, and Western blotting in different clinical stages of OSCC samples. The relationship between NETs-related markers and clinicopathological characteristics in 180 samples was analyzed using immunohistochemistry data. Furthermore, the abili
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Curcumin exhibits both immunomodulatory properties and anticarcinogenic effects which have been investigated in different experimental tumor … omparison with untreated tumor-bearing rats (G1) and provide insights into the modifications in the tumor microenvironment/malignant cell crosstalk. The cross-comparing analyses of the histological sections of residual tumors from two groups of rats given curcumin twice on days 21 and 26 after the tumor challenge (G2) or four times on days 7, 9, 11 and 14 (G3), in compa …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There is increasing evidence to suggest that the Wnt signaling pathway plays a critical role in the pathogenesis of myeloma bone disease. In the present study, we determined whether increasing Wnt signaling within the bone marrow microenvironment in myeloma counteracts development of osteolytic bone disease. C57BL/KaLwRij mice were inoculated intravenously with murine 5TGM1 myeloma cells, resulting in tumor growth in bone and development of myeloma bone disease. Lithium chloride (LiCl) treatment activated Wnt signaling in osteoblasts, inhibited myeloma bone disease, and decreased tumor burden
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Colorectal cancer (CRC) is characterized by marked epithelial heterogeneity and dynamic tumor-microenvironment interactions. However, epithelial states associated with progression across the normal-adenoma-carcinoma sequence remain incompletely defined.
METHODS: Single-cell RNA sequencing data from normal colorectal mucosa, adenoma, and tumor tissues were analyzed using inferCNV, Monocle, Slingshot, CytoTRACE, CellChat, and SCENIC. An OLFM4⁺ tumor cell risk score (OTRS) was constructed using Cox and LASSO regression, and TIMP1 function was evaluated in vitro.
RESULTS: Eight major
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pseudogenes are barely transcribed normally, but some of them are transcribed as long non-coding RNAs during tumorigenesis. The pathological features of pseudogenes in hepatocellular carcinoma (HCC) have not been illustrated clearly. Here, we engaged the pseudogene DUXAP8 into a feedback loop affecting the HCC indicator Piezo1 and concerning the HCC tumor microenvironment (TME). As we discovered, the DUXAP8 transcript was detectable in HCC. The transcriptional activity of DUXAP8 in HCC is associated with dismal HCC clinicopathological features. By depleting DUXAP8, the HCC cells presented the …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metastatic breast cancer (MBC) has traditionally been managed as an incurable systemic disease in which the main goals are survival extension, symptom control, and preservation of quality of life. This principle remains appropriate for most patients. However, contemporary systemic therapies, high-resolution imaging, antibody-drug conjugates (ADCs), immune checkpoint inhibition, liquid biopsy, and metastasis-directed therapy (MDT) have made prolonged no evidence of disease (NED) clinically recognizable in selected patients. This Hypothesis and Theory article proposes NED-oriented oncology as a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Epigenetic modulators may sensitize platinum-resistant ovarian cancer (PROC) to immune checkpoint inhibition by reprogramming the tumor microenvironment.
METHODS: We report clinical and translational findings from a phase II non-randomized study of pembrolizumab and oral azacitidine in 34 women with PROC (NCT02900560). Key eligibility criteria included age 18 years or older, performance status of 0-1, measurable disease, platinum-resistant disease and histologically confirmed epithelial ovarian cancer, fallopian tube carcinoma or primary peritoneal carcinoma. Primary endpoints inc…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The effectiveness of immune checkpoint inhibitors in solid tumors is limited and heavily dependent on the tumor microenvironment (TME). Radiation therapy (RT) reshapes the TME, promoting T cell infiltration. We explored the combined antitumor effects of the stimulator of interferon genes (STING) agonist with low-dose RT and immunotherapy.
METHODS AND MATERIALS: Tumor cell lines (PRM-SCLC, MC38, and LL2) were treated with the STING agonist diABZI (0.001-10 µM) to assess cytotoxicity. The mRNA expression levels of chemokines and cytokines in tumor cells were quantitatively analyzed in …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Orphan class A G protein-coupled receptors (GPCRs) are a large and diverse family with broad tissue expression, and their roles in tumors are increasingly recognized. However, their involvement in gastric cancer (GC) remains unclear. Methods: We performed survival and differential expression analyses to characterize orphan class A GPCR expression patterns in stomach adenocarcinoma (STAD). A prognostic risk model was developed using univariate Cox and LASSO regression analysis and validated in the GEO database. Drug sensitivity and immune infiltration were evaluated across different
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: To explore the effect of radiotherapy on anti-pd-1 anti-tumor activity in metastatic hepatocellular carcinoma.
METHODS: Patients with metastatic HCC treated with intensity-modulated radiation therapy (IMRT) in combination with immunotherapy (n = 13) were retrospectively analyzed by comparing its efficacy with that of immunotherapy alone (n = 12) as well as untreated (n = 20) patients with metastatic hepatocellular carcinoma. Animal experiment used mouse hepatocellular carcinoma H22 cell metastatic tumor model and were also divided into a control group, a PD-1 antibody group, an SB
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer-associated fibroblasts (CAFs) drive tumor progression through restructuring of the tumor microenvironment. This investigation aim to elucidate the function of molecular subtypes (MS) derived from cancer cells communication with CAFs, depicting the hallmarks of the tumor microenvironment and precise bladder cancer (BLCA) treatment. The BLCA data from TCGA and several external sources are utilized to generate a novel ligand, receptor, and transcription factor (LRT) associated molecular subtype and their corresponding score (LRT score). The LRT-mediated molecular subtype is identified via …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.