BACKGROUND: The 15q24 microdeletion syndrome has been recently described as a recurrent, submicroscopic genomic imbalance found in individua … e (AGRE) for CNVs across 15q24 using oligonucleotide arrays. Rearrangements were confirmed by array comparative genomic hybridization and quantitative PCR.
RESULTS: Among the patients from Costa Rica, an atypical de novo deletion of 3.06 Mb in 15q23-q24.1 was detected in a boy with autism sharing many features with the other 13 subjects with the 15q24 microdeletion syndrome descr …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adult T-cell leukemia/lymphoma (ATLL) is a peripheral T-cell neoplasm of highly pleomorphic lymphoid cells. ATLL is usually widely dissemina … al variants of ATLL have been identified: acute, lymphomatous, chronic, and smoldering. Oligo-array comparative genomic hybridization revealed that genomic loss of 9p21.3 was a significant characteristic of acute-type, but not of chronic-type ATLL. Furthermore, we found that genomic alteration of CD58, which is implicated in immune escape, is more frequently observed in acute than …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: HER2 gene amplification and protein overexpression (HER2+) define a clinically challenging subgroup of breast cancer with variable prognosis and response to therapy. Although gene expression profiling has identified an ERBB2 molecular subtype of breast cancer, it is clear that HER2+ tumors reside in all molecular subtypes and represent a genomically and biologically heterogeneous group, needed to be further characterized in large sample sets.
METHODS: Genome-wide DNA copy number profiling, using bacterial artificial chromosome (BAC) array comparative genomic hybridization (aCGH)…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Campylobacter jejuni infection represents the most frequent antecedent infection triggering the onset of the neuropathic disorde … gen and/or host-related factors contribute to the onset of neurological complications. We have used comparative genomic hybridization to perform a detailed genomic comparison of strains isolated from GBS/MFS and enteritis-only patients. Our dataset, in which the gene conservation profile for 1712 genes was assayed in 102 strains, including 56 neuropathogenic isolates, represents t …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA replication of 2 human lymphoid cell lines (U296 and Raji), latently infected with the Epstein-Barr virus, has been compared using a density transfer approach. Typical of non-malignant lymphoblastoid cells, U296 cells divided once in bromodeoxyuridine-supplemented medium to form hybrid but not heavy-density host DNA. Replication of the intracellular Epstein-Barr virus DNA was selectively inhibited in these cells with only 15% of the viral genomes duplicating once to form hybrid-density viral DNA. However, some heavy-density viral DNA was formed in the U296 cells and DNA synthesis can thus
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Microarrays are widely used for the study of gene expression; however deciding on whether observed differences in expression are significant remains a challenge.
RESULTS: A computing tool (ArrayLeaRNA) has been developed for gene expression analysis. It implements a Bayesian approach which is based on the Gumbel distribution and uses printed genomic DNA control features for normalization and for estimation of the parameters of the Bayesian model and prior knowledge from predicted operon structure. The method is compared with two other approaches: the classical LOWESS normalization
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background. Mycobacterium tuberculosis (Mtb) genomic epidemiology often relies on culturing patient sputum, a time- and labour-intensive process. Hybrid capture approaches have been successfully used to enrich Mtb DNA from complex clinical samples, yet the accuracy of variant identification from captured samples has not been systematically evaluated.Methods. We created artificial strain mixtures of two well-characterized Mtb isolates such that the minor strain comprised 0-50% of Mtb DNA and serially diluted the Mtb DNA into human DNA to simulate diagnostic samples with different sputum smear b
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A key question in evolutionary biology is how barriers to gene flow operate and arise between populations, leading to speciation. Barriers are typically identified by comparing populations distinguished by phenotype, geographical location and/or environment. However, such prior classifications may bias recovery towards features obvious to the human eye, influencing mechanistic interpretations. Here we develop a method blind to prior classifications. We apply it to 18 Antirrhinum populations occupying habitats from coastal to alpine. By scanning the genome for regions with deeply rooted similar
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Corpus callosum malformations (CCM) represent one of the most common congenital cerebral malformations with a prevalence of arou … penis, and HCC associated with decreased volume of the periventricular white matter. Both the array comparative genomic hybridization and fluorescence in situ hybridization techniques were used.
RESULTS: Array CGH analysis reveals that patient 1 had the greater deletion size (11,7 Mb) at 1q43. The same region harbors a 2,7 Mb deletion in patient 2. Here, we notice that the larger …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Preimplantation genetic screening (PGS) provides an opportunity to eliminate a potential implantation failure due to aneuploidy … ic characterization of the POC was performed by fluorescence in situ hybridization (FISH) and array-comparative genomic hybridization (a-CGH) analyses. To investigate the possibility of a spontaneous conception, a panel of 40 single nucleotide polymorphisms (SNPs) was used to compare genetic similarity between the DNA of the POC and the DNA leftover of the TE biopsy.
FINDINGS: We …
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: One of the frequent reasons for unsuccessful conception is premature ovarian failure/primary ovarian insufficiency (POF/POI) tha … rescent in situ hybridization methods and a high resolution molecular cytogenetic method, the array comparative genomic hybridization technique. For this patient applying the G-banding, we identified a large deletion on the X chromosome at the critical region (ChrX q21.31-q28) which is associated with the premature ovarian failure phenotype. In order to detect the exact breakpoint …
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We analyzed the role of methylthioadenosine phosphorylase (MTAP) for chemoselective treatment of T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL). MTAP converts methylthioadenosine into adenine which serves as an alternative purine source, if de novo purine biosynthesis is inhibited by antimetabolites (i.e., methotrexate). The idea of the chemoselectivity concept is that tumors with MTAP deletion at chromosome 9p21 are more susceptible to antimetabolites than normal cells without such a deletion. First, we screened 13 T-ALL lines for 9p21 deletions by comparative genomic hybridization. Five cell li…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Primary mediastinal germ cell tumors (M-GCTs) represent a heterogeneous group of tumors that varies with regard to age at presentation, histologic differentiation, and outcome. We retrospectively analyzed archival tissue samples of mediastinal mature and immature teratomas (n = 15) and malignant nonseminomatous M-GCTs (n = 20) with comparative genomic hybridization (CGH). The aim of this study was to define distinct genetic subgroups of M-GCT among the pediatric cohort that may differ in their clinical behavior and prognosis. All pure teratomas showed normal CGH profiles. Malignant M-GCTs in i…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Deletions of 3p25, gains of chromosomes 7 and 10, and isochromosome 17q are known cytogenetic aberrations in sporadic renal cell carcinoma ( … lanced translocations and losses of chromosome arms 2q, 3p, 4q, 9p, 14q, and 19p as demonstrated by comparative genomic hybridization (CGH). By combining SKY, CGH, and FISH of multiple tumors from the same VHL kidney, we have begun to identify chromosomal aberrations in the earliest stages of VHL-related renal cell tumors. Our current findings illustrate the cytogenetic heterogene …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PREMISE OF THE STUDY: Hybridization between diploids and tetraploids can lead to new allopolyploid species, often via a triploid intermediate. Viable triploids are often produced asymmetrically, with greater success observed for "maternal-excess" crosses where the mother has a higher ploidy than the father. Here we investigated the evolutionary origins of Mimulus peregrinus, an allohexaploid recently derived from the triploid M. ×robertsii, to determine whether reproductive asymmetry has shaped the formation of this new species.
METHODS: We used reciprocal crosses between the diploid (M. gutt
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Brucella melitensis is a key etiological agent of brucellosis and has been increasingly subject to characterization using sequencing methodologies. This study aimed to investigate and compare short-read, long-read, and hybrid assemblies of B. melitensis. Eighteen B. melitensis isolates from Southern Israel were sequenced using Illumina and the Oxford Nanopore (ONP) MinION, and hybrid assemblies were generated with ONP long reads scaffolded on Illumina short reads. Short reads were assembled with INNUca with SPADes, long reads and hybrid with dragonflye. Abricate with the virulence factor datab
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The deletion 22q13.3 syndrome (deletion 22q13 syndrome or Phelan-McDermid syndrome) is a chromosome microdeletion syndrome characterized by … detected by high resolution chromosome analysis, fluorescence in situ hybridization (FISH) or array comparative genomic hybridization (CGH) is recommended for confirmation. Differential diagnosis includes syndromes associated with hypotonia, developmental delay, speech delay and/or autistic-like affect (Prader-Willi, Angelman, Williams, Smith-Magenis, Fragile X, Sotos, FG, trichor …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oncocytic cells are characterized by a greatly increased number of mitochondria that distend the cell cytoplasm and result in a distinctive … set of thyroid lesions, and recently, both interphase fluorescence in situ hybridization (FISH) and comparative genomic hybridization (CGH) studies reported that they may show aneuploidy, with widespread numerical chromosomal alterations. In contrast, very few cases have been studied by conventional cytogenetic analysis. Whether the cells with chromosomal changes are the same as t …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In hybrid plants, phenotypic outcomes are governed by interactions between the two parental genomes. However, the mechanisms underlying the interplay of divergent regulatory networks from these genomes remain poorly understood. In this study, we compared gene-level and allele-specific expression patterns, as well as differentially enriched pathways between F₁ and complex backcross (CBC) lines derived from a natural interspecific hybrid population of Populus fremontii (Pf) and P. angustifolia (Pa). Metabolic differences between Pf and Pa which exhibit low and high levels respectively of phenylp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Saffron crocus (Crocus sativus) is the source of the most expensive spice of the world, produced from manually harvested stigmas, thus serving as a cash crop for rural communities. However, despite its economic importance, its genome and chromosomes are poorly studied. C. sativus is a sterile triploid species harboring eight chromosome triplets, and propagated only as a clonal lineage by corms. Saffron's evolutionary origin, parental species and allo- or autotriploidy has been a matter of discussion for almost a century. We performed a survey sequencing of the saffron genome and selected cytog
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования