Colorectal cancer is characterized by epigenetic dysregulation that alters gene expression and drives tumorigenesis. It has been established that most cases of colorectal cancer are driven by the aberrant behavior of APC, TP53, KRAS, CTNNB1, and mismatch repair pathways, while RSPO2 has also contributed to some extent. The oncogenic function of RSPO2 is well documented; however, none of the studies have adopted an integrated perspective that links epigenetic dynamics, immune modulation, omics analysis, and therapeutics to clinical settings, particularly in colorectal cancer. Therefore, underst
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genes of mismatch repair system (MMR) are responsible for correcting errors in DNA replication. MMR defects (dMMR) lead to mutations in microsatellites - repetitive nucleotide base sequences - resulting in microsatellite instability (MSI). Determination of dMMR/MSI status in tumors is an important factor for the development of patient management tactics, as the dMMR/MSI phenotype serves as both a marker of favorable prognosis and a predictor of response to immunotherapy in tumors of many localizations. MMR status is assessed via immunohistochemistry (IHC) on histological material. However,
СтатьяОбзорАннотация на английскомПолный текст не найденОригинал на русском
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The interplay between regulated cell death processes, especially disulfidptosis, and the immune microenvironment in hepatocellular carcinoma (HCC) remains poorly understood. Therefore, this study aimed to elucidate these relationships systematically at single-cell resolution.
METHODS: Multi-omics data from TCGA (n = 315) were integrated with single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data from 21 HCC samples. Disulfidptosis-related subtypes were identified using non-negative matrix factorization (NMF) clustering of co-expressed long non-coding RNAs (lncRNAs). At the single-cell level,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pancreatic ductal adenocarcinoma is traditionally characterized as a glycolytic tumor. However, the extent and clinical relevance of its metabolic heterogeneity remain poorly understood. In this study, we investigated whether glycolytic activity follows a consistent expression pattern across pancreatic ductal adenocarcinoma patients and explored how metabolic diversity influences therapeutic responses. Using spatial transcriptomics of ex vivo primary human pancreatic ductal adenocarcinoma specimens, along with single-cell and bulk RNA sequencing, we mapped glycolytic heterogeneity within the t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: PLD3, a type-II transmembrane glycoprotein enriched in late endosomes and lysosomes, governs nucleic-acid turnover, immune signalling and intracellular homeostasis, and consequently influences both cell-cycle progression and programmed death. Although carcinoma of the stomach ranks among the most frequently diagnosed and lethal malignancies of the gastrointestinal tract, the precise functional dialogue between PLD3 and gastric tumorigenesis has yet to be elucidated.
METHODS: Bioinformatics workflows were applied to analyze gastric carcinoma datasets retrieved from The Cancer Genom
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The SPARC (secreted protein acidic and rich in cysteine) family represents a unique class of matricellular proteins - including SPARC, SPARCL1, SPOCK1-3, SMOC1-2, and FSTL1 - that regulate extracellular matrix (ECM) dynamics, cell signaling, and tissue homoeostasis. In cancer, their expression is frequently dysregulated, through epigenetic mechanisms, microRNAs, and interactions within the tumor microenvironment (TME). Dysregulation of SPARC family members is most pronounced in aggressive malignancies with SPARC, SPARCL1, SPOCK1, and SPOCK2 most consistently altered. These proteins drive tumor
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glioblastoma (GBM) is defined by extreme lethality and transcriptomic plasticity, but the signatures driving the most aggressive tumors remain incompletely defined. In this exploratory in silico study, TCGA-GBM patients were stratified using a strict 1-year overall survival threshold. We integrated differential expression analysis, WGCNA, single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics, and virtual knockout simulations. A high-risk signature centered on CCL2 and TIMP1 was identified. Single-cell and spatial mapping linked these genes to an inflammatory, macrophage-enriched microenvironment. The s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) has a dismal prognosis due to treatment resistance and an immunosuppressive, fibrotic microenvironment. Ferroptosis, a novel form of regulated cell death, offers a promising therapeutic strategy. Transcriptomic datasets GSE28735 and GSE62452 were integrated for differential expression and WGCNA. Ferroptosis-related genes were intersected, followed by machine learning (LASSO, SVM-RFE, etc.) to screen core genes. Enrichment, immune infiltration, and single-cell transcriptome (GSE197177) analyses were performed. Clinical validation used HPA and TCGA. Resver
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Angiogenesis is a hallmark process of tumor growth, metastatic progression, and therapeutic resistance. The role of long noncoding RNAs (lncRNAs) in the regulation of angiogenesis has emerged as a critical factor influencing cancer progression. Flavonoids are natural polyphenolic compounds known for antioxidant and anti-inflammatory activities and have been recognized for their potential to regulate epigenetic and transcriptional networks involved in angiogenesis. This review seems to incorporate recent experimental evidence supporting that flavonoids such as quercetin, luteolin, curcumin, and
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatocellular carcinoma (HCC) ranks among the most prevalent and lethal malignancies worldwide. The majority of patients are diagnosed at advanced stages, where current targeted therapies benefit only a subset of patients. Consequently, there is a pressing need to identify novel therapeutic targets and develop corresponding treatment strategies. Human endogenous retroviruses (HERVs), which constitute approximately 8% of the human genome, represent remnants of ancient viral infections and have been increasingly implicated in cancer pathogenesis. In HCC, HERVs exhibit a significant "double-edge
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biliary tract carcinoma (BTC) is a malignancy with poor prognosis. Current molecular targeted therapies benefit only a limited subset of patients, underscoring the need for novel approaches, such as combining DNA-damaging chemoradiotherapy with an immune checkpoint inhibitor. Although cellular responses following chemoradiotherapy-induced DNA damage are essential, they remain poorly understood in the context of three-dimensional tumor structures. This study aimed to investigate the effects of ionizing radiation, a DNA-damaging cancer therapy, on patient-derived BTC organoids. DNA repair and ge
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In recent years, plant-derived microRNAs (miRNAs), as a new type of cross-kingdom regulatory molecules, have shown great potential in anti-tumor therapy. These non-coding RNAs, about 20-24 nucleotides (nt) long, can stably exist in the human body through dietary intake and resist nuclease degradation through unique protective mechanisms, thereby achieving cross-kingdom gene regulation. Studies show that they can directly target tumor-related signaling pathways to inhibit cancer cell proliferation and induce apoptosis and indirectly exert anti-tumor effects by regulating long non-coding RNAs an
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Programmed cell death protein 1 (PD-1) and programmed death ligand 1 (PD-L1) constitute a core immune checkpoint axis that restrains T cell activation. Under physiological conditions, the interaction between PD-1 and PD-L1 maintains peripheral tolerance and prevents tissue damage from excessive immune responses. In tumor microenvironment, this axis is frequently activated through upregulation of PD-L1 on cancer cells, causing T cell dysfunction and tumor immune escape. PD-1/PD-L1 blockades reactivate exhausted T cells to kill cancer cells. However, some cancer patients fail to respond to PD-1/
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer metastasis involves complex molecular mechanisms that cannot be fully explained by individual gene expression profiles. Previous studies have shown that correlations between RNA and miRNA expression can capture metastatic behaviour more effectively than expression of individual genes. However, no publicly available databases provide systematic analysis of RNA-miRNA correlations specific to cancer metastasis. We developed an efficient computational method to identify differential correlations between miRNAs and RNAs that are specific to individual tumour samples. Using data from The Canc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dysregulated cellular protein metabolism is a key hallmark of pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC). However, much remains to be learned about how this process is regulated in cancerous cells. Here we investigated the role of two co-transcribed microRNA (miRNA) species, miR-15a/16, in regulating cellular protein translation, cell growth, metabolic processes, and clinical features in PDAC. Using cultured PDAC models, we show that overexpression of miR-15a/16 in cancerous cells slows proliferation and attenuates protein synthesis rates. Bioinformatics analysis reveals that these miRNAs target
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pituitary Neuroendocrine Tumors (PitNETs) are the most frequently diagnosed intracranial neoplasms in adults. The World Health Organization's 2022 fifth edition classification of pituitary neuroendocrine tumours (PitNETs) maintains an immunohistochemistry based taxonomy that places molecular biology at the centre of diagnosis. This framework provides a solid basis for subtype classification and therapy development. Methylation, defined as the transfer of a methyl group (CH₃) to DNA bases, histone side chains, or RNA nucleotides, is an epigenetic modification that has emerged as a key mechanism
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Glioblastoma (GBM), IDH-wildtype WHO Grade IV, is the most aggressive primary brain tumour. Although temozolomide (TMZ) remains standard-of-care, ~50% develop resistance driven by cytoprotective autophagy. GORASP2, an autophagy regulator linked to hyperactivated mTOR signaling in GBM, remains largely unexplored. This study characterized the molecular significance of GORASP2 across independent Western and Eastern cohorts using an integrative multi-database approach..
METHODS: This in silico study used GEPIA2 (TCGA, n=163; GTEx, n=207) and CGGA cohorts (mRNAseq_693, n=672; mRNAseq_3
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DExH-box helicase 9 (DHX9) is a multifunctional nucleic acid helicase that participates in R-loop homeostasis, genome maintenance, RNA metabolism, and innate immune signaling. Accumulating evidence has linked aberrant DHX9 expression or activity to tumorigenesis, tumor progression, treatment response, and patient prognosis. However, its role in cancer is highly context-dependent, rather than uniformly oncogenic or tumor suppressive. Depending on its molecular partners, subcellular localization, post-translational modifications, tumor genotype, and immune microenvironment, DHX9 may either promo
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Histones scaffold genomic DNA and regulate access to the transcriptional machinery. However, naturally occurring histone variants can alter histone-DNA interactions, DNA and histone modifications, and the chromatin interactome. Hence, alterations in histone variant deposition can disrupt chromatin, and are increasingly recognized as a way to trigger various disease, including cancer. While significant attention has been placed on the biochemical and functional roles of H2A, H3, and H4 histone variants, the variants of H2B remain largely understudied. Here, we show that H2B variants are dysregu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
tRNA-derived small RNAs (tsRNAs) have emerged as important regulators in cancer biology, yet their role in breast cancer remains insufficiently understood. This study identifies tRF-30-PW5SVP9N15WV as a tsRNA consistently upregulated in breast cancer, supported by analyses of TCGA-BRCA and independent clinical cohorts. Elevated expression was an independent predictor of poor overall survival (HR = 20.83, 95% CI 2.76-157.35; p < 0.001) and displayed superior prognostic power compared with TNM stage. A nomogram integrating tRF-30-PW5SVP9N15WV achieved a C-index of 0.78, with time-dependent ROC A
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.