The relationship between thyroid function and pancreatic disease has been observed clinically, yet causality remains unestablished. We applied bidirectional Mendelian randomization using genetic instruments from genome-wide association studies encompassing over 500,000 individuals to determine causal relationships. We demonstrate that genetic liability to hypothyroidism substantially protects against acute pancreatitis (odds ratio 0.37, 95 % CI 0.17-0.80). Genetically elevated basal metabolic rate increases acute pancreatitis risk (OR 1.16) while decreasing chronic pancreatitis risk (OR 0.77),
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Occupational dust is a widespread environmental contaminant associated with cardiovascular disease risk, yet its underlying molecular mechanisms remain insufficiently elucidated. This study investigated the associations between occupational respirable dust exposure (CDE) and early indicators of cardiovascular risk in 8662 participants from the China-Northern Anhui Coal Workers Cohort (C-NACWC). To explore potential mechanisms, we employed an integrative multi-omics approach, combining serum lipidomics from these participants with publicly available single-cell RNA sequencing data (GSE159677) f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
GATA2 deficiency predisposes patients to recurrent infections, myelodysplastic neoplasms (MDSs), and malignancies through disrupted hematopoiesis and immune dysfunction. The role of the gut microbiome (GM) in this condition remains poorly defined. In this multicenter study, we analyzed GM composition, metabolomic, and lipidomic profiles in 12 Italian GATA2-deficient patients, comparing non-HSCT and post-HSCT GATA2-deficient individuals with healthy controls. Non-HSCT patients showed a relative enrichment of Proteobacteria-associated Gram-negative taxa, accompanied by increased levels of metabo
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Emodin exhibits promising hepatomodulatory potential, yet its precise actions remain poorly characterized across distinct hepatic pathological states. Dose-dependent effects of emodin (40, 80, and 120 mg/kg) were investigated in mice with metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease (MASLD), as well as healthy control mice, through integrated histopathological, biochemical, metabolomic, and gut microbiota profiling. The 80 mg/kg dose tended to yield the most favorable hepatoprotective outcomes in MASLD mice, whereas the 120 mg/kg dose was accompanied by apparent adverse hepatic alt
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Suicide is defined as an intentional act of ending one's own life. Suicide attempt (SA) is a significant risk factor for suicide death. Research on SA has progressed from socio-psychological perspectives to the molecular and genetic levels. While the biological mechanisms underlying genome-wide association studies (GWAS) identified risk loci remain largely unclear. To investigate the potential risk mechanisms, we constructed a systematic analytic pipeline using brain protein quantitative trait locus (pQTL) datasets (Banner, N=152; ROSMAP, N=376), a brain expression quantitative trait locus (eQ
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) is characterized not only by neuronal dysfunction but also by profound remodeling of the brain microenvironment, including immune-glial activation and metabolic dysregulation. Increasing evidence also implicates neurosteroid-related pathways in AD and dementia. Nobiletin has shown neuroprotective effects in AD-related models, but its upstream human targets and mechanism-based translational relevance remain insufficiently defined. Here, we integrated multi-omics analyses, interpretable machine learning, causal inference, structural modeling, and experimental validation
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
European journal of surgical oncology : the journal of the European Society of Surgical Oncology and the British Association of Surgical Oncology2026eng
BACKGROUND: Neoadjuvant treatment response in rectal cancer is highly heterogeneous, complicating patient selection for organ-preservation strategies. Robust biomarkers capable of accurately predicting treatment response are needed to improve personalized treatment decisions.
METHODS: We conducted a narrative review of studies published since 2015 evaluating predictors of response to neoadjuvant therapy in rectal cancer. A comprehensive PubMed/MEDLINE search identified evidence across six domains: (1) genomic and molecular biomarkers, (2) imaging-based biomarkers, (3) histopathological and di
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Temperament, as a determinant of behavioural and emotional responses, has a substantial adaptive value in different environments. This study aims to investigate the association between the gut microbiota and temperament plasticity, and clarify the potential metabolic mechanism that underpins that association by running a multi-omics study in sheep.
METHODS: The TrackSheep research cohort was generated using 200 healthy juvenile Merino ewes, and the rumen microbiota, plasma metabolome, and temperament phenotype was measured.
RESULTS: Rumen metagenomic analysis identified 25 microb
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gut microbiome shapes cancer progression and treatment responses, yet scalable microbiome-targeted interventions remain limited. We screened commercial probiotics for activation of the host aryl hydrocarbon receptor (AhR) and identified the yeast Saccharomyces boulardii as a consistent AhR activator. In an immunocompetent syngeneic colorectal cancer model, daily oral gavage of S. boulardii slowed growth of established subcutaneous tumors without detectable tumor colonization. Integrated profiling of the gut microbiome, circulating metabolites, cytokines, and tumor transcriptomes revealed a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: The rapid accumulation of multi-omics data presents a valuable opportunity to advance our understanding of complex diseases and biological systems, driving the development of integrative computational methods. However, the complexity of biological processes, spanning multiple molecular layers and involving intricate regulatory interactions, requires models that can capture both intra- and cross-omics relationships. Most existing integration methods primarily focus on sample-level similarities or intra-omics feature interactions, often neglecting the interactions across different om
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The advent of single-cell genomics has revealed profound cellular heterogeneity, yet transcriptomic profiling alone often fails to show the functional proteomic state of a cell. Cellular indexing of transcriptomes and epitopes by sequencing (CITE-seq) emerged to bridge this critical gap, enabling the simultaneous quantification of RNA and surface protein expression within individual cells. This transformative technology leverages oligonucleotide-conjugated antibodies to assess protein abundance using a panel of marker-specific tags, which are cocaptured with cellular messenger RNA in single-ce
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rhizome of Drynaria roosii (Drynariae Rhizoma) holds significant medicinal and economic value. It is traditionally used to promote blood circulation, remove blood stasis, and strengthen the kidneys and bones. However, the distribution and biosynthetic pathways of medicinal compounds in different tissues of D. roosii remain unclear. In this study, non-targeted metabolomics and transcriptomics analyses were conducted on leaves, stems, and tubers of D. roosii, and a high-quality reference transcriptome was obtained using Pacific BioSciences (PacBio) single-molecule real-time (SMRT) sequencing
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/OBJECTIVES: This study aims to reveal the physiological and molecular regulatory mechanisms of the genuine medicinal herb I. suzhouensis K. F. Zhai, Z. B. Han & S. B. Zhou (Wangzaozi) of Anhui province in response to drought stress, and clarify the regulatory patterns of drought adversity on the accumulation of its medicinal active ingredients.
METHODS: Mild natural drought treatment was applied to I. suzhouensis. Combined with Illumina high-throughput transcriptome sequencing and HPLC-MS/MS targeted metabolomics detection, this study jointly deciphered the dynamic changes in gene
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chi-flavor Baijiu is a unique liquor in the Pearl River Delta region. Ethyl lactate is the key flavor with low content in base liquor, affecting qualities of Chi-flavor Baijiu. To address this issue, Limosilactobacillus fermentum Y8 (Y8) isolated from sour mash, was used to fortify the fermentation. Results showed that contents of ethyl acetate and ethyl lactate reached to 663.55 mg/L and 604.25 mg/L, increased by 334.97% and 331.26%, respectively, with that of ethanol unchanged and main higher alcohols reduced significantly. Metagenomic analysis revealed that Lactiplantibacillus, Limosilactob
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cardiovascular-kidney-metabolic (CKM) syndrome integrates excess adiposity, metabolic dysfunction, kidney impairment, subclinical cardiovascular diseases, and clinical events along a staged continuum that invites unified prevention and treatment. Ultra-processed foods (UPFs) are a complex, high-prevalence exposure that may influence risk across CKM stages through nutrient profiles, additives, processing-induced compounds, and packaging-related contaminants. This review synthesizes epidemiologic, mechanistic, and translational evidence with attention to exposure definition and analytic rigor. W
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mitochondrial single-cell lineage tracing has recently emerged as a scalable and non-invasive tool to trace somatic cell lineages. However, the reliability and resolution of this technology remains highly debated. Here, we present MiTo, a novel end-to-end framework for robust mitochondrial single-cell lineage tracing data analysis. Benchmarked against real-world datasets, MiTo outperforms state-of-the-art methods and baselines in data pre-processing and clonal inference. Applied to a time-resolved dataset of breast cancer evolution (>2,500 cells), MiTo accurately infers ground-truth cell linea
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hyperuricemia (HUA) is a major risk factor for gout and multiple metabolic disorders. Although serum uric acid (UA) is the gold standard for HUA diagnosis, it fails to reflect early metabolic disturbances and shows limited predictive value for asymptomatic HUA. This study sought to elucidate the pathological mechanisms underlying HUA and identify novel diagnostic biomarkers beyond UA.
METHODS: This study enrolled 195 patients with HUA and 98 healthy controls. Global metabolomics and proteomics profiling were performed to characterize molecular alterations underlying HUA. Based on
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Obesity is a negative prognostic factor in BC, a heterogeneous and complex disease representing the leading cause of mortality from female cancer. Within the breast tumour microenvironment (TME), adipocytes, fibroblasts, immune cells and the extracellular matrix are aberrantly activated in obesity, leading to inflammatory responses, together with hormonal and metabolic changes, and activation of oncogenic pathways that facilitate disease progression. To fully grasp the metabolic complexity and heterogeneity of obese BC patients, proper experimental models, able to mimic the aberrant interactio
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic kidney disease (CKD) is a significant public health problem worldwide because of its increasing prevalence and strong association wi … gnificant challenges to their research and clinical applications remain, including the high cost of multiomics profiling and the complexity of assessing comparative cardiovascular risk between multidimensional omics data across different stages of CKD. In this article, based on a comprehensive literature search on PubMed and Google Scholar, we review emergin …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Inferring partial correlation networks is essential in systems biology to uncover direct interactions between biological entities. Traditional Gaussian graphical models rely on the assumption of normally distributed data; this assumption is not satisfied when dealing with multi-omics datasets comprising heterogeneous data types such as continuous and discrete variables.
RESULTS: We propose a novel likelihood-based approach for network inference using a Gaussian copula model with semiparametric pairwise-likelihood estimation of the latent correlation matrix. The inferred correlatio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.