The Nova family of proteins are target antigens in the autoimmune disorder paraneoplastic opsoclonus-myoclonus ataxia and contain K-homology (KH)-type RNA binding domains. The Nova-1 protein has recently been shown to regulate alternative splicing of the alpha2 glycine receptor subunit pre-mRNA by binding to an intronic element containing repeats of the tetranucleotide UCAU. Here, we have used selection-amplification to demonstrate that the KH3 domain of Nova recognizes a single UCAY element in the context of a 20-base hairpin RNA; the UCAY tetranucleotide is optimally presented as a loop elem
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sporotrichosis is an emerging chronic, granulomatous, subcutaneous, mycotic infection caused by Sporothrix species. Sporotrichosis is treated with the azole drug itraconazole as ketoconazole is ineffective. It is a well-known fact that azole drugs act by inhibiting cytochrome P450 monooxygenases (P450s), heme-thiolate proteins. To date, nothing is known about P450s in Sporothrix schenckii and the molecular basis of its resistance to ketoconazole. Here we present genome-wide identification, annotation, phylogenetic analysis and comprehensive P450 family-level comparative analysis of S. schencki
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oil bodies (OBs) are native lipid storage organelles in plant seeds that form highly stable natural emulsification systems stabilized by intrinsic proteins (IPs). However, the poor water solubility of IPs limits their practical application in food systems. Herein, a stable two-protein complex was constructed by the simultaneous folding and co-assembly of IPs with extrinsic proteins (EPs). The co-assembly significantly improved the dispersibility of IPs and reduced their particle size, yielding a nanocomposite with a hydrophobic core that formed an OB-inspired interfacial barrier partially mimi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The structure of the complex between the transcription cofactor Vgll1 and the transcription factor TEAD4, the mammalian equivalent of the Drosophila Vestigial and Scalloped, respectively, is determined in this study. Remarkably, Vgll1 interacts with TEAD in a manner similar to the transcription coactivators, as well as oncogenes YAP and TAZ, despite having a varied primary sequence. Vgll1-TEAD complex upregulates the expression of IGFBP-5, a proliferation-promoting gene, and facilitates anchorage-independent cell proliferation. The YAP/TAZ-TEAD complex also upregulates several other proliferat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Rho family GTPases, Cdc42, Rac and Rho, regulate signal transduction pathways via interactions with downstream effector proteins. We report here the solution structure of Cdc42 bound to the GTPase binding domain of alphaPAK, an effector of both Cdc42 and Rac. The structure is compared with those of Cdc42 bound to similar fragments of ACK and WASP, two effector proteins that bind only to Cdc42. The N-termini of all three effector fragments bind in an extended conformation to strand beta2 of Cdc42, and contact helices alpha1 and alpha5. The remaining residues bind to switches I and II of Cdc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aggregation of amyloid-β (Aβ) into oligomers and fibrillary structures is critical for the pathogenesis of Alzheimer's disease (AD). Recently, research effort has been focused on developing novel agents that can preferentially suppress Aβ oligomer mediated toxicities, for example, by directly targeting these toxic assemblies. The compound RD2 has been developed and optimized for Aβ42 monomer binding and stabilization of the monomer in its native intrinsically disordered conformation. It has been demonstrated to improve and even reverse the cognitive and behavioral deficits in AD mouse mode
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Several gram-positive pathogenic bacteria employ near-iron transporter (NEAT) domains to acquire heme from hemoglobin during infection. However, the structural requirements and mechanism of action for NEAT-mediated heme extraction remains unknown. Bacillus anthracis exhibits a rapid growth rate during systemic infection, suggesting that the bacterium expresses efficient iron acquisition systems. To understand how B. anthracis acquires iron from heme sources, which account for 80% of mammalian iron stores, we investigated the properties of the five-NEAT domain hemophore IsdX2. Using a combinati
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parkinson's disease (PD) is characterized by dopaminergic dysfunction and degeneration. DJ-1/PARK7 mutations have been linked with a familial form of early onset PD. In this study, we found that human DJ-1 wild type and the missense mutants M26I, R98Q, A104T and D149A were stable proteins in cells, only the L166P mutant was unstable. In parallel, the former were not degraded and the L166P mutant was directly degraded in vitro by proteasome-mediated endoproteolytic cleavage. Furthermore, genetic evidence in fission yeast showed the direct involvement of proteasome in the degradation of human DJ
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteogenesis imperfecta (OI), a disorder characterized by fragile bones, is often a consequence of missense mutations in type I collagen, which change one Gly in the repeating (Gly-Xaa-Yaa)(n) sequence to a larger amino acid. The impact of local environment and the identity of the residue replacing Gly were investigated using two sets of triple-helical peptides. Gly mutations in the highly stable (Pro-Hyp-Gly)(10) system are compared with mutations in T1-865 peptides where the mutation is located within a less stable natural collagen sequence. Replacement of a Gly residue by Ala, Ser, or Arg l
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vibrio cholerae accessory cholera enterotoxin (Ace) is the third toxin, along with cholera toxin (CT) and zonula occludens toxin (Zot), that causes the endemic disease cholera. Structural characterization of Ace has been restricted because of the limited production of this toxic protein by V. cholerae. We have cloned, overexpressed, and purified Ace from V. cholerae strain O395 in Escherichia coli to homogeneity and determined its biological activity. The unfolding of the purified protein was investigated using circular dichroism and intrinsic tryptophan fluorescence. Because Ace is predominan
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The αA-crystallin protein plays a vital role in maintaining the refractive index and transparency of the eye lens. Significant clinical studies have emerged as the αA-crystallin is prone to aggregation, resulting in the formation of cataracts with varied etiologies due to mutations. This work aims to comprehend the structural and functional role of cataract-causing mutations in αA-crystallin, particularly at N-Terminal and α-Crystallin Domains, using in-silico approaches including molecular dynamics simulation. About 19 mutants of αA-crystallin along with native structure were simulated for 10
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biomolecular interactions are central to many essential cellular processes, but RNA-containing complexes remain challenging to resolve structurally, even as experimental methods and AI-based prediction have expanded structural coverage. Tools for the integrated analysis of interfaces within such complexes remain limited. We present ProNA3D, a tool that provides a unified platform for analyzing protein-nucleic acid and nucleic acid-only complexes, bridging the gap between structure prediction and functional interpretation. ProNA3D supports both experimental and computationally predicted structu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The NMR structure of a new toxin, butantoxin (BuTX), which is present in the venoms of the three Brazilian scorpions Tityus serrulatus, Tityus bahiensis, and Tityus stigmurus, has been investigated. This toxin was shown to reversibly block the Shaker B potassium channels (K(d) approximately 660 nM) and inhibit the proliferation of T-cells and the interleukin-2 production of antigen-stimulated T-helper cells. BuTX is a 40 amino acid basic protein stabilized by the four disulfide bridges: Cys2-Cys5, Cys10-Cys31, Cys16-Cys36, and Cys20-Cys38. The latter three are conserved among all members of th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Systemic amyloidosis is caused by the misfolding of a circulating amyloid precursor protein and the deposition of amyloid fibrils in multiple organs. Chemical and biophysical analysis of amyloid fibrils from human AL and murine AA amyloidosis reveal the same fibril morphologies in different tissues or organs of one patient or diseased animal. The observed structural similarities concerned the fibril morphology, the fibril protein primary and secondary structures, the presence of post-translational modifications and, in case of the AL fibrils, the partially folded characteristics of the polypep
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Cystic Fibrosis (CF) is a lethal genetic disorder caused by variants in CF transmembrane conductance regulator (CFTR). Many variants are treatable with correctors, which enhance the folding and trafficking of CFTR. However, approximately 3% of persons with CF harbor poorly responsive variants. Here, we used affinity purification mass spectrometry proteomics to profile the protein homeostasis (proteostasis) changes of CFTR variants during correction to assess modulated interactions with protein folding and maturation pathways. Responsive variant interactions converged on similar pro
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The solid-phase synthesis, structural characterization, and biological evaluation of a small library of cancer-targeting peptides have been determined in HepG2 hepatoblastoma cells. These peptides are based on the highly specific Pep42 motif, which has been shown to target the glucose-regulated protein 78 receptors overexpressed and exclusively localized on the cell surface of tumors. In this study, Pep42 was designed to contain varying lengths (3-12) of poly(arginine) sequences to assess their influence on peptide structure and biology. Peptides were effectively synthesized by 9-fluorenylmeth
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study investigated the locations of amino acid modifications within two major human hair keratins (Type I K31 and Type II K85) with probable implications for protein and hair structural component integrity. The particular focus was on cysteine modifications that disrupt intra-protein and inter-protein disulphide bonds.
METHODS: Human hair was exposed to accelerated, sequential heat or UV treatments, simulating effects resulting from the use of heated styling tools and environmental exposure over a time frame approximating one year. The proteins were extracted and detected usin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The retromer is a highly conserved multimeric protein complex present in all eukaryotic cells whose activity is essential for regulating the recycling and retrieval of numerous protein cargos from the endosome to trans-Golgi network or the cell surface. In recent years, molecular and genomic studies have provided evidence that aberrant regulation of endosomal protein sorting and trafficking secondary to a dysfunction of the retromer complex could be implicated in the pathogenesis of several neurodegenerative diseases. Thus, deficiency or mutations in one or more protein components of the retro
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The tendency of HIV-1 Nef to form aggregates in solution, particularly at pH values below 8, together with its large fraction of highly mobile residues seriously complicated determination of its three-dimensional structure, both for heteronuclear solution NMR (Grzesiek et al., 1996a, Nat Struct Biol 3:340-345) and for X-ray crystallography (Lee et al., 1996, Cell 85:931-942). Methods used to determine the Nef structure by NMR at pH 8 and 0.6 mM concentration are presented, together with a detailed description of Nef's secondary and tertiary structure. The described techniques have general appl
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The XPA (xeroderma pigmentosum group A) gene encodes a protein of 273 amino acids with a zinc finger motif. The human XPA cDNA was placed in an Escherichia coli expression vector for the synthesis of the recombinant XPA protein. The molecular weight of the wild-type protein was about 40 kDa in SDS-PAGE. Microinjection of the wild-type protein specifically restored the defect of UV-induced unscheduled DNA synthesis in XP-A cells. Thus, the bacterially expressed XPA protein retains biochemical properties identical to those of natural sources. The wild-type protein binds preferentially to UV-, ci
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования