Heterologous expression of the biosynthetic gene cluster (BGC) is important for studying the microbial natural products (NPs), especially for those kept in silent or poorly expressed in their original strains. Here, we cloned the spinosad BGC through the Cas9-Assisted Targeting of Chromosome segments and amplified it to five copies through a ZouA-dependent DNA amplification system in Streptomyces coelicolor M1146. The resulting strain produced 1253.9 ± 78.2 μg l-1 of spinosad, which was about 224-fold compared with that of the parent strain carrying only one copy of the spinosad BGC. Moreover,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To investigate the resistance mechanisms and genetic support underlying the high resistance level of the Klebsiella pneumoniae strain CMUL78 to aminoglycoside and β-lactam antibiotics.
METHODS: Antibiotic susceptibility was assessed by the disc diffusion method and MICs were determined by the microdilution method. Antibiotic resistance genes and their genetic environment were characterized by PCR and Sanger sequencing. Plasmid contents were analysed in the clinical strain and transconjugants obtained by mating-out assays. Complete plasmid sequencing was performed with PacBio and I
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The purpose of this study was to investigate the gene amplification and clinical significance of the epithelial growth factor receptor (EGFR) gene in cervical lesions. This study was designed to detect the EGFR gene amplification by liquid-based cytology and fluorescence in situ hybridization (FISH) techniques in 78 cases of cervical various lesions [28 cases of normal control cervix, 26 low grade squamous intraepithelial lesion (LSIL) and 25 high grade squamous intraepithelial lesion (HSIL)]. Positive gene amplification rates of the EGFR gene in normal cervix, LSIL and HSIL were 7.14%, 23.08%
Сравнительное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study was designed to investigate whether a correlation exists between amplification of the human telomerase gene (human telomerase RNA component [TERC]) and high-risk human papillomavirus (HR-HPV) infection in 101 women with cervical intra-epithelial neoplasia (CIN). Eight patients (7.9%) had CIN 1, 24 (23.8%) had CIN 2 and 69 (68.3%) had CIN 3. TERC was amplified in 31.7% of all CIN patients. The difference in frequency of TERC amplification between patients with low-grade CIN (CIN 1) and those with high-grade CIN (CIN 2 and CIN 3) was not significant. HR-HPV infection was detected in 8
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Conventional polymerase chain reaction (PCR) testing requires many pipetting steps and has to be transported and stored in cold chain. To overcome these limitations, we designed a ready-to-use PCR test for Salmonella typhi using PCR reagents, primers against the ST50 gene of S. typhi, a built-in internal amplification control (IAC), and gel loading dye mixed and freeze-dried in a single tube. The 2-step dry-reagent-based assay was used to amplify a 1238-bp target gene and an 810-bp IAC gene from 73 BACTEC blood culture broths (33 true positives for S. typhi and 40 true negatives for non-S. typ
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The HER-2/neu oncogene encodes a transmembrane receptor with intrinsic tyrosine kinase activity. A pilot study was performed to investigate downstream effects of HER-2/neu (or related growth factor receptor) activation by identifying phosphorylated tyrosine. Fifty-four breast carcinomas were evaluated for HER-2/neu overexpression by the HercepTest (Dako, Carpinteria, CA) and the monoclonal CB11 antibody (Ventana, Tucson, AZ). Phosphotyrosine (an indication of tyrosine kinase activity) was detected by an antiphosphotyrosine mouse monoclonal antibody (Upstate Biotechnology, Lake Placid, NY). The
Сравнительное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gene amplification resulting from double strand breaks (DSBs) is a typical genetic alteration in tumorigenesis and drug-resistant progression. Amplified oncogenes and drug-resistant genes are present on extrachromosomal DNAs (ecDNAs), or chromosomal homogeneously staining regions (HSRs). Considering the role of mismatch repair (MMR) as a sensor of DSBs, we hypothesized that MMR may be involved in gene amplification. We used two MTX-resistant HT-29 colorectal cancer cell lines, which served as models with amplified genes mainly in HSRs or ecDNAs. Expression of MSH2, a key protein in MMR, was in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Anaplastic lymphoma kinase (ALK)-rearranged renal cell carcinoma (ALK-RCC) is a rare molecularly defined tumor entity included in the fifth edition of the World Health Organization Classification of Tumors. It is characterized by rearrangement of the ALK gene with various fusion partner genes, which most commonly results in oncogenic fusion proteins leading to ALK activation.
CASE PRESENTATION: A 30-year-old Chinese man underwent partial nephrectomy for a left renal tumor measuring 5 cm in diameter. Histologically, the tumor is pleomorphic and arranged in papillary, tubular, and s
СтатьяКлинический случайОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Investigate the prevalence of ERBB2/HER2 gene amplification among patients with gynecologic malignancies.
METHODS: The American Association of Cancer Research (AACR) Genomics Evidence of Neoplasia Information Exchange (GENIE) (version 13.1) database was accessed and patients with endometrial, ovarian, and cervical cancer were identified. Patients with available data on the presence of copy-number gene alterations were selected for further analysis. Incidence of ERBB2 amplification following stratification by tumor site and histology was evaluated. Data from the OncoKB database, as
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: bla TEM-1 encodes a narrow-spectrum β-lactamase that is inhibited by β-lactamase inhibitors and commonly present in Escherichia coli. Hyperproduction of blaTEM-1 may cause resistance to penicillin/β-lactamase inhibitor (P/BLI) combinations.
OBJECTIVES: To characterize EC78, an E. coli bloodstream isolate, resistant to P/BLI combinations, which contains extensive amplification of blaTEM-1 within the chromosome.
METHODS: EC78 was sequenced using Illumina and Oxford Nanopore Technology (ONT) methodology. Configuration of blaTEM-1 amplification was probed using PCR. Expression of bla
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: To assess differences in methylation profiles, and thus pathogenesis, between Epstein-Barr virus (EBV)-positive and negative nasopharyngeal carcinomas (NPCs). Also, promoter hypermethylation is a common phenomenon in early carcinogenesis to inactivate tumour suppressor genes. Since epigenetic changes are reversible, the therapeutic application of methylation inhibitors could provide treatment options.
METHODS: We evaluated promoter hypermethylation profiles of 22 common tumour suppressor genes in 108 NPCs using methylation-specific multiplex ligation-dependent probe amplification. Corre
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Аннотация не предоставлена источником. Откройте карточку для перехода к публикации.
Письмо в редакциюПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report a case of acute mixed-lineage leukemia, as seen in a 65 year-old female with MLL gene amplification and biallelic loss of wild type p53 gene. The diagnosis was based on the findings that her bone marrow (BM) blasts expressed cytoplasmic CD3 (cyCD3), B-lineage antigens and myeloid antigens accompanied by clonal rearrangements of IgH gene. The BM blasts consisted of small-sized peroxidase-negative blasts (97%) and large-sized peroxidase-positive blasts (3%). The BM blasts showed a complex "karyotype," including dic(17;20) (p11;q11), -5 and add (11q23). Add (11q23) abnormality was found
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Deletions in the beta-globin cluster causing thalassaemia and hereditary persistence of fetal haemoglobin (HPFH) are uncommon and difficult to detect. Data in Chinese are very scarce.
AIMS: To use a recently available technique to investigate the frequencies and nature of beta-globin cluster deletions in Chinese.
METHODS: 106 subjects with phenotypes of thalassaemia or HPFH and suspected to have deletions in the beta-globin cluster were studied. A commercially available kit employing multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) was used to screen for deletions. Gap PCR
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The purpose of this study was to determine if any relationship exists between Her-2/neu gene amplification and estrogen receptor (ER), progesterone receptor (PR), MIB-1, grade, size and age in female breast cancer. Five hundred and eighteen female patients with invasive breast carcinoma, 390 ductal and 128 lobular, in which assessment of Her-2/neu amplification by fluorescence in-situ hybridization (FISH) has been performed, were reviewed retrospectively. Each patient was further assessed for ER, PR, MIB-1, grade, size and age at diagnosis. Chi-square analysis was then used to correlate the ab
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Characterization of mutations of the PKD1 gene has been limited by the fact that three-fourths of this gene at its 5' end is homologous to sequences of at least three other genes on the same chromosome. We have therefore developed a method of long reverse transcription PCR for selective amplification of the entire coding sequence of the PKD1 gene from its mRNA. A PCR primer specific to the sequence in the 3' unique region of the PKD1 gene was synthesized for use coupled with a primer binding to sequence in the homologous region at a distance of about 13.6 kb apart. The commercial availability
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: HER-2/neu gene amplification, established as a prognostic factor in breast carcinoma and other cancers, has not been correlated with outcome in prostate carcinomas (PCs).
METHODS: HER-2/neu gene amplification was determined by automated fluorescence in situ hybridization (FISH) using a unique sequence cosmid probe on 113 formalin fixed, paraffin embedded 4-microns tissue sections and the results compared with tumor grade, DNA ploidy, HER-2/neu protein expression by immunohistochemistry (IHC), serum prostate specific antigen, pathologic stage, and postoperative disease recurrence (
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Secondary attachment site lambda-lysogens were isolated in an Escherichia coli strain carrying multiple tandem 9.8 kb repeats. The repeat carried the structural gene for chromosomal beta-lactamase, ampC. One lysogen produced lysates with amp-transducing activity. Three types of phages with different densities were obtained from this lysogen. The one with the lowest density was found to be a helper lambda cI857S7 phage. The other two phage showed identical restriction endonuclease fragmentation patterns. The difference in density was due to the presence or absence of phage tail. In lambda damp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutation detection in the PKD1 gene proved to be difficult because two-thirds of the gene is reiterated several times on chromosome 16. Long-range PCR has been used previously to overcome this limitation, but due to a 2.5-kb polypyrimidine tract in intron 21, the screening capacity of the PKD1 gene using this technique was hindered. Here we report the measures that we have used to overcome this limitation.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Plasmodium vivax is the most widespread malaria parasite, and its cocirculation with Plasmodium falciparum often leads to underdiagnosis and underestimated transmission. We investigated whether underdiagnosis contributes to the selection and spread of drug-resistant parasites in coendemic areas of the Brazilian Amazon.
METHODS: We enrolled 727 confirmed malaria cases from three Brazilian states, primarily from Roraima in the Guiana Shield, a region characterized by cocirculation of P. vivax and P. falciparum, intense cross-border mobility, illegal mining activities, and informal a
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования