Gene dosage abnormalities account for a significant proportion of the mutations in genes tested in DNA diagnostic laboratories. Detection of these changes has proved a challenge as the methods available to date are time consuming or unreliable. The multiplex ligation-dependent probe assay (MLPA) is a new technique allowing relative quantification of up to 40 different nucleic acid sequences in a single reaction tube. We have evaluated MLPA for potential use in the diagnostic setting against the following criteria: accuracy, reagent cost, hands-on time, reliability, and retests required. A tota
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To prospectively assess bone density and the factors determining the rate of bone loss over a 10-year period of postmenopausal life.
DESIGN: Prospective, observational study.
METHODS: One hundred and four normal White postmenopausal women, baseline mean age 59 years (range 47-71 years) completed the study (mean duration of follow-up 10.2 years, range 9.4-10.6 years). None had diseases or were taking medications affecting bone metabolism at entry to the study. Information was collected on medical, fracture and smoking history, alcohol use, dietary calcium intake and physical activi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Muir-Torre syndrome (MTS) is characterized by the co-existence of sebaceous gland tumors of the skin and internal malignancies. Currently, MTS is regarded as a variant of the hereditary non-polyposis colon cancer syndrome (HNPCC). Both MTS and HNPCC are secondary to germline mutations in DNA mismatch repair genes (mainly MSH-2 and MLH-1).
METHODS: Cutaneous (eight sebaceous adenomas, one sebaceous carcinoma and one keratoacanthoma) and internal tumors (four colonic adenocarcinomas, two endometrial carcinomas, two transitional cell carcinomas of renal pelvis and ureter, one adenoca
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ovarian cancer is the fifth most common cause of cancer death in women in Western countries and family history is one of the strongest known risk factors. Approximately 5 to 13% of all ovarian cancer cases are caused by the inheritance of cancer predisposing genes with an autosomal pattern of transmission. The inherited fraction of ovarian cancer may differ between populations. Based on analysis of familial ovarian cancer pedigrees and other epidemiological studies, three hereditary ovarian cancer syndromes have been defined. The identification of the genes responsible for most hereditary ovar
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Left and right colon carcinomas can display different clinical, pathologic, and genetic characteristics. The purpose of this study was to characterize multiple molecular genetic alterations in sporadic colon carcinoma and to correlate them with the location of the tumors and with lymph node metastasis.
METHODS: One hundred and twenty-five cases of sporadic colon carcinoma (50 in the right colon and 75 in the left colon in patients with no family history of colon carcinoma) were studied. Status of the p53 gene was assessed by polymerase chain reaction (PCR), single strand conformat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Both pembrolizumab (P) and combination of pembrolizumab with platinum-based chemotherapy (PCT) represent standard 1st-line options for advanced non-small cell lung cancer (aNSCLC) with PD-L1 tumor proportion score (TPS) ≥50%. The two strategies have never been compared in a randomized trial. 256 consecutive patients with EGFR/ALK/ROS1-wild-type PD-L1 TPS ≥50% aNSCLC receiving P (group P, n = 203) or PCT (group PCT, n = 53) as a 1st-line treatment were identified in the electronic databases of 4 Israeli cancer centers. Time-to-treatment discontinuation (TTD) and overall survival (OS) were asses
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Immunohistochemistry for mismatch repair (MMR) proteins is being increasingly used to examine MMR status in tumours. The aim of the present article was to report the case of a colon cancer patient with Lynch syndrome who showed unusual cytoplasmic MMR protein localization.
METHODS AND RESULTS: Histologically, the colon cancer was diagnosed as medullary carcinoma associated with prominent tumour-infiltrating lymphocytes and a Crohn's-like reaction. Immunohistochemistry revealed cytoplasmic and nuclear expression of MSH2 in non-neoplastic cells, and exclusively cytoplasmic expression in t
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: A subset of microglandular adenosis (MGA) displays protein expression and molecular genetic alterations similar to those of synchronous triple-negative breast carcinoma (TNBC), supporting the hypothesis that MGA is a non-obligate precursor lesion to a subset of breast carcinomas. Here, we further explore this association in the context of genomic instability.
METHODS: We use whole-genome sequencing to investigate the genetic landscape of two unusual cases of MGA associated with carcinoma in the setting of two distinct varieties of genomic instability.
RESULTS: The first case describes
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Drug resistance significantly limits the efficacy of chemotherapy. The DNA mismatch repair (MMR) system maintains genomic stability by correcting DNA errors. During DNA-damaging treatments, cancer cells transiently increase their adaptive mutability, also known as microsatellite instability (MSI), to evade therapeutic pressure through MMR downregulation, conferring drug resistance. However, an understanding of the underlying mechanisms of MMR protein downregulation under DNA-damaging drugs remains limited. Our study reveals a negative correlation between SIRT7 protein levels and MMR core prote
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Muir-Torre syndrome (MTS) is clinically characterized by the occurrence of skin, usually sebaceous, and visceral tumors in the same individual. The most common underlying mechanism is a constitutional defect of the mismatch repair (MMR) genes that cause Lynch syndrome (LS). Herewithin we report on a 76 years-old male patient heterozygous for a pathogenic MSH2 missense substitution who presented with a striking cutaneous phenotype in the absence of typical LS visceral tumors. The patient developed 20 skin tumors, including sebaceous adenomas/carcinomas and keratoacanthomas. Two skin tumors show
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microsatellite instability and reduced expression of mismatch repair proteins were reported in melanomas. However, little is known about mutational changes of the mismatch repair genes in radial growth-phase melanoma especially following UVB irradiation. To investigate these changes, an in vitro system consisting of radial growth-phase Wistar melanoma cell lines (WM35, WM3211 and WM1650) was established. The cells were UVB irradiated (10 mJ/cm(2)), and evaluated for mutational changes of exon regions 13,16 and 19 (hMLH1) and 6,7 and 12 (hMLH2) of these genes before and after irradiation. The g
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have characterized the role of genetic alterations in the development of liver fluke related cholangiocarcinoma. We analyzed the loss of heterozygosity (LOH) and microsatellite instability (MSI) of hMSH2, hMLH1, and p53 genes in 55 patients with intrahepatic cholangiocarcinoma by using polymerase chain reaction based microsatellite markers D2S119, D3S1611, and TP53, respectively and determined the association between microsatellite alterations and patient survival. A total of 27 (49.1%) out of 55 cases exhibited microsatellite alterations in one locus or more. Of 55 samples, 11 (20%) demons
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Defects in DNA mismatch repair genes MLH1 and MSH2, first described in hereditary nonpolyposis colon cancer (HNPCC), have been postulated to be responsible for malignant transformation in several tumours. To date there are no data on cutaneous tumours. Using a PCR assay it was possible to identify deletions in MSH2 (exonic regions 12 and 13) in 16 of 47 lentigos maligna and in 10 of 36 malignant melanomas. Deletions in MLH1 (exonic regions 15 and 16) were found in 11 of 47 lentigos and in 15 of 36 melanomas. Comparison of DNA ploidy-related parameters between lentigos with and without exonic d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent characterization of the molecular genetic basis of hereditary nonpolyposis colorectal cancer provides an important opportunity for identification of individuals and their families with germline mutations in mismatch repair genes. Cancer family history criteria that accurately define hereditary colorectal cancer are necessary for cost-effective testing for germline mutations in mismatch repair genes. The present report describes the results of analysis of 33 colorectal cancer cases/families that satisfy our modified family history criteria (Mount Sinai criteria) for colorectal cancer. Fo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Lip squamous cell carcinoma (LSCC) is associated with malignant transformation of actinic cheilitis (AC). Since solar radiation alters the functions of mismatch repair (MMR) complex, we evaluated for their possible role in lip carcinogenesis.
MATERIALS AND METHODS: Samples of normal lip epithelia (NLE) (n=15), AC (n=30), and LSCC (n=45) were subjected to immunohistochemistry for MutSα (MSH2/MSH6) and MutLα (MLH1/PMS2) to assess the percentage (brown nuclei over all the keratinocytes in NLE and AC or all tumoral cells in LSCC) of nuclear positive cells and MSH2/MSH6 (MutSα-imbalance
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lynch syndrome (LS) is a hereditary cancer predisposition that increases risk for colorectal, endometrial, and other cancers. Although population-based genomic screening programs identify individuals with LS, clinical presentation in such genomically ascertained populations is unknown.
METHODS: MyCode is a healthcare system-based biobank that returns clinically actionable genomic screening results to participants, including pathogenic/likely pathogenic (P/LP) variants in LS genes (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2). Adult cases (participants with an LS result) and controls (participants with
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Previous estimates of the prevalence of mismatch repair (MMR) deficiency and Lynch syndrome in small bowel cancer have varied widely. The aim of this study was to establish the prevalence of MMR deficiency and Lynch syndrome in a large group of small bowel adenocarcinomas.
METHODS: To this end, a total of 400 small bowel adenocarcinomas (332 resections, 68 biopsies) were collected through the Dutch nationwide registry of histopathology and cytopathology (Pathologisch-Anatomisch Landelijk Geautomatiseerd Archief (PALGA)). No preselection criteria, such as family history, were applied, th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: For more precise, personalized care in prostate cancer (PC), a new classification based on molecular features relevant for prognostication and treatment stratification is needed. Genomic aberrations in the DNA damage repair pathway are common in PC, particularly in late-stage disease, and may be relevant for treatment stratification.
OBJECTIVE: To review current knowledge on the prevalence and clinical significance of aberrations in DNA repair genes in PC, particularly in metastatic disease.
EVIDENCE ACQUISITION: A literature search up to July 2016 was conducted, including clinical
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Increased risk for urological tumors has been observed in mutation carriers with Lynch syndrome (LS). In this study, we evaluated the clinical features of uroepithelial (bladder and ureter) and kidney cancers in 974 Finnish mutation carriers. Altogether 30 patients had a total of 34 urological tumors: 12 ureter, 12 bladder, and 10 kidney cancers. Urological tumor was the only tumor in 9 (30 %) patients, and metachronous other tumor occurred in 21 (70 %). The occurrence of uroepithelial cancers was significantly higher in MSH2 mutation carriers (6 %; 95 % CI, 2.7-11.0) than in MLH1 carriers (2
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
METHODS: In this study, to investigate the significance of mismatch repair genes (MMR) promoter methylation and expression in the pathogenesis and malignant transformation of hydatidiform moles, we assayed promoter methylation and protein expression of the MMR genes hMLH1 and hMSH2 in gestational trophoblastic diseases (GTDs). DNA was extracted from normal placentas, partial hydatidiform moles, complete hydatidiform moles, and invasive moles, over-digested by methylation-sensitive endonuclease Hpa II, and then the promoters were amplificated by polymerase chain reaction. The protein expression
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.