Inherited metabolic diseases (IMDs) of the liver represent a vast and diverse group of rare genetic diseases characterized by the loss or dysfunction of enzymes or proteins essential for metabolic pathways in the liver. Conventional gene therapy involving adeno-associated virus (AAV) serotype 8 vectors provide therapeutically high levels of hepatic transgene expression facilitating the correction of the disease phenotype in pre-clinical studies and are currently being evaluated in clinical trials for multiple IMDs. However, insertional mutagenesis and immunogenicity risks as well as efficacy l
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Integration-deficient lentiviral vectors (IDLVs) are promising gene delivery tools that retain the high transduction efficiency of standard lentiviral vectors, yet fail to integrate as proviruses and are instead converted into episomal circles. These episomes are metabolically stable and support long-term expression of transgenes in non-dividing cells, exhibiting a decreased risk of insertional mutagenesis. We have embarked on an extensive study to compare the transduction efficiency of IDLVs pseudotyped with different envelopes (vesicular stomatitis, Rabies, Mokola and Ross River viral envelo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bobby sox homolog (Bbx) is an evolutionally conserved gene, but its biological function remains elusive. Here, we characterized defects of Bbx mutant rats that were created by PiggyBac-mediated insertional mutagenesis. Smaller body size and male infertility were the two major phenotypes of homozygous Bbx mutants. Bbx expression profile analysis showed that Bbx was more highly expressed in the testis and pituitary gland than in other organs. Histology and hormonal gene expression analysis of control and Bbx-null pituitary glands showed that loss of Bbx appeared to be dispensable for pituitary h
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Toxoplasma gondii cyst stage is resistant to drug therapy. To identify potential targets for new therapeutics, we screened insertional mutants of T. gondii for a reduced ability to form cysts in the brains of mice. In one of these mutants, named 38C3, the mutagenesis plasmid inserted into the mRNA of a protein that is highly conserved in microbes but is not present in humans. The mutation in 38C3 causes reduced brain cyst production during chronic infection, but does not affect acute virulence, so the disrupted gene and protein are called T. gondii Brain Colonization Protein 1 (TgBCP1). Tg
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recombinant adeno-associated viruses (rAAVs) have been tested in humans and other large mammals without adverse events. However, one study of mucopolysaccharidosis VII correction in mice showed repeated integration of rAAV in cells from hepatocellular carcinoma (HCC) in the Dlk1-Dio3 locus, suggesting possible insertional mutagenesis. In contrast, another study found no association of rAAV integration with HCC, raising questions about the generality of associations between liver transformation and integration at Dlk1-Dio3. Here we report that in rAAV-treated ornithine transcarbamylase (Otc)-de
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recessive dystrophic epidermolysis bullosa (RDEB) is characterized by a functional deficit of type VII collagen protein due to gene defects in the type VII collagen gene (COL7A1). Gene augmentation therapies are promising, but run the risk of insertional mutagenesis. To abrogate this risk, we explored the possibility of using engineered transcription activator-like effector nucleases (TALEN) for precise genome editing. We report the ability of TALEN to induce site-specific double-stranded DNA breaks (DSBs) leading to homology-directed repair (HDR) from an exogenous donor template. This process
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lentiviral vectors are under intense scrutiny as unique candidate viral vector vaccines against tumor and aggressive pathogens because of their ability to initiate potent and durable specific immune responses. Strategies that alleviate safety concerns will facilitate the clinical developments involving lentiviral vectors. In this respect, the development of integration deficient lentiviral vectors circumvents the safety concerns relative to insertional mutagenesis and might pave the way for clinical applications in which gene transfer is targeted to non-dividing cells. We thus evaluated the po
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Serratia marcescens strains are ubiquitous bacteria isolated from environmental niches, such as soil, water, and air, and also constitute emergent nosocomial opportunistic pathogens. Among the numerous extracellular factors that S. marcescens is able to produce, the PhlA phospholipase is the only described exoprotein secreted by the flagellar apparatus while simultaneously being a member of the flagellar regulon. To gain insight into the regulatory mechanism that couples PhlA and flagellar expression, we conducted a generalized insertional mutagenesis and screened for PhlA-deficient strains. W
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The klotho gene, originally identified by insertional mutagenesis in mice, suppresses multiple aging phenotypes, including atherosclerosis. We tested the hypothesis that the G-395A polymorphism of the klotho gene is associated with increased risk for 2 types of ischemic heart disease in Japanese.
METHODS: The study population consisted of 197 patients with coronary heart disease (CAD) who had >75% luminal diameter narrowing, 77 patients with vasospastic angina (VSA) without significant fixed coronary artery disease, and 331 healthy control subjects.
RESULTS: The frequency of the
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlamydomonas reinhardtii adapts to copper deficiency by degrading apoplastocyanin and inducing Cyc6 and Cpx1 encoding cytochrome c(6) and coproporphyrinogen oxidase, respectively. To identify other components in this pathway, colonies resulting from insertional mutagenesis were screened for copper- conditional phenotypes. Twelve crd (copper response defect) strains were identified. In copper-deficient conditions, the crd strains fail to accumulate photosystem I and light-harvesting complex I, and they contain reduced amounts of light-harvesting complex II. Cyc6, Cpx1 expression and plastocyan
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High-throughput functional assays, such as multiplexed assays of variant effect (MAVE), increasingly demand stable, precise integration of large DNA libraries into mammalian genomes. While CRISPR-based technologies excel at localized, small-scale edits, they are constrained by payload size limits, heterogeneous editing outcomes, and, depending on the specific modality and repair pathway utilized, potential variability in junction fidelity during multikilobase insertions. In this review, we highlight large serine recombinases (LSRs) as highly efficient, single-enzyme alternatives for unidirecti
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptococcus anginosus, part of the Streptococcus anginosus group (SAG), is a human commensal increasingly recognized as an opportunistic pathogen responsible for abscesses formation and infections, also invasive ones. Despite its growing clinical importance, the genetic determinants of its pathogenicity remain poorly understood. This study aimed to identify essential genes in S. anginosus 980/01, a bloodstream isolate, under nutrient-rich laboratory conditions using a transposon mutagenesis combined with Transposon-Directed Insertion Site Sequencing (TraDIS). A mutant library was generated u
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Protein-truncating variants in the TTN gene are a well-established cause of dilated cardiomyopathy (DCM). We report a novel case of DCM caused by a mobile element insertion (MEI) in TTN, through which we highlight the key features of MEIs in next-generation sequencing data. Because of the rarity of MEIs, the next-generation sequencing data features associated with these events may be mistaken as noise, potentially leading to missed diagnoses.
METHODS: Next-generation sequencing gene panel testing for DCM was performed on a 17-year-old male patient presenting with severe left ventr
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A 47-year-old man with a family history of juvenile dementia in his mother presented with memory loss and cognitive decline. Neuropsychological tests revealed impaired orientation, working memory, and apraxia. Magnetic resonance imaging revealed diffuse brain atrophy, and fluorodeoxyglucose positron emission tomography (PET) showed hypometabolism in the bilateral parietal lobes, posterior cingulate gyri, and precuneus, suggestive of Alzheimer's disease. However, amyloid-beta and tau PET scans were negative. Genetic testing revealed an abnormal repeat insertion in the prion protein gene, confir
СтатьяКлинический случайПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dyskeratosis congenita (DC) is an inherited bone marrow failure syndrome characterized by defects in telomere biology and clinical manifestations such as nail dystrophy, skin pigmentation abnormalities, and mucosal leukoplakia. Here, using whole exome sequencing (WES), whole genome sequencing (WGS), optical mapping sequencing (OGM), third-generation sequencing, and mRNA sequencing, we diagnosed a participant with PARN gene complex compound heterozygous variants. In addition, protein structure simulation, immunohistochemistry, and western blot were conducted to investigate the structure and exp
СтатьяКлинический случайПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infectious coryza (IC) is a respiratory disease in poultry caused by Avibacterium paragallinarum (Av. paragallinarum). The disease caused growth retardation in broilers and reduced egg production in laying hens, resulting in significant economic losses to the global chicken industry. The biofilm is an important virulence factor for many bacterial pathogens, yet there is a paucity of research on the biofilm of Av. paragallinarum. This study aimed to construct a random mutant library of Av. paragallinarum using the Tn5-Kan transposon to identify genes involved in biofilm formation. A total of ap
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vibrio cholerae, the causative agent of cholera, has sparked seven pandemics in recent centuries, with the current one being the most prolonged. V. cholerae's pathogenesis hinges on its ability to switch between low- and high-cell-density gene regulatory states, enabling transmission between the host and the environment. Previously, a transposon mutant library for V. cholerae was created to support investigations aimed toward uncovering the genetic determinants of its pathogenesis. However, subsequent sequencing uncovered a mutation in the gene luxO of the parent strain, rendering mutants unab
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sunvozertinib is an oral, irreversible, and selective tyrosine kinase inhibitor that has a favourable safety profile and encouraging antitumour activity, as shown in phase 1 studies of patients with heavily pretreated non-small cell lung cancer (NSCLC) with EGFR exon 20 insertion mutation (exon20ins). We aimed to assess the antitumour efficacy of sunvozertinib in patients with platinum-pretreated locally advanced or metastatic NSCLC with EGFR exon20ins.
METHODS: WU-KONG6 is a single-group, open-label, multicentre phase 2 trial of sunvozertinib monotherapy, conducted across 37 medi
Клиническое исследование II фазыМногоцентровое исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leptomeningeal metastasis (LM) is a disastrous complication in lung cancer. LM patients with oncogene-addicted non-small cell lung cancer (NSCLC) have a relatively better prognosis than those with the wild-type counterpart; however, overall post-LM survival is short. Additionally, the high heterogenicity of the LM entity creates a treatment challenge, and to date, no standard strategy has been established. This article describes a female lung adenocarcinoma patient with a resistant epidermal growth factor receptor (EGFR) exon20ins mutation who developed LM only 11 months after radical surgery
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Essential genes are crucial for bacterial viability and represent attractive targets for novel anti-pathogen drug discovery. However, essential genes determined by the transposon insertion sequencing (Tn-seq) approach often contain many false positives. We hypothesized that some of those false positives are genes that are actually deleted from the genome, so they do not present any transposon insertion in the course of Tn-seq analysis. Based on this assumption, we performed a large-scale whole-genome sequencing analysis for the bacterium of interest. Our analysis revealed that some "essential
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования