A SpeI-AvaI fragment (0.3 kbp) from pBbi16 (a pBR322 derivative containing a 6.3-kbp Babesia bigemina DNA insert) was subcloned into the pBluescript phagemid vector and was sequenced by the dideoxy-mediated chain termination method. Two sets of primers were designed for the polymerase chain reaction (PCR) assay. Primer set IA-IB was used to amplify a 278-bp DNA fragment, and primer set IAN-IBN was used to prepare a probe directed to a site within the PCR-amplified target DNA. Digoxigenin-dUTP was incorporated into the probe during the amplification reaction. PCR amplification of target DNA obt…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A rapid and sensitive polymerase chain reaction (PCR)-based assay for detection of Chlamydia trachomatis in cervical specimens is described. This assay consists of (i) sample preparation which avoids the use of heat, centrifugation, or organic extractions; (ii) rapid, two-temperature PCR amplification of C. trachomatis cryptic plasmid sequences; and (iii) capture and colorimetric detection of amplified DNA in microwell plates. PCR was compared with culture by using 503 cervical specimens. After resolution of discrepant specimens with a confirmatory PCR assay directed against the chlamydial maj…
Сравнительное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two sets of oligonucleotide primers were used to amplify the genomic DNA of Rickettsia tsutsugamushi, the causative agent of scrub typhus (tsutsugamushi disease), by the polymerase chain reaction. Each set of primers amplified 538-bp and 109-bp products, representing part of a gene encoding a possible major 58-kDa immunogenic protein, from whole genomic DNA extracted from R. tsutsugamushi strains Karp, Kato, Gilliam, Kuroki and Kawasaki. No amplification was observed from R. sibirica, R. rickettsii, mouse and human genomic DNA. DNA amplification was observed from crude lysates of peripheral wh…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
bcl-2 is a marker for the translocation t(14;18)(q32;q21) indicative of follicular B-cell lymphoma. We studied 115 cases of lymphoproliferative disease with the polymerase chain reaction for bcl-2 oncogene using biotin and radiolabeled probes to the major breakpoint and minor cluster regions. Twenty-three percent of B-cell lymphomas were positive for bcl-2. These included 12 of 20 cases of nodular follicular center cell lymphoma (nine small cleaved cell, one mixed small and large cell, and two large cell types). bcl-2 translocation was detected in only three of 45 cases of diffuse B-cell lymph…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to develop a simple and sensitive detection method for fomivirsen, a 21-nucleotide phosphorothioate oligonucleotide used as a nucleic acid medicine, using a ligase detection reaction. A ligation probe was designed to hybridize with fomivirsen and polymerase chain reaction (PCR) primers, with a deoxyuridine part between the primer binding sites. The probe was ligated to a circular product by Taq DNA ligase, and the resulting product was converted to a linear form through the removal of the uracil base using uracil DNA glycosylase. The linear product was then quantified using re…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Group B Streptococcus (GBS) is a predominant causative pathogen of neonatal meningitis that is associated with a high rate of mortality and … e the case of a preterm male infant diagnosed with early-onset of GBS meningitis diagnosed by using polymerase chain reaction (PCR) method on the cerebrospinal fluid (CSF) of the infant. Initially the pathogen was not isolated in both blood and CSF cultures as sampling was performed after the administration of antibiotics. Hence, PCR was a crucial diagnostic test in facili …
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Congenital toxoplasmosis can result in visual impairment, hearing loss, serious neurologic sequelae and death in the infant. We studied the potential of the polymerase chain reaction (PCR) in cerebrospinal fluid (CSF) for diagnosis of congenital toxoplasmosis.
METHODS: For this purpose, we studied both congenitally infected (diagnosed clinically and serologically) and noninfected infants born to untreated mothers.
RESULTS: The infants ranged in age from 0 to 180 days. CSF PCR was positive in 27 of the 58 (46.5%) congenitally infected infants and was negative in each of the 103 in…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The successful treatment of onychomycosis depends on accurate diagnosis. Conventional diagnostic methods, including direct microscopy and fungal culture, are non-specific, insensitive and time-consuming. Recently, PCR has shown promise in improving the diagnosis of onychomycosis. We aimed to evaluate a commercially available PCR kit for the in vitro detection of dermatophytes and specifically Trichophyton rubrum in nail specimens with suspected onychomycosis, and to compare the detection rates of PCR with conventional diagnostic methods.
METHODS: Nail specimens were prospectively
Клиническое исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Definite diagnosis of Leishmania infections is based on demonstration of the parasite by microscopic analysis of tissue biopsy specimens or aspirate samples. However, microscopy generally shows low sensitivity and requires invasive sampling.
METHODS: We describe here the development of a simple and rapid test for the detection of polymerase chain reaction-amplified Leishmania DNA. A phase 1 evaluation of the text was conducted in clinical samples from 60 nonendemic and 45 endemic control subjects and from 44 patients with confirmed cutaneous leishmaniasis (CL), 12 with mucocutaneo…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A prospective study was performed including all children younger than 18 years with the clinical diagnosis of invasive meningococcal disease (IMD) hospitalized at the University Hospital Sant Joan de Déu in Barcelona, Spain, from January 2001 to December 2006. During the study period, 168 meningococcal disease cases were reported. Microbiologic confirmation was obtained in 118 cases. Forty-six (38.9%) of 118 cases were only detected by polymerase chain reaction (PCR); 6 patients were culture positive and PCR negative (5%). Serogroup B predominated in the 6-year period with 83.1% of the strains…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial meningitis remains an important cause of morbidity and mortality in Vietnam. Diagnosis is hampered by the ready availability of antibiotics in the community, leading to late presentation, masked clinical signs, and poor organism detection during the microscopical examination and culture of cerebrospinal fluid (CSF). In order to improve organism detection at the Hospital for Tropical Diseases in Ho Chi Minh City, a diagnostic PCR-based protocol was developed. This protocol was followed in the investigation of CSF samples from 36 patients with clinical signs of bacterial meningitis. Ea
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The objective of this study was to compare a polymerase chain reaction (PCR) assay and a monoclonal antibody-based immunofluorescence assay (IFA) for detection of Cryptosporidium parvum in cat feces. Eight C. parvum-naive DSH cats were orally inoculated with 1 x 10(6) oocysts of a C. parvum human isolate. Fecal samples were collected before inoculation, daily for the next 30 days, and twice weekly until day 85. Methylprednisolone acetate was administered at 20 mg/kg i.m. on days 85, 92, and 99. From days 86 to 115, feces were collected daily and then up to twice weekly until day 126. Immunoflu…
Сравнительное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Visceral leishmaniasis due to infection with Leishmania infantum (a member of the L. donovani complex) has been known in Malta since the beg … the Maltese islands, we tested for deoxyribonucleic acid (DNA) of the L. donovani complex using the polymerase chain reaction (PCR). The samples had all been subjected to the indirect immunofluorescent antibody test (IFAT) and a direct comparison was made. DNA was extracted using the phenol/chloroform method and amplified with primers specific for kinetoplast mini-circle D …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we have established a sensitive semi-nested polymerase chain reaction (PCR) for detection of Nocardia in clinical specimens by first amplifying a 422 bp DNA fragment from the groEL gene, followed by a second amplification of 342 bp DNA by targeting sequences internal to the first amplicon. The semi-nested PCR was evaluated in a murine model of nocardiosis for detection of Nocardia in blood and visceral organs. Healthy BALB/c mice were intravenously infected with 0.2 ml suspension of 2.9 x 10(5)/ml cfu of Nocardia asteroides and N. farcinica. Viable counts and seminested PCR were…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A protocol for testing cerebrospinal fluid specimens using a range of PCR assays for the diagnosis of central nervous system infection was developed and used to test prospectively 383 specimens. PCR assays were used for the detection of adenovirus, Borrelia burgdorferi, enteroviruses, Epstein Barr virus, cytomegalovirus, herpes simplex virus, human herpes virus type 6, JC virus, Leptospira interrogans, Listeria monocytogenes, lymphocytic choriomeningitis virus, measles virus, mumps virus, Mycobacterium sp. , Mycoplasma pneumoniae, Toxoplasma gondii and varicella zoster virus. Of the 383 specim
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polymerase chain reaction and other DNA amplification techniques to identify elusive infections should prove to be an effective tool for the clinical and investigative rheumatologist. The capability to identify and characterize infectious organisms in fluids and tissue will enable early, specific, and potentially curative treatment. Similarly, the capability to exclude infection and differentiate postinfectious diseases will enable other therapies to control the inflammation. Understanding these molecular techniques will most certainly improve clinicians' effectiveness for diagnosis and care.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Brucelosis is a severe acute febrile disease caused by bacteria of the genus Brucella. Its current diagnosis is based on clinical observations that may be complemented by serology and microbiological culture tests; however, the former is limited in sensitivity and specificity, the latter is time consuming. To improve brucelosis diagnosis we developed a test which is specific and sensitive and is capable of differentiating the six species of Brucella.
MATERIALS AND METHODS: Four primers were designed from B. abortus sequences at the well-conserved Omp2 locus that are able to amplif
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A simple procedure is described for the detection of Mycobacterium leprae by the polymerase chain reaction in nerve biopsies sectioned with a cryostat and then treated with proteinase K. All samples from lepromatous leprosy patients and the majority of samples from paucibacillary cases yielded positive results. This approach may be useful for differentiating between leprosy and other inflammatory neuropathies.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: To investigate cagA, which is linked to vacuolating cytotoxin activity of Helicobacter pylori, using molecular techniques.
MATERIALS AND METHODS: A polymerase chain reaction method was used to detect cagA from clinical isolates of H. pylori. H. pylori strain diversity was examined by DNA restriction fragment length polymorphism (RFLP) patterns with cagA as a probe.
RESULTS: The detection rate of the cagA products was significantly higher in strains from gastric ulcer patients than in those of chronic gastritis patients (78.9 versus 56.0%; P < 0.05), and RFLP patterns were different betw…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To study the value of a rapid diagnostic method based on the amplification by polymerase chain reaction (PCR) of a fragment of the IS6110 insertion element for the detection of Mycobacterium tuberculosis in children.
DESIGN: We tested 199 specimens obtained from 68 children referred for evaluation of suspected tuberculosis.
RESULTS: In 83.3% of children with active disease and 38.9% with tuberculous infection but no evidence of disease, at least one positive PCR result was observed. No child without tuberculosis had positive PCR results (100% specificity). The sensitivity of the P…
Клиническое исследованиеСравнительное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования