Acute myeloid leukemia (AML) is a blood cancer complicated by acquired drug resistance, disease relapse, and low overall survival rates. Combination therapies using multiple targeted inhibitors have been effective in treating patients with AML. However, combination treatments are limited by the number of usable targets and our ability to create rational pairings using complimentary molecular mechanisms. Here, we used a human kinase domain-targeted CRISPR screen to identify histone H3-associated protein (HASPIN) kinase as a significant, understudied dependency in AML. HASPIN depletion significa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: RNA splicing factor (SF) mutations are associated with adverse outcomes in patients with acute myeloid leukemia (AML) and higher-risk myelodysplastic syndromes/neoplasms (HR-MDS). Preclinical data suggest that aberrant RNA splicing can lead to the generation of neoantigens, which renders these tumors more susceptible to immune checkpoint inhibitors. However, dedicated studies on immune checkpoint inhibitors in AML and MDS patients with SF mutations are limited.
OBJECTIVES: To characterize the immune and epigenetic landscape of AML and MDS patients with SF mutations.
DESIGN: Post …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nitric oxide (NO) is a crucial signaling molecule involved in various developmental processes and stress responses through post-translationa … ulates the phosphorylation of splicing factors within the spliceosome. We propose that NO regulates RNA splicing through the enhancement of KIN10 activity via S-nitrosylation, thereby establishing a molecular link between NO signaling and gene expression.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The major spliceosome contains five small nuclear RNAs (snRNAs; U1, U2, U4, U5 and U6) essential for splicing. Variants in RNU4-2, encoding U4, cause a neurodevelopmental disorder called ReNU syndrome. We investigated de novo variants in 50 snRNA-encoding genes in a French cohort of 23,649 individuals with rare disorders and gathered additional cases through international collaborations. Altogether, we identified 145 previously unreported probands with (likely) pathogenic variants in RNU4-2 and 21 individuals with de novo and/or recurrent variants in RNU5B-1 and RNU5A-1, encoding U5. Pathogeni
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Primary microcephaly, a rare congenital condition characterized by reduced brain size, occurs due to impaired neurogenesis during brain deve … more, our data uncovered previously undocumented indirect effects of CETN3 through interaction with RNA splicing machinery involved in brain development. These findings expand the scope of known regulatory mechanisms of CETN3 in brain development and its etiological roles in human brain malformation.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gallbladder cancer (GBC) is a highly malignant and rapidly progressing tumor of the human biliary system, and there is an urgent need to develop new therapeutic targets and modalities. Non-POU domain-containing octamer-binding protein (NONO) is an RNA-binding protein involved in the regulation of transcription, mRNA splicing, and DNA repair. NONO expression is elevated in multiple tumors and can act as an oncogene to promote tumor progression. Here, we found that NONO was highly expressed in GBC and promoted tumor cells growth. The dysregulation of RNA splicing is a molecular feature of almost…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this issue of Neuron, Wu et al.1 show that nuclear speckle proteins are sequestered by both nuclear RNA foci and cytoplasmic dipeptide repeat aggregates in C9ORF72-ALS/FTD. Consequently, dysregulation of splicing induces widespread splicing alterations and contributes to neurodegeneration.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sam68 and SLM2 are paralog RNA binding proteins (RBPs) expressed in the cerebral cortex and display similar splicing activities. However, their relative functions during cortical development are unknown. We found that these RBPs exhibit an opposite expression pattern during development. Sam68 expression declines postnatally while SLM2 increases after birth, and this developmental pattern is reinforced by hierarchical control of Sam68 expression by SLM2. Analysis of Sam68:Slm2 double knockout (Sam68:Slm2dko) mice revealed hundreds of exons that respond to joint depletion of these proteins. More
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The RNA-binding protein TDP-43, associated to amyotrophic lateral sclerosis and frontotemporal dementia, regulates the alternative splicing of several genes, including the skipping of TNIK exon 15. TNIK, a genetic risk factor for schizophrenia and causative for intellectual disability, encodes for a Ser/Thr kinase regulating negatively F-actin dynamics. Here we show that in the human adult nervous system TNIK exon 15 is mostly included compared to the other tissues and that, during neuronal differentiation of human induced pluripotent stem cells and of human neuroblastoma cells, TNIK exon 15 i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hirschsprung disease is a heterogeneous genetic disorder, causative genes of which include the endothelin B receptor (ETB). To investigate the mutations of ETB in Hirschsprung disease, expression of the ETB gene in lymphoblastoid cells from patients and normal healthy adults was examined, and novel mutant transcripts were found. The mutant ETB gene transcripts lacked a 134-bp nucleotide sequence corresponding to exon 5, and some also contained a substitution from A to G at position 950 in exon 4, resulting in an amino acid substitution from glutamine (Q) to arginine (R). This substitution was
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Podocytes are terminally differentiated cells that function as the glomerular filtration barrier in the kidney, and podocyte injury leads to serious proteinuria and podocyte leakage into urine. Recent studies have demonstrated that the number of urinary podocytes is correlated with the progression of glomerular diseases. Therefore, urinary podocytes may serve as an indicator of podocyte injury. In this study, to explore podocyte injury-related genes, we performed comprehensive transcriptome analysis of primary rat podocytes cultured in the presence or absence of puromycin aminonucleoside (PAN)
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CTNNA3 encodes αT-catenin, an intercalated disc (ICD) protein essential for cardiomyocyte coupling. Human omics studies have shown reduced CTNNA3 expression, ICD ultrastructural disruption, and dilated cardiomyopathy (DCM)-associated hyperphosphorylation of αT-catenin. Direct RNA-level evidence linking biallelic CTNNA3 variants to human cardiomyopathy has been lacking. Clinical exome sequencing was performed in a 21-year-old man with DCM, severe left ventricular systolic dysfunction (LVEF 20%), and atrial fibrillation (AF). The identified homozygous variant (NM_013266.4 : c.1733 - 1G > C) was
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peutz–Jeghers syndrome is an autosomal dominant disease characterized by intestinal polyposis, mucocutaneous pigmentation, and an increased risk of various types of cancer. Germline mutations in STK11 (LKB1), which encodes serine/threonine kinase 11, have been identified as the major cause of Peutz–Jeghers syndrome. Here, we detected a rare variant of undetermined significance in intron 2 of STK11 using multi-gene panel analysis in a girl with clinically suspected Peutz–Jeghers syndrome. We confirmed this variant caused abnormal splicing in exons 2 and 3 using reverse transcription-PCR and San
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pathogenic variants in TRIO, encoding the guanine nucleotide exchange factor, are associated with two distinct neurodevelopmental delay phenotypes: gain-of-function missense mutations within the spectrin repeats are causative for a severe developmental delay with macrocephaly (MIM: 618825), whereas loss-of-function missense variants in the GEF1 domain and truncating variants throughout the gene lead to a milder developmental delay and microcephaly (MIM: 617061). In three affected family members with mild intellectual disability/NDD and microcephaly, we detected a novel heterozygous TRIO varian
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We describe a patient with type I hereditary angioedema presenting recurrent episodes of skin swelling and abdominal pain. Laboratory examination showed reduced levels of CH50 and C4 with a normal C3 level. The C1 inhibitor was decreased to 7.0 mg/dl (normal, 10-25 mg/dl) with a remarkably reduced activity (<25%; normal, 80-125%). DNA analysis of the C1 inhibitor gene revealed a novel point mutation at the 3' acceptor mRNA splice site of the intron 5 (G-->A at nucleotide 8722). This mutation may abolish the correct splicing of the intron 5 and create unstable mRNA.
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
WT1 is a tumor suppressor gene encoding a zinc finger DNA-binding protein required for normal vertebrate kidney and gonad development. Although the sequence and function of this gene has been studied mostly in mammals, comparative analysis in other vertebrates may suggest regions of conservation of function as well as evolution of function. We have initiated a study of this gene in the freshwater turtle, Trachemys scripta, a species that demonstrates temperature dependent sex determination. The turtle WT1 amino acid sequence (GenBank Accession No. AF019779) is over 85% identical to that of oth
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many cellular and viral genes are parts of complex transcription units containing multiple splicing choices. During the course of an adenoviral replicative cycle, different spliced versions of a single gene predominate, depending on the stage of infection. This is true for several adenoviral genes. In this paper we show for the viral E1B transcription unit that splice site usage regulates this process. The change in alternative splicing in this system does not depend on the sequence of the transcribed genes. Non-adenoviral genes, such as the SV40 early region and the polyoma early region, whic
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Excess neutrophil apoptosis and the release of neutrophil extracellular traps (NETs) in systemic lupus erythematosus (SLE) lead to the accumulation of cell debris and the production of auto-antibodies targeting nuclear proteins and DNA. SLE neutrophil activation is regulated by changes in gene expression, notably expression of type I interferon-response genes and genes coding for granule proteins. This observational study measured both mRNA and small noncoding RNAs in SLE (n = 11) and healthy control (HC, n = 10) ultra-pure blood neutrophils to identify changes in expression that are involved
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prenatal exposure to bisphenol A (BPA), a common endocrine disruptor, has been increasingly implicated in neurodevelopmental disorders, including autism spectrum disorder. This study explores the molecular mechanisms by which prenatal BPA exposure affects alternative RNA splicing in the prefrontal cortex and investigates the potential link between alternative RNA splicing and autism-related behaviors in rat offspring. Using RNA sequencing and high-resolution melting real-time PCR, we identified differentially alternative splicing events associated with autism candidate genes. Gene ontology and…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Novel drug discoveries have shifted the treatment paradigms of most hematological malignancies, including multiple myeloma (MM). However, this plasma cell malignancy remains incurable, and novel therapies are therefore urgently needed. Whole-genome transcriptome analyses in a large cohort of MM patients demonstrated that alterations in pre-mRNA splicing (AS) are frequent in MM. This manuscript describes approaches to identify disease-specific alterations in MM and proposes RNA-based therapeutic strategies to eradicate such alterations. As a "proof of concept", we examined the causes of aberran…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования