We report herein the synthesis and physical and physiological characterization of fully modified 2'-modified-4'-thioRNAs, i.e. 2'-fluoro-4'-thioRNA (F-SRNA) and 2'-O-Me-4'-thioRNA (Me-SRNA), which can be considered as a hybrid chemical modification based on 2'-modified oligonucleotides (ONs) and 4'-thioRNA (SRNA). In its hybridization with a complementary RNA, F-SRNA (15mer) showed the highest T(m) value (+16 degrees C relative to the natural RNA duplex). In addition, both F-SRNA and Me-SRNA preferred RNA as a complementary partner rather than DNA in duplex formation. The results of a comprehe
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6-methyladenosine (m6A) was the most abundant modification of mRNA and lncRNA in mammalian cells and played an important role in many biolo … zing ZBTB4 mRNA m6A motifs in coding sequences (CDS), dual-luciferase reporter assay was conducted. RNA stability assays using actinomycin D were conducted to study the RNA stability of the HTR-8 cell line with METTL3 overexpression and knockdown. To illustrate the role of METTL3 in the invasion of trophoblast, matrigel invasion assays and transwell migration a …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plasmodium falciparum, a protozoan parasite and causative agent of human malaria, has one of the most A/T-biased genomes sequenced to date. This may give the genome and the transcriptome unusual structural features. Recent progress in sequencing techniques has made it possible to study the secondary structures of RNA molecules at the transcriptomic level. Thus, in this study we produced the in vivo RNA structurome of a protozoan parasite with a highly A/U-biased transcriptome. We showed that it is possible to probe the secondary structures of P. falciparum RNA molecules in vivo using two diffe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ovary is an important reproductive and endocrine organ for the continuation of the species and the homeostasis of the body's internal environment. Arsenic exposure is a global public health problem. However, the damage to the ovaries caused by exposure to arsenic-contaminated drinking water from neonatal mice period remains unclear. Here, we showed that arsenic exposure resulted in reduced granulosa cell proliferation, diminished ovarian reserve, decreased oogenesis, and endocrine disruption in mice. Mechanistically, arsenic exposure decreased the protein level of METTL3 in granulosa cells
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNAs (miRNAs) are pervasive regulators of gene expression, necessitating the development of tools to inhibit individual miRNAs for functional studies or therapeutic targeting. Specialized base-pairing configurations between a miRNA and an RNA target site can trigger the degradation of the targeting miRNA through target-directed miRNA decay (TDMD). Previous work has identified several natural sites that induce TDMD of specific miRNAs. We explored retargeting known TDMD sites for the inhibition of heterologous miRNAs, including several encoded by Kaposi's Sarcoma-associated herpesvirus (KSH
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Keratoconus (KTCN, OMIM 148300) is a degenerative eye disorder characterized by progressive stromal thinning that leads to a conical shape of the cornea, resulting in optical aberrations and even loss of visual function. The biochemical background of the disease is poorly understood, which motivated us to perform RNA-Seq experiment, aimed at better characterizing the KTCN transcriptome and identification of long non-coding RNAs (lncRNAs) that might be involved in KTCN etiology. The in silico functional studies based on predicted lncRNA:RNA base-pairings led us to recognition of a number of lnc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The CCR4-NOT complex is a multi-subunit assembly found in all eukaryotic cells. Yet, its composition varies across organisms, with a universally conserved core enriched by lineage-specific subunits. Further, heterogeneity results from the occurrence of paralogous proteins, substoichiometric subunits, transient partners, and protein isoforms. Altogether, multiple CCR4-NOT complexes exist, and some even coexist within a single cell. The CCR4-NOT complex is an essential actor of gene expression through its roles in messenger RNA (mRNA) deadenylation, decay, and translation. Over time, support for
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IN BRIEF: The dysregulation of spermatogonial proliferation is one of the causes of male infertility. Using mice as an animal model, this study reveals the function and mechanism of m6A methylation reader insulin-like growth factor-2 mRNA-binding protein 1 (IGF2BP1) and its target Akt2 in spermatogonia.
ABSTRACT: IGF2BP1, as a newly identified N6-methyladenosine (m6A) methylation reader, plays a key role in mRNA stability, alternative splicing and translation. However, the function of IGF2BP1 and its target genes in the development of male germ cells remains unclear. In the present study, Wes…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The COVID-19 pandemic highlighted the critical role of reliable molecular diagnostics in outbreak response and the vulnerabilities of existing systems to delays and reagent instability. Armored RNA technology, which packages RNA within bacteriophage-derived capsids, offers a robust solution by combining nuclease resistance, safety, and versatility into a single platform. Armored RNA has become a trusted internal and external control for RT-qPCR and RT-LAMP, enabling accurate detection across a wide range of viral pathogens. Also, recent advances in alternative expression systems, such as plant
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA abundance is controlled by rates of synthesis and degradation. Although mis-regulation of RNA turnover is linked to neurodevelopmental disorders, how it contributes to cortical development is largely unknown. Here, we discover the landscape of RNA stability regulation in the cerebral cortex and demonstrate that intact RNA decay machinery is essential for corticogenesis in vivo. We use SLAM-seq to measure RNA half-lives transcriptome-wide across multiple stages of cortical development. Leveraging these data, we discover cis-acting features associated with RNA stability and probe the relatio…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Herpesviral infection reflects thousands of years of coevolution and the constant struggle between virus and host for control of cellular gene expression. During Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus (KSHV) lytic replication, the virus rapidly seizes control of host gene expression machinery by triggering a massive RNA decay event via a virally encoded endoribonuclease, SOX. This virus takeover strategy decimates close to 80% of cellular transcripts, reallocating host resources toward viral replication. The host cell, however, is not entirely passive in this assault on RNA stability. A small…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The leukemia inhibitory factor (LIF) gene encodes a pleiotropic cytokine which is produced by the endometrium and plays an important role in implantation and early embryonic development. Because of its function, LIF gene is considered as a candidate gene for litter size in many mammalian species including pig. The aim of present study was to evaluate the expression of LIF gene in the porcine ovary, oviduct and two regions of uterus (corpus uteri, cornu uteri) in prepubertal and pubertal gilts. In order to precise estimation of LIF transcript abundance we evaluated the stability of expression f
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In England the introduction of PCR for HCV RNA in minipools has been a nationally coordinated project. The current programme is designed to ensure that all frozen components will have been tested for HCV RNA on pools of 96 samples before their release. To meet EEC requirements, the original planning was aimed at the PCR testing of minipools of 480 samples before making final pools of plasma for fractionation. However, with the sourcing of plasma for fractionation from the USA as a precaution against possible risk from new variant CJD, the project was modified to allow release of HCV PCR tested
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rapid responses involving fast redistribution of messenger(m)RNA and alterations of mRNA translation are pertinent to ongoing homeostatic adjustments of the cells. These adjustments are critical to eukaryotic cell survivability and 'damage control' during fluctuating nutrient and salinity levels, temperature, and various chemical and radiation stresses. Due to the highly dynamic nature of the RNA-level responses, and the instability of many of the RNA:RNA and RNA:protein intermediates, obtaining a meaningful snapshot of the cytoplasmic RNA state is only possible with a limited number of method
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАVideo-Audio MediaПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biomolecular condensates create distinct subcellular niches, but their chemical environments and impacts on clients remain poorly understood. Using ratiometric fluorescent probes in vivo, we find that bacterial ribonucleoprotein bodies (BR-bodies) exhibit an acidic dense phase (pH ~5.1) due to the scaffold's low pI and negative charge. Single-molecule localization microscopy and fluorescence lifetime imaging reveal spatially variable, acidic nanoscale RNase E clusters in Caulobacter crescentus BR-bodies. Reducing RNase E's negative charge yields more neutral BR-bodies, causing morphological de
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many viruses degrade host mRNAs to reduce competition for proteins/ribosomes and promote viral gene expression. In this issue of Cell Host & Microbe, Abernathy et al. (2015) demonstrate that a herpesviral RNA endonuclease induces host transcriptional repression that is mediated through the decay factor Xrn1 and evaded by viral genes.
СтатьяКомментарийПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The phosphate (Pi) retention in patients with chronic kidney disease leads to secondary hyperparathyroidism (2HPT). 2HPT is the physiological response of the parathyroid not only to Pi retention but also to decreased synthesis of 1,25(OH)(2) vitamin D, and the attendant hypocalcemia. 2HPT is characterized by increased PTH synthesis, secretion, and parathyroid cell proliferation. Extracellular fluid (ECF) Ca(2+) is recognized by the parathyroid calcium receptor and a small decrease in the ECF Ca(2+) results in relaxation of the calcium receptor and allows the unrestrained secretion and synthesi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Legionella pneumophila is an aquatic bacterium that is also the agent of Legionnaires' disease pneumonia. Since L. pneumophila is transmitted directly from the environment to the lung, it is important to understand how legionellae survive at low temperatures. To identify genes that are needed for L. pneumophila growth at low temperature, we screened a population of mutagenized legionellae for strains that are specifically impaired for growth at 17 degrees C. From the 7,400 mutants tested, 11 displayed defects ranging from ca. 10-fold to a complete inability to grow at the low temperature. PCR
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intestinal fibroblast senescence contributes to gut aging and the development of related diseases, yet the regulatory mechanisms governing t … senescence in intestinal fibroblasts. Mechanistically, NAT10-driven ac4C deposition enhances DHRS2 mRNA stability, thereby promoting fibroblast senescence. Collectively, our findings establish the NAT10/ac4C/DHRS2 regulatory axis as a critical player in intestinal fibroblast senescence and suggest its potential as a therapeutic target for age-related intestinal …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ribosomes can pause during mRNA translation, but what causes pausing, how pauses affect protein production, and whether they trigger cotranslational mRNA decay are poorly understood in plants. Here, we investigate the causes and consequences of ribosome pausing in Arabidopsis and maize. This is accomplished by sizing, mapping, and quantifying footprints of individual ribosomes (monosomes) and closely spaced ribosome pairs (disomes) at single-codon resolution on open reading frames (ORFs). Ribosome footprinting was combined with 5'P-degradome-seq to examine the coincidence of pausing with cotra
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования