Aptamers are perfect tools to study the interaction of small ligands with RNA. To study the mode of interaction of tetracycline with RNA, we isolated aptamers with high affinity to this antibiotic via in vitro selection. One of the selected aptamers, cb28, which has a comparable affinity to tetracycline as the small ribosomal subunit, was characterised in more detail. Cb28 binds only to typical tetracyclines, while atypical tetracyclines are not recognised. The hydroxyl group at position 6 is an essential determinant for recognition, while modifications at positions 4, 5 and 7 do not interfere
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pregnancy loss is a major problem in clinical medicine with devastating consequences for families. Next generation sequencing has improved our ability to identify underlying molecular causes, though over half of all cases lack a clear etiology. Here, we began with clinical evaluation combined with exome sequencing across independent families to identify bi-allelic candidate genetic variants in the Programmed Cell Death 2 (PDCD2) gene in multiple fetuses with nonimmune hydrops fetalis (NIHF). PDCD2 is an evolutionarily conserved protein with no prior association with monogenic disorders. PDCD2
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diamond-Blackfan anemia (DBA) is a rare, pure red-cell aplasia that presents during infancy. Approximately 40% of cases are associated with other congenital defects, particularly malformations of the upper limb or craniofacial region. Mutations in the gene coding for the ribosomal protein RPS19 have been identified in 25% of patients with DBA, with resulting impairment of 18S rRNA processing and 40S ribosomal subunit formation. Moreover, mutations in other ribosomal protein coding genes account for about 25% of other DBA cases. Recently, the analysis of mice from which the gene coding for the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Translation elongation is a universally conserved step in protein synthesis, relying on elongation factors that engage the ribosomal L7/L12 stalk to mediate aminoacyl-tRNA delivery, accommodation, and ribosomal translocation. Using in organello cryo-electron microscopy, we reveal how the mitochondrial translation accelerator TACO1 promotes efficient elongation on human mitoribosomes. TACO1 binds the mitoribosomal region typically bound by elongation factor Tu (mtEF-Tu), bridging the large and small subunits via contacts with 16S rRNA, bL12m, A-site tRNA, and uS12m. While active throughout elon
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A new species of Synthesium from the bottlenose dolphin Tursiops truncatus in South Brazilian waters is described. Morphological and molecular identification was performed, and phylogenetic analyses were carried out using the ribosomal small subunit and internal transcribed spacer 1 and the mitochondrial NDH dehydrogenase subunit 3 and cytochrome c oxidase subunit 1 genes. The main characteristics of the new species are the subterminal round-shaped oral sucker, the anterior distribution of vitellaria reaching the level of the ovary and the oval-shaped testes. The results obtained with the mole
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this paper, mtDNA gene cytochrome coxidase subunit I (COI) and small subunit ribosomal RNA (12S rDNA) were used to examine the phylogenetic position of Dirofilaria immitis from dogs and red pandas in the evolutionary tree of filarial. Different approaches, including minimal evolution (ME) and maximum parsimony (MP) from distance matrix and character state, were used to evaluate the evolutional relation between Dirofilaria spp. and other species included in the family Onchocercidae. Intra-specific variation was found in COI but not in 12S rDNA. D. immitis and D. repens appear to be sister sp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ribosome ensures translational accuracy by monitoring codon-anticodon interactions at the A site decoding center, yet the mechanism of conserved nucleotides contributing to this process remains controversial. Here, we performed molecular dynamics simulations based on a tRNA recognition intermediate that reflects the ribosomal state during ongoing tRNA recognition. We systematically investigated the coupling between the stability of the first codon-anticodon base pair and the conformational dynamics of A1493 in both cognate and near-cognate tRNA systems. Our results show that A1493 stabiliz
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The naked mole-rat (Heterocephalus glaber) is a long-lived mammal with resistance to cancer and hypoxia, suggesting the evolution of robust proteostasis networks. The ribosome, central for protein synthesis, is key to cellular stress responses and has an unusual feature: the 28S rRNA split; however, the details of its organization remain unknown. Here, we present high-resolution cryo-EM structures of the naked mole-rat 80S ribosome in four states of the elongation cycle. The structures reveal a conserved overall architecture and rRNA modification landscape compared to other mammals, and provid
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diamond-Blackfan anemia (DBA) was the first ribosomopathy described and is a constitutional inherited bone marrow failure syndrome. Erythroblastopenia is the major characteristic of the disease, which is a model for ribosomal diseases, related to a heterozygous allelic variation in 1 of the 20 ribosomal protein genes of either the small or large ribosomal subunit. The salient feature of classical DBA is a defect in ribosomal RNA maturation that generates nucleolar stress, leading to stabilization of p53 and activation of its targets, resulting in cell-cycle arrest and apoptosis. Although activ
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Based on a study of sporocarps developed in moist chamber cultures on the bark of Dacrydium elatum collected in Kon Chu Rang Reserve, central Vietnam, we describe a new species, Licea gorgona (Myxomycetes, Liceales). The new species is morphologically distinct from other species of the genus Licea due to its well-developed capillitium threads connected to the peridial margins, minute sporocarps with dark brown spore mass, circumscissile dehiscence via preformed ridges, and spores with ephemeral, rounded warts that detach readily, creating irregularly smooth ("bald") patches. Apart from the mor
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Multiple species of the genera Cytauxzoon and Hepatozoon can infect wild felines, but the diversity of these and other apicomplexan parasites in Eurasian lynx is scarcely known. The aim of this study was to detect Cytauxzoon and Hepatozoon species with molecular methods in Eurasian lynxes and their ticks in northwestern China.
METHODS: DNA was extracted from the heart, liver, spleen, lung, and kidney samples of three Eurasian lynxes as well as from their five ixodid ticks. These DNA samples were screened with polymerase chain reactions (PCRs) for Cytauxzoon with the partial cytoch
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Herein, we describe several newly-collected specimens of Neopolystoma cf. orbiculare from the urinary bladder of 2 alligator snapping turtles, Macrochelys temminckii (Troost in Harland, 1835) (Cryptodira: Chelydridae Gray, 1831) from Comet Lake (30°35'46.94″N, 88°36'3.12″W), Pascagoula River, Mississippi. Our specimens differed from all previous descriptions of N. orbiculare and its junior subjective synonyms by the combination of having intestinal ceca adorned with triangular pockets and that terminate dorsal to the haptor, distinctive hooklets each having a handle and guard of approximately
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A mathematical model is suggested to describe the subinhibitory effects of chloramphenicol upon growth of Escherichia coli. It represents a generalization of Monod's equation. Our model was constructed entirely on the basis of biochemical factors, such as the reversibility of the interaction between the drug and its ribosomal target or intracellular uptake. The subinhibitory effects of chloramphenicol were satisfactorily described by this law within the range of 0.4-2.4 micrograms/ml. After simplifying the equation, this model was extrapolated to provide an accurate description of the mode of
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Post stroke hyperglycemia has been shown to deter functional recovery. Earlier findings have indicated the cap-dependent translation regulator 4E-BP1 is detrimentally upregulated in hyperglycemic conditions. The present study aims to test the hypothesis that hyperglycemic ischemic reperfusion injury (I/R) affects normal protein translation poststroke.
METHODS: Rat primary cortical neurons (PCNs) were exposed to oxygen glucose deprivation (OGD) followed by increasing glucose concentration (0, 5, 10, 25 mM) at reoxygenation. In vivo, adult rats were subjected to two hours transient distal
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Isolated congenital asplenia (ICA) is characterized by the absence of a spleen at birth in individuals with no other developmental defects. The patients are prone to life-threatening bacterial infections. The unbiased analysis of exomes revealed heterozygous mutations in RPSA in 18 patients from eight kindreds, corresponding to more than half the patients and over one-third of the kindreds studied. The clinical penetrance in these kindreds is complete. Expression studies indicated that the mutations carried by the patients-a nonsense mutation, a frameshift duplication, and five different misse
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
North American Indian Childhood Cirrhosis (NAIC) is a rare, autosomal recessive, progressive cholestatic disease of infancy affecting the Cree-Ojibway first Nations of Quebec. All NAIC patients are homozygous for a missense mutation (R565W) in CIRH1A, the human homolog of the yeast nucleolar protein Utp4. Utp4 is part of the t-Utp subcomplex of the small subunit (SSU) processome, a ribonucleoprotein complex required for ribosomal RNA processing and small subunit assembly. NAIC has thus been proposed to be a primary ribosomal disorder (ribosomopathy); however, investigation of the pathophysiolo
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Loss of fragile X messenger ribonucleoprotein (FMRP) causes fragile X syndrome (FXS), an inherited neurodevelopmental disorder resulting in intellectual disability and autism spectrum disorder; however, the molecular function of FMRP remains uncertain. Here, using cell lines and fibroblasts and induced pluripotent stem cell-derived neurons from healthy individuals and patients with FXS, we showed that FMRP regulates collided ribosomes by recruiting activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 (ASCC3), an early-acting ribosome-associated quality control (RQC) factor to collided ribosomes,
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two-component regulatory systems (TCSSs) are key regulatory elements responsible for the adaptation of bacteria to environmental stresses. A classical TCSS is typically comprised of a sensory histidine kinase and a corresponding response regulator. Here, we used homologous recombination to construct a Mycobacterium smegmatis mutant defective in the synthesis of cytosolic histidine kinase PdtaS (Msmeg_1918). The resulting ΔpdtaS mutant strain was tested in the Phenotype Microarray screening system, which allowed us to identify aminoglycoside antibiotic sensitivity, tetracyclines antibiotic resi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ribosomal RNA (rRNA) methylation is conserved across biology, yet the effect of rRNA methylation on ribosome function is poorly understood. In this work, we identify a biological function for the rRNA 2'-O-methylcytidine methyltransferase TlyA, conserved between Bacillus subtilis and Mycobacterium tuberculosis (Mtb). The tlyA deletion in B. subtilis confers a cold sensitive phenotype and resistance to aminoglycoside and cyclic polypeptide antibiotics. We show that ∆tlyA cells have ribosome assembly defects characterized by accumulation of the 50S subunit. Using a genetic approach, we tested th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two structurally unique ribosomal antibiotics belonging to the orthosomycin family, avilamycin and evernimicin, possess activity against Enterococci, Staphylococci, and Streptococci, and other Gram-positive bacteria. Here, we describe the high-resolution crystal structures of the eubacterial large ribosomal subunit in complex with them. Their extended binding sites span the A-tRNA entrance corridor, thus inhibiting protein biosynthesis by blocking the binding site of the A-tRNA elbow, a mechanism not shared with other known antibiotics. Along with using the ribosomal components that bind and d
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования