Molecular systematists generally rely on computer algorithms to establish the alignment of DNA sequences. However, when alignment regions are characterized by multiple insertions and deletions, these gap-filled stretches of DNA are often excised before phylogenetic reconstruction. This exclusion of systematic data is generally determined by subjective criteria. We explore a replicable methodology in which the comparison of several multiple sequence alignments can be used to eliminate regions of unstable sequence alignment. Using crocodilian and insect mitochondrial (mt) ribosomal (r) DNA as ex
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The amino acid sequences of Escherichia coli histidyl-tRNA synthetase and alanyl-tRNA synthetase, two proteins recently identified as autoantigens in polymyositis, were compared by a computer alignment procedure with those of the 3600 proteins tabulated in the National Biomedical Research Foundation protein sequence database. Both proteins contain sequences long enough to function as epitopes that match sequences on viral and muscle proteins. The homology thus revealed not only lends strong support to mechanisms of autoimmunity that invoke the theory of molecular mimicry of viral proteins, but
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Organic chromophores in photo-excited triplet states can transiently exhibit uneven population distribution among spin sublevels, which is called spin polarization. Spin polarization can be realized even at room temperature and low magnetic fields, and it has recently attracted much attention due to its potential for application in quantum technologies such as quantum sensing and quantum computing. Molecular spin polarizing agents offer tunability of their physical properties through molecular modification, and from the perspective of molecular design, it is desirable to understand the structu
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Atherosclerosis is a chronic inflammatory disease characterized by endothelial dysfunction and leukocyte adhesion, mediated by cell adhesion molecules such as E-selectin, intercellular adhesion molecule-1 (ICAM-1), and vascular cell adhesion molecule-1 (VCAM-1). Tocotrienols, a subgroup of vitamin E, exhibit potent antioxidant and anti-inflammatory properties, suggesting their potential role in attenuating atherosclerosis. This study comparatively evaluated the binding affinities and molecular interaction profiles of α-, β-, γ-, and δ tocotrienol isomers towards E-selectin, ICAM-1, and VCAM-1
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Marburg virus (MARV) is a hemorrhagic fever virus, and its glycoprotein (GP) represents an important target for vaccine research. MHC class I (MHC-I)-restricted T cell epitopes are critical for inducing cytotoxic CD8+ T cell responses. In this study, we aimed to identify MHC-I-restricted T cell epitopes derived from the MARV Angola strain GP through an integrated bioinformatics and experimental approach.
METHODS: We retrieved the MARV Angola strain GP sequence and divided it into 673 overlapping 9-mer peptides. By integrating five computational prediction algorithms, immunogenic
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Arsenic poisoning significantly elevates the risk of cancer and other chronic illnesses. The goal of this research is to identify important genes whose expression changes in response to arsenic toxicity, and the molecular pathways affected by arsenic, using computational analysis of arsenic toxicity profiles. This approach will computationally identify and analyze genes whose expression changes in response to arsenic, thereby elucidating the heightened risk of carcinogenesis in arsenic-exposed individuals. This work employed high-throughput arsenic toxicity profiles to computationally identify
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: Chagas disease, caused by T. cruzi, remains a neglected tropical disease with limited therapeutic options, underscoring the urgent need for novel antitrypanosomal agents. A computer-aided drug design (CADD) protocol was applied to investigate pyrazolone derivatives with reported antitrypanosomal activity and their putative interaction with cruzain (Cz), a cysteine protease essential for parasite survival. A 2D-QSAR model built from a curated set of 33 phenyl-dihydropyrazolone derivatives guided the design of four new candidates (LMM1-LMM4), which showed intermediate predicted antitryp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Theranostics represents a transformative advancement in nuclear medicine by integrating molecular imaging and targeted radionuclide therapy within the paradigm of personalized oncology. This review elucidates the historical evolution and contemporary clinical applications of theranostics, emphasizing its pivotal role in precision cancer management. The theranostic approach involves the coupling of diagnostic and therapeutic radionuclides that target identical molecular biomarkers, enabling simultaneous visualization and treatment of malignancies such as neuroendocrine tumors (NETs), prostate c
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence of Sin Nombre orthohantavirus, an etiological agent of hantavirus cardiopulmonary syndrome, exacerbates the situation and imposes a heavy financial burden on healthcare organizations. Multidrug-resistant forms of the disease are prevalent, and there is currently no licensed commercial vaccine. Due to the numerous limitations of experimental vaccines, vaccines against various bacterial and viral diseases have developed via computational vaccine design. Several subtractive proteomics, immunoinformatics, docking, and simulation approaches were used in this study to develop a multi-e
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High-throughput, comprehensive, and confident identifications of metabolites and other chemicals in biological and environmental samples will revolutionize our understanding of the role these chemically diverse molecules play in biological systems. Despite recent technological advances, metabolomics studies still result in the detection of a disproportionate number of features that cannot be confidently assigned to a chemical structure. This inadequacy is driven by the single most significant limitation in metabolomics, the reliance on reference libraries constructed by analysis of authentic r
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Journal of environmental pathology, toxicology and oncology : official organ of the International Society for Environmental Toxicology and Cancer2026eng
BACKGROUND: N-nitrosodimethylamine (NDMA), a prevalent environmental contaminant found in food, water, and pharmaceuticals, is a recognized carcinogen strongly associated with colorectal cancer (CRC). However, the precise molecular mechanisms underlying NDMA-induced colorectal carcinogenesis remain incompletely understood. This study aimed to systematically investigate the molecular interactions between NDMA and CRC-related proteins to uncover potential mechanisms and therapeutic targets.
METHODS: We employed an integrated computational approach combining network toxicology and molecular dock
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Cancer remains a major cause of mortality worldwide; therefore, research continues to focus on the development of more effective therapeutic agents.
METHODS: In this study, the cytotoxic effects of a series of uracil-quinazoline hybrids were evaluated against A549 (lung cancer) and HepG2 (hepatocellular carcinoma) cell lines using the MTT assay.
RESULTS: The biological results demonstrated that several of the studied hybrids exhibited significant cytotoxic activity against both A549 and HepG2 cell lines compared to the reference drugs Erlotinib (IC50 = 35.5 ± 0.4 μM for A549; 1
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sirtuins are NAD+-dependent lysine deacetylases member of the class III HDAC family. These are demonstrated to be therapeutic targets in parasitic diseases like schistosomiasis. Observations suggested that sirtuin enzyme is necessary for the functionality of fe/male reproductive system, due to which SmSirt2 is treated as a potential therapeutic target. There are no structural and molecular features of SmSirt2 have been reported yet. In this study, homology modeling has been used to determine the three-dimensional features of the SmSITRT2. Further, structure validation has been performed by ene
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enteric fever is a major cause of morbidity in several parts of the Indian subcontinent. The treatment for typhoid fever majorly includes the fluoroquinolone group of antibiotics. Excessive and indiscriminate use of these antibiotics has led to development of acquired resistance in the causative organism Salmonella Typhi. The resistance towards fluoroquinolones is associated with mutations in the target gene of DNA Gyrase. We have estimated the Minimum Inhibitory Concentration (MIC) of commonly used fluoroquinolone representatives from three generations, ciprofloxacin, ofloxacin, levofloxacin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Millions of deaths occur every year due to malaria. Growing resistance against existing drugs for treatment of malaria has exaggerated the problem further. There is an intense demand of identifying drug targets in malaria parasite. PfPRL-PTP protein is PRL group of phosphatase, and one of the interesting drug targets being involved in three important pathways of malaria parasite (secretion, phosphorylation, and prenylation). Therefore, in this study, we have modeled three-dimensional structure of PfPRL-PTP followed by validation of 3D structure using RAMPAGE, verify3D, and other structure vali
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The petrous portion of the temporal bone (often informally referred to as the "petrous bone") is a key element in human evolutionary studies due to its exceptional preservation of biomolecules and morphological information. Intensive and often redundant sampling raises concerns about sustainability and long-term conservation, however. Digital recording of morphology (micro-computed and medical tomography) can preserve what destructive sampling destroys, enabling future analyses, yet there have been concerns regarding its effect on biomolecular preservation. Here, we present a systematic observ
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Deer Horn Glue is rich in collagen- and tissue-derived proteins, but the link between its experimentally observed proteome, the theoretical peptide sequence space derived from that proteome, and bone-related molecular targets remains poorly defined. This study established a proteomics-guided multiscale computational workflow to prioritize putative receptor activator of nuclear factor-κB ligand (RANKL)-binding peptide candidates generated from proteins identified in one Deer Horn Glue sample. The Deer Horn Glue proteome was characterized by liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Psoriasis is a chronic inflammatory skin disorder arising from immune dysregulation, cytokine storms, and excessive keratinocyte proliferation. Because single-target therapies often show limited efficacy, drug resistance, high costs, and long-term safety concerns, we performed the first large-scale comparative virtual screening of 32 dietary flavonoids against 20 psoriasis-related protein targets to identify safe and cost-effective multi-target therapeutic candidates. Consensus docking predicted quercetin as the top hit, exhibiting a broad binding profile across 11 targets, including previousl
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Developing brain-penetrant BACE1 inhibitors remains a major challenge in Alzheimer's disease. Unlike conventional studies focusing solely on binding affinity, this work presents an integrated computational pipeline that prioritizes both potency and pharmacokinetic developability from the outset. A robust quantitative structure-activity relationship (QSAR) model was built for 41 N-(pyridin-3-yl)-picolinamide derivatives using Molecular Electrostatic Surface Potential (MESP) descriptors. Principal component analysis identified three key electrostatic features - mean MESP, variance of negative ME
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
It is generally believed that earthquakes occur when faults weaken with increasing slip rates. An important factor contributing to this phenomenon is the faults' dynamic friction, which may be reduced during earthquakes with high slip rates, a process known as slip-rate weakening. It has been hypothesized that the weakening phenomenon during fault slip may be activated by thermal pressurization of pores' fluid and flash heating, a microscopic phenomenon in which heat is generated at asperity contacts due to high shear slip rates. Due to low thermal conductivity of rock, the heat generated at t
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.