In a new study, Zhao et al. (2025) obtain 959 whole genome sequences of H1N1 subtype swine influenza virus (SIV) isolated from China. Their analysis of the sequences, isolated between 1977 and 2020, reveals how H1N1 lineages have co-evolved and contributed to instances of zoonotic transmission within the region. This study's findings characterize the long-term evolutionary effects of frequent viral reassortment in SIV and highlight its potential to drive future pandemics.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chimeric RNAs resulting from intergenic splicing represent a distinct mechanism for transcriptome expansion. To explore the role of this previously unidentified layer of the transcriptome in sex-specific immunity, we analyzed RNA sequencing data from 425 blood samples and identified a female-specific chimeric RNA, UBA1-CDK16, which was further validated in more than 1200 blood samples. This chimeric RNA forms via cis-splicing between two adjacent X-linked parental genes, UBA1 and CDK16, despite both being expressed in both sexes. We demonstrated that a female-specific chromatin loop at the UBA
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: SARS-CoV-2 transmission has declined, yet ongoing viral evolution continues to pose public health challenges. This study conducted long-term (2020-2024) genomic surveillance within a large and globally diverse university community. Viral genomes obtained from clinical (n = 1,786) and surveillance (n = 888) testing samples were classified under clade, lineage, and variant systems, and compared with global genomic data sets. Local patterns broadly paralleled global evolutionary trends, including the phased emergence of major variants, episodic introductions of new lineages, and shift
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Synonymous mutations, long regarded as evolutionarily neutral, are increasingly recognized as important determinants of viral evolution and adaptation. In this review, we propose that viral codon usage reflects a multi-objective optimization process shaped by competing evolutionary constraints, positioning synonymous variation as a key layer of translational control with direct implications for viral evolution and rational vaccine design. We first summarize the quantitative metrics used to characterize viral codon usage bias and then examine the evolutionary forces that shape viral codon usage
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Oral squamous cell carcinoma (OSCC) is represented as a major global health concern with few treatment options. Codon usage bias (CUB) is a non-random selection of synonymous codons. It offers information on gene expression patterns and molecular evolution.
METHODS: This study examined CUB patterns in 1328 differentially expressed genes (651 up-regulated, 677 down-regulated) from oral cancer tissues. Nucleotide composition analysis, effective number of codons (ENC), Relative Synonymous Codon Usage (RSCU) analysis, neutrality plot analysis, and gene expression analysis were perform
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amongst the Macropodidae (kangaroos and wallabies) the morphologically distinct forest wallabies are the most poorly studied. Modern forest wallabies are confined to the rainforests of New Guinea, with three species inhabiting the lowlands (Dorcopsis), two species in the highlands (Dorcopsulus), and one satellite island endemic (Dorcopsis atrata). Due to limited sampling in previous studies, our understanding of the evolutionary history and systematics of these genera is unresolved. We obtained tissue samples from 17 individual Dorcopsis and 26 Dorcopsulus including representatives from five o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA editing is a post-transcriptional pyrimidine exchange process that alters plastid and mitochondrial transcripts in nearly all land plants. Although confined to organelles, it is directed by nuclear-encoded PLS-type pentatricopeptide repeat (PPR) proteins, each typically recognizing a specific RNA target. While many editing sites are functionally neutral, edits at cryptic start and internal stop codons have been implicated in modulating organellar gene expression. Ferns-and some lycophytes-are unique among vascular plants in exhibiting both C-to-U and U-to-C editing, making them valuable fo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spanning almost six decades (1966-2024), 23 whole-genome sequences of Chandipura virus (CHPV), a neurotropic rhabdovirus associated with acute encephalitis primarily in India, have been analyzed. The virus is believed to be transmitted mainly by Sergentomyia and Phlebotomus sandflies. An epidemiological geographical map was developed showing global CHPV detection in sandflies, district-level human encephalitis reports in India, and sandfly species distribution across the country. This integrated landscape links viral occurrence with vector ecology and outbreak potential. To investigate evoluti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial peptides (AMPs) constitute key components of innate immunity across the tree of life. Canonical AMPs are typically translated as small proteins and secreted from host cells to act against microbes. However, cryptic AMP-like domains are also embedded within diverse proteins not classically associated with antimicrobial function. How such embedded AMPs first emerge and diversify remains unclear. Here we retrace the origin and evolution of the abundant mammalian protein lactoferrin and its embedded AMP, lactoferricin. By resurrecting extinct lactoferrin ancestors dating back to the
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alternative splicing is a key post-transcriptional process that generates multiple mRNAs from a single pre-mRNA through the coordinated action of the spliceosome and associated splicing factors. SMNDC1 (survival motor neuron domain containing 1) has been identified as an integral component of the spliceosome complex. Previous studies have shown that SMNDC1 is essential for splicing catalysis in vitro and plays a regulatory role in intron retention in cancer. However, the phylogenetic relationships and expression patterns of SMNDC1 across the animal kingdom have not been systematically investig
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The chloroplast genomes of Verbascum speciosum and V. sinuatum reveal lineage-specific structural variations and hypervariable loci (ycf3_1-trnS-GGA, rps15, matK) that serve as powerful markers for species identification. Signatures of positive selection in ndhB, ycf3, and ycf4 suggest adaptive evolution in plastid genes, while phylogenomic analyses confirm that plastome-scale data are essential for resolving species-level relationships in this medicinally valuable genus. The genus Verbascum (Scrophulariaceae) is both species-rich and notoriously difficult to classify, with many members valued
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: No studies have deeply examined the phylogenetic patterns and spatiotemporal spread of H1N1pdm09 in Anhui Province, China.
METHODS: We conducted a genome-wide analysis of 162 historical epidemic strains in Anhui Province, China to understand the phylogenetic relationships and geographic clustering, incoming and outgoing events, and evolutionary dynamics of the strains.
RESULTS: The number of strains available for sequencing was higher for the period 2018-2023, reflecting intensified surveillance activity. Time of most recent common ancestor (TMRCA) estimates for major clades in A
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Synonymous mutations do not alter proteins but undergo natural selection in many species. For Drosophila melanogaster, reports on selection strength vary from undetectable to surprisingly strong. Here we apply a new method to estimate the population selection coefficient (2Ns) for all 134 ordered pairs of synonymous codon changes. The method uses ratios of site frequency spectra for synonymous codon changes and matched neutral changes, avoiding reliance on divergence data or codon frequencies and remaining relatively insensitive to demographic history. Results indicate that natural selection o
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The humphead wrasse (Cheilinus undulatus) is a protogynous hermaphroditic fish and a top predator in coral reef ecosystems. However, overfishing has led to a significant decline in its population, making it challenging to study its adaptive evolution and sex reversal mechanisms. RESULTS: In this study, comparative genomics analyses revealed adaptive evolutionary signals associated with feeding capacity, digestive function, and color pattern transformation in C. undulatus. Notably, positive selection signals were detected in the key masculinization pathway gene amh in C. undulatus,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: The 3' untranslated region (3' UTR) integrates cleavage and polyadenylation signals, microRNA targets, RNA-binding-protein sites, and RNA secondary structure, but the organizational levels that remain conserved during long-term sequence evolution are poorly understood. Methods: We analyzed the ras85D 3' UTR in 37 drosophilid taxa. Substitution rates were estimated by maximum likelihood and RelTime; insertions and deletions were reconstructed with ARPIP and summarized as insertion-deletion evolutionary localizations (IELs). Mobile-element candidates were detected with CEN
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human PTGS1 and PTGS2 encode cyclooxygenase paralogs that regulate prostaglandin biosynthesis and are major targets of nonsteroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDs). Interpreting population-differentiated PTGS variation requires integration of allele-frequency structure with transcript consequence, protein topology, splice-prediction evidence and structural context. This study integrated allele-resolved population differentiation, transcript-aware consequence annotation, splice-prediction boundary checks, protein-domain mapping, direct leader-sequence property calculations and controlled struc
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Respiratory syncytial virus (RSV) is an important respiratory pathogen in infants, young children and older adults. Based on global RSV genomic surveillance data, this review systematically summarizes the geographic distribution, seasonal epidemic patterns, and long-term evolutionary trends of RSV, with particular emphasis on the sustained circulation and evolutionary mechanisms of dominant genotypes such as ON1 in RSV-A and BA9 in RSV-B. Current evidence indicates that RSV transmission dynamics are tightly coupled with viral evolution. The G gene evolves relatively rapidly and contains multip
СтатьяОбзорАннотация на английскомПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Foot-and-mouth disease (FMD) represents a significant global economic burden and remains the primary constraint on Ethiopia's livestock economy and international trade. This desk review synthesized 60 years of data (1957-2025) using a structured, multidatabase search across four domains: disease, genotype/lineage, geographic spread, and temporal context. Data were stratified into three periods: Period I (1957-1980), Period II (1981-2000), and Period III (2001-2025). Results indicate that Period I saw the identification of serotypes O, A, and C, though serotype C has not been detected after 198
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Neocortical expansion and diversification in primates, especially humans, underpin advanced cognitive abilities, yet the molecular and cellular bases of neocortical area specification remain incompletely understood.
RESULTS: Here, we perform an integrative multimodal analysis combining single-nucleus multiomic and spatial transcriptomic sequencing, morphological and electrophysiological profiling, and secondary comparisons across humans, macaques, and mice. We uncovered enhanced area-specific cellular diversification in primates, including distinct upper-layer projection neuron an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spiders are largely terrestrial, but some lineages have independently adapted to marine and freshwater habitats. Although physiological and behavioral traits supporting these evolutionary transitions have been characterized, the genomic basis of adaptation to aquatic and semi-aquatic habitats in spiders remains unclear. Here, we report a chromosome-level genome assembly for the aquatic spider Argyroneta aquatica. Comparative analysis of 22 spider species supports 2 independent transitions in semi-aquatic (∼56 Mya) and aquatic (∼44 Mya) lineages. The aquatic spider shows distinct respiratory mo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования