Leishmania are trypanosomatid parasites whose unorthodox genomes challenge classical views of how DNA replication and gene expression are regulated in eukaryotes. Within this unconventional genomic context, chromosome replication, constitutive polycistronic transcription, chromatin architecture, and noncoding RNAs emerge not as discrete regulatory layers but as mutually dependent determinants of gene expression and genome stability. Recent advances have also uncovered an unexpected interconnection between Leishmania's evolutionarily divergent replication stress response machinery and its pecul
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Investigating genetic progression and lineage using sequence data is a fundamental focus within the realm of viral genome research. Given the substantial increase in publicly accessible genome sequences, tools designed for extensive data analytics, particularly insightful visualizations play an important role in elucidating the spatio-temporal evolution as well as the diversity of viral lineages. Existing genome data analysis methods frequently rely on multiple sequence alignment (MSA) and phylogeny computations, making integration of new sequences computationally expensive. Such m
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sharing clinical and genomic data is essential for accurate variant interpretation, the advancement of genomic research, and supporting couples planning to conceive. This cross-sectional study examined attitudes toward newborn genomic data sharing in a cohort of peripartum mothers in Slovenia. Among the 1111 respondents, 84% expressed willingness to share anonymized genomic data to benefit other couples and to advance novel diagnostic and preventive strategies. Support was reported by 87% for clinical applications and by 59% for research purposes, while 74% favored international data sharing.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The variability of nucleotide sequences of complete mitochondrial genomes in the Shors, a Turkic-speaking people from the Altai-Sayan region, was studied. The Shors exhibit a high level of nucleotide diversity due to the presence of two components of the East and West Eurasian origin in their gene pool (79.5 and 20.5 %, respectively). However, a relatively low level of mtDNA haplotype diversity was found among the Shors, which is associated with the high prevalence of certain identical mitochondrial haplotypes. Multidimensional scaling of interpopulation genetic distances indicates that the Sh
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Seborrheic keratosis is a common benign skin tumor that affects most individuals, particularly later in life. Despite its high prevalence, the underlying biology of seborrheic keratosis remains poorly understood. In this study, we performed whole-exome sequencing and spatial transcriptomics on a cohort of seborrheic keratosis and solar lentigo lesions to gain insight into their molecular landscape. Our results reveal a high mutational burden driven by solar UV damage, with recurrent somatic variants observed in genes such as FGFR3, NOTCH1, and TP53. Spatial transcriptomic analysis uncovered a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The exponential expansion of metagenomic data obtained through high-throughput sequencing technologies has surpassed the petabyte-scale threshold, resulting in an unprecedented abundance of data now enabling the in silico discovery of previously unknown viral and bacterial species. Here, we demonstrate the power and promise of mining sequencing data to uncover natural adeno-associated virus (AAV) cap(sid) genes, with the synergistic aims to expand our repertoire of templates for vector development and to enhance our understanding of the AAV space and of virus evolution across species. Specific
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Yeasts are ubiquitous microorganisms thriving in diverse environments. They are prevalent members of the phyllosphere microbiome … cing of 96 high-quality genomes from this collection, representing 14 yeast genera, and comparative genomics revealed specific signatures associated with life in the phyllosphere, the aboveground part of the plant. These adaptive traits encompass enriched carbohydrate metabolism, secondary metabolite biosynthetic pathways, and pectin degradation. The subst …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Candidozyma auris is an emerging multi-drug resistant fungal pathogen characterized by high mortality and rapid transmission in healthcare settings, but the genetic drivers of phenotypic variation between strains and the landscape of gene essentiality in this organism remain undercharacterized. Here, we integrate pangenomic analysis with global essentiality screening to establish a foundational understanding of the C. auris genome and identify potential therapeutic targets. We performed pangenome analysis on 695 outbreak strains of C. auris selected to be genetically representative of publicly
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Indigenous chickens are an essential part of biodiversity and a vital protein resource to humans, yet global warming and environmental chang … and shrubs coverage) that shape ecological niches of indigenous chickens. Landscape and comparative genomics analyses revealed both known and novel candidate genes, such as UNC80, PTPRO, NCOR2, CSF2RB, NXT2 and PALLD for the solar radiation, precipitation, diurnal temperature range, cropland areas, trees coverage and bare ground, respectively. Particularly …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The chloroplast genome of Artocarpus gongshanensis S. K. Wu ex C. Y. Wu & S. S. Chang 1989, a threatened species endemic to China, was sequenced for the first time using Illumina NovaSeq 6000. The complete chloroplast genome assembly reveals a quadripartite structure with a total length of 160,174 bp, consisting of a large single-copy (LSC) region (89,311 bp) and a small single-copy (SSC) region (19,489 bp), separated by two inverted repeat (IR) regions (25,687 bp each). Phylogenetic reconstruction based on chloroplast genome data strongly supports that A. gongshanensis forms a sister clade wi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Horsenettle (Solanum carolinense L.) is a noxious weed widely distributed across North America and increasingly invasive in other regions. Its strong environmental adaptability, complex defense strategies, and distinctive reproductive traits make it an important model for studying plant-herbivore coevolution. However, the absence of high-quality genomic resources has limited deeper investigation into its adaptive evolutionary mechanisms. In this study, we generated a chromosome-level reference genome assembly for S. carolinense using an integrated approach combining PacBio HiFi long-read seque
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome editing enzymes have vast therapeutic potential. However, achieving sufficient delivery in vivo remains a major challenge, because editing machinery is confined to the subset of transfectable cells in a tissue. Here, we tested the possibility that genome editing could be amplified in vivo by programming transfected cells to produce and transfer editing enzymes in lipid vesicles to neighboring cells. Our data show that this NANoparticle-Induced Transfer of Enzyme (NANITE) strategy tripled editing efficiency in cultured cells relative to non-spreading controls. Furthermore, a single intra
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Siphonophores (Cnidaria: Hydrozoa) are pelagic colonial marine invertebrates with many highly specialized bodies (zooids) within a single colony. Their unique biology and ecological importance have made them of particular interest, and motivate questions on their genomic structure, organization and content. To investigate siphonophores' genome biology and develop resources for future studies, we sequenced the genome of a single Nanomia septata to chromosome scale. The haploid genome is 1.7 GB across 8 chromosomes. Relative to closely related hydrozoan genomes, this is an expansion in length bu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Reliable genomic DNA isolation is essential for investigating the genetic basis of any organism. In fungi such as Ustilago maydis, this task is particularly challenging due to the rigid cell wall and the presence of polysaccharides, pigments, and other compounds that can compromise DNA quality as contaminants. This chapter provides practical guidance on overcoming these challenges by detailing robust cell lysis strategies, including enzymatic digestion and mechanical disruption, which form the critical first step in gDNA extraction. Additionally, a set of protocols is presented, tailored to di
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer is a disease caused by genomic alterations, and identifying the profile of genetic changes in each cancer leads to the optimal choice of treatment, that is, precision medicine. In Japan, comprehensive genomic profiling tests were covered by insurance in June 2019, and cancer genomic medicine was fully implemented in clinical practice. In the field of urological malignancies, the approval of olaparib for metastatic castration-resistant prostate cancer with BRCA1/2 mutations has led to the practical application of cancer genomic medicine in many cases. However, various challenges exist in
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Studies have shown that individuals assigned male at birth with a first-degree relative diagnosed with breast cancer have approximately twice the risk of developing breast cancer. Advances in genomic science have revolutionized cancer care. However, many nurses and nursing students have received little formal education in genomic science. This foundational knowledge, including proper use of terminology, is critical to providing comprehensive and safe genomic care. Nurses also play a significant role in collecting family health histories and in identifying and educating males and their families
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The construction of microbial cell factories frequently encounters bottlenecks due to the complexity of metabolic pathways, insufficient enzyme functionality, and poor environmental tolerance. Directed evolution, as a pivotal technology for overcoming these engineering constraints, can significantly enhance the titer, productivity, and overall robustness of target-producing strains. Its development originated from traditional random mutagenesis, a method that generates genetic diversity through the imposition of artificial growth pressures and is currently in widespread use. However, owing to
СтатьяОбзорАннотация на английскомПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genomic regulation depends on coordinated interactions among DNA sequence, chromatin state, epigenetic marks, three-dimensional architecture, and cellular context. Yet formal approaches for representing higher-order regulatory organization across these layers remain limited. Here, we propose a discrete hierarchical coding framework to examine whether regulatory systems exhibit reusable state constraints beyond sequence-level coding. The model defines an eight-symbol alphabet, including a re-entry symbol DO' for hierarchical closure, and yields a 64-state space of ordered dominant-contextual pa
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования