Cohesin is a central architect of the 3D genome. As it extrudes DNA, it must navigate a 'busy' genomic landscape, leading to constant biophysical engagements with diverse chromatin binding proteins and molecular machineries. In this review, we examine how cohesin's loop extrusion is shaped by mechanical encounters with directional barriers like CCCTC-binding factor (CTCF), moving transcriptional fronts, and advancing replication forks. We highlight how these players can arrest, slow, or actively push cohesin, dynamically modulating chromatin topology. Furthermore, we discuss how the replisome
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigates the molecular mechanisms underlying thermal resilience in the Cynops orientalis (Chinese fire-bellied newt) through functional characterization of CoHsp70, a cytosolic heat shock protein 70 homolog. Comparative genomic analysis revealed conserved structural domains (ATPase, substrate-binding domain, and EEVD motif) and > 80% sequence identity with amphibian orthologs. Tissue-specific profiling identified fat tissue as the predominant site of CoHsp70 expression. Temperature-dependent transcriptional regulation exhibited bidirectional dynamics: rapid induction under acute
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The evolution of skin appendages has involved innovation at the levels of keratin intermediate filament proteins, which build stable cornified structures, and regulatory factors, which determine the anatomical location of skin appendages. The keratin components of nails and claws have evolved at the digit tips under the control of the transcription factor Hoxc13 in a common ancestor of tetrapods. The additional expression of hoxc13 at other skin sites allowed the evolution of hair in mammals. Here, we show that the cornification of epithelial spines within nuptial pads of Xenopus frogs involve
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Klebsiella michiganensis, an emerging multidrug-resistant pathogen, poses a significant public health threat. This study employed subtractive genomics to identify potential therapeutic targets in K. michiganensis THO-011. From 4,024 predicted open reading frames, we identified non-redundant, human non-homologous proteins and analyzed them for essentiality, subcellular localization, and metabolic pathway involvement. Two promising druggable targets, WP_004097788.1 and WP_219541799, vital for bacterial survival, were identified. Using AlphaFold-predicted structures, virtual screening of 10,000 n
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bromodomain adjacent to zinc finger 2A and 2B (BAZ2A and BAZ2B) are homologous proteins that serve as regulatory subunits in different initiation switch complexes. Despite their structural similarity, BAZ2A/B seem to play different roles in disease development. However, reported BAZ2A/B inhibitors bind similarly to both homologues. Here we report the discovery of dBAZ2 and dBAZ2B, first-in-class Proteolysis Targeting Chimeras (PROTACs) degrading BAZ2A/B and BAZ2B, respectively. dBAZ2 induces BAZ2A/B degradation with a D max ≥ 97% (BAZ2A_DC50 = 180 nM; BAZ2B_DC50 = 250 nM), while dBAZ2B selecti
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Serine/threonine kinases of the TSSK (Testis-Specific Serine/Threonine Kinase) family play crucial roles in spermatogenesis and male fertility across species, but the underlying regulatory mechanism remains incompletely understood. In this study, we identified and characterized a novel TSSK homolog in Drosophila, named dTSSK2 (CG9222), which functions as the ortholog of human TSSK4. dTSSK2 is specifically expressed in the testis and localizes to individualization complexes during spermiogenesis. Disruption of dTSSK2 severely compromises sperm motility, leading to failed sperm transit into the
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The first leptospiral recombinant vaccine was developed in the late 1990s. Since then, progress in the fields of reverse vaccinology (RV) and structural vaccinology (SV) has significantly improved the identification of novel surface-exposed and conserved vaccine targets. However, developing recombinant vaccines for leptospirosis faces various challenges, including selecting the ideal expression platform or delivery system, assessing immunogenicity, selecting adjuvants, establishing vaccine formulation, demonstrating protective efficacy against lethal disease in homologous challenge, achieving
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The α3β2 and α3β4 nicotinic acetylcholine receptors (nAChRs) are widely expressed in the central and peripheral nervous systems, playing critical roles in various physiological processes and in such pathologies as addiction to nicotine and other drugs of abuse. α-Conotoxin LvIA, which we previously isolated from Conus lividus, modestly discriminates α3β2 and α3β4 rat nAChRs exhibiting a ∼17-fold tighter binding to the former. Here, alanine scanning resulted in two more selective analogues [N9A]LvIA and [D11A]LvIA, the former having a >2000-fold higher selectivity for α3β2. The determined cryst
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the present study, we have isolated and characterized a Yarrowia lipolytica morphological mutant growing exclusively in the pseudohyphal morphology. The gene responsible for this phenotype, YALI0E06519g, was identified as homologous to the mitosis regulation gene HSL1 from Saccharomyces cerevisiae. Taking advantage of its morphology, we achieved the immobilization of the Δhsl1 mutant on the metallic structured packing of immobilized-cell bioreactors. We obtained significant cell retention and growth on the support during shake flask and bioreactor experiments without an attachment step prio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
α-Conotoxins are disulfide-rich peptides that target nicotinic acetylcholine receptors. Recently we identified several α-conotoxins that also modulate voltage-gated calcium channels by acting as G protein-coupled GABA(B) receptor (GABA(B)R) agonists. These α-conotoxins are promising drug leads for the treatment of chronic pain. To elucidate the diversity of α-conotoxins that act through this mechanism, we synthesized and characterized a set of peptides with homology to α-conotoxins known to inhibit high voltage-activated calcium channels via GABA(B)R activation. Remarkably, all disulfide isome
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nonstructural protein 15 (nsp15), also called endoribonuclease, is a gene product of open reading frame 1b (ORF 1b) in coronaviruses. It is an important enzyme in the transcription/replication process involved in discontinuous negative-strand RNA synthesis. In this work, mutants of nsp15 from Human coronavirus 229E (HCoV-229E) were made based on structural analysis of the homologous nsp15s in Severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) and Mouse hepatitis virus (MHV). The I26A/N52A mutant of nsp15 was overexpressed, purified and crystallized, and this mutant led to a trimeric form
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Charybdotoxin, belonging to the group of so-called scorpion toxins, is a short peptide able to block many voltage-gated potassium channels, such as mKv1.3, with high affinity. We use a reliable homology model based on the high-resolution crystal structure of the 94% sequence identical homologue Kv1.2 for charybdotoxin docking followed by molecular dynamics simulations to investigate the mechanism and energetics of unbinding, tracing the behavior of the channel protein and charybdotoxin during umbrella-sampling simulations as charybdotoxin is moved away from the binding site. The potential of m
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nitric oxide synthases (NOSs) are multidomain metalloproteins first identified in mammals as being responsible for the synthesis of the wide-spread signaling and protective agent nitric oxide (NO). Over the past 10 years, prokaryotic proteins that are homologous to animal NOSs have been identified and characterized, both in terms of enzymology and biological function. Despite some interesting differences in cofactor utilization and redox partners, the bacterial enzymes are in many ways similar to their mammalian NOS (mNOS) counterparts and, as such, have provided insight into the structural an
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Yep-phi, a lytic phage of Yersinia pestis, was isolated in China and is routinely used as a diagnostic phage for the identification of the plague pathogen. Yep-phi has an isometric hexagonal head containing dsDNA and a short non-contractile conical tail. In this study, we sequenced the Yep-phi genome (GenBank accession no. HQ333270) and performed proteomics analysis. The genome consists of 38 ,616 bp of DNA, including direct terminal repeats of 222 bp, and is predicted to contain 45 ORFs. Most structural proteins were identified by proteomics analysis. Compared with the three available genome
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel serum protein inhibiting specifically the enzymatic activity of the basic phospholipase A(2) (PLA(2)) from the venom of the Chinese mamushi snake (Agkistrodon blomhoffii siniticus) was purified from a nonvenomous Colubridae snake, Elaphe quadrivirgata. The purified inhibitor was a 150-kDa glycoprotein having a trimeric structure, composed of two homologous 50-kDa subunits. Their amino acid sequences, containing leucine-rich repeats, were typical of the beta-type PLA(2) inhibitor (PLIbeta), previously identified from the serum of A. blomhoffii siniticus. The inhibitor inhibited exclusiv
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cholesterol-dependent cytolysins (CDCs) are part of a large family of pore-forming proteins that include the human proteins perforin and the complement membrane attack complex. The activity of all family members is focused on membranes, but the proteins are themselves involved in a diverse range of phenomena. An overview of some of these phenomena is provided here, along with an historical perspective of CDCs themselves and how our understanding of their mechanism of action has developed over the years. The way in which pore formation depends on specific characteristics of the membrane und
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The glutamate-gated chloride channels (GluCls) play essential roles in signal transduction by regulating fast inhibitory synaptic transmission in the nervous system of invertebrates. While there is only one GluCl subunit in the insect, the diversity of insect GluCls is broadened by alternative splicing. In the present study, three TcGluCl variant genes were cloned from the red flour beetle Tribolium castaneum. Analysis of the characteristics of TcGluCls including sequence features, genomic structures, and alternative splicing revealed that TcGluCls had the typical structural features of GluCls
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chagas disease is a neglected tropical disease endemic to Latin America, though migratory movements have recently spread it to other regions. Here, we have applied a cascade virtual screening campaign combining ligand- and structure-based methods. In order to find novel inhibitors of putrescine uptake in Trypanosoma cruzi, an ensemble of linear ligand-based classifiers obtained by has been applied as initial screening filter, followed by docking into a homology model of the putrescine permease TcPAT12. 1,000 individual linear classifiers were inferred from a balanced dataset. Subsequently, dif
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Plant profilins are important pan-allergens. They are responsible for a significant percentage of pollen-related allergies. Limited information is available about their involvement in the latex-fruit syndrome and the cross-reactivities between latex and pollen. We aimed to clone and express the Hevea brasiliensis latex profilin to investigate its allergological significance and serological cross-reactivities to profilins from plant foods and pollens.
METHODS: A DNA complementary to messenger RNA (cDNA) coding for the Hevea latex profilin, Hev b 8, was amplified by polymerase chain
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Xeroderma pigmentosum (XP) complementation group A (XPA) is an essential scaffolding protein in the multiprotein nucleotide excision repair (NER) machinery. The interaction of XPA with DNA is a core function of this protein; a number of mutations in the DNA-binding domain (DBD) are associated with XP disease. Although structures of the central globular domain of human XPA and data on binding of DNA substrates have been reported, the structural basis for XPA's DNA-binding activity remains unknown. X-ray crystal structures of the central globular domain of yeast XPA (Rad14) with lesion-containin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования