BACKGROUND: Chromosomal rearrangements can play an important role in shaping patterns of genomic divergence and speciation, yet their evolutionary context is still largely unclear, as such events are rare and challenging to identify in recent evolutionary history. Geladas (Theropithecus gelada) provide a unique system to investigate this process, as a novel fission on chromosome 7 has resulted in polymorphic karyotypes among gelada populations.
RESULTS: We integrate new cytogenetic data from ten animals together with whole-genome sequencing from 149 individuals spanning all three extant gelad
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ribosomal RNAs (rRNAs), essential components of ribosomes involved in protein synthesis, are encoded by ribosomal DNAs (rDNAs), which are typically organized as tandem repeats within rDNA clusters. The internal transcribed spacer (ITS) region of rDNA, characterized by low intraspecific but high interspecific divergence, has been a focus of phylogenetic and diagnostic studies. However, comprehensive analysis of rDNA clusters remains challenging due to their repetitive nature and polymorphisms. In apicomplexan genomes, rDNA structure and function remain poorly explored. Here, we developed a pipe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report a complete rodent telomere-to-telomere genome assembly from the brown rat, Rattus norvegicus. Annotation was enriched with multi-tissue long-read RNA sequencing and uncovered numerous novel genes. Assembly of both sex chromosomes reveals the absence of gene coding in the presumed pseudo-autosomal regions and the presence of centromeric satellite repeats on distal chromosome Y (chrY). We provide evidence of meiotic conjunction between Xp and Yq. The genome assembly reveals several expanded autosomal regions enriched for testis-expressed genes. Finally, we have generated a pangenome fr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Externalizing spectrum disorders-spanning attention-deficit/hyperactivity disorder, conduct disorder, substance use disorders, and other disorders characterized by disinhibition-frequently co-occur within individuals due, in part, to shared genetic etiology. To advance understanding of this genetic architecture, we conducted a multi-ancestry, multivariate genome-wide association analysis of more than 4 million individuals, identifying 1,294 genomic regions linked to an externalizing factor. Fine-mapping and gene prioritization efforts identified 961 effector genes, with the putative causal var
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Programmable genome editing has advanced from nucleases through base and prime editors, yielding an increasingly precise and versatile editing toolkit that is nonetheless best suited to small, localized changes. Efficient, site-specific writing of kilobase-scale DNA, including whole genes, regulatory elements, and multi-component cassettes, remains a central unmet goal, with implications for dissecting regulatory logic, building physiologically accurate disease models, and engineering mutation- and gene-agnostic therapies. Here, we review recent advances in programmable large-DNA writing in th
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Disorders of or differences in sex development (DSD) are congenital conditions characterized by a discrepancy between chromosomal, gonadal and/or anatomic sex. They are broadly classified on the basis of karyotype into 46,XX, 46,XY and sex chromosomal DSDs. While the most common cause of 46,XX DSD is congenital adrenal hyperplasia (CAH) due to 21-hydroxylase deficiency, the genetics of 46,XY DSD is more complex with over 100 genes implicated. A precise genetic diagnosis of DSD ends the diagnostic odyssey and helps predict the future course with respect to gender development, puberty and extrag
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The diagnosis of nephrocalcinosis (NC) is challenging due to difficulties in radiologic detection, clinical heterogeneity, and its broad etiological spectrum that includes both genetic and non-genetic causes. This study aimed to uncover, in a pioneering manner, the distinct NC etiologies in a Brazilian cohort according to age of onset.
METHODS: This retrospective cross-sectional study was based on 96 medical records of outpatients (66 adults and 30 children) with NC, who had followed a comprehensive investigation.
RESULTS: Distal renal tubular acidosis was the leading cause of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
While induced pluripotent stem cells (iPSCs) have gained popularity in studying neurodegenerative diseases, the heterogeneity of stem cells … available. This resource will enable more accurate investigation of the KOLF2.1J cell line and any genomics data generated compared to using traditional generalized references, while also serving as a foundational approach for establishing custom reference assemblies for other high-value iPSC lines.
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Aggressive evolution of PitNETs is rare; metastatic spread is even more. Defining aggressiveness and malignancy is challenging, subsequently hard to predict, and to understand. The aim was to provide a molecular definition of aggressiveness using genomic approaches.
METHODS: PitNETs from 206 patients were included. Associations between 9 clinicopathological features of aggressiveness and PitNETs' omics were explored. Omics included transcriptome, DNA methylation, chromosomal alterations, and mutations. Clonal tumor evolution was monitored in 7 patients.
RESULTS: Among the 9 clini
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genomic information for hematologic malignancies is now routinely available in clinical practice, supporting the adaptation of hematopoietic cell transplantation, selection of conditioning intensity, and implementation of post-transplant maintenance therapy through refinement of disease risk assessment and minimal residual disease (MRD) measurement. This review presents the current evidence on the effective utilization of genomic information for acute myeloid leukemia (AML), myelodysplastic syndromes (MDS), and myeloproliferative neoplasms (MPN). It also presents an up-to-date framework for op
СтатьяОбзорАннотация на английскомПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sporotrichosis, a subcutaneous mycosis caused by dimorphic fungi of the Sporothrix genus, has become a major zoonotic epidemic in South America, primarily driven by Sporothrix brasiliensis. To elucidate the genomic basis of its emergence and antifungal adaptation, we analyzed whole-genome sequences from 95 Sporothrix isolates, integrating single-nucleotide polymorphism (SNP), copy number variation (CNV), and genome-wide association (GWAS) analyses. Comparative genomics revealed 610,242 SNPs within S. brasiliensis and 1,474,627 within S. schenckii, confirming a marked disparity in intraspecific…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IMPORTANCE: West Nile virus (WNV), a mosquito-borne orthoflavivirus, represents an increasing public health threat in Europe. In July 2025, WNV lineage 2 (WNV-L2) was associated with the first autochthonous cases ever detected in the metropolitan area around Paris, France; understanding the dispersal dynamics and geographic origin of these emergence events is critical for public health preparedness.
OBJECTIVES: To characterize the spatial and temporal dynamics of WNV circulation in France from 2022 to 2025 and to determine the origin of the virus lineages responsible for the 2025 emergence in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Penile squamous cell carcinoma (PSCC) is a rare but highly heterogeneous malignancy accounting for over 95% of penile cancers. While it is more prevalent in regions such as South America, parts of Africa, and South Asia, its global rarity has historically limited molecular research. Recent advances in high-throughput sequencing have enabled the detailed genomic and epigenomic characterization of HPV-associated and HPV-independent carcinogenesis, unveiling critical differences between these two processes. These discoveries are reshaping classification, prognosis, and therapeutic decision-making
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Smallpox was a major driver of population collapse in the Americas after European contact, yet the genetic identity of the causal strains remains unknown. Here, we report the first ancient smallpox genomes in the Americas, dating to approximately 1492-1631 common era (CE), recovered from two Inca-Colonial individuals in northern Chile. These genomes form a now-extinct lineage that diverged around 1296 CE, after the splitting of early medieval European strains but before the emergence of modern variola lineages, providing direct molecular evidence for smallpox introduction through European colo
СтатьяИсторическая статьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report the draft genome sequence of Dermacoccus nishinomiyaensis Y5 isolated from a glycerol stock prepared from a fungal culture from the gill of the lucinid bivalve, Stewartia floridana . This bacterial strain is gram-positive, coccus-shaped, and citrate-positive. Its draft genome of 3.3 Mb was assembled with 100% completeness, comprising 11 contigs and 2,937 protein-coding genes. Dermacoccus nishinomiyaensis Y5 shared 98.9% average nucleotide identity (ANI) with its closest genome relative, D. nishinomiyaensis CTOTU46710 assembled from an urban metagenome. Further investigation is needed
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microbial symbiosis drives the functional and phylogenomic diversification of life on Earth yet remains underexplored because of culturing challenges. This study used machine learning (ML) to predict symbiotic lifestyles in more than a hundred thousand microbial genomes from diverse environmental metagenome samples and reference genomes. Predictions were performed using symclatron, an ML framework developed to identify genomic signatures of symbionts. Predictions were deposited in a catalog we established called Symbiont Genomes (SymGs). The results indicate that 15-23% of uncultivated microor
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bovine tuberculosis (bTB), caused by the bacterium Mycobacterium bovis, is one of the most pressing animal health issues in Wales today. It negatively impacts cattle health, affects profitability and trade, and can decimate years of genetic improvement towards desirable production traits. It also imposes substantial financial, social, and psychological burdens on farming communities. Eradication of bTB requires an understanding of local transmission pathways to target effective disease-control interventions. In this study, we characterised the genomic diversity of M. bovis across Wales by anal
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Screening for UV-sensitive DNA mutation sites as dosimeters for individual sun exposure, using high-fidelity Duplex Sequencing to reduce false positives and a stringent genome alignment protocol to reduce false negatives, revealed: (i) Sun-exposed human skin contained UV signature mutations (C → T at a diypyrimidine) >1000-fold more frequently than unexposed neonatal skin, making these mutations sensitive genomic dosimeters for UV exposure. (ii) Tumor suppressor gene hotspot nucleotides (nt) reached variant allele frequency (VAF) 0.1%-10% via 30-3000 fold clonal expansion in occasional biopsie
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The question of when people first entered the American continents has been the subject of scholarly research for over a century, yet a consensus remains elusive. This is in part due to the unique circumstances of the peopling process itself, in part because of the specific history of the field and cultural dynamics of the researchers [1], and in part because of extraordinary recent contributions from the fields of paleogenomics, new archaeological discoveries, and insights from related fields. In this article, we review different models for early migrations into the Western Hemisphere, conside…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pancreatic adenosquamous carcinoma (PASC) is a highly rare and aggressive disease with poor prognosis. The median overall survival is less than one year. Aiming to identify the genomic characterization of the PASC, we conducted a retrospective analysis of the clinical characteristics and genomic alterations in 14 patients with PASC who underwent surgery at Beijing Hospital and Peking Union Medical College Hospital from 2010 to 2021. Genomic alterations were identified using targeted panel sequencing. We developed a PASC-specific signature to aid in the prognostic stratification of these patien
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.