The vertebral column is derived from somites formed by segmentation of presomitic mesoderm, a fundamental process of vertebrate embryogenesis. Models on the mechanism controlling this process date back some three to four decades. Access to understanding the molecular control of somitogenesis has been gained only recently by the discovery of molecular oscillators (segmentation clock) and gradients of signaling molecules, as predicted by early models. The Notch signaling pathway is linked to the oscillator and plays a decisive role in inter- and intrasomitic boundary formation. An Fgf8 signaling
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The accurate prediction of adverse drug reactions (ADRs) is essential for comprehensive drug safety evaluation. Pre-trained deep chemical language models have emerged as powerful tools capable of automatically learning molecular structural features from large-scale datasets, showing promising capabilities for the downstream prediction of molecular properties. However, the performance of pre-trained chemical language models in predicting ADRs, especially idiosyncratic ADRs induced by marketed drugs, remains largely unexplored. In this study, we propose MoLFormer-XL, a pre-trained model for enco
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Congenital diaphragmatic hernia (CDH) is a congenital malformation that occurs with a frequency of 0.08 to 0.45 per 1,000 births. Children with CDH are born with the abdominal contents herniated through the diaphragm and exhibit an associated pulmonary hypoplasia which is frequently accompanied by severe morbidity and mortality. Although the etiology of CDH is largely unknown, considerable progress has been made in understanding its molecular mechanisms through the usage of genetic, teratogenic, and surgical models. The following review focuses on the teratogenic and surgical models of CDH and
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fragment-based drug discovery is a technique that finds potent binding fragments to the binding hotspots and makes them a hit compound. The combination of fragments allows us to explore the large chemical space. Thus, it becomes an effective methodology for identifying lead compounds. Three concepts have been introduced to make the fragments into the compound: growing, merging, and linking. Recently, growing and merging techniques using AI have significantly improved the accuracy and efficiency of molecular design. In this review, recent techniques such as VAE, reinforcement learning, and SE(3
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Gram-positive bacterium Staphylococcus aureus infects diverse tissues and causes a wide spectrum of diseases, suggesting that it possesses a repertoire of distinct molecular mechanisms promoting bacterial survival in disparate in vivo environments. Signature-tag transposon mutagenesis screening of a 1520-member library identified numerous S. aureus genetic loci affecting growth and survival in four complementary animal infection models including mouse abscess, bacteraemia and wound and rabbit endocarditis. Of a total of 237 in vivo attenuated mutants identified by the murine models, less t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cases abound in which nearly identical traits have appeared in distant species facing similar environments. These unmistakable examples of adaptive evolution offer opportunities to gain insight into their genetic origins and mechanisms through comparative analyses. Here, we present an approach to build genetic models that underlie the independent origins of convergent traits using evolutionary sparse learning with paired species contrast (ESL-PSC). We tested the hypothesis that common genes and sites are involved in the convergent evolution of two key traits: C4 photosynthesis in grasses and e
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heart valve disease is a major burden in the Western world and no effective treatment is available. This is mainly due to a lack of knowledge of the molecular, cellular and mechanical mechanisms underlying the maintenance and/or loss of the valvular structure. Current models used to study valvular biology include in vitro cultures of valvular endothelial and interstitial cells. Although, in vitro culturing models provide both cellular and molecular mechanisms, the mechanisms involved in the 3D-organization of the valve remain unclear. While in vivo models have provided insight into the molecul
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАVideo-Audio MediaПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increasing demand for efficient and interpretable computational methods for molecular property prediction has stimulated the development of quantitative structure-property relationship (QSPR) models based on graph-theoretical molecular descriptors. Topological indices are numerical descriptors derived from graph-theoretical representations of chemical structures and are widely used in QSPR studies to predict physicochemical and biological properties. In this study, degree-based and neighborhood-degree-sum-based topological indices were computed for 18 drugs used to treat bipolar disorder a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The extracellular calcium-sensing receptor (CaSR) in fishes, like the CaSRs of tetrapod vertebrates, is a dimeric seven transmembrane, G protein-coupled receptor. The receptor is expressed on the plasma membranes of a variety of tissues and cells where it functions as a sensor of extracellular calcium concentration ([Ca(2+)](o)) in the physiological range. In the context of systemic calcium homeostasis, CaSR expressed in endocrine tissues that secrete calciotropic and other hormones (pituitary gland and corpuscles of Stannius) may play a central role in global integrative signaling, whereas re
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Structural optimization of lead compounds is a crucial step in drug discovery. One optimization strategy is to modify the molecular structure of a scaffold to improve both its biological activities and absorption, distribution, metabolism, excretion, and toxicity (ADMET) properties. One of the deep molecular generative model approaches preserves the scaffold while generating drug-like molecules, thereby accelerating the molecular optimization process. Deep molecular diffusion generative models simulate a gradual process that creates novel, chemically feasible molecules from noise. However, the
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ab initio calculations at the MP2/6-31G* level have shown that variously substituted di- and trifluorobenzenes form non-covalent complexes with benzene that adopt either aromatic-aromatic or H--F binding, the choice being determined by the pattern of fluorination. The binding energies of these structures are from 3.4 to 4.5 kcal mol(-1). This range is large enough to account for observed variations in the binding affinity of a library of fluoroaromatic inhibitors of carbonic anhydrase. This enzyme has an aromatic amino acid at a central position in the active site. The diverse modes of binding
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Organ fibrosis, notably affecting the liver and kidneys, remains a major contributor to global morbidity. This review examines the pathophysiology, molecular mechanisms, and preclinical models used to study hepatic and renal fibrosis. In liver fibrosis, hepatic stellate cell activation, chronic inflammation, and extracellular matrix accumulation are central features, while renal fibrosis involves myofibroblast activation and redox-mediated signaling pathways. The present review highlights both in vitro and in vivo models such as the carbon tetrachloride, bile duct ligation, and dimethylnitrosa
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parkinson's disease (PD) is a complex genetic disorder that is associated with environmental risk factors and aging. Vertebrate genetic models, especially in mice, has aided the study of autosomal-dominant and autosomal-recessive PD. Mice are capable of exhibiting a broad range of phenotypes and coupled with their conserved genetic and anatomical structures provides unparalleled molecular and pathological tool to model human disease. These models used in combination with aging and PD-associated toxins have expanded our understanding of PD pathogenesis. Attempts to refine PD animal models using
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Excessive androgen production and obesity are key to polycystic ovary syndrome (PCOS) pathogenesis. Prenatal androgenized (PNA), peripubertal androgenized, and overexpression of nerve growth factor in theca cells (17NF) are commonly used PCOS-like mouse models and diet-induced maternal obesity model is often included for comparsion. To reveal the molecular features of these models, we have performed transcriptome survey of the hypothalamus, adipose tissue, ovary and metaphase II (MII) oocytes. The largest number of differentially expressed genes (DEGs) is found in the ovaries of 17NF and in th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Cholangiocarcinoma (CCA) is one of the most lethal cancers, characterized by molecular heterogeneity and treatment resistance. To uncover new biological signals and therapeutic opportunities, we employed multiomic characterization combined with machine learning.
APPROACH AND RESULTS: We profiled all anatomical CCA subtypes using whole exome sequencing, mRNA sequencing, and proteome/phosphoproteome analysis. Integrative dimensional reduction revealed RNA, protein, and phosphoprotein features driving tumor heterogeneity, enabling clustering. Machine learning algorithms iden
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The binding affinity between an antibody and an antigen, measured by the equilibrium dissociation constant ( K d ) and the associated Gibbs free energy of binding ( Δ G ) , is key to immune recognition and the design of therapeutic antibodies. This study explores whether degree-based topological indices, derived from molecular graph models of fifteen antibody-antigen Fab complexes from the Protein Data Bank, contain structural information related to binding affinity. Fifteen indices were calculated using an edge-partitioning technique and analyzed against two thermodynamically based respo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
EGFR activation is both a key molecular driver of disease progression and the target of a broad class of molecular agents designed to treat advanced cancer. Nevertheless, resistance develops through several mechanisms, including activation of AKT signaling. Though much is known about the specific molecular lesions conferring resistance to anti-EGFR-based therapies, additional molecular characterization of the downstream mediators of EGFR signaling may lead to the development of new classes of targeted molecular therapies to treat resistant disease. We identified a transcriptional network invol
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dystonia refers to a heterogeneous group of movement disorders characterized by involuntary, sustained muscle contractions leading to repetitive twisting movements and abnormal postures. A better understanding of the etiology, pathogenesis and molecular mechanisms underlying dystonia may be obtained from animal models. Indeed, while studies in vitro using cell and tissue models are helpful for investigating molecular pathways, animal models remain essential for studying the pathogenesis of these disorders and exploring new potential treatment strategies. To date, the mouse is the most common c
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Deep neural network (DNN)-based in silico models show great promise in predicting the properties and bioactivities of novel compounds, including small molecules. Among traditional approaches, structure-based drug design (SBDD) remains a fundamental approach for drug discovery using molecular docking, scoring functions, and molecular dynamics simulations. However, these approaches are often constrained by limited flexibility, resolution, and generalizability. Geometric deep learning (GDL) offers a transformative alternative by enabling models to learn directly from non-Euclidean molecular repre
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Based on prediction models and expert opinion, most obstetric venous thromboembolism guidelines recommend low-molecular-weight heparin for many postpartum women, including most delivering by caesarean. Scrutiny reveals major oversights: prediction models are based on studies that report asymptomatic deep vein thrombosis; risk estimates are not adjusted for time exposure; and harm caused by heparin has been overlooked. The benefits of heparin are exaggerated and its harms are under-appreciated. Estimates of the numbers-needed-to-treat and harm are universally lacking. This paper cri
СтатьяСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования