Autosomal recessive polycystic kidney disease (ARPKD) leads to severe renal cysts and progressive kidney dysfunction, with no approved treatments. The absence of such cystic phenotypes in Pkhd1-/- mice underscores the need for novel models that better recapitulate the human disease. We developed kidney organoid-on-chip models that mimic patients' distal-nephron cysts, identifying RAC1/c-FOS as potential therapeutic targets. However, critical questions remain regarding RAC1 activation during cyst formation, cyst origins, and underlying molecular mechanisms. Using a multifaceted approach, organo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Approximately 10% US infants are born small for gestational age (SGA), a condition linked to increased morbidity and mortality. Infants born to Black women are twice as likely to be SGA compared with those born to White women. Although maternal factors, including epigenetic modifications, likely contribute to SGA, the underlying biological mechanisms remain poorly understood. We evaluated whether epigenetic modifications in early pregnancy were associated with SGA among pregnant Black women. We analyzed data from 931 pregnant non-Hispanic Black women (6-13 weeks of gestation) enrolled in the N
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Systemic Lupus Erythematosus (SLE) exhibits a pronounced sex bias, affecting females approximately nine times more frequently than males; however, males tend to experience a more severe clinical course yet the molecular basis for these differences remains unclear.
METHODS: Leveraging epigenomic, transcriptomic, and proteomic data from the whole blood of 720 SLE patients (679 females, 41males) and 84 healthy controls (77 females, 7 males), we conducted comprehensive multi-omic analyses to identify sex-specific molecular features of this disease. Specifically, differential express
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autoimmune diseases are chronic disorders characterized by dysregulated immune responses directed against self-tissues. However, current therapies are limited by suboptimal efficacy, substantial adverse effects, or an inability to halt or reverse disease progression. Emerging evidence indicates that epigenetic regulation—including DNA methylation, histone modification and non-coding RNA—has a central role in the pathogenesis of autoimmune diseases, creating transformative opportunities for the development of targeted therapies. This review provides an up-to-date synthesis of advances in epigen
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glioblastoma (GBM) is the most common primary malignant neoplasm of the central nervous system in adults. GBM is defined as an isocitrate dehydrogenase (IDH)-wildtype diffuse astrocytic glioma with characteristic histologic and/or molecular features. The expanding use of integrated histologic, molecular, and epigenetic diagnostics has revealed increasing biological heterogeneity within this category. We report a case of a 73-year-old man with GBM, IDH-wildtype, harboring a novel EWSR1::RAD51B gene fusion identified by next-generation sequencing (NGS). Magnetic resonance imaging revealed a hete
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Opioid use disorder (OUD), which frequently co-occurs with HIV infection, causes long-term neurological disease, yet the epigenetic and transcriptomic effects of OUD and HIV on specific cell types and regions of the brain are poorly understood. To assess the cell-type specific impacts of OUD and HIV across the human brain, we measured single cell transcriptomes and epigenomes of 580,353 cells in the prefrontal cortex, amygdala and cerebellum of 44 donors. We cataloged over 750k candidate cis-regulatory elements (cCREs) and identified gene regulatory networks (GRNs) of transcription factor acti
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mammalian sex is determined by opposing networks of ovarian and testicular genes that are well characterized; however, its epigenetic regulation is still largely unknown. Here we explore the 3D chromatin landscape of sex determination in vivo by profiling fluorescence-activated cell-sorted embryonic mouse gonadal populations in both sexes before and after sex determination. Through conventional Hi-C analyses, we show that chromatin structures, particularly topologically associating domains, remain largely unchanged during sex determination, suggesting a preformed configuration. We further inte
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic exposure to the widely used organophosphate pesticide chlorpyrifos has been associated with reproductive dysfunction; however, the early subclinical events preceding overt reproductive dysfunction remain poorly understood due to cell-specific and non-monotonic responses to the toxicant. The present study investigated the effect of chronic CPF exposure on the spermatogenic niche and sperm epigenome in a mouse model. Despite the absence of detectable oxidative stress or reproductive toxicity, chronic CPF exposure induced significant changes in the testicular microenvironment. Testicular
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Exposure to adverse environments early in life can shape health trajectories across the lifespan. A key mechanism by which this life-long reprogramming occurs is via epigenetic modifications, including altered DNA methylation (DNAm), histone modifications, and microRNA (miRNA) regulation. This invited perspective highlights key human population studies and selected animal studies from our group and collaborators that have examined toxicant exposure occurring during or prior to pregnancy including metals, pharmaceuticals, microorganisms, air pollution, and socioeconomic stressors and their impa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transposable elements (TEs) have played a central role in major evolutionary transitions across the human lineage, from eukaryogenesis to the emergence of the eutherian placenta, and are currently reactivated in cancer and autoimmune diseases. The complete telomere-to-telomere (T2T) assembly enables comprehensive investigation of TE contributions to gene regulation. Using a 10 kb window around transcription start sites, we mapped 3,709,429 human TEs to 28,738 genes against a 500-permutation background and assessed the enrichment and functional associations of 6 TE classes and 44 families. We i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This international Consensus Statement updates 2016 guidelines for diagnosis and management of individuals with Silver-Russell syndrome (SRS), using a Delphi-like process to reach agreement through iterative expert discussions, based on published data and/or expert opinion. Individuals referred with suspected SRS show substantial clinical and genetic heterogeneity. Advances in genomic and epigenomic technology highlight the need for strict, primarily molecular, criteria for diagnosis, which should be made in those with maternal uniparental disomy for chromosome 7 (upd(7)mat) or 11p15 loss of m
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prion diseases are fatal neurodegenerative disorders caused by the misfolding of the host-encoded prion protein (PrP) into a pathogenic conformer (PrPSc). Despite decades of investigation, no therapy has proven effective, largely due to rapid disease progression and the absence of druggable intermediates. Recent molecular advances, however, have established PrP itself as a viable therapeutic substrate. Experimental ablation or suppression of Prnp in mice -the gene encoding PrP- confers complete resistance to prion infection in animal models, providing a strong genetic rationale for PrP- loweri
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Sex differences strongly influence immune responses and susceptibility to inflammatory diseases, yet how biological sex shapes immune regulatory mechanisms in chronic obstructive pulmonary disease (COPD) remains poorly understood. Neutrophils are key drivers of COPD pathogenesis, but whether biological sex shapes their inflammatory programming has not been systematically investigated.
METHODS: Here we integrated transcriptomic and epigenomic profiling of circulating neutrophils from male and female COPD patients to define sex-dependent regulatory programs in innate immune cells.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cell-free DNA in blood originates from fragmented chromatin released by dying cells from both healthy and diseased tissues1,2. These fragments carry rich molecular modalities that can reveal pathological alterations in tissues of origin3-10. Here we develop cf-EpiTracing, a highly sensitive automated platform that profiles histone modifications in cell-free DNA from as little as 50 μl of human plasma. By integrating multimodal chromatin states with machine learning, cf-EpiTracing enables accurate deconvolution of cell types of origin. We generated 2,417 cf-EpiTracing profiles from plasma of 12
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The ability to predict cardiometabolic risk is essential to support efforts to prevent future onset of disease. Biomarkers that assess biological aging-the rate of decline in physiological functioning that occurs across the systems of the human body-have the potential to support this goal.
METHODS: We investigated the extent to which Dunedin Pace of Aging Calculated From the Epigenome (DunedinPACE), an epigenetic measure of biological aging, predicted cardiometabolic disease onset in a cohort of 2062 US military veterans free of disease at baseline and followed for an average of 1
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Emerging evidence underscores the pivotal role of Ten-eleven translocation 2 (Tet2), as an epigenetic regulator with neuroprotective functions, yet its temporal dynamics and pathogenic contributions to Alzheimer’s disease (AD) remain poorly understood. By integrating human longitudinal cohort data with experimental models, we demonstrated that Tet2 deficiency accelerated AD‑like neurodegeneration through oxidative stress-dependent cGAS-STING activation. Clinically, Tet2 loss-of-function carriers among Aβ-positive individuals exhibited significantly accelerated cognitive decline. In mice, Tet2
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rett syndrome (RTT) is a severe X-linked neurodevelopmental disorder that is caused in most cases by pathogenic variants in MECP2, the gene encoding methyl-CpG-binding protein 2 (MeCP2). Despite substantial progress in the development of gene therapy, restoring MECP2 expression remains challenging because MeCP2 is highly dosage-sensitive. Both deficiency and excessive expression of this protein are associated with severe neurological abnormalities. This makes simple viral vector-mediated replacement of MECP2 potentially unsafe and underscores the need for multilayered systems that control tran
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IN BRIEF: The transition from histones to protamines during spermiogenesis is critical for male genome integrity and influences fertilisation and early embryogenesis. This study reveals that specific 5' UTR single nucleotide polymorphisms (SNPs) and promoter methylation of the H2BC1 gene may regulate TSH2B expression in sperm, contributing new insights into the regulatory mechanisms of testis-specific genes and their implications for male fertility.
ABSTRACT: The transition from histones to protamines during spermiogenesis plays a crucial role in shaping the male epigenome, and any changes in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGOUND: Ligand-activated Retinoid X Receptors (RXRs) regulate gene networks essential for neural development, neuroinflammation, and metabolism. Understanding how RXR activation influences chromatin architecture and gene expression may reveal therapeutic strategies for neurodegenerative diseases.
METHODS: We used Bexarotene-treated APP/PS1ΔE9 mice to study RXR-mediated regulatory mechanisms. To investigate epigenomic and transcriptional effects, we integrated single-nucleus ATAC-seq (snATAC-seq) with single-cell RNA-seq (scRNA-seq) and validated differentially accessible chromatin peaks us
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colorectal liver metastasis (CRLM) remains lethal, and the convergence of cellular senescence with metabolic reprogramming via epigenomic rewiring is poorly understood. We integrated genome-wide DNA methylation and RNA-seq data from 10 paired primary tumors and liver metastases (GSE213402). After calling differentially methylated genes (3,399 hyper- and 9,519 hypomethylated) and differentially expressed genes (406 DEGs), we intersected them with curated senescence (n = 866) and metabolic reprogramming (n = 948) gene sets, yielding 28 differentially expressed cellular-senescence-related genes (
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.