Carboplatin resistance remains a major challenge in the treatment of high-grade serous ovarian cancer (HGSOC), the most lethal subtype of epithelial ovarian cancer. To uncover mechanisms driving chemoresistance, we combined patient-derived transcriptomic data with advanced 3D in vitro models. Analysis of TCGA datasets revealed significant upregulation of matrix remodelling gene MMP9. To mimic clinical response, 3D models of four HGSOC cell lines were compared with conventional 2D models. The IC50 values for carboplatin were substantially higher in 3D models, indicating increased chemoresistanc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Lung adenocarcinoma (LUAD) has a poor prognosis, and effective metabolic biomarkers are still few. Glutamine metabolism is one of the central features of tumor metabolic reprogramming, but the cellular heterogeneity and clinical significance of glutamine metabolism in the LUAD tumor microenvironment (TME) remain unknown. The goal of this paper was to define glutamine metabolism on a single-cell basis and determine major regulators that have predictive value.
METHODS: A single-cell RNA sequencing dataset (GSE149655) was combined with The Cancer Genome Atlas Lung Adenocarcinoma (TCG
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RATIONALE: Therapy resistance remains a critical challenge in colon adenocarcinoma (COAD). The dysregulation of programmed cell death (PCD) pathways significantly influences therapeutic response, but its integrated role in shaping the tumor microenvironment (TME) and driving clinical heterogeneity in COAD is poorly defined.
METHODS: We established a Programmed Cell Death-related Subtype (PCDS) classification by integrating 12 PCD pathways across transcriptomic data from 1,140 COAD patients using non-negative matrix factorization (NMF). The subtypes were validated in independent RNA-sequencing
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: This study explores a novel mechanism by which the RNA helicase DHX37 contributes to melanoma and elucidates the reasons for resistance to tumor immunotherapy, providing new insights for the treatment of melanoma. METHOD: This study integrated multiomics data for systematic analysis. The prognostic value of the candidate differentially expressed genes was assessed on the basis of public databases. Single-cell transcriptome data were used to determine the expression patterns of key genes and elucidate intercellular communication networks. Finally, in vitro and in vivo experiments
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Identifying recurrent genetic mutations is crucial for advancing the understanding and treatment of hepatocellular carcinoma (HCC). The chromatin regulator ARID1A is frequently mutated in cancers, but its integrated impact on prognosis and the tumor immune microenvironment (TIME) in HCC is unclear.
METHODS: Somatic mutation and transcriptome data from TCGA and ICGC databases were analyzed. Associations with tumor mutation burden (TMB) and prognosis were evaluated. Immune infiltration was estimated using CIBERSORT/ssGSEA. Pathway and immunomodulator analyses were performed. ARID1A
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hepatocellular carcinoma (HCC) is a malignant tumour with high global incidence and mortality, featuring limited therapeutic options and poor prognosis, which necessitates novel prognostic biomarkers. The immune checkpoint molecule CD274 (Programmed Death-Ligand 1, PD-L1) correlates with poor prognosis in most solid tumours, yet its prognostic value in HCC remains controversial, and circulating levels are unclear. This study aimed to multi-dimensionally investigate CD274's expression patterns and clinical significance in HCC.
METHODS: Bioinformatics analyses were performed on The
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The role of Bisphenol A (BPA) in endometrial cancer (EC) remains uncertain. In this study, we integrated toxicological prediction, network toxicology, gene expression profiling, survival analysis, and molecular docking to explore potential BPA-associated molecular features in EC. Toxicological predictions from ADMETLAB 3.0 and ProTox-3 suggested a potential affinity of BPA for estrogen receptor α (ERα), along with possible involvement in oxidative stress and mitochondrial dysfunction. Integrative database analysis identified 129 putative BPA–EC–related genes, and GO/KEGG enrichment analyses in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cellular origin and molecular mechanisms underlying therapeutic resistance in colorectal cancer remain largely unclear.This study integrates single-cell transcriptomics, spatial transcriptomics, molecular docking, and multi-cohort public databases to systematically elucidate the epithelial cell-driven drug resistance mechanism, and combines clinical pathological paraffin samples to evaluate the clinical significance and prognosis of the key protein TMEM184A. Integrated single-cell datasets underwent quality control and PCA/UMAP clustering, followed by annotation verified through spatial tr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Programmed cell death (PCD) plays a complex and critical role in the progression of colon adenocarcinoma (COAD). Elucidating PCD-related characteristics is expected to provide new insights for tumor subtyping, prognosis assessment, and personalized therapy.
METHODS: This study integrated multi-omics data from COAD and employed 10 clustering algorithms for molecular subtyping. Based on PCD-related genes, a Programmed cell death signature (PCDS) predictive model was constructed using 113 machine learning algorithms. The focus then shifted to the core gene of the model, TERT. Single-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tumor heterogeneity in breast cancer is well recognized, but research has largely focused on primary tumors, while metastatic lesions, particularly brain metastases (BM), remain understudied. With the rising incidence of BM in metastatic breast cancer (MBC) and their poor prognosis, a deeper understanding of the molecular mechanisms driving BM formation, progression, and immune evasion is crucial for developing better therapeutic strategies. We performed an integrated analysis of BM and matched primary breast tumors using immunohistochemistry, in-situ hybridization, tumor-infiltrating lymphocy
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) is a heterogeneous malignancy. Although the R-CHOP regimen has significantly improved the prognosis for most patients, a subset continues to experience poor therapeutic outcomes. Recent studies have highlighted the role of the nervous system in cancer, yet its impact on DLBCL remains unclear. In this study, 21 neuro-related (NR) genes were identified from the Gene Ontology database, and a prognostic risk scoring model for DLBCL was developed and validated across multiple cohorts. The NR-based score effectively stratified patients according to survival outc
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bladder cancer is one of the major health threats worldwide, and aberrant regulation of nitrogen metabolism is closely related to its development. Understanding the role of nitrogen metabolism-related genes in BC is pivotal for the development of new therapeutic strategies and prognostic assessment.
AIM AND OBJECTIVES: This study aimed to explore the prognostic factors associated with nitrogen metabolism in bladder cancer (BC) and to construct a prognostic model.
METHODS: Differential expression gene analysis was performed to identify genes associated with nitrogen metabolism by
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Glioblastoma (GBM) is an aggressive brain tumor with therapeutic resistance and poor prognosis. Mitochondrial dysfunction has emerged as a critical driver of tumor progression and immune modulation, yet mitochondrial gene alterations and their cellular specificity in GBM remain unclear.
METHODS: Transcriptomic datasets (TCGA-GBM, GSE66354) were analyzed to identify differentially expressed mitochondria-associated genes using MitoCarta3.0. Prognostic mitochondrial DEGs (MitoDEGs) were determined by Cox regression, and a nomogram was constructed for survival prediction. Single-cell
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To generate a single-cell atlas of colorectal cancer (CRC) development in Lynch syndrome (LS), and to delineate the associated cellular reprogramming and intercellular communication networks.
METHODS: We performed single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) on matched normal mucosa, adenoma, and carcinoma tissues obtained from patients with LS. Following quality control and batch-effect correction, we used the Uniform Manifold Approximation and Projection (UMAP) clustering and marker gene analyses to annotate cell types, differential expression analyses to identify stage-specific genes,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Adenosine-related RNA modifications, including N6-methyladenosine (m6A), N1-methyladenosine (m1A), alternative polyadenylation (APA), and adenosine-to-inosine (A-to-I) editing, critically regulate transcriptional programs in cancer. However, their coordinated contribution to bladder cancer biology and response to immunotherapy remains poorly understood. METHODS: We systematically characterized four classes of RNA modification “writer” genes in bladder cancer, assessing somatic mutations, copy-number variations, and mRNA expression patterns across seven independent cohorts, includin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
2',2',4',4'-Tetrabromodiphenyl ether (BDE-47), the most widespread congener of polybrominated diphenyl ethers, has attracted considerable attention due to its environmental persistence and extensive use. Although epidemiological data associate BDE-47 exposure with increased cancer risk, its role in bladder cancer (BC) remains insufficiently characterized. We found that BDE-47 at a physiologically relevant concentration (0.1 μM, comparable to human exposure levels) enhanced malignant phenotypes of BC cells in vitro. A total of 229 candidate genes were uncovered at both bulk and single-cell tran
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pyrethroid insecticides are widely used in agricultural and domestic settings. Increasing evidence suggests that pyrethroid exposure may harm multiple organ systems and is associated with potential carcinogenicity. However, the mechanisms linking pyrethroids to clear cell renal cell carcinoma (ccRCC) remain unclear. Using an integrative framework combining network toxicology, single-cell sequencing-based analyses, and molecular docking, we investigated putative core targets and associated signaling pathways through which six prevalent pyrethroid active ingredients in household insecticides may
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Osteosarcoma, an aggressive bone malignancy with limited response to immunotherapy, remains a major clinical challenge. Tertiary lymphoid structures (TLS), as organized ectopic lymphoid aggregates, play a pivotal role in modulating antitumor immune responses. However, their landscape, clinical significance, and molecular determinants in osteosarcoma remain largely unexplored.
METHODS: TLS were identified in osteosarcoma tissues by immunohistochemistry and multiplex immunofluorescence. Using transcriptomic data from the TARGET, GEO (GSE21257, GSE16091, GSE39055), and PKUPH cohorts,
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cisplatin-based chemotherapy is widely used for bladder cancer, yet therapeutic resistance remains a major clinical obstacle. Here, by integrating cisplatin-related single-cell RNA sequencing datasets with spatial transcriptomics, we identified distinct malignant cell populations associated with cisplatin resistance. These resistant states exhibited enhanced stemness features, increased intercellular communication, and metabolic adaptation. Building on these resistance-associated cellular programs, we applied a cross-platform screening strategy incorporating urinary proteomics and transcriptom
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: WD-repeat domain 1 (WDR1), a key regulator of actin cytoskeleton dynamics, has been implicated in tumor progression. However, its pan-cancer characteristics and immunological relevance remain unclear. In this study, we performed an integrative pan-cancer analysis to evaluate the expression patterns, prognostic value, molecular features, and immune associations of WDR1.
METHODS: We systematically analyzed WDR1 across cancers using integrated datasets from The Cancer Genome Atlas (TCGA), Genotype-Tissue Expression (GTEx), and Gene Expression Omnibus (GEO). By integrating R software
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования