In the race to contain severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), efficient detection and triage of infected patients must rely on rapid and reliable testing. In this work, we performed the first evaluation of the QIAstat-Dx respiratory SARS-CoV-2 panel (QIAstat-SARS) for SARS-CoV-2 detection. This assay is the first rapid multiplex PCR (mPCR) assay, including SARS-CoV-2 detection, and is fully compatible with a non-PCR-trained laboratory or point-of-care (PoC) testing. This evaluation was performed using 69 primary clinical samples (66 nasopharyngeal swabs [NPS], 1 bronchoa
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Increasing resistance drives empirical use of less potent and previously reserved antibiotics, including for urinary tract infections (UTIs). Molecular profiling, without culture, might better guide early therapy.
OBJECTIVES: To explore the potential of AusDiagnostics multiplex tandem (MT) PCR UTI assays.
METHODS: Two MT-PCR assays were developed successively, seeking 8 or 16 resistance genes. Amplification was tracked in real time, with melting temperatures used to confirm product identity. Assays were variously performed on: (i) extracted DNA; (ii) cultured bacteria; (iii) urin
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Considering the great lethality and sequels caused by meningitis, rapid diagnosis and prompt treatment initiation have a great impact on patient outcome. Here, we developed a multiplex-PCR for simultaneous detection of the four most prevalent bacterial pathogens directly in CSF samples. The multiplex-PCR was designed to detect the following genes: fbsA (Streptococcus agalactiae), lytA (Streptococcus pneumoniae), crtA (Neisseria meningitidis), p6 (Haemophilus influenzae), and 16S rRNA (any bacterial agent). The multiplex-PCR showed a DNA detection limit of 1 pg/μL. Among 447 CSF samples tested,
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In this study, we evaluated the diagnostic potential and clinical impact of an automated multiplex PCR platform (the FilmArray Respiratory Panel; FA-RP), specially designed for pathogen detection in respiratory tract infections in adults with unexplained pneumonia (UP).
METHODS: A total of 112 UP patients in Shanghai, China, were enrolled prospectively and assessed using the FA-RP from October 2016 to March 2018. We examined the test results and their influence on clinical decisions. Furthermore, as a control group, we retrospectively obtained the clinical data of 70 UP patients b
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RATIONALE: Hereditary multiple exostoses (HMEs) is an autosomal dominant skeletal disorder.
PATIENT CONCERNS: Six probands of the 6 unrelated Han Chinese families were identified as having HME. These patients had exostoses at multiple sites and significantly affected joints malformation and movement.
DIAGNOSES: Hereditary multiple exostoses.
INTERVENTIONS: To detect the genetic mechanism of HME in 6 unrelated Chinese families, whole-exome sequencing (WES) and multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) were used after genomic DNA was isolated from peripheral blood leucocytes. Po
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diffuse panbronchiolitis (DPB) is a sinopulmonary disease mainly affecting Asian populations. Primary ciliary dyskinesia (PCD) is a genetically heterogeneous disorder impairing ciliary structure and function. These two disorders are not easily distinguished by clinical signs and symptoms.
METHODS: In 105 Japanese patients with recurrent sinopulmonary infection, initially diagnosed with DPB, and 37 patients with recurrent airway infection diagnosed in adulthood, the deletion allele of DRC1 or CCDC164, recently recognized as a pathogenic PCD gene variant, was searched using a multip
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Alveolar echinococcosis is a dangerous zoonotic disease caused by larval forms of Echinococcus multilocularis. In its life-cycle, the principal definitive host is the red fox; however, domesticated carnivorous animals (dogs and cats) can also act as definitive hosts. Until now, there were no data concerning this infection in cats in Poland. The aim of this study was to estimate the prevalence of E. multilocularis in cats and dogs originating from rural areas and animal shelters in a region characterised by a high prevalence of E. multilocularis in red foxes.
METHODS: Samples of fa
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the present study, 110 enterococci were isolated from two Sicilian cheese types, Ragusano PDO and Pecorino Siciliano. Isolates, firstly identified by MALDI-TOF/MS and a multiplex PCR assay, were tested for susceptibility to the most relevant clinical antibiotics. Clonal relationships among isolates were evaluated by pulsed-field-gel electrophoresis (PFGE) analysis and the presence of vanA and vanB genes, in vancomycin resistant enterococci (VRE), was investigated. Overall, E. faecalis, E. durans (35% for each species) and E. faecium (28%) were the major identified species. Different occurre
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTIONSyndromic panels were first FDA cleared for detection of respiratory pathogens in 2008. Since then, other panels have been approved by the FDA, and most recently, the FilmArray meningitis/encephalitis panel (BioFire, Salt Lake City, UT) has become available. This assay detects 14 targets within 1 h and includes pathogens that typically cause different manifestations of infection, although they infect the same organ system. Several studies have reported both false-positive and false-negative results with this test, and all agree that the cost is significant. As with other panels, he
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) is a group of emerging pathogens that can cause human diseases, including hemolytic uremic syn … lected by dilution plating on MacConkey agar with sorbitol, cefixime, and tellurite and analyzed by multiplex polymerase chain reaction for virulence genes. Serotyping of non-O157 was performed, and testing for 12 antibiotics by disk diffusion was carried out. A total of 18 STEC strains were isolated, presenting different virulence profiles. Contamination by STEC was observed in the …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Maturity onset diabetes of the young (MODY) is a rare form of monogenic diabetes. Being clinically and genetically heterogeneous, it is often misdiagnosed as type 1 or type 2 diabetes, leading to inappropriate therapy. MODY is caused by a single gene mutation. Thirteen genes, defining 13 subtypes, have been identified to cause MODY. A correct diagnosis is important for the right therapy, prognosis, and genetic counselling.
MATERIAL AND METHODS: Twenty-nine unrelated paediatric patients clinically suspected of having MODY diabetes were analysed using TruSight One panel for next-g
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Staphylococcus aureus is responsible for large numbers of hospital-related and community-acquired infections. In this study, we investigated the presence of S. aureus and methicillin-resistant S. aureus (MRSA) in 100 samples from animals (55 cattle, 36 dogs, and 9 cats) and 150 samples from hospitalized human patients. The samples were collected from healthy and diseased animals and from diseased humans and included milk, wound swab, pus, exudates, nasal swab and diabetic ulcer. Initially, S. aureus was isolated and identified by colony morphology, Gram staining, and biochemical te
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiplex molecular techniques can detect a diversity of respiratory viruses and bacteria that cause childhood acute respiratory infection rapidly and conveniently. However, currently available techniques show high variation in performance. We sought to compare the diagnostic accuracy of the novel multiplex NxTAG respiratory pathogen panel (RPP) RUO test versus a routine multiplex Anyplex II RV16 assay in respiratory specimens collected from children <18 years of age hospitalized with nonspecific symptoms of acute lower respiratory infection. Parallel testing was performed on nasopharyngeal as
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute respiratory tract infections (ARTIs) are a leading cause of morbidity and mortality in young children in low and middle income countries. To analyse the overall burden of respiratory viruses responsible for ARTIs in paediatrics population in eastern India, this study was performed. Clinical information, demographic information and nasal/oral swabs were collected from 332 paediatric patients (aged from 1 month to 12 years old) with the symptoms of ARTI, enrolled from the outpatient department from Nov 2012 to Oct 2014. Multiplex PCR was performed to detect eight respiratory viral pathogen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amelogenesis imperfecta (AI) is a clinically and genetically heterogeneous disorder of tooth development which is due to aberrant deposition or composition of enamel. Both syndromic and isolated forms exist; they may be inherited in an X-linked, autosomal recessive, or autosomal dominant manner. WDR72 is one of ten currently known genes for recessive isolated AI; nine WDR72 mutations affecting single nucleotides have been described to date. Based on whole exome sequencing in a large consanguineous AI pedigree, we obtained evidence for presence of a multi-exonic WDR72 deletion. A home-made mult
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Infections of Echinococcus granulosus sensu stricto (s.s), E. multilocularis and E. shiquicus are commonly found co-endemic on the Qinghai-Tibet plateau, China, and an efficient tool is needed to facilitate the detection of infected hosts and for species identification.
METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: A single-tube multiplex PCR assay was established to differentiate the Echinococcus species responsible for infections in intermediate and definitive hosts. Primers specific for E. granulosus, E. multilocularis and E. shiquicus were designed based on sequences of the mitochondrial NA
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To examine the genetic mutations in the first UK cohort of patients with cystinuria with preliminary genotype/phenotype correlation.
PATIENTS AND METHODS: DNA sequencing and multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) were used to identify the mutations in 74 patients in a specialist cystinuria clinic in the UK. Patients with type A cystinuria were classified into two groups: Group M patients had at least one missense mutation and Group N patients had two alleles of all other types of mutations including frameshift, splice site, nonsense, deletions and duplications. The
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To identify IKZF1 gene copy number abnormalities in BCR/ABL-negative B-lineage acute lymphoblastic leukemia (B-ALL) in children, and to investigate the association between such abnormalities and prognosis.
METHODS: Multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) was applied to detect IKZF1 gene copy number abnormalities in 180 children diagnosed with BCR/ABL-negative B-ALL. These children were classified into IKZF1 deletion group and IKZF1 normal group according to the presence or absence of IKZF1 gene deletion. The association between IKZF1 copy number abnormalities and pr
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An antigen detection kit (Trichin-L), based on latex agglutination and developed by the Bio-Rad company was validated at five European laboratories. The validation parameters included specificity, sensitivity, robustness and reproducibility. Specificity was evaluated by testing parasite antigens from five non-Trichinella parasites in addition to the Trichinella genus. To evaluate sensitivity, 10 pork samples spiked with 1, 3, 6 or 15 Trichinella larvae were tested in each laboratory. To evaluate the robustness of the test, the solubilized antigens were maintained at room temperature and tested
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Trichinella infections are endemic in the Balkan region of Europe. Though trichinellosis and agents thereof are serious problems for human health and animal husbandry, only a limited number of Trichinella isolates from Serbia have been identified at the species level so far. The aim of the present study was the surveillance and monitoring of Trichinella in domestic pigs and wild animals from the endemic district of Branicevo. Investigations performed during the 2009-2010 period revealed Trichinella infections in 344 out of 282,960 (0.12%) domestic pigs. Among wildlife, Trichinella infections w
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования